Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A316TWS6

Protein Details
Accession A0A316TWS6    Localization Confidence Medium Confidence Score 12
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
3-22ASTKSSPKAATPNKKPRISSHydrophilic
380-402AAKVSGDKKEREKKEKAATKGKKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
355-359SKKTK
366-402NKGAAKAGKVAATSAAKVSGDKKEREKKEKAATKGKK
Subcellular Location(s) mito 24, mito_nucl 13.833, cyto_mito 12.833
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR023674  Ribosomal_L1-like  
IPR028364  Ribosomal_L1/biogenesis  
IPR016095  Ribosomal_L1_3-a/b-sand  
Gene Ontology GO:0005840  C:ribosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF00687  Ribosomal_L1  
CDD cd00403  Ribosomal_L1  
Amino Acid Sequences MPASTKSSPKAATPNKKPRISSAASASGSPSTSKAAASSSSSSSSAALIDARVSSSQALKAIKALQSHRQKYKAAQLDKGKEAGKSVLPLDGEDDDAAGAGRTEDMGYLNVTVKRLAKEKKSKPVSIALPHPLNPLRATEVCLFVKDPQRTYKDLLPTLGVSCIHRIVGVSKLKGKFAPFEARRSLMDEYDLFLCDERVAPMMPALLGTKWMQKKKMPVAVNVVKSRHMKAELEKAIGSTRFFSNKGSTISVPVGSLSHYSPEEILENLSTALPKVVSKIPFDGWQNIQNIEIKTGKSASLPVWNCDLDSRWVGVPDAEMIESPEISEADSESEAEEAAPAQAQVAAATKPKEGSKKTKSSTQVENKGAAKAGKVAATSAAKVSGDKKEREKKEKAATKGKK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.73
2 0.77
3 0.82
4 0.78
5 0.75
6 0.73
7 0.68
8 0.62
9 0.59
10 0.57
11 0.51
12 0.5
13 0.44
14 0.37
15 0.32
16 0.27
17 0.21
18 0.16
19 0.16
20 0.15
21 0.15
22 0.15
23 0.16
24 0.19
25 0.21
26 0.21
27 0.22
28 0.23
29 0.22
30 0.21
31 0.19
32 0.15
33 0.13
34 0.11
35 0.09
36 0.09
37 0.09
38 0.1
39 0.1
40 0.1
41 0.11
42 0.12
43 0.14
44 0.17
45 0.18
46 0.17
47 0.2
48 0.24
49 0.25
50 0.29
51 0.31
52 0.36
53 0.46
54 0.54
55 0.58
56 0.59
57 0.59
58 0.58
59 0.65
60 0.65
61 0.59
62 0.58
63 0.6
64 0.61
65 0.61
66 0.6
67 0.52
68 0.43
69 0.4
70 0.35
71 0.27
72 0.23
73 0.21
74 0.19
75 0.18
76 0.17
77 0.18
78 0.15
79 0.14
80 0.12
81 0.11
82 0.08
83 0.08
84 0.07
85 0.05
86 0.04
87 0.03
88 0.04
89 0.04
90 0.04
91 0.04
92 0.05
93 0.06
94 0.07
95 0.08
96 0.11
97 0.12
98 0.13
99 0.15
100 0.17
101 0.19
102 0.26
103 0.31
104 0.37
105 0.47
106 0.54
107 0.63
108 0.68
109 0.67
110 0.63
111 0.65
112 0.61
113 0.56
114 0.53
115 0.49
116 0.44
117 0.42
118 0.43
119 0.37
120 0.32
121 0.28
122 0.24
123 0.22
124 0.2
125 0.23
126 0.2
127 0.23
128 0.22
129 0.22
130 0.22
131 0.22
132 0.29
133 0.27
134 0.28
135 0.3
136 0.34
137 0.36
138 0.39
139 0.39
140 0.38
141 0.37
142 0.35
143 0.29
144 0.26
145 0.24
146 0.22
147 0.17
148 0.12
149 0.11
150 0.11
151 0.1
152 0.09
153 0.09
154 0.08
155 0.15
156 0.18
157 0.18
158 0.24
159 0.25
160 0.26
161 0.27
162 0.27
163 0.22
164 0.23
165 0.32
166 0.28
167 0.32
168 0.33
169 0.33
170 0.32
171 0.33
172 0.3
173 0.2
174 0.19
175 0.15
176 0.14
177 0.13
178 0.13
179 0.09
180 0.08
181 0.08
182 0.07
183 0.07
184 0.06
185 0.06
186 0.05
187 0.05
188 0.05
189 0.05
190 0.05
191 0.05
192 0.05
193 0.04
194 0.06
195 0.07
196 0.13
197 0.18
198 0.21
199 0.24
200 0.26
201 0.34
202 0.39
203 0.46
204 0.42
205 0.4
206 0.46
207 0.49
208 0.52
209 0.48
210 0.42
211 0.39
212 0.39
213 0.37
214 0.31
215 0.27
216 0.23
217 0.23
218 0.32
219 0.3
220 0.29
221 0.28
222 0.26
223 0.26
224 0.25
225 0.22
226 0.14
227 0.14
228 0.15
229 0.15
230 0.17
231 0.18
232 0.2
233 0.22
234 0.22
235 0.2
236 0.21
237 0.21
238 0.2
239 0.17
240 0.13
241 0.11
242 0.09
243 0.1
244 0.08
245 0.09
246 0.09
247 0.09
248 0.09
249 0.1
250 0.1
251 0.09
252 0.09
253 0.07
254 0.08
255 0.08
256 0.08
257 0.07
258 0.06
259 0.06
260 0.06
261 0.06
262 0.09
263 0.13
264 0.15
265 0.17
266 0.2
267 0.21
268 0.25
269 0.27
270 0.29
271 0.27
272 0.3
273 0.3
274 0.28
275 0.28
276 0.28
277 0.26
278 0.25
279 0.24
280 0.19
281 0.19
282 0.2
283 0.19
284 0.15
285 0.16
286 0.15
287 0.21
288 0.23
289 0.23
290 0.26
291 0.25
292 0.25
293 0.24
294 0.24
295 0.19
296 0.19
297 0.19
298 0.16
299 0.17
300 0.17
301 0.16
302 0.14
303 0.12
304 0.11
305 0.09
306 0.08
307 0.09
308 0.1
309 0.09
310 0.09
311 0.08
312 0.07
313 0.07
314 0.08
315 0.07
316 0.08
317 0.08
318 0.08
319 0.08
320 0.08
321 0.08
322 0.07
323 0.07
324 0.05
325 0.05
326 0.05
327 0.05
328 0.05
329 0.06
330 0.06
331 0.07
332 0.08
333 0.1
334 0.13
335 0.15
336 0.16
337 0.18
338 0.23
339 0.31
340 0.36
341 0.45
342 0.51
343 0.6
344 0.63
345 0.69
346 0.72
347 0.7
348 0.74
349 0.74
350 0.73
351 0.67
352 0.69
353 0.62
354 0.57
355 0.54
356 0.44
357 0.34
358 0.29
359 0.28
360 0.24
361 0.22
362 0.21
363 0.23
364 0.24
365 0.24
366 0.21
367 0.21
368 0.18
369 0.2
370 0.24
371 0.28
372 0.33
373 0.39
374 0.48
375 0.56
376 0.66
377 0.74
378 0.77
379 0.77
380 0.81
381 0.84
382 0.83