Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A316U0F7

Protein Details
Accession A0A316U0F7    Localization Confidence High Confidence Score 19.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
102-145EADEEEMRRRRRRRAREADEEEVYESEQRRKKKSRNRGGDDAGEBasic
184-208IAKAAKGGRKKIKRRKKGDEEDLGABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
109-117RRRRRRRAR
130-138RRKKKSRNR
176-200KRRKLDEDIAKAAKGGRKKIKRRKK
441-455RLNAFKRKVKEGKRR
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 13, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR035441  TFIIS/LEDGF_dom_sf  
IPR017923  TFIIS_N  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
Pfam View protein in Pfam  
PF08711  Med26  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51319  TFIIS_N  
Amino Acid Sequences MSLMADVDMQGVPSSPPPDRSIAGQPMSAPEPAPLSPSGHHDDPPSASRGTNTVGGGGVGNIFDDDDDDEEDKNATARGTNGAGAGAGAGAGMMEEEEEDDEADEEEMRRRRRRRAREADEEEVYESEQRRKKKSRNRGGDDAGEEEEEEEDDEDADGETQDQTGEMSQSMALEAKRRKLDEDIAKAAKGGRKKIKRRKKGDEEDLGAAGDLEVNELRQDMLTAAEDDAIANEERKPALAKLRMLPRVVDGLQKSHWQQSIFDSNLLEAVRRFLEPLPDKSLPALNIQRELFAALEKLSPAIDTISLKMSGLGKVVMFYSRNKRVEGDLRRRADRLIEMWSRPILKRSASYRAMEITRKAYHGASSQSQSTRALMDSQSQSQSQSQDSGRRNVSIPQPVMGGFKIAPQSSLGSGGGGDGESGVGGGGGDERFRAAAASRDRLNAFKRKVKEGKRR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.16
2 0.17
3 0.2
4 0.23
5 0.27
6 0.28
7 0.31
8 0.36
9 0.4
10 0.39
11 0.37
12 0.34
13 0.35
14 0.36
15 0.32
16 0.24
17 0.17
18 0.18
19 0.17
20 0.19
21 0.17
22 0.18
23 0.18
24 0.24
25 0.29
26 0.28
27 0.3
28 0.29
29 0.31
30 0.32
31 0.34
32 0.32
33 0.26
34 0.25
35 0.24
36 0.24
37 0.24
38 0.24
39 0.2
40 0.18
41 0.17
42 0.17
43 0.16
44 0.13
45 0.11
46 0.06
47 0.06
48 0.05
49 0.05
50 0.05
51 0.05
52 0.06
53 0.07
54 0.09
55 0.1
56 0.11
57 0.11
58 0.12
59 0.11
60 0.11
61 0.11
62 0.09
63 0.09
64 0.1
65 0.12
66 0.13
67 0.14
68 0.13
69 0.12
70 0.12
71 0.1
72 0.09
73 0.06
74 0.04
75 0.03
76 0.02
77 0.02
78 0.02
79 0.02
80 0.02
81 0.02
82 0.02
83 0.03
84 0.03
85 0.04
86 0.04
87 0.05
88 0.05
89 0.06
90 0.06
91 0.06
92 0.07
93 0.13
94 0.2
95 0.27
96 0.35
97 0.41
98 0.52
99 0.62
100 0.72
101 0.77
102 0.82
103 0.84
104 0.86
105 0.88
106 0.83
107 0.74
108 0.64
109 0.54
110 0.43
111 0.34
112 0.26
113 0.21
114 0.23
115 0.26
116 0.31
117 0.38
118 0.48
119 0.57
120 0.65
121 0.74
122 0.77
123 0.83
124 0.86
125 0.85
126 0.8
127 0.75
128 0.66
129 0.57
130 0.47
131 0.35
132 0.27
133 0.19
134 0.14
135 0.09
136 0.08
137 0.06
138 0.05
139 0.05
140 0.05
141 0.05
142 0.05
143 0.05
144 0.04
145 0.05
146 0.05
147 0.04
148 0.04
149 0.04
150 0.04
151 0.05
152 0.05
153 0.05
154 0.05
155 0.05
156 0.05
157 0.06
158 0.07
159 0.07
160 0.13
161 0.16
162 0.21
163 0.25
164 0.25
165 0.27
166 0.28
167 0.36
168 0.37
169 0.41
170 0.41
171 0.39
172 0.38
173 0.37
174 0.36
175 0.31
176 0.27
177 0.29
178 0.32
179 0.41
180 0.52
181 0.62
182 0.71
183 0.79
184 0.85
185 0.88
186 0.89
187 0.89
188 0.87
189 0.84
190 0.76
191 0.67
192 0.58
193 0.46
194 0.35
195 0.25
196 0.15
197 0.09
198 0.05
199 0.04
200 0.03
201 0.03
202 0.04
203 0.04
204 0.04
205 0.03
206 0.04
207 0.03
208 0.04
209 0.05
210 0.05
211 0.05
212 0.05
213 0.05
214 0.05
215 0.05
216 0.06
217 0.05
218 0.05
219 0.06
220 0.06
221 0.06
222 0.07
223 0.08
224 0.08
225 0.15
226 0.18
227 0.2
228 0.24
229 0.32
230 0.35
231 0.34
232 0.33
233 0.28
234 0.27
235 0.26
236 0.24
237 0.17
238 0.16
239 0.17
240 0.2
241 0.2
242 0.21
243 0.23
244 0.2
245 0.2
246 0.23
247 0.28
248 0.26
249 0.26
250 0.21
251 0.19
252 0.2
253 0.19
254 0.15
255 0.08
256 0.09
257 0.09
258 0.09
259 0.1
260 0.09
261 0.17
262 0.21
263 0.24
264 0.3
265 0.29
266 0.3
267 0.29
268 0.31
269 0.24
270 0.26
271 0.27
272 0.21
273 0.25
274 0.25
275 0.24
276 0.21
277 0.21
278 0.16
279 0.11
280 0.11
281 0.07
282 0.07
283 0.07
284 0.07
285 0.06
286 0.06
287 0.06
288 0.06
289 0.07
290 0.07
291 0.08
292 0.1
293 0.1
294 0.1
295 0.12
296 0.12
297 0.11
298 0.11
299 0.11
300 0.09
301 0.09
302 0.1
303 0.1
304 0.11
305 0.15
306 0.23
307 0.32
308 0.34
309 0.34
310 0.35
311 0.39
312 0.47
313 0.52
314 0.54
315 0.54
316 0.58
317 0.59
318 0.58
319 0.53
320 0.47
321 0.4
322 0.31
323 0.3
324 0.3
325 0.29
326 0.3
327 0.32
328 0.32
329 0.3
330 0.31
331 0.26
332 0.24
333 0.29
334 0.32
335 0.38
336 0.39
337 0.4
338 0.38
339 0.4
340 0.41
341 0.39
342 0.37
343 0.34
344 0.32
345 0.31
346 0.31
347 0.27
348 0.26
349 0.26
350 0.28
351 0.26
352 0.27
353 0.3
354 0.3
355 0.31
356 0.3
357 0.27
358 0.23
359 0.2
360 0.2
361 0.16
362 0.22
363 0.24
364 0.26
365 0.28
366 0.27
367 0.28
368 0.29
369 0.3
370 0.25
371 0.26
372 0.26
373 0.32
374 0.36
375 0.41
376 0.41
377 0.41
378 0.4
379 0.41
380 0.45
381 0.45
382 0.42
383 0.35
384 0.34
385 0.33
386 0.34
387 0.28
388 0.23
389 0.14
390 0.17
391 0.2
392 0.19
393 0.19
394 0.18
395 0.2
396 0.19
397 0.21
398 0.17
399 0.13
400 0.12
401 0.12
402 0.11
403 0.08
404 0.07
405 0.05
406 0.04
407 0.04
408 0.04
409 0.04
410 0.03
411 0.03
412 0.03
413 0.05
414 0.06
415 0.06
416 0.07
417 0.07
418 0.08
419 0.08
420 0.09
421 0.08
422 0.16
423 0.23
424 0.29
425 0.31
426 0.36
427 0.38
428 0.42
429 0.48
430 0.5
431 0.52
432 0.54
433 0.57
434 0.63
435 0.71