Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A316UG70

Protein Details
Accession A0A316UG70    Localization Confidence Low Confidence Score 8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
252-275TAPASPTKGSKKRKKPDAPIITSDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
259-266KGSKKRKK
Subcellular Location(s) extr 19, cyto 4.5, cyto_nucl 3.5, mito 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001352  RNase_HII/HIII  
IPR024567  RNase_HII/HIII_dom  
IPR023160  RNase_HII_hlx-loop-hlx_cap_dom  
IPR012337  RNaseH-like_sf  
IPR036397  RNaseH_sf  
Gene Ontology GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0004523  F:RNA-DNA hybrid ribonuclease activity  
GO:0006401  P:RNA catabolic process  
Pfam View protein in Pfam  
PF01351  RNase_HII  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51975  RNASE_H_2  
CDD cd07181  RNase_HII_eukaryota_like  
Amino Acid Sequences SQSQSQSQSQSDSQSQVDAVLVASTPPVPSVHGSPLVDSYTYQSPVPSQARGVPCILGVDEAGRGPVLGPLVYGVAYCPASFSDELKGVGFADSKALTAERRDALLAALINHPDQLGWATQTMSPQDISAGMLRKRPFNLNQQSTEATVHLIHSILSSGVDISEIFVDTVGDPATYCKTLKSFFPQAKYKHIEWTVTSKADAIYPIVGAASIAAKVTRDRWVEDWRYAESVGDQSTAGETQAGPSTSALEETAPASPTKGSKKRKKPDAPIITSDTPHAFWHEFGSGYPGDPGTVAYLQRTIDPVFGWPGVVRFSWATIKTLLEEKRTVKGAASSAGATRASKAVNGGAGPATIGDAANTVAPFLTSTGSLPPPVGQPRGYKIKWIDEPAQITSFFAAKGGTPSNGSSAGSGDPVAL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.3
2 0.28
3 0.23
4 0.21
5 0.15
6 0.12
7 0.09
8 0.08
9 0.07
10 0.07
11 0.07
12 0.07
13 0.08
14 0.08
15 0.1
16 0.12
17 0.16
18 0.2
19 0.24
20 0.25
21 0.25
22 0.27
23 0.26
24 0.24
25 0.21
26 0.21
27 0.2
28 0.21
29 0.2
30 0.18
31 0.19
32 0.27
33 0.29
34 0.27
35 0.24
36 0.3
37 0.33
38 0.35
39 0.35
40 0.27
41 0.24
42 0.23
43 0.21
44 0.15
45 0.11
46 0.1
47 0.09
48 0.09
49 0.08
50 0.07
51 0.07
52 0.06
53 0.08
54 0.08
55 0.07
56 0.07
57 0.07
58 0.07
59 0.07
60 0.07
61 0.06
62 0.08
63 0.08
64 0.08
65 0.08
66 0.08
67 0.12
68 0.13
69 0.14
70 0.14
71 0.16
72 0.17
73 0.17
74 0.17
75 0.14
76 0.14
77 0.14
78 0.1
79 0.11
80 0.1
81 0.1
82 0.11
83 0.11
84 0.11
85 0.12
86 0.17
87 0.15
88 0.16
89 0.16
90 0.16
91 0.15
92 0.16
93 0.15
94 0.12
95 0.12
96 0.12
97 0.12
98 0.12
99 0.12
100 0.09
101 0.09
102 0.08
103 0.07
104 0.07
105 0.08
106 0.09
107 0.1
108 0.12
109 0.13
110 0.13
111 0.12
112 0.11
113 0.1
114 0.09
115 0.1
116 0.11
117 0.16
118 0.16
119 0.21
120 0.23
121 0.26
122 0.28
123 0.32
124 0.34
125 0.39
126 0.48
127 0.49
128 0.51
129 0.5
130 0.49
131 0.45
132 0.41
133 0.3
134 0.21
135 0.15
136 0.13
137 0.1
138 0.09
139 0.07
140 0.06
141 0.06
142 0.05
143 0.05
144 0.05
145 0.04
146 0.04
147 0.04
148 0.04
149 0.04
150 0.04
151 0.04
152 0.04
153 0.04
154 0.05
155 0.04
156 0.05
157 0.05
158 0.04
159 0.04
160 0.05
161 0.07
162 0.08
163 0.08
164 0.08
165 0.1
166 0.12
167 0.14
168 0.2
169 0.26
170 0.29
171 0.35
172 0.41
173 0.42
174 0.49
175 0.52
176 0.46
177 0.45
178 0.43
179 0.38
180 0.32
181 0.36
182 0.31
183 0.26
184 0.25
185 0.19
186 0.18
187 0.17
188 0.15
189 0.09
190 0.07
191 0.06
192 0.06
193 0.05
194 0.04
195 0.04
196 0.03
197 0.03
198 0.03
199 0.03
200 0.03
201 0.04
202 0.04
203 0.06
204 0.12
205 0.13
206 0.14
207 0.18
208 0.25
209 0.28
210 0.3
211 0.3
212 0.26
213 0.26
214 0.24
215 0.21
216 0.14
217 0.13
218 0.11
219 0.09
220 0.08
221 0.07
222 0.07
223 0.07
224 0.06
225 0.05
226 0.05
227 0.05
228 0.07
229 0.08
230 0.08
231 0.07
232 0.09
233 0.09
234 0.09
235 0.08
236 0.06
237 0.07
238 0.07
239 0.08
240 0.08
241 0.07
242 0.08
243 0.09
244 0.12
245 0.21
246 0.29
247 0.39
248 0.49
249 0.6
250 0.69
251 0.79
252 0.85
253 0.86
254 0.88
255 0.88
256 0.83
257 0.77
258 0.74
259 0.65
260 0.56
261 0.47
262 0.37
263 0.28
264 0.22
265 0.21
266 0.14
267 0.13
268 0.15
269 0.14
270 0.13
271 0.12
272 0.15
273 0.12
274 0.12
275 0.12
276 0.1
277 0.09
278 0.09
279 0.09
280 0.08
281 0.1
282 0.1
283 0.1
284 0.12
285 0.12
286 0.13
287 0.14
288 0.12
289 0.12
290 0.12
291 0.12
292 0.13
293 0.12
294 0.12
295 0.1
296 0.11
297 0.12
298 0.11
299 0.12
300 0.09
301 0.12
302 0.17
303 0.17
304 0.18
305 0.18
306 0.19
307 0.19
308 0.26
309 0.26
310 0.25
311 0.29
312 0.29
313 0.32
314 0.34
315 0.33
316 0.27
317 0.28
318 0.26
319 0.23
320 0.22
321 0.19
322 0.17
323 0.19
324 0.18
325 0.15
326 0.15
327 0.15
328 0.14
329 0.13
330 0.14
331 0.13
332 0.14
333 0.14
334 0.14
335 0.12
336 0.11
337 0.11
338 0.09
339 0.08
340 0.07
341 0.06
342 0.05
343 0.05
344 0.06
345 0.07
346 0.07
347 0.07
348 0.06
349 0.07
350 0.07
351 0.07
352 0.08
353 0.07
354 0.08
355 0.12
356 0.14
357 0.14
358 0.14
359 0.15
360 0.21
361 0.25
362 0.28
363 0.27
364 0.3
365 0.37
366 0.47
367 0.46
368 0.47
369 0.47
370 0.53
371 0.56
372 0.58
373 0.56
374 0.52
375 0.56
376 0.52
377 0.49
378 0.4
379 0.34
380 0.29
381 0.24
382 0.18
383 0.14
384 0.11
385 0.1
386 0.14
387 0.17
388 0.17
389 0.18
390 0.19
391 0.21
392 0.22
393 0.22
394 0.18
395 0.17
396 0.16
397 0.15