Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A316U902

Protein Details
Accession A0A316U902    Localization Confidence High Confidence Score 22.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
4-24GSSPTKLTKKQQKAADFKAGKHydrophilic
75-122SLTKDKVKEKEAKKSKKDKTAADADGEGKEAKKSKKKRSREDDEDGPABasic
320-340VPSLEEKKKKGEEKRERGEEVBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
23-43GKSGSASGSGSASKGKGKKRD
80-114KVKEKEAKKSKKDKTAADADGEGKEAKKSKKKRSR
170-176KGKKKAK
291-369GKGAGRQKKIEEKNSKLDEERKKLHEKYVVPSLEEKKKKGEEKRERGEEVGPPRKKIRKGDEGEAQWGKRGGAAAPATG
377-377K
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 10, mito 8
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR034228  Nop6_RRM  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12400  RRM_Nop6  
Amino Acid Sequences MSEGSSPTKLTKKQQKAADFKAGKSGSASGSGSASKGKGKKRDRQATGGDVPEEDFLGEGEGTEVMGESSAAAASLTKDKVKEKEAKKSKKDKTAADADGEGKEAKKSKKKRSREDDEDGPAATEAKASSSKAKDAKAGPSSTKGKKMAFDEDGNATAAATEEQVVEGAKGKKKAKESGEEGGAARRLIVFVGNMSFKSTADEIASHFKSHCSETPSVRLLTTRSSASTTLSASKLKSIAKGKAADTTIRSKGCAFLEFKTAPALQKALGLHHTLFGGRTINVELTAGGGGKGAGRQKKIEEKNSKLDEERKKLHEKYVVPSLEEKKKKGEEKRERGEEVGPPRKKIRKGDEGEAQWGKRGGAAAPATGAGAAGGAKKQPRWMASGANAVRLTG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.74
2 0.78
3 0.8
4 0.81
5 0.82
6 0.75
7 0.65
8 0.67
9 0.58
10 0.49
11 0.41
12 0.36
13 0.27
14 0.27
15 0.27
16 0.18
17 0.19
18 0.19
19 0.18
20 0.18
21 0.18
22 0.21
23 0.28
24 0.35
25 0.43
26 0.52
27 0.61
28 0.7
29 0.79
30 0.78
31 0.79
32 0.78
33 0.76
34 0.73
35 0.66
36 0.56
37 0.45
38 0.4
39 0.32
40 0.25
41 0.16
42 0.1
43 0.07
44 0.08
45 0.07
46 0.06
47 0.06
48 0.06
49 0.05
50 0.05
51 0.05
52 0.04
53 0.04
54 0.04
55 0.03
56 0.04
57 0.03
58 0.04
59 0.03
60 0.04
61 0.06
62 0.1
63 0.12
64 0.14
65 0.17
66 0.22
67 0.27
68 0.34
69 0.42
70 0.44
71 0.53
72 0.62
73 0.7
74 0.75
75 0.82
76 0.83
77 0.84
78 0.84
79 0.79
80 0.76
81 0.75
82 0.67
83 0.58
84 0.52
85 0.43
86 0.37
87 0.32
88 0.25
89 0.16
90 0.17
91 0.21
92 0.26
93 0.34
94 0.44
95 0.54
96 0.64
97 0.74
98 0.81
99 0.86
100 0.89
101 0.88
102 0.86
103 0.82
104 0.76
105 0.67
106 0.56
107 0.46
108 0.35
109 0.27
110 0.19
111 0.12
112 0.07
113 0.08
114 0.09
115 0.1
116 0.16
117 0.17
118 0.23
119 0.26
120 0.27
121 0.31
122 0.32
123 0.38
124 0.37
125 0.38
126 0.34
127 0.37
128 0.43
129 0.42
130 0.46
131 0.42
132 0.38
133 0.4
134 0.42
135 0.41
136 0.37
137 0.35
138 0.31
139 0.28
140 0.28
141 0.24
142 0.2
143 0.14
144 0.1
145 0.09
146 0.07
147 0.05
148 0.05
149 0.04
150 0.04
151 0.04
152 0.04
153 0.04
154 0.09
155 0.13
156 0.16
157 0.22
158 0.25
159 0.3
160 0.34
161 0.41
162 0.4
163 0.43
164 0.45
165 0.43
166 0.41
167 0.38
168 0.34
169 0.29
170 0.25
171 0.18
172 0.13
173 0.09
174 0.07
175 0.06
176 0.06
177 0.04
178 0.04
179 0.06
180 0.06
181 0.06
182 0.08
183 0.08
184 0.08
185 0.09
186 0.09
187 0.08
188 0.08
189 0.09
190 0.09
191 0.15
192 0.15
193 0.14
194 0.14
195 0.15
196 0.16
197 0.17
198 0.19
199 0.18
200 0.21
201 0.22
202 0.27
203 0.29
204 0.28
205 0.25
206 0.23
207 0.19
208 0.19
209 0.18
210 0.14
211 0.13
212 0.14
213 0.14
214 0.15
215 0.15
216 0.13
217 0.14
218 0.15
219 0.16
220 0.14
221 0.16
222 0.17
223 0.17
224 0.22
225 0.24
226 0.26
227 0.3
228 0.32
229 0.32
230 0.34
231 0.34
232 0.3
233 0.28
234 0.3
235 0.3
236 0.28
237 0.28
238 0.23
239 0.25
240 0.25
241 0.26
242 0.22
243 0.19
244 0.25
245 0.24
246 0.24
247 0.24
248 0.23
249 0.2
250 0.19
251 0.19
252 0.12
253 0.15
254 0.15
255 0.14
256 0.15
257 0.16
258 0.15
259 0.15
260 0.15
261 0.12
262 0.12
263 0.11
264 0.11
265 0.09
266 0.1
267 0.1
268 0.1
269 0.1
270 0.1
271 0.08
272 0.07
273 0.08
274 0.07
275 0.05
276 0.05
277 0.05
278 0.05
279 0.08
280 0.13
281 0.18
282 0.2
283 0.22
284 0.27
285 0.38
286 0.45
287 0.53
288 0.57
289 0.59
290 0.67
291 0.7
292 0.68
293 0.62
294 0.64
295 0.63
296 0.62
297 0.62
298 0.59
299 0.63
300 0.62
301 0.64
302 0.63
303 0.57
304 0.54
305 0.56
306 0.51
307 0.44
308 0.48
309 0.49
310 0.51
311 0.53
312 0.5
313 0.48
314 0.55
315 0.62
316 0.65
317 0.69
318 0.7
319 0.76
320 0.84
321 0.83
322 0.78
323 0.71
324 0.66
325 0.61
326 0.6
327 0.6
328 0.53
329 0.5
330 0.56
331 0.62
332 0.65
333 0.68
334 0.67
335 0.67
336 0.7
337 0.74
338 0.75
339 0.7
340 0.72
341 0.68
342 0.58
343 0.51
344 0.45
345 0.37
346 0.29
347 0.27
348 0.19
349 0.2
350 0.21
351 0.18
352 0.18
353 0.18
354 0.16
355 0.15
356 0.14
357 0.06
358 0.05
359 0.06
360 0.06
361 0.07
362 0.12
363 0.15
364 0.17
365 0.24
366 0.3
367 0.31
368 0.35
369 0.37
370 0.4
371 0.42
372 0.5
373 0.45
374 0.46