FuNGI

A0A316U0P9

Protein Details

Accession

A0A316U0P9

Localization Confidence

High

Confidence Score

16.7

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
26-46	APAARNPVKKQRSPSPPPPTT	Hydrophilic
79-103	QAQFVPPLKLNRKHPPRIKAPAAKA	Hydrophilic
167-186	RSYAHRGKGQKRVRQIHKAS	Basic
660-681	QQSKTNSPSKNKNKPLPRGNSS	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
90-98	RKHPPRIKA

Subcellular Location(s)

nucl 14.5, cyto_nucl 12.5, cyto 7.5, mito 5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter

Amino Acid Sequences

MSQQIKSGAAAAAPPRTVKTEPGTTAPAARNPVKKQRSPSPPPPTTYRDIPLLSTSSQSPWLHHLIRFAHHNRTDPTDQAQFVPPLKLNRKHPPRIKAPAAKAGDPVVDRYGKPIRLSNGNVLKWPVAGEDLTEHRKQVEKLKPVEKTPSAQYDSSLVAPSAAASSRSYAHRGKGQKRVRQIHKASATARRIHNDETLPWVLEDYETGNYWESSRVGRKDSIFALAKHLEEGGVGVPDDSTVKTGDGEEDVKPVDSKVIQHAPWVGKLEGDDASLSSDASSSAQVLFVFDERNQGGFKVVPIRRTYRFMQKSRFMDNLGDEEREKEYARQQKSRELAPGKFVTRNTNGGLPGSYPLSRPGSGSSASGMGVGGVGLPGVFGAGRNSSDSGSGGSSGGVRIKKEEDLDDDSWPQLRGLSLGSGPSRPRGLVAVSGGASRGRRRGDDDDDEYSHRRGDDEGGTFDELDYQEDFADDEERMGGEAELVEDNEAREMEERLKREMAKAGFGGEDDEDDGMVGEGGGEIDAPQGNMWGEASSGGGRREDDQLTGSGKQMKKIMKALAKREGGMGEEYESDEEYNPYVSDDEEEEEEVAMANPEEAMRLAREEKEREEKEAARLGKGTAAGTSTATPSTGGGGTGMSSTAPSGKNSRGTTPVPSTLQQSKTNSPSKNKNKPLPRGNSSGHLHRAGSGHADVAKRATTNIPSGSGGSSSGGGARSRGGSPHGSRSPSPSRGFDGSSHLPRQSSPLAGADASNVAPSGSTSSATSGSLKRPASPTQSHTSSFQGPSANLSAPNAGSGSSNKDPSAKRLKTSPSPSRPSSPPHTSSSSPSSTSTSLPGIPPSPSSLEGELISLVRGGQVKSIAEVIARFKRRLQERPELKGEMMAAFKKVLTGGTKGEALRVKEGY

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.22
2	0.21
3	0.26
4	0.27
5	0.29
6	0.32
7	0.36
8	0.37
9	0.41
10	0.43
11	0.39
12	0.44
13	0.43
14	0.41
15	0.4
16	0.44
17	0.47
18	0.51
19	0.61
20	0.63
21	0.66
22	0.7
23	0.73
24	0.77
25	0.79
26	0.82
27	0.82
28	0.79
29	0.78
30	0.77
31	0.73
32	0.69
33	0.65
34	0.58
35	0.53
36	0.47
37	0.44
38	0.4
39	0.37
40	0.32
41	0.28
42	0.26
43	0.22
44	0.28
45	0.27
46	0.26
47	0.27
48	0.34
49	0.35
50	0.35
51	0.4
52	0.35
53	0.39
54	0.46
55	0.46
56	0.48
57	0.48
58	0.53
59	0.49
60	0.54
61	0.53
62	0.47
63	0.48
64	0.44
65	0.41
66	0.38
67	0.39
68	0.35
69	0.34
70	0.36
71	0.34
72	0.37
73	0.46
74	0.5
75	0.54
76	0.61
77	0.7
78	0.76
79	0.81
80	0.81
81	0.81
82	0.84
83	0.85
84	0.84
85	0.8
86	0.79
87	0.74
88	0.66
89	0.58
90	0.5
91	0.44
92	0.35
93	0.31
94	0.26
95	0.25
96	0.23
97	0.28
98	0.33
99	0.32
100	0.34
101	0.37
102	0.37
103	0.42
104	0.46
105	0.49
106	0.51
107	0.49
108	0.48
109	0.45
110	0.41
111	0.34
112	0.3
113	0.21
114	0.14
115	0.13
116	0.11
117	0.13
118	0.18
119	0.23
120	0.23
121	0.23
122	0.23
123	0.28
124	0.3
125	0.36
126	0.4
127	0.43
128	0.51
129	0.58
130	0.61
131	0.6
132	0.66
133	0.59
134	0.54
135	0.52
136	0.52
137	0.48
138	0.44
139	0.41
140	0.35
141	0.33
142	0.3
143	0.25
144	0.17
145	0.13
146	0.12
147	0.11
148	0.1
149	0.09
150	0.09
151	0.09
152	0.1
153	0.13
154	0.16
155	0.21
156	0.22
157	0.26
158	0.32
159	0.41
160	0.48
161	0.55
162	0.62
163	0.64
164	0.72
165	0.78
166	0.79
167	0.8
168	0.78
169	0.78
170	0.74
171	0.72
172	0.67
173	0.66
174	0.62
175	0.58
176	0.56
177	0.51
178	0.48
179	0.46
180	0.46
181	0.39
182	0.35
183	0.35
184	0.32
185	0.28
186	0.25
187	0.22
188	0.17
189	0.15
190	0.14
191	0.1
192	0.09
193	0.09
194	0.1
195	0.11
196	0.11
197	0.12
198	0.13
199	0.12
200	0.15
201	0.22
202	0.24
203	0.26
204	0.3
205	0.31
206	0.33
207	0.33
208	0.36
209	0.32
210	0.3
211	0.32
212	0.3
213	0.29
214	0.25
215	0.24
216	0.17
217	0.13
218	0.13
219	0.08
220	0.06
221	0.06
222	0.05
223	0.05
224	0.06
225	0.07
226	0.06
227	0.06
228	0.07
229	0.07
230	0.07
231	0.08
232	0.09
233	0.1
234	0.12
235	0.11
236	0.12
237	0.12
238	0.12
239	0.12
240	0.11
241	0.11
242	0.11
243	0.12
244	0.17
245	0.22
246	0.22
247	0.23
248	0.29
249	0.28
250	0.29
251	0.31
252	0.25
253	0.19
254	0.19
255	0.2
256	0.15
257	0.14
258	0.11
259	0.08
260	0.09
261	0.09
262	0.08
263	0.06
264	0.06
265	0.06
266	0.06
267	0.07
268	0.06
269	0.06
270	0.07
271	0.07
272	0.07
273	0.07
274	0.07
275	0.09
276	0.08
277	0.12
278	0.12
279	0.13
280	0.13
281	0.12
282	0.13
283	0.12
284	0.13
285	0.19
286	0.2
287	0.23
288	0.27
289	0.32
290	0.34
291	0.38
292	0.4
293	0.42
294	0.49
295	0.51
296	0.55
297	0.58
298	0.59
299	0.6
300	0.58
301	0.48
302	0.41
303	0.37
304	0.34
305	0.27
306	0.24
307	0.2
308	0.19
309	0.19
310	0.18
311	0.17
312	0.14
313	0.21
314	0.28
315	0.34
316	0.38
317	0.39
318	0.45
319	0.47
320	0.48
321	0.48
322	0.45
323	0.4
324	0.4
325	0.42
326	0.37
327	0.37
328	0.36
329	0.34
330	0.31
331	0.33
332	0.28
333	0.27
334	0.25
335	0.22
336	0.21
337	0.16
338	0.14
339	0.13
340	0.12
341	0.1
342	0.13
343	0.15
344	0.15
345	0.15
346	0.16
347	0.16
348	0.16
349	0.16
350	0.14
351	0.11
352	0.11
353	0.1
354	0.08
355	0.06
356	0.05
357	0.04
358	0.03
359	0.02
360	0.02
361	0.02
362	0.02
363	0.02
364	0.02
365	0.02
366	0.02
367	0.03
368	0.04
369	0.05
370	0.06
371	0.07
372	0.07
373	0.08
374	0.08
375	0.08
376	0.08
377	0.08
378	0.07
379	0.06
380	0.06
381	0.06
382	0.1
383	0.1
384	0.1
385	0.11
386	0.13
387	0.14
388	0.15
389	0.16
390	0.16
391	0.21
392	0.23
393	0.22
394	0.22
395	0.2
396	0.2
397	0.19
398	0.15
399	0.09
400	0.08
401	0.07
402	0.06
403	0.07
404	0.06
405	0.08
406	0.09
407	0.11
408	0.11
409	0.12
410	0.12
411	0.11
412	0.11
413	0.11
414	0.11
415	0.1
416	0.1
417	0.1
418	0.09
419	0.09
420	0.09
421	0.09
422	0.1
423	0.1
424	0.13
425	0.13
426	0.14
427	0.19
428	0.23
429	0.28
430	0.32
431	0.34
432	0.33
433	0.34
434	0.35
435	0.32
436	0.27
437	0.22
438	0.17
439	0.14
440	0.11
441	0.12
442	0.13
443	0.13
444	0.13
445	0.14
446	0.14
447	0.14
448	0.13
449	0.12
450	0.09
451	0.09
452	0.08
453	0.07
454	0.07
455	0.07
456	0.07
457	0.05
458	0.06
459	0.05
460	0.05
461	0.05
462	0.05
463	0.05
464	0.05
465	0.04
466	0.03
467	0.03
468	0.04
469	0.04
470	0.04
471	0.04
472	0.04
473	0.04
474	0.05
475	0.05
476	0.04
477	0.05
478	0.06
479	0.11
480	0.15
481	0.16
482	0.18
483	0.21
484	0.21
485	0.22
486	0.27
487	0.22
488	0.21
489	0.19
490	0.18
491	0.15
492	0.15
493	0.14
494	0.08
495	0.08
496	0.06
497	0.06
498	0.05
499	0.04
500	0.04
501	0.03
502	0.03
503	0.03
504	0.02
505	0.02
506	0.02
507	0.02
508	0.02
509	0.02
510	0.03
511	0.03
512	0.03
513	0.03
514	0.04
515	0.04
516	0.04
517	0.05
518	0.04
519	0.04
520	0.04
521	0.05
522	0.05
523	0.07
524	0.08
525	0.08
526	0.09
527	0.1
528	0.14
529	0.14
530	0.13
531	0.13
532	0.14
533	0.16
534	0.16
535	0.16
536	0.2
537	0.2
538	0.21
539	0.25
540	0.27
541	0.28
542	0.32
543	0.36
544	0.36
545	0.41
546	0.45
547	0.48
548	0.46
549	0.43
550	0.4
551	0.34
552	0.29
553	0.24
554	0.18
555	0.11
556	0.1
557	0.1
558	0.09
559	0.09
560	0.08
561	0.07
562	0.07
563	0.07
564	0.07
565	0.06
566	0.07
567	0.07
568	0.06
569	0.07
570	0.07
571	0.08
572	0.08
573	0.09
574	0.08
575	0.08
576	0.08
577	0.07
578	0.06
579	0.05
580	0.04
581	0.04
582	0.04
583	0.04
584	0.04
585	0.04
586	0.05
587	0.05
588	0.07
589	0.09
590	0.13
591	0.18
592	0.2
593	0.25
594	0.34
595	0.35
596	0.37
597	0.4
598	0.38
599	0.38
600	0.42
601	0.38
602	0.29
603	0.29
604	0.25
605	0.22
606	0.21
607	0.17
608	0.11
609	0.11
610	0.1
611	0.1
612	0.1
613	0.09
614	0.08
615	0.08
616	0.08
617	0.07
618	0.08
619	0.08
620	0.07
621	0.06
622	0.06
623	0.06
624	0.06
625	0.06
626	0.04
627	0.04
628	0.04
629	0.08
630	0.09
631	0.11
632	0.14
633	0.17
634	0.25
635	0.26
636	0.29
637	0.31
638	0.32
639	0.35
640	0.36
641	0.37
642	0.33
643	0.32
644	0.35
645	0.36
646	0.39
647	0.4
648	0.4
649	0.42
650	0.47
651	0.53
652	0.54
653	0.54
654	0.61
655	0.65
656	0.72
657	0.75
658	0.76
659	0.78
660	0.83
661	0.85
662	0.84
663	0.78
664	0.75
665	0.68
666	0.67
667	0.61
668	0.57
669	0.52
670	0.45
671	0.39
672	0.35
673	0.33
674	0.26
675	0.25
676	0.19
677	0.16
678	0.17
679	0.18
680	0.16
681	0.16
682	0.17
683	0.14
684	0.15
685	0.16
686	0.16
687	0.19
688	0.2
689	0.2
690	0.2
691	0.2
692	0.2
693	0.17
694	0.15
695	0.12
696	0.11
697	0.09
698	0.09
699	0.1
700	0.1
701	0.1
702	0.11
703	0.12
704	0.12
705	0.14
706	0.15
707	0.2
708	0.24
709	0.32
710	0.36
711	0.37
712	0.38
713	0.44
714	0.49
715	0.5
716	0.5
717	0.44
718	0.44
719	0.43
720	0.45
721	0.39
722	0.38
723	0.38
724	0.4
725	0.41
726	0.37
727	0.35
728	0.33
729	0.37
730	0.32
731	0.26
732	0.22
733	0.21
734	0.21
735	0.2
736	0.2
737	0.15
738	0.14
739	0.12
740	0.11
741	0.09
742	0.07
743	0.06
744	0.07
745	0.09
746	0.08
747	0.09
748	0.1
749	0.11
750	0.13
751	0.14
752	0.17
753	0.17
754	0.2
755	0.27
756	0.27
757	0.29
758	0.32
759	0.37
760	0.41
761	0.44
762	0.46
763	0.47
764	0.5
765	0.49
766	0.47
767	0.46
768	0.44
769	0.39
770	0.36
771	0.3
772	0.27
773	0.28
774	0.29
775	0.25
776	0.2
777	0.2
778	0.19
779	0.17
780	0.17
781	0.14
782	0.11
783	0.11
784	0.12
785	0.19
786	0.21
787	0.23
788	0.23
789	0.3
790	0.31
791	0.38
792	0.47
793	0.43
794	0.43
795	0.48
796	0.56
797	0.59
798	0.67
799	0.7
800	0.68
801	0.73
802	0.74
803	0.73
804	0.7
805	0.67
806	0.66
807	0.64
808	0.59
809	0.57
810	0.58
811	0.53
812	0.55
813	0.54
814	0.49
815	0.42
816	0.4
817	0.38
818	0.34
819	0.33
820	0.3
821	0.26
822	0.24
823	0.23
824	0.25
825	0.23
826	0.22
827	0.22
828	0.23
829	0.24
830	0.23
831	0.25
832	0.23
833	0.23
834	0.22
835	0.21
836	0.18
837	0.15
838	0.14
839	0.11
840	0.09
841	0.1
842	0.12
843	0.12
844	0.13
845	0.16
846	0.16
847	0.17
848	0.19
849	0.16
850	0.15
851	0.17
852	0.21
853	0.28
854	0.32
855	0.32
856	0.36
857	0.44
858	0.52
859	0.59
860	0.6
861	0.62
862	0.67
863	0.74
864	0.76
865	0.7
866	0.62
867	0.56
868	0.49
869	0.41
870	0.36
871	0.29
872	0.24
873	0.21
874	0.21
875	0.19
876	0.18
877	0.18
878	0.17
879	0.18
880	0.2
881	0.22
882	0.27
883	0.26
884	0.31
885	0.33
886	0.33

A0A316U0P9

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer