Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A1CIR2

Protein Details
Accession A1CIR2    Localization Confidence Medium Confidence Score 10
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
291-310DIPLDLRHHKPKRQLRFPESBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
323-326ARRR
373-384KLSGKGMKKRVR
Subcellular Location(s) mito 19.5, cyto_mito 12.333, cyto 4, cyto_nucl 3.833
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039848  Ribosomal_S24/S35  
IPR019349  Ribosomal_S24/S35_mit  
Gene Ontology GO:0005739  C:mitochondrion  
GO:0005840  C:ribosome  
GO:0003735  F:structural constituent of ribosome  
GO:0032543  P:mitochondrial translation  
KEGG act:ACLA_052400  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF10213  MRP-S28  
Amino Acid Sequences MASVARFLGRSAFSFARRRPVAIQSRSFAVTPLRFLPEDPPVPQERELSPEDYPDMPDYSPDMLSKEERSMYDMLSPEERELFDAEQRRLVQEFNDHSKRAAAFAEIDKSVRDLEKEVGLRFEDLPEKNKGFWAEEEDDEFALVEDGDEDFHDDEITSMAHAEVELHREIREYARITAWDMPLLSKLAQPFTLPPETHILRFRYTTYMGEQHPAEAKVVVEVASKDLVPKHLSEAQRQTFLKLVGPRYNPDTDIVRMSCEKFTTRAENKRYLGDLINTLVKEAKEGDSFADIPLDLRHHKPKRQLRFPESWVMTEERKKQLAARRRERLAREQERQSIVDGNAVVALASRSLPSLNPALSARAAEEREKVAVKLSGKGMKKRVR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.4
2 0.43
3 0.48
4 0.48
5 0.5
6 0.48
7 0.54
8 0.58
9 0.58
10 0.61
11 0.53
12 0.55
13 0.54
14 0.49
15 0.4
16 0.38
17 0.31
18 0.29
19 0.29
20 0.3
21 0.28
22 0.29
23 0.32
24 0.33
25 0.34
26 0.32
27 0.34
28 0.34
29 0.37
30 0.38
31 0.38
32 0.31
33 0.32
34 0.34
35 0.31
36 0.28
37 0.26
38 0.27
39 0.24
40 0.25
41 0.22
42 0.21
43 0.17
44 0.18
45 0.18
46 0.17
47 0.17
48 0.16
49 0.15
50 0.16
51 0.19
52 0.2
53 0.21
54 0.22
55 0.21
56 0.24
57 0.24
58 0.22
59 0.23
60 0.23
61 0.21
62 0.22
63 0.22
64 0.19
65 0.2
66 0.19
67 0.16
68 0.17
69 0.16
70 0.18
71 0.24
72 0.24
73 0.27
74 0.27
75 0.28
76 0.27
77 0.26
78 0.22
79 0.23
80 0.28
81 0.32
82 0.37
83 0.35
84 0.35
85 0.38
86 0.36
87 0.3
88 0.25
89 0.17
90 0.16
91 0.17
92 0.2
93 0.17
94 0.17
95 0.16
96 0.16
97 0.16
98 0.14
99 0.13
100 0.12
101 0.13
102 0.18
103 0.2
104 0.2
105 0.2
106 0.2
107 0.2
108 0.18
109 0.19
110 0.19
111 0.19
112 0.22
113 0.25
114 0.26
115 0.25
116 0.27
117 0.26
118 0.22
119 0.22
120 0.25
121 0.22
122 0.22
123 0.23
124 0.22
125 0.2
126 0.18
127 0.16
128 0.1
129 0.07
130 0.06
131 0.04
132 0.03
133 0.03
134 0.04
135 0.04
136 0.05
137 0.05
138 0.05
139 0.06
140 0.05
141 0.05
142 0.05
143 0.06
144 0.04
145 0.04
146 0.04
147 0.04
148 0.04
149 0.05
150 0.05
151 0.08
152 0.08
153 0.09
154 0.09
155 0.1
156 0.11
157 0.11
158 0.15
159 0.14
160 0.14
161 0.15
162 0.15
163 0.17
164 0.19
165 0.18
166 0.15
167 0.13
168 0.12
169 0.12
170 0.12
171 0.11
172 0.09
173 0.09
174 0.09
175 0.09
176 0.09
177 0.1
178 0.13
179 0.16
180 0.14
181 0.15
182 0.2
183 0.21
184 0.22
185 0.26
186 0.24
187 0.22
188 0.23
189 0.22
190 0.2
191 0.2
192 0.19
193 0.18
194 0.2
195 0.19
196 0.21
197 0.2
198 0.18
199 0.19
200 0.18
201 0.16
202 0.12
203 0.11
204 0.09
205 0.09
206 0.08
207 0.06
208 0.06
209 0.07
210 0.07
211 0.07
212 0.08
213 0.08
214 0.1
215 0.1
216 0.11
217 0.14
218 0.2
219 0.22
220 0.26
221 0.34
222 0.34
223 0.39
224 0.39
225 0.36
226 0.33
227 0.32
228 0.3
229 0.26
230 0.29
231 0.29
232 0.3
233 0.31
234 0.33
235 0.33
236 0.3
237 0.28
238 0.26
239 0.21
240 0.23
241 0.22
242 0.2
243 0.2
244 0.21
245 0.21
246 0.19
247 0.19
248 0.18
249 0.21
250 0.28
251 0.34
252 0.42
253 0.46
254 0.52
255 0.53
256 0.53
257 0.51
258 0.44
259 0.38
260 0.31
261 0.27
262 0.21
263 0.23
264 0.19
265 0.18
266 0.18
267 0.16
268 0.15
269 0.15
270 0.15
271 0.13
272 0.14
273 0.14
274 0.15
275 0.16
276 0.15
277 0.14
278 0.11
279 0.11
280 0.12
281 0.14
282 0.14
283 0.19
284 0.3
285 0.36
286 0.42
287 0.52
288 0.6
289 0.68
290 0.75
291 0.8
292 0.78
293 0.79
294 0.78
295 0.77
296 0.7
297 0.6
298 0.52
299 0.46
300 0.43
301 0.42
302 0.45
303 0.41
304 0.41
305 0.4
306 0.44
307 0.5
308 0.54
309 0.58
310 0.61
311 0.64
312 0.69
313 0.76
314 0.76
315 0.77
316 0.78
317 0.77
318 0.75
319 0.74
320 0.74
321 0.7
322 0.64
323 0.56
324 0.5
325 0.4
326 0.36
327 0.28
328 0.21
329 0.17
330 0.16
331 0.14
332 0.09
333 0.09
334 0.06
335 0.06
336 0.06
337 0.07
338 0.08
339 0.08
340 0.11
341 0.15
342 0.15
343 0.17
344 0.18
345 0.2
346 0.21
347 0.21
348 0.2
349 0.22
350 0.24
351 0.24
352 0.26
353 0.25
354 0.29
355 0.3
356 0.28
357 0.26
358 0.29
359 0.28
360 0.3
361 0.34
362 0.39
363 0.44
364 0.51