Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A1CDM9

Protein Details
Accession A1CDM9    Localization Confidence High Confidence Score 15.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
196-218EKVDGKKVKKDSKKKSKDDDSSFBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
196-212EKVDGKKVKKDSKKKSK
325-332KNKKRKQI
341-349GSKKTKKSK
382-402NKKSAAAGKAASGAPKKKRKS
Subcellular Location(s) nucl 14.5, cyto_nucl 13.333, cyto 10, mito_nucl 8.666
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR023674  Ribosomal_L1-like  
IPR028364  Ribosomal_L1/biogenesis  
IPR016095  Ribosomal_L1_3-a/b-sand  
Gene Ontology GO:1990904  C:ribonucleoprotein complex  
KEGG act:ACLA_007150  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00687  Ribosomal_L1  
CDD cd00403  Ribosomal_L1  
Amino Acid Sequences MVSSTAVTTKVESGSPYQLEKGQVARASTALLRHIKSKQEEQEKTATKKTLIGDNDDESDEETALKNEAIWLVLTTKKHVVDKNRLKPGKISIPHSLNAYPSLSVCLITADPQRSVKNIVADPSFPQHLSSRIERVIGYSKLKARYHSFESRRQLLSEHDVFLADDRIIMRLVNTLGKVFYKSSKRPIPIRIAEIEKVDGKKVKKDSKKKSKDDDSSFASPAIVAKEIERTLNCAAVQLAPATTAAIRVGSSKFTPEQLAENVEAVVKGLTDKFITKGWRNIKAIHIKGANTMAMPVWLASELWVDEADVVEEAEEDVKAIEGAKNKKRKQIGDDEKLLEGSKKTKKSKPEDDDDASSMAARKEKLQQQKAKALEDGADSGNKKSAAAGKAASGAPKKKRKSIL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.25
2 0.27
3 0.28
4 0.28
5 0.3
6 0.31
7 0.31
8 0.31
9 0.3
10 0.3
11 0.29
12 0.28
13 0.24
14 0.24
15 0.23
16 0.22
17 0.24
18 0.27
19 0.27
20 0.31
21 0.36
22 0.41
23 0.46
24 0.53
25 0.55
26 0.6
27 0.63
28 0.62
29 0.68
30 0.68
31 0.67
32 0.65
33 0.58
34 0.49
35 0.5
36 0.48
37 0.46
38 0.4
39 0.41
40 0.38
41 0.37
42 0.38
43 0.34
44 0.31
45 0.24
46 0.23
47 0.16
48 0.13
49 0.11
50 0.1
51 0.1
52 0.1
53 0.08
54 0.09
55 0.09
56 0.09
57 0.08
58 0.08
59 0.1
60 0.14
61 0.15
62 0.17
63 0.21
64 0.24
65 0.29
66 0.34
67 0.4
68 0.47
69 0.58
70 0.64
71 0.7
72 0.7
73 0.66
74 0.65
75 0.64
76 0.63
77 0.57
78 0.53
79 0.5
80 0.51
81 0.51
82 0.5
83 0.43
84 0.34
85 0.31
86 0.27
87 0.19
88 0.15
89 0.16
90 0.13
91 0.13
92 0.11
93 0.1
94 0.09
95 0.12
96 0.17
97 0.16
98 0.18
99 0.21
100 0.22
101 0.22
102 0.25
103 0.25
104 0.25
105 0.25
106 0.26
107 0.24
108 0.24
109 0.25
110 0.24
111 0.23
112 0.18
113 0.18
114 0.16
115 0.19
116 0.22
117 0.23
118 0.24
119 0.23
120 0.25
121 0.23
122 0.24
123 0.26
124 0.25
125 0.25
126 0.25
127 0.29
128 0.36
129 0.37
130 0.38
131 0.38
132 0.4
133 0.44
134 0.5
135 0.5
136 0.51
137 0.56
138 0.58
139 0.54
140 0.49
141 0.43
142 0.36
143 0.38
144 0.31
145 0.26
146 0.2
147 0.19
148 0.19
149 0.18
150 0.16
151 0.09
152 0.08
153 0.06
154 0.07
155 0.07
156 0.07
157 0.06
158 0.07
159 0.08
160 0.09
161 0.09
162 0.09
163 0.09
164 0.1
165 0.11
166 0.1
167 0.16
168 0.21
169 0.24
170 0.32
171 0.37
172 0.41
173 0.45
174 0.5
175 0.52
176 0.48
177 0.48
178 0.44
179 0.4
180 0.37
181 0.33
182 0.29
183 0.23
184 0.2
185 0.18
186 0.2
187 0.18
188 0.22
189 0.29
190 0.37
191 0.43
192 0.53
193 0.63
194 0.7
195 0.8
196 0.81
197 0.83
198 0.84
199 0.84
200 0.79
201 0.73
202 0.67
203 0.6
204 0.53
205 0.43
206 0.33
207 0.24
208 0.19
209 0.15
210 0.1
211 0.07
212 0.07
213 0.1
214 0.1
215 0.12
216 0.11
217 0.14
218 0.13
219 0.15
220 0.14
221 0.12
222 0.12
223 0.11
224 0.11
225 0.08
226 0.08
227 0.06
228 0.06
229 0.06
230 0.05
231 0.05
232 0.05
233 0.05
234 0.05
235 0.06
236 0.07
237 0.09
238 0.09
239 0.11
240 0.12
241 0.13
242 0.14
243 0.13
244 0.16
245 0.15
246 0.17
247 0.15
248 0.15
249 0.14
250 0.13
251 0.11
252 0.09
253 0.07
254 0.05
255 0.05
256 0.05
257 0.06
258 0.06
259 0.08
260 0.09
261 0.12
262 0.18
263 0.21
264 0.29
265 0.35
266 0.42
267 0.44
268 0.45
269 0.5
270 0.54
271 0.52
272 0.5
273 0.46
274 0.38
275 0.38
276 0.37
277 0.3
278 0.2
279 0.19
280 0.13
281 0.1
282 0.1
283 0.07
284 0.06
285 0.05
286 0.05
287 0.05
288 0.06
289 0.06
290 0.06
291 0.06
292 0.06
293 0.06
294 0.06
295 0.06
296 0.05
297 0.05
298 0.04
299 0.04
300 0.04
301 0.05
302 0.05
303 0.04
304 0.04
305 0.04
306 0.05
307 0.06
308 0.08
309 0.15
310 0.24
311 0.32
312 0.42
313 0.47
314 0.55
315 0.62
316 0.65
317 0.67
318 0.69
319 0.72
320 0.71
321 0.73
322 0.68
323 0.61
324 0.56
325 0.48
326 0.39
327 0.31
328 0.3
329 0.32
330 0.38
331 0.45
332 0.5
333 0.6
334 0.67
335 0.76
336 0.76
337 0.77
338 0.76
339 0.74
340 0.73
341 0.65
342 0.56
343 0.44
344 0.37
345 0.3
346 0.24
347 0.21
348 0.18
349 0.19
350 0.28
351 0.36
352 0.46
353 0.54
354 0.61
355 0.65
356 0.73
357 0.74
358 0.69
359 0.62
360 0.53
361 0.45
362 0.38
363 0.33
364 0.26
365 0.26
366 0.24
367 0.23
368 0.26
369 0.24
370 0.21
371 0.23
372 0.28
373 0.25
374 0.28
375 0.27
376 0.25
377 0.29
378 0.3
379 0.33
380 0.33
381 0.39
382 0.46
383 0.54
384 0.59