Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A316TZU5

Protein Details
Accession A0A316TZU5    Localization Confidence High Confidence Score 20.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
36-56AATQEKKEKKPPADAKKQVFAHydrophilic
136-157KEAKAAQRREKNAKKKEAKEAABasic
170-197VEGSAVKKEKKKRAKKPKTAAGRRPRADBasic
224-245TSSTAAPKKRNRKTKAQKAAAAHydrophilic
266-290ATPAAEKKPRERKPRAPKGPPTGEABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
138-156AKAAQRREKNAKKKEAKEA
175-195VKKEKKKRAKKPKTAAGRRPR
230-241PKKRNRKTKAQK
271-285EKKPRERKPRAPKGP
Subcellular Location(s) cyto 13, nucl 12.5, mito_nucl 7, cyto_pero 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd00590  RRM_SF  
Amino Acid Sequences MAVASDAVTANAGGANDALAGVSVSETTTVGVEGAAATQEKKEKKPPADAKKQVFAGNLAFSTTEDDLRALFSQAGPVADIQIITRGSRSLGYCFITYESEDSAQKAVSTLNKQVVAGREINLEGAKPQEELAALKEAKAAQRREKNAKKKEAKEAAAAAAAPAEATETVEGSAVKKEKKKRAKKPKTAAGRRPRADDGEEADKEPAAVDGAEAAVATNGAEGTSSTAAPKKRNRKTKAQKAAAAAAANGEAAPVEGGEGTAAATATPAAEKKPRERKPRAPKGPPTGEASSTLLFAANLSFETEDEQLKEAFTSEGLQVVSATVVKRKFGLKKSKGFGFVEFADKEEQTKALEKVNGKVVGGREISLKVAIQGSKEQADAESKQEADAATTTQAPSAAA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.06
2 0.06
3 0.06
4 0.06
5 0.05
6 0.04
7 0.04
8 0.04
9 0.04
10 0.04
11 0.04
12 0.05
13 0.05
14 0.06
15 0.06
16 0.06
17 0.06
18 0.06
19 0.06
20 0.05
21 0.05
22 0.06
23 0.07
24 0.07
25 0.1
26 0.18
27 0.23
28 0.28
29 0.37
30 0.45
31 0.51
32 0.61
33 0.69
34 0.73
35 0.79
36 0.83
37 0.8
38 0.78
39 0.75
40 0.67
41 0.58
42 0.5
43 0.41
44 0.34
45 0.28
46 0.21
47 0.18
48 0.15
49 0.17
50 0.16
51 0.14
52 0.12
53 0.12
54 0.12
55 0.14
56 0.14
57 0.11
58 0.11
59 0.1
60 0.12
61 0.13
62 0.13
63 0.11
64 0.1
65 0.1
66 0.1
67 0.1
68 0.08
69 0.1
70 0.11
71 0.1
72 0.11
73 0.1
74 0.11
75 0.14
76 0.15
77 0.14
78 0.17
79 0.2
80 0.19
81 0.2
82 0.2
83 0.18
84 0.18
85 0.16
86 0.15
87 0.14
88 0.15
89 0.15
90 0.14
91 0.13
92 0.12
93 0.11
94 0.12
95 0.15
96 0.18
97 0.21
98 0.24
99 0.25
100 0.25
101 0.27
102 0.28
103 0.26
104 0.24
105 0.21
106 0.18
107 0.18
108 0.18
109 0.15
110 0.13
111 0.1
112 0.1
113 0.09
114 0.08
115 0.08
116 0.08
117 0.08
118 0.09
119 0.1
120 0.15
121 0.14
122 0.14
123 0.16
124 0.17
125 0.21
126 0.27
127 0.3
128 0.32
129 0.4
130 0.47
131 0.56
132 0.64
133 0.7
134 0.73
135 0.8
136 0.8
137 0.78
138 0.82
139 0.8
140 0.72
141 0.65
142 0.57
143 0.47
144 0.38
145 0.31
146 0.21
147 0.12
148 0.1
149 0.06
150 0.04
151 0.04
152 0.03
153 0.03
154 0.03
155 0.04
156 0.04
157 0.05
158 0.05
159 0.05
160 0.09
161 0.12
162 0.16
163 0.22
164 0.3
165 0.39
166 0.5
167 0.6
168 0.68
169 0.77
170 0.84
171 0.89
172 0.9
173 0.89
174 0.9
175 0.89
176 0.88
177 0.87
178 0.85
179 0.76
180 0.71
181 0.64
182 0.55
183 0.47
184 0.38
185 0.31
186 0.28
187 0.26
188 0.22
189 0.2
190 0.18
191 0.16
192 0.14
193 0.11
194 0.05
195 0.04
196 0.03
197 0.03
198 0.03
199 0.03
200 0.03
201 0.03
202 0.02
203 0.02
204 0.02
205 0.02
206 0.02
207 0.02
208 0.02
209 0.02
210 0.04
211 0.05
212 0.05
213 0.06
214 0.1
215 0.13
216 0.2
217 0.29
218 0.38
219 0.46
220 0.56
221 0.61
222 0.69
223 0.78
224 0.82
225 0.85
226 0.81
227 0.77
228 0.7
229 0.68
230 0.58
231 0.47
232 0.36
233 0.25
234 0.18
235 0.13
236 0.1
237 0.06
238 0.03
239 0.03
240 0.03
241 0.02
242 0.02
243 0.02
244 0.03
245 0.03
246 0.03
247 0.03
248 0.03
249 0.03
250 0.03
251 0.03
252 0.03
253 0.03
254 0.04
255 0.05
256 0.07
257 0.12
258 0.16
259 0.26
260 0.37
261 0.46
262 0.56
263 0.64
264 0.73
265 0.8
266 0.88
267 0.89
268 0.88
269 0.88
270 0.87
271 0.85
272 0.77
273 0.72
274 0.63
275 0.54
276 0.47
277 0.4
278 0.3
279 0.23
280 0.2
281 0.14
282 0.11
283 0.1
284 0.08
285 0.05
286 0.05
287 0.06
288 0.06
289 0.06
290 0.09
291 0.1
292 0.11
293 0.11
294 0.13
295 0.12
296 0.12
297 0.12
298 0.1
299 0.09
300 0.08
301 0.09
302 0.08
303 0.1
304 0.1
305 0.1
306 0.09
307 0.09
308 0.09
309 0.09
310 0.1
311 0.12
312 0.13
313 0.14
314 0.17
315 0.24
316 0.31
317 0.39
318 0.5
319 0.53
320 0.62
321 0.67
322 0.71
323 0.7
324 0.64
325 0.57
326 0.51
327 0.44
328 0.41
329 0.35
330 0.31
331 0.27
332 0.26
333 0.25
334 0.21
335 0.2
336 0.16
337 0.21
338 0.21
339 0.24
340 0.29
341 0.3
342 0.33
343 0.4
344 0.39
345 0.34
346 0.36
347 0.32
348 0.33
349 0.32
350 0.28
351 0.23
352 0.22
353 0.23
354 0.21
355 0.19
356 0.15
357 0.18
358 0.19
359 0.19
360 0.22
361 0.25
362 0.25
363 0.25
364 0.24
365 0.21
366 0.25
367 0.25
368 0.24
369 0.24
370 0.23
371 0.22
372 0.24
373 0.22
374 0.19
375 0.18
376 0.16
377 0.14
378 0.16
379 0.16
380 0.15