Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A1C9Z4

Protein Details
Accession A1C9Z4    Localization Confidence High Confidence Score 17.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
332-352GGTPIRKKKRKGALTNPSAYSHydrophilic
450-473KTSAQAKRKGAKAKRGKNGNEAIGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
337-342RKKKRK
455-467AKRKGAKAKRGKN
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 11.5, mito 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007307  Ltv1  
Gene Ontology GO:0042274  P:ribosomal small subunit biogenesis  
KEGG act:ACLA_009850  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04180  LTV  
Amino Acid Sequences MPPRKQWIDKKNATTYQLFHRSQNDPLIHDPAADDRVLHPVYGPPIPAAQSSDRSKKLSDLASEFGSNSVRKNEGEAANYGIYYDDSKYDYMQHLRELGTGGGESYFVEAASKGKAKAKGLKLEDALKEQLTLDDERSEFGAGSVYGSEYSDMRSTASSYVRRPTYQDQQNVPDAIAGFQPNMDPRLREVLEALEDEEYVDGDDEEDVFGKLTSNAEEIDSGEWEDTLFDEDNEDDGWESDATEKAPVQMDTTDAKAKHEAIPPKQSEPTEPGELPSHDAPAPDMDPEDQGWMREFAKFKKDGKVTATPATPASVVPSEQRSTLASTIFTMGGTPIRKKKRKGALTNPSAYSMTSSALARTEGHRLLDDRFDRVEALYALDEEGEEYDDSMSMVSGMTGMTGMTGMTGMTGISTASSQAPSLIDANGREVAPRHNFNEVMDDFLAGWDDKTSAQAKRKGAKAKRGKNGNEAIGIRMLDEIRQGLGPARVPGKVPGRV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.7
2 0.63
3 0.62
4 0.63
5 0.57
6 0.51
7 0.52
8 0.5
9 0.51
10 0.56
11 0.48
12 0.42
13 0.44
14 0.45
15 0.38
16 0.35
17 0.31
18 0.26
19 0.25
20 0.21
21 0.18
22 0.14
23 0.21
24 0.21
25 0.2
26 0.17
27 0.18
28 0.22
29 0.23
30 0.23
31 0.17
32 0.18
33 0.2
34 0.2
35 0.21
36 0.21
37 0.27
38 0.33
39 0.41
40 0.43
41 0.44
42 0.44
43 0.44
44 0.46
45 0.44
46 0.42
47 0.38
48 0.37
49 0.37
50 0.37
51 0.33
52 0.28
53 0.27
54 0.22
55 0.2
56 0.21
57 0.21
58 0.2
59 0.24
60 0.29
61 0.29
62 0.31
63 0.3
64 0.3
65 0.28
66 0.27
67 0.24
68 0.17
69 0.14
70 0.13
71 0.12
72 0.1
73 0.11
74 0.12
75 0.13
76 0.16
77 0.21
78 0.24
79 0.25
80 0.25
81 0.26
82 0.26
83 0.26
84 0.24
85 0.19
86 0.15
87 0.13
88 0.11
89 0.08
90 0.08
91 0.07
92 0.07
93 0.06
94 0.05
95 0.06
96 0.06
97 0.07
98 0.11
99 0.13
100 0.14
101 0.2
102 0.25
103 0.29
104 0.38
105 0.43
106 0.49
107 0.5
108 0.53
109 0.5
110 0.52
111 0.49
112 0.44
113 0.39
114 0.3
115 0.27
116 0.22
117 0.2
118 0.17
119 0.16
120 0.13
121 0.14
122 0.14
123 0.14
124 0.15
125 0.14
126 0.11
127 0.1
128 0.1
129 0.07
130 0.07
131 0.07
132 0.07
133 0.06
134 0.07
135 0.07
136 0.06
137 0.08
138 0.08
139 0.08
140 0.09
141 0.09
142 0.1
143 0.13
144 0.18
145 0.2
146 0.22
147 0.28
148 0.3
149 0.31
150 0.35
151 0.37
152 0.42
153 0.46
154 0.5
155 0.48
156 0.49
157 0.52
158 0.47
159 0.41
160 0.32
161 0.24
162 0.18
163 0.15
164 0.12
165 0.08
166 0.08
167 0.09
168 0.09
169 0.11
170 0.11
171 0.1
172 0.11
173 0.19
174 0.19
175 0.18
176 0.17
177 0.16
178 0.17
179 0.16
180 0.16
181 0.09
182 0.08
183 0.08
184 0.07
185 0.06
186 0.05
187 0.04
188 0.03
189 0.03
190 0.04
191 0.04
192 0.04
193 0.04
194 0.04
195 0.04
196 0.04
197 0.05
198 0.05
199 0.06
200 0.06
201 0.06
202 0.07
203 0.07
204 0.07
205 0.07
206 0.07
207 0.07
208 0.07
209 0.06
210 0.05
211 0.05
212 0.05
213 0.04
214 0.06
215 0.06
216 0.05
217 0.06
218 0.06
219 0.07
220 0.07
221 0.06
222 0.04
223 0.05
224 0.06
225 0.05
226 0.05
227 0.05
228 0.06
229 0.06
230 0.07
231 0.07
232 0.07
233 0.08
234 0.08
235 0.09
236 0.08
237 0.1
238 0.1
239 0.12
240 0.14
241 0.13
242 0.14
243 0.15
244 0.16
245 0.19
246 0.23
247 0.27
248 0.28
249 0.36
250 0.37
251 0.38
252 0.4
253 0.35
254 0.32
255 0.3
256 0.3
257 0.26
258 0.24
259 0.23
260 0.22
261 0.22
262 0.23
263 0.19
264 0.16
265 0.13
266 0.13
267 0.12
268 0.12
269 0.12
270 0.09
271 0.09
272 0.08
273 0.08
274 0.08
275 0.1
276 0.09
277 0.09
278 0.1
279 0.11
280 0.11
281 0.14
282 0.16
283 0.16
284 0.22
285 0.27
286 0.28
287 0.35
288 0.37
289 0.37
290 0.4
291 0.45
292 0.42
293 0.41
294 0.39
295 0.32
296 0.3
297 0.28
298 0.22
299 0.15
300 0.14
301 0.1
302 0.1
303 0.11
304 0.15
305 0.14
306 0.14
307 0.15
308 0.14
309 0.16
310 0.16
311 0.15
312 0.12
313 0.12
314 0.13
315 0.12
316 0.11
317 0.08
318 0.08
319 0.11
320 0.13
321 0.17
322 0.24
323 0.35
324 0.42
325 0.46
326 0.55
327 0.62
328 0.7
329 0.76
330 0.78
331 0.79
332 0.8
333 0.81
334 0.72
335 0.64
336 0.54
337 0.44
338 0.35
339 0.25
340 0.17
341 0.13
342 0.12
343 0.1
344 0.11
345 0.12
346 0.11
347 0.12
348 0.16
349 0.16
350 0.17
351 0.18
352 0.19
353 0.2
354 0.27
355 0.26
356 0.24
357 0.23
358 0.23
359 0.22
360 0.2
361 0.2
362 0.13
363 0.13
364 0.11
365 0.1
366 0.1
367 0.09
368 0.09
369 0.06
370 0.07
371 0.06
372 0.06
373 0.06
374 0.06
375 0.06
376 0.06
377 0.06
378 0.06
379 0.04
380 0.04
381 0.04
382 0.04
383 0.03
384 0.03
385 0.03
386 0.03
387 0.03
388 0.03
389 0.03
390 0.03
391 0.03
392 0.03
393 0.03
394 0.03
395 0.03
396 0.03
397 0.03
398 0.03
399 0.04
400 0.04
401 0.05
402 0.07
403 0.07
404 0.07
405 0.09
406 0.09
407 0.1
408 0.12
409 0.12
410 0.13
411 0.13
412 0.16
413 0.17
414 0.17
415 0.16
416 0.17
417 0.23
418 0.28
419 0.32
420 0.31
421 0.34
422 0.34
423 0.34
424 0.41
425 0.34
426 0.31
427 0.27
428 0.25
429 0.2
430 0.2
431 0.2
432 0.12
433 0.12
434 0.08
435 0.09
436 0.08
437 0.12
438 0.17
439 0.22
440 0.31
441 0.37
442 0.45
443 0.52
444 0.59
445 0.66
446 0.7
447 0.74
448 0.77
449 0.8
450 0.82
451 0.84
452 0.82
453 0.81
454 0.8
455 0.74
456 0.7
457 0.61
458 0.53
459 0.46
460 0.4
461 0.31
462 0.26
463 0.22
464 0.15
465 0.16
466 0.14
467 0.12
468 0.13
469 0.13
470 0.14
471 0.17
472 0.19
473 0.22
474 0.24
475 0.24
476 0.25
477 0.32