Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A316TYJ8

Protein Details
Accession A0A316TYJ8    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
410-429AEFKRRLKASKKRSNARGPGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
413-429KRRLKASKKRSNARGPG
443-465SGRGISRGVDRGRGRGRGGTRGR
Subcellular Location(s) nucl 14, cyto_nucl 13, cyto 10
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR038664  Gar1/Naf1_Cbf5-bd_sf  
IPR007504  H/ACA_rnp_Gar1/Naf1  
IPR040309  Naf1  
Gene Ontology GO:0005732  C:sno(s)RNA-containing ribonucleoprotein complex  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0000493  P:box H/ACA snoRNP assembly  
GO:0001522  P:pseudouridine synthesis  
GO:0042254  P:ribosome biogenesis  
Pfam View protein in Pfam  
PF04410  Gar1  
Amino Acid Sequences MSSPAAGPVQSGAADEGEHLTSTAPPSEGEVAAQDDVLKAAADVHIEHASAMASAGQASDASSSAQGSQLTADAQAKTQVSASASSSPKYPAVVGSEGNSEYSARTDEAKIVEPSPIPGDSDLAIVGEYSADEVKDSTLEALRTKIIQTRGARAQLPAGWEEDTVMPAIPDASDSNRAQGTSSSSSESDSDSSSSDDSSDDDQEQVTMVSDYDSDDSSVAKKGTGDGPRGPMTKSELPPSRAAEMFGKLPFEEVPQDRKCDLKPLGKVHGNVQEVLVIAQAEEVQRGNVSTAMSRPPPGVRVIGGASNERQGPILDAGSLVCTQEGKVIGFIFETFGSLLAPLYSVLLPTSTVAASYKSGQDIFFLPSHSTILRPAELRATQGKASDASNVNDEEAGVEEMDFSDDEEEAEFKRRLKASKKRSNARGPGGSIEEGHTDGTSRSGRGISRGVDRGRGRGRGGTRGRGDRGTDLDSTQRGGSTAAFPLPQRPNWQLDDPAPTSATTLSYDEPASSASVGGRSKPSAYESGRFTPPKSAGLPAIPKIAAELADPISSEARTASATRTVHPLPPIPSPAPPAPATDTPMRSGVHNASATPPTLPASRPHQTGASAVAGSSSIAGSPAFTAGPPPGAHINPLFAHQWAPQQSQQQQHVAPSPHYTGVQQQHYSSQQQYPQQAWNGYQYNYRGQVGGGQYPYPQQHAQYGGQQVQQTPYWSQQHQDTQQYSYPPPYGQHQQSYANGSVQGHAQGQGPHYWPTQQYQGGQYPPDGAGDAGNGSYDPSEGKMNFGK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.1
2 0.1
3 0.11
4 0.11
5 0.11
6 0.1
7 0.1
8 0.11
9 0.13
10 0.14
11 0.13
12 0.12
13 0.15
14 0.18
15 0.18
16 0.16
17 0.16
18 0.17
19 0.16
20 0.16
21 0.13
22 0.1
23 0.1
24 0.1
25 0.08
26 0.06
27 0.07
28 0.07
29 0.08
30 0.09
31 0.12
32 0.13
33 0.13
34 0.13
35 0.12
36 0.11
37 0.1
38 0.1
39 0.07
40 0.06
41 0.06
42 0.06
43 0.06
44 0.05
45 0.06
46 0.06
47 0.06
48 0.07
49 0.08
50 0.09
51 0.09
52 0.11
53 0.11
54 0.11
55 0.11
56 0.11
57 0.11
58 0.13
59 0.15
60 0.14
61 0.14
62 0.18
63 0.18
64 0.18
65 0.18
66 0.18
67 0.16
68 0.17
69 0.19
70 0.22
71 0.24
72 0.24
73 0.25
74 0.25
75 0.25
76 0.24
77 0.22
78 0.17
79 0.2
80 0.22
81 0.21
82 0.2
83 0.22
84 0.21
85 0.21
86 0.19
87 0.15
88 0.13
89 0.13
90 0.13
91 0.11
92 0.14
93 0.14
94 0.17
95 0.2
96 0.24
97 0.24
98 0.23
99 0.25
100 0.22
101 0.23
102 0.22
103 0.2
104 0.17
105 0.15
106 0.16
107 0.13
108 0.14
109 0.12
110 0.09
111 0.08
112 0.07
113 0.06
114 0.05
115 0.04
116 0.05
117 0.05
118 0.05
119 0.06
120 0.06
121 0.07
122 0.07
123 0.07
124 0.08
125 0.1
126 0.12
127 0.13
128 0.14
129 0.15
130 0.16
131 0.17
132 0.21
133 0.21
134 0.28
135 0.3
136 0.35
137 0.4
138 0.43
139 0.43
140 0.38
141 0.38
142 0.32
143 0.31
144 0.25
145 0.21
146 0.17
147 0.16
148 0.17
149 0.14
150 0.12
151 0.11
152 0.09
153 0.07
154 0.07
155 0.07
156 0.05
157 0.06
158 0.07
159 0.09
160 0.15
161 0.16
162 0.19
163 0.19
164 0.2
165 0.19
166 0.19
167 0.22
168 0.2
169 0.22
170 0.21
171 0.2
172 0.22
173 0.22
174 0.22
175 0.17
176 0.14
177 0.14
178 0.12
179 0.13
180 0.12
181 0.12
182 0.1
183 0.09
184 0.1
185 0.12
186 0.13
187 0.12
188 0.12
189 0.12
190 0.12
191 0.11
192 0.1
193 0.08
194 0.06
195 0.06
196 0.05
197 0.06
198 0.07
199 0.08
200 0.08
201 0.07
202 0.07
203 0.08
204 0.09
205 0.12
206 0.11
207 0.1
208 0.1
209 0.12
210 0.19
211 0.23
212 0.25
213 0.25
214 0.3
215 0.34
216 0.35
217 0.33
218 0.28
219 0.31
220 0.34
221 0.33
222 0.37
223 0.38
224 0.4
225 0.43
226 0.44
227 0.4
228 0.33
229 0.33
230 0.27
231 0.23
232 0.23
233 0.2
234 0.18
235 0.15
236 0.15
237 0.14
238 0.13
239 0.16
240 0.16
241 0.24
242 0.25
243 0.28
244 0.28
245 0.3
246 0.29
247 0.32
248 0.36
249 0.35
250 0.39
251 0.41
252 0.48
253 0.5
254 0.5
255 0.47
256 0.49
257 0.43
258 0.36
259 0.31
260 0.24
261 0.2
262 0.19
263 0.14
264 0.07
265 0.05
266 0.05
267 0.06
268 0.05
269 0.06
270 0.06
271 0.05
272 0.06
273 0.06
274 0.06
275 0.07
276 0.07
277 0.07
278 0.09
279 0.12
280 0.13
281 0.13
282 0.14
283 0.14
284 0.15
285 0.16
286 0.15
287 0.12
288 0.13
289 0.13
290 0.14
291 0.14
292 0.14
293 0.13
294 0.14
295 0.14
296 0.12
297 0.12
298 0.1
299 0.1
300 0.1
301 0.09
302 0.07
303 0.07
304 0.07
305 0.08
306 0.08
307 0.06
308 0.05
309 0.05
310 0.05
311 0.07
312 0.08
313 0.07
314 0.08
315 0.08
316 0.08
317 0.08
318 0.08
319 0.07
320 0.06
321 0.06
322 0.05
323 0.05
324 0.05
325 0.05
326 0.05
327 0.04
328 0.04
329 0.03
330 0.04
331 0.04
332 0.04
333 0.04
334 0.04
335 0.05
336 0.05
337 0.06
338 0.04
339 0.05
340 0.05
341 0.06
342 0.07
343 0.08
344 0.09
345 0.09
346 0.1
347 0.09
348 0.1
349 0.11
350 0.12
351 0.12
352 0.12
353 0.11
354 0.11
355 0.12
356 0.11
357 0.1
358 0.1
359 0.1
360 0.11
361 0.11
362 0.11
363 0.14
364 0.14
365 0.16
366 0.16
367 0.16
368 0.16
369 0.16
370 0.16
371 0.13
372 0.13
373 0.15
374 0.15
375 0.14
376 0.15
377 0.14
378 0.14
379 0.12
380 0.12
381 0.08
382 0.07
383 0.06
384 0.04
385 0.04
386 0.04
387 0.04
388 0.04
389 0.04
390 0.03
391 0.04
392 0.04
393 0.04
394 0.04
395 0.05
396 0.05
397 0.09
398 0.1
399 0.11
400 0.15
401 0.18
402 0.23
403 0.33
404 0.42
405 0.49
406 0.58
407 0.67
408 0.71
409 0.77
410 0.81
411 0.78
412 0.74
413 0.67
414 0.58
415 0.51
416 0.44
417 0.36
418 0.27
419 0.2
420 0.15
421 0.12
422 0.11
423 0.08
424 0.07
425 0.07
426 0.09
427 0.09
428 0.08
429 0.09
430 0.11
431 0.11
432 0.13
433 0.15
434 0.15
435 0.18
436 0.23
437 0.23
438 0.28
439 0.29
440 0.33
441 0.34
442 0.35
443 0.32
444 0.32
445 0.33
446 0.36
447 0.38
448 0.39
449 0.4
450 0.41
451 0.43
452 0.39
453 0.39
454 0.31
455 0.31
456 0.26
457 0.22
458 0.19
459 0.19
460 0.17
461 0.17
462 0.15
463 0.12
464 0.1
465 0.1
466 0.1
467 0.09
468 0.09
469 0.09
470 0.1
471 0.1
472 0.17
473 0.2
474 0.21
475 0.24
476 0.27
477 0.3
478 0.32
479 0.34
480 0.29
481 0.28
482 0.33
483 0.29
484 0.27
485 0.23
486 0.2
487 0.18
488 0.16
489 0.15
490 0.1
491 0.1
492 0.1
493 0.11
494 0.11
495 0.1
496 0.1
497 0.09
498 0.08
499 0.07
500 0.07
501 0.06
502 0.09
503 0.1
504 0.11
505 0.12
506 0.13
507 0.14
508 0.14
509 0.17
510 0.2
511 0.22
512 0.25
513 0.28
514 0.32
515 0.37
516 0.37
517 0.36
518 0.35
519 0.34
520 0.33
521 0.3
522 0.27
523 0.23
524 0.26
525 0.29
526 0.24
527 0.25
528 0.21
529 0.2
530 0.18
531 0.17
532 0.13
533 0.1
534 0.1
535 0.09
536 0.09
537 0.09
538 0.1
539 0.1
540 0.09
541 0.09
542 0.07
543 0.07
544 0.08
545 0.09
546 0.1
547 0.15
548 0.16
549 0.17
550 0.23
551 0.23
552 0.25
553 0.27
554 0.29
555 0.26
556 0.28
557 0.32
558 0.28
559 0.28
560 0.3
561 0.3
562 0.29
563 0.27
564 0.26
565 0.26
566 0.26
567 0.28
568 0.28
569 0.28
570 0.26
571 0.29
572 0.27
573 0.23
574 0.25
575 0.23
576 0.23
577 0.22
578 0.21
579 0.21
580 0.22
581 0.22
582 0.19
583 0.17
584 0.14
585 0.15
586 0.16
587 0.17
588 0.23
589 0.28
590 0.29
591 0.3
592 0.3
593 0.29
594 0.29
595 0.27
596 0.21
597 0.17
598 0.14
599 0.13
600 0.11
601 0.1
602 0.09
603 0.06
604 0.04
605 0.05
606 0.05
607 0.05
608 0.05
609 0.06
610 0.06
611 0.06
612 0.07
613 0.07
614 0.11
615 0.1
616 0.13
617 0.16
618 0.16
619 0.18
620 0.18
621 0.2
622 0.18
623 0.2
624 0.19
625 0.15
626 0.17
627 0.17
628 0.23
629 0.24
630 0.28
631 0.3
632 0.37
633 0.42
634 0.48
635 0.5
636 0.49
637 0.45
638 0.44
639 0.47
640 0.42
641 0.38
642 0.35
643 0.33
644 0.29
645 0.29
646 0.26
647 0.27
648 0.32
649 0.37
650 0.35
651 0.33
652 0.37
653 0.4
654 0.43
655 0.39
656 0.37
657 0.36
658 0.41
659 0.44
660 0.42
661 0.44
662 0.45
663 0.43
664 0.39
665 0.41
666 0.39
667 0.36
668 0.37
669 0.35
670 0.35
671 0.37
672 0.36
673 0.28
674 0.24
675 0.29
676 0.27
677 0.29
678 0.25
679 0.22
680 0.22
681 0.27
682 0.28
683 0.27
684 0.26
685 0.22
686 0.25
687 0.29
688 0.31
689 0.32
690 0.37
691 0.36
692 0.38
693 0.38
694 0.35
695 0.34
696 0.33
697 0.31
698 0.27
699 0.31
700 0.33
701 0.33
702 0.34
703 0.38
704 0.45
705 0.49
706 0.55
707 0.5
708 0.48
709 0.51
710 0.52
711 0.48
712 0.43
713 0.39
714 0.32
715 0.32
716 0.33
717 0.39
718 0.41
719 0.45
720 0.44
721 0.47
722 0.49
723 0.53
724 0.49
725 0.41
726 0.37
727 0.32
728 0.28
729 0.25
730 0.23
731 0.18
732 0.18
733 0.19
734 0.19
735 0.21
736 0.24
737 0.25
738 0.26
739 0.26
740 0.29
741 0.29
742 0.3
743 0.36
744 0.35
745 0.36
746 0.4
747 0.44
748 0.44
749 0.43
750 0.39
751 0.35
752 0.31
753 0.28
754 0.22
755 0.16
756 0.13
757 0.12
758 0.12
759 0.09
760 0.09
761 0.08
762 0.08
763 0.08
764 0.08
765 0.08
766 0.09
767 0.15
768 0.15