Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A316U317

Protein Details
Accession A0A316U317    Localization Confidence High Confidence Score 17.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
630-655QRALAKEEEEKKRRKRVNLQDVYHAVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
423-429KARRKRA
483-487KKKGK
640-644KKRRK
708-713GGGKKK
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 13, cyto 2.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045144  TAF4  
IPR007900  TAF4_C  
Gene Ontology GO:0005669  C:transcription factor TFIID complex  
GO:0006352  P:DNA-templated transcription initiation  
Pfam View protein in Pfam  
PF05236  TAF4  
CDD cd08045  TAF4  
Amino Acid Sequences MAQLPGSHANSRAGSFSAPSPSPGPSHPTGSSGQNGNHPNLNRPGMPLPGGYPYQTSMGPPQPGTRRPSMGGHSAGGMSPQQKPMSFPYGGMPPAGQQTGGGVGSGADGGYQYPPAGSYNNQQQQWTSNAASPSPAPSSALWGGPTAMPYPGYTYQPQSGPPHQSSNGPAAAPSPVHRPSQSNAAPSNPNRQVAPSPAASRAVSGAPPETSAPPSPWGGQQQQQPQQQQQQQQHTSSGRDDPQDAKQVMDVLGGSGIDLRAEEEAMRGRDPHHPPGLGPGEYNTQRSMPSGSSLTSAYPSGSQGQSTQPPISSLPFLQLYPLASFVHAISSTHEIGVEPEVLSTLSTAARIRFRNLLENMIASSRQRCWTTHERPPPLYESGDDDVEGTSRKKRKAMYHQELISDPSKWLTAIEKADRGEEVKARRKRAQRQREAMLAAAATDSAGQGGASGSGGVAGLDGEGDETMGEGGPATPGGDGSGGKKKGKALSAKNVSEDVRRRLANNTAARALGGATTPKWMIMGTGSASSTGAFSTPTRIKGEVKGETNGEAQTPAFGGGPAPAGGLSSLPKPRFGPAAGASTASGAGGPWGRSLAPSGLAGTPLSRPGGAESPSGTDGKINPQGWGDLAQRALAKEEEEKKRRKRVNLQDVYHAVETERRSGIGRGSGEKTTWRWRNLGPEAARKAAASAGGGAGDETPTGGETRGGGGGKKK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.21
2 0.21
3 0.22
4 0.24
5 0.23
6 0.24
7 0.24
8 0.25
9 0.27
10 0.27
11 0.31
12 0.28
13 0.33
14 0.31
15 0.33
16 0.33
17 0.35
18 0.37
19 0.35
20 0.34
21 0.36
22 0.39
23 0.39
24 0.42
25 0.4
26 0.41
27 0.44
28 0.46
29 0.39
30 0.4
31 0.39
32 0.36
33 0.36
34 0.31
35 0.25
36 0.26
37 0.26
38 0.22
39 0.21
40 0.19
41 0.2
42 0.19
43 0.2
44 0.22
45 0.27
46 0.29
47 0.29
48 0.35
49 0.41
50 0.47
51 0.5
52 0.5
53 0.48
54 0.47
55 0.52
56 0.49
57 0.48
58 0.44
59 0.38
60 0.33
61 0.3
62 0.27
63 0.22
64 0.21
65 0.17
66 0.18
67 0.22
68 0.23
69 0.23
70 0.26
71 0.31
72 0.34
73 0.32
74 0.29
75 0.28
76 0.3
77 0.3
78 0.28
79 0.22
80 0.18
81 0.21
82 0.2
83 0.16
84 0.11
85 0.12
86 0.14
87 0.13
88 0.11
89 0.07
90 0.07
91 0.07
92 0.07
93 0.06
94 0.04
95 0.04
96 0.05
97 0.05
98 0.06
99 0.06
100 0.06
101 0.07
102 0.08
103 0.1
104 0.12
105 0.18
106 0.28
107 0.35
108 0.36
109 0.36
110 0.36
111 0.37
112 0.39
113 0.37
114 0.28
115 0.25
116 0.25
117 0.24
118 0.25
119 0.22
120 0.22
121 0.19
122 0.18
123 0.16
124 0.15
125 0.2
126 0.21
127 0.21
128 0.18
129 0.17
130 0.17
131 0.16
132 0.17
133 0.12
134 0.11
135 0.1
136 0.1
137 0.15
138 0.16
139 0.19
140 0.2
141 0.23
142 0.26
143 0.27
144 0.31
145 0.32
146 0.35
147 0.39
148 0.4
149 0.42
150 0.4
151 0.41
152 0.39
153 0.38
154 0.34
155 0.27
156 0.24
157 0.19
158 0.19
159 0.17
160 0.16
161 0.18
162 0.19
163 0.21
164 0.23
165 0.25
166 0.26
167 0.35
168 0.36
169 0.35
170 0.34
171 0.35
172 0.41
173 0.4
174 0.48
175 0.42
176 0.4
177 0.35
178 0.37
179 0.35
180 0.32
181 0.34
182 0.27
183 0.26
184 0.26
185 0.28
186 0.25
187 0.23
188 0.2
189 0.17
190 0.14
191 0.13
192 0.13
193 0.11
194 0.12
195 0.13
196 0.13
197 0.14
198 0.15
199 0.16
200 0.16
201 0.18
202 0.18
203 0.2
204 0.23
205 0.24
206 0.28
207 0.33
208 0.4
209 0.46
210 0.51
211 0.52
212 0.52
213 0.57
214 0.58
215 0.6
216 0.59
217 0.6
218 0.58
219 0.55
220 0.56
221 0.49
222 0.45
223 0.4
224 0.37
225 0.3
226 0.27
227 0.28
228 0.25
229 0.27
230 0.33
231 0.31
232 0.26
233 0.24
234 0.24
235 0.21
236 0.19
237 0.14
238 0.07
239 0.07
240 0.06
241 0.05
242 0.05
243 0.04
244 0.04
245 0.04
246 0.04
247 0.04
248 0.04
249 0.04
250 0.05
251 0.09
252 0.1
253 0.11
254 0.11
255 0.13
256 0.21
257 0.26
258 0.3
259 0.3
260 0.29
261 0.29
262 0.36
263 0.38
264 0.29
265 0.25
266 0.21
267 0.23
268 0.24
269 0.25
270 0.19
271 0.16
272 0.16
273 0.16
274 0.17
275 0.11
276 0.12
277 0.12
278 0.12
279 0.12
280 0.12
281 0.12
282 0.11
283 0.11
284 0.09
285 0.08
286 0.09
287 0.1
288 0.1
289 0.1
290 0.11
291 0.13
292 0.16
293 0.18
294 0.17
295 0.15
296 0.16
297 0.16
298 0.16
299 0.15
300 0.12
301 0.12
302 0.12
303 0.12
304 0.11
305 0.11
306 0.11
307 0.1
308 0.11
309 0.09
310 0.08
311 0.08
312 0.08
313 0.08
314 0.07
315 0.07
316 0.07
317 0.1
318 0.11
319 0.1
320 0.1
321 0.09
322 0.09
323 0.1
324 0.09
325 0.06
326 0.05
327 0.06
328 0.05
329 0.05
330 0.05
331 0.05
332 0.04
333 0.05
334 0.06
335 0.08
336 0.13
337 0.14
338 0.15
339 0.19
340 0.2
341 0.26
342 0.26
343 0.26
344 0.22
345 0.21
346 0.2
347 0.16
348 0.16
349 0.09
350 0.1
351 0.1
352 0.13
353 0.14
354 0.14
355 0.21
356 0.31
357 0.37
358 0.44
359 0.51
360 0.53
361 0.53
362 0.54
363 0.5
364 0.43
365 0.36
366 0.28
367 0.24
368 0.21
369 0.19
370 0.17
371 0.14
372 0.11
373 0.11
374 0.12
375 0.08
376 0.13
377 0.18
378 0.2
379 0.24
380 0.29
381 0.38
382 0.48
383 0.58
384 0.6
385 0.62
386 0.62
387 0.6
388 0.56
389 0.5
390 0.39
391 0.29
392 0.21
393 0.14
394 0.12
395 0.1
396 0.1
397 0.09
398 0.12
399 0.15
400 0.17
401 0.19
402 0.2
403 0.2
404 0.2
405 0.19
406 0.17
407 0.18
408 0.23
409 0.3
410 0.35
411 0.4
412 0.47
413 0.55
414 0.63
415 0.7
416 0.74
417 0.75
418 0.77
419 0.75
420 0.72
421 0.65
422 0.54
423 0.44
424 0.32
425 0.22
426 0.15
427 0.1
428 0.05
429 0.04
430 0.04
431 0.03
432 0.03
433 0.03
434 0.03
435 0.03
436 0.03
437 0.03
438 0.03
439 0.03
440 0.03
441 0.03
442 0.03
443 0.03
444 0.02
445 0.02
446 0.02
447 0.02
448 0.02
449 0.02
450 0.02
451 0.02
452 0.02
453 0.03
454 0.03
455 0.03
456 0.03
457 0.03
458 0.03
459 0.03
460 0.04
461 0.03
462 0.03
463 0.04
464 0.05
465 0.05
466 0.09
467 0.16
468 0.19
469 0.2
470 0.22
471 0.26
472 0.3
473 0.35
474 0.4
475 0.4
476 0.47
477 0.55
478 0.55
479 0.53
480 0.51
481 0.47
482 0.45
483 0.43
484 0.38
485 0.34
486 0.34
487 0.34
488 0.34
489 0.39
490 0.41
491 0.4
492 0.39
493 0.34
494 0.33
495 0.32
496 0.28
497 0.22
498 0.14
499 0.1
500 0.08
501 0.07
502 0.09
503 0.09
504 0.09
505 0.09
506 0.08
507 0.08
508 0.07
509 0.09
510 0.08
511 0.09
512 0.09
513 0.09
514 0.1
515 0.09
516 0.09
517 0.07
518 0.06
519 0.06
520 0.06
521 0.13
522 0.16
523 0.19
524 0.22
525 0.24
526 0.26
527 0.31
528 0.38
529 0.37
530 0.37
531 0.37
532 0.35
533 0.35
534 0.34
535 0.28
536 0.22
537 0.16
538 0.13
539 0.11
540 0.1
541 0.09
542 0.07
543 0.07
544 0.07
545 0.07
546 0.08
547 0.07
548 0.07
549 0.06
550 0.06
551 0.06
552 0.07
553 0.07
554 0.11
555 0.18
556 0.19
557 0.21
558 0.22
559 0.25
560 0.27
561 0.27
562 0.28
563 0.25
564 0.29
565 0.27
566 0.27
567 0.25
568 0.21
569 0.2
570 0.14
571 0.11
572 0.05
573 0.07
574 0.08
575 0.09
576 0.09
577 0.1
578 0.1
579 0.1
580 0.13
581 0.12
582 0.12
583 0.12
584 0.14
585 0.13
586 0.14
587 0.14
588 0.12
589 0.12
590 0.13
591 0.13
592 0.11
593 0.11
594 0.14
595 0.19
596 0.19
597 0.19
598 0.19
599 0.21
600 0.23
601 0.23
602 0.19
603 0.17
604 0.17
605 0.23
606 0.3
607 0.27
608 0.26
609 0.27
610 0.28
611 0.26
612 0.3
613 0.24
614 0.19
615 0.19
616 0.2
617 0.2
618 0.2
619 0.21
620 0.17
621 0.17
622 0.22
623 0.31
624 0.4
625 0.47
626 0.57
627 0.64
628 0.73
629 0.8
630 0.82
631 0.83
632 0.84
633 0.87
634 0.87
635 0.82
636 0.8
637 0.75
638 0.7
639 0.59
640 0.48
641 0.37
642 0.32
643 0.3
644 0.26
645 0.24
646 0.2
647 0.21
648 0.23
649 0.26
650 0.28
651 0.29
652 0.29
653 0.32
654 0.33
655 0.32
656 0.36
657 0.37
658 0.41
659 0.46
660 0.44
661 0.45
662 0.47
663 0.56
664 0.58
665 0.62
666 0.57
667 0.6
668 0.61
669 0.59
670 0.56
671 0.46
672 0.4
673 0.33
674 0.27
675 0.18
676 0.14
677 0.12
678 0.11
679 0.11
680 0.1
681 0.09
682 0.08
683 0.07
684 0.06
685 0.06
686 0.06
687 0.07
688 0.07
689 0.08
690 0.08
691 0.11
692 0.14
693 0.15