Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A316U4N3

Protein Details
Accession A0A316U4N3    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
293-314AGEKKDKVSKKKEKEPGKPPVLBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
188-226KGSGKASRAPASGRKGSVGGVGNGAGAPSKKAGGGAKGA
294-322GEKKDKVSKKKEKEPGKPPVLKSHLKPPK
410-427RKAGKSRKGNLKDPNAPK
Subcellular Location(s) cyto 13.5, cyto_nucl 11, nucl 5.5, mito 4, pero 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009071  HMG_box_dom  
IPR036910  HMG_box_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00505  HMG_box  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50118  HMG_BOX_2  
Amino Acid Sequences MQPSAFSHEQGGGAGQHGGFYGQQAGAYGTGGAPHHNAHTGVHGGYGGYAAHPSHGDQSPSMSYLQPGSGHSTHMGMYGGYSGHYPTHHANPQQQQHYSHVNAAAFGGQPGGGQSILGGNNVDYQGGVHPSSYSHMAPQHGMYYQDAGGMMHPAHAHNMMGSAGTMPGSGYSHPSAIAAPLQTPAGAKGSGKASRAPASGRKGSVGGVGNGAGAPSKKAGGGAKGAKAQAQSDAIAAAAAAGVDPNDPVALAAMGIVLDTPASGKAKSSKANTGGDRHHPYGGAAPGGLAPDAGEKKDKVSKKKEKEPGKPPVLKSHLKPPKQAPSAWQVYFTEELQKIKAEQPGARLNVAHVAKDAGQRYAALPDEKKQEFQRRSQEAKQQWEQDMLDWKSHLTPEDIKQENMFRTAQRKAGKSRKGNLKDPNAPKKPLSAYFLFLRAIRADPKMTEDVFHGEQETTKQSVLAAAKWRSLEEPEKQPFLEKAEADKVEYERLRKDYEASHGVGGDGLRDDSEEGGSAVGGTGDYGGYDEGEGGVPPSLAAGAGGDEAFKLDSHFGLGEDAVLGFSSKDEGGFGLEG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.15
2 0.12
3 0.11
4 0.1
5 0.11
6 0.09
7 0.1
8 0.11
9 0.1
10 0.1
11 0.1
12 0.11
13 0.11
14 0.11
15 0.1
16 0.07
17 0.1
18 0.1
19 0.11
20 0.12
21 0.13
22 0.15
23 0.17
24 0.18
25 0.15
26 0.19
27 0.2
28 0.18
29 0.17
30 0.16
31 0.13
32 0.12
33 0.12
34 0.08
35 0.06
36 0.08
37 0.07
38 0.09
39 0.09
40 0.11
41 0.16
42 0.19
43 0.2
44 0.19
45 0.23
46 0.24
47 0.24
48 0.25
49 0.19
50 0.17
51 0.17
52 0.19
53 0.16
54 0.16
55 0.22
56 0.21
57 0.22
58 0.22
59 0.21
60 0.19
61 0.19
62 0.18
63 0.1
64 0.1
65 0.1
66 0.09
67 0.08
68 0.08
69 0.08
70 0.09
71 0.1
72 0.13
73 0.16
74 0.24
75 0.29
76 0.33
77 0.41
78 0.48
79 0.56
80 0.6
81 0.6
82 0.55
83 0.54
84 0.57
85 0.5
86 0.44
87 0.4
88 0.33
89 0.29
90 0.26
91 0.23
92 0.16
93 0.14
94 0.11
95 0.07
96 0.07
97 0.07
98 0.08
99 0.06
100 0.05
101 0.05
102 0.09
103 0.09
104 0.1
105 0.09
106 0.08
107 0.11
108 0.11
109 0.11
110 0.07
111 0.08
112 0.09
113 0.12
114 0.12
115 0.09
116 0.09
117 0.1
118 0.13
119 0.15
120 0.13
121 0.14
122 0.17
123 0.18
124 0.2
125 0.2
126 0.2
127 0.18
128 0.19
129 0.16
130 0.16
131 0.14
132 0.13
133 0.13
134 0.11
135 0.1
136 0.1
137 0.09
138 0.08
139 0.09
140 0.08
141 0.1
142 0.1
143 0.1
144 0.08
145 0.09
146 0.08
147 0.07
148 0.07
149 0.06
150 0.05
151 0.05
152 0.05
153 0.04
154 0.05
155 0.06
156 0.06
157 0.09
158 0.1
159 0.1
160 0.1
161 0.11
162 0.1
163 0.1
164 0.12
165 0.09
166 0.08
167 0.09
168 0.09
169 0.08
170 0.09
171 0.09
172 0.09
173 0.09
174 0.08
175 0.1
176 0.15
177 0.18
178 0.19
179 0.21
180 0.23
181 0.25
182 0.27
183 0.27
184 0.29
185 0.32
186 0.35
187 0.33
188 0.31
189 0.28
190 0.27
191 0.28
192 0.23
193 0.17
194 0.14
195 0.13
196 0.12
197 0.11
198 0.11
199 0.07
200 0.05
201 0.05
202 0.05
203 0.06
204 0.06
205 0.08
206 0.09
207 0.1
208 0.16
209 0.19
210 0.21
211 0.23
212 0.23
213 0.23
214 0.23
215 0.21
216 0.17
217 0.15
218 0.13
219 0.1
220 0.1
221 0.08
222 0.07
223 0.06
224 0.04
225 0.03
226 0.02
227 0.02
228 0.02
229 0.02
230 0.02
231 0.02
232 0.03
233 0.03
234 0.03
235 0.03
236 0.03
237 0.03
238 0.03
239 0.03
240 0.02
241 0.02
242 0.02
243 0.02
244 0.02
245 0.02
246 0.02
247 0.02
248 0.04
249 0.05
250 0.05
251 0.06
252 0.11
253 0.15
254 0.2
255 0.22
256 0.26
257 0.3
258 0.35
259 0.36
260 0.37
261 0.37
262 0.39
263 0.41
264 0.38
265 0.33
266 0.28
267 0.26
268 0.25
269 0.22
270 0.15
271 0.09
272 0.08
273 0.08
274 0.08
275 0.07
276 0.04
277 0.03
278 0.06
279 0.06
280 0.07
281 0.08
282 0.08
283 0.11
284 0.18
285 0.23
286 0.29
287 0.39
288 0.49
289 0.56
290 0.66
291 0.72
292 0.76
293 0.8
294 0.81
295 0.8
296 0.79
297 0.77
298 0.68
299 0.68
300 0.65
301 0.59
302 0.51
303 0.52
304 0.52
305 0.48
306 0.52
307 0.49
308 0.53
309 0.53
310 0.52
311 0.44
312 0.43
313 0.47
314 0.42
315 0.37
316 0.28
317 0.27
318 0.27
319 0.24
320 0.22
321 0.18
322 0.18
323 0.17
324 0.17
325 0.17
326 0.18
327 0.21
328 0.18
329 0.18
330 0.22
331 0.27
332 0.28
333 0.27
334 0.24
335 0.21
336 0.26
337 0.24
338 0.19
339 0.14
340 0.13
341 0.15
342 0.19
343 0.2
344 0.13
345 0.13
346 0.14
347 0.14
348 0.15
349 0.15
350 0.14
351 0.14
352 0.18
353 0.25
354 0.25
355 0.28
356 0.32
357 0.41
358 0.42
359 0.48
360 0.55
361 0.55
362 0.61
363 0.64
364 0.66
365 0.63
366 0.67
367 0.65
368 0.6
369 0.53
370 0.51
371 0.45
372 0.38
373 0.4
374 0.33
375 0.28
376 0.23
377 0.23
378 0.2
379 0.21
380 0.19
381 0.13
382 0.17
383 0.2
384 0.29
385 0.31
386 0.3
387 0.31
388 0.34
389 0.32
390 0.31
391 0.28
392 0.21
393 0.25
394 0.28
395 0.32
396 0.34
397 0.38
398 0.44
399 0.53
400 0.59
401 0.62
402 0.68
403 0.73
404 0.74
405 0.77
406 0.76
407 0.76
408 0.77
409 0.78
410 0.8
411 0.75
412 0.71
413 0.64
414 0.61
415 0.57
416 0.51
417 0.46
418 0.38
419 0.35
420 0.34
421 0.35
422 0.3
423 0.26
424 0.23
425 0.2
426 0.2
427 0.19
428 0.2
429 0.19
430 0.18
431 0.23
432 0.25
433 0.23
434 0.22
435 0.2
436 0.23
437 0.23
438 0.23
439 0.19
440 0.16
441 0.16
442 0.18
443 0.2
444 0.16
445 0.15
446 0.15
447 0.13
448 0.18
449 0.19
450 0.21
451 0.25
452 0.26
453 0.28
454 0.29
455 0.3
456 0.26
457 0.3
458 0.32
459 0.3
460 0.38
461 0.4
462 0.42
463 0.42
464 0.43
465 0.4
466 0.39
467 0.37
468 0.29
469 0.29
470 0.34
471 0.35
472 0.33
473 0.35
474 0.31
475 0.33
476 0.35
477 0.34
478 0.32
479 0.35
480 0.37
481 0.34
482 0.36
483 0.32
484 0.37
485 0.38
486 0.34
487 0.31
488 0.28
489 0.27
490 0.25
491 0.21
492 0.15
493 0.11
494 0.09
495 0.08
496 0.08
497 0.09
498 0.08
499 0.09
500 0.08
501 0.07
502 0.07
503 0.07
504 0.06
505 0.06
506 0.05
507 0.04
508 0.04
509 0.04
510 0.04
511 0.04
512 0.05
513 0.05
514 0.05
515 0.05
516 0.05
517 0.06
518 0.06
519 0.06
520 0.06
521 0.07
522 0.06
523 0.06
524 0.06
525 0.06
526 0.05
527 0.05
528 0.04
529 0.05
530 0.06
531 0.06
532 0.06
533 0.05
534 0.06
535 0.07
536 0.07
537 0.08
538 0.08
539 0.09
540 0.11
541 0.11
542 0.11
543 0.12
544 0.12
545 0.1
546 0.1
547 0.09
548 0.07
549 0.07
550 0.07
551 0.06
552 0.06
553 0.08
554 0.07
555 0.08
556 0.08
557 0.08