Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A316U528

Protein Details
Accession A0A316U528    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
28-58FAMSSAGQKARKKRSKRRRQHSPGRPPPINWHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
36-53KARKKRSKRRRQHSPGRP
Subcellular Location(s) nucl 11.5, cyto_nucl 9.5, cyto 6.5, mito 5, pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000467  G_patch_dom  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR040052  RBM17  
Gene Ontology GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0045292  P:mRNA cis splicing, via spliceosome  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50174  G_PATCH  
Amino Acid Sequences MLPLHEGRGHSLSSSSIRWDEDEDVNGFAMSSAGQKARKKRSKRRRQHSPGRPPPINWDADYDPRTPNDYAAWKDVVRNRREALKRMEAQRRREAGDGDDDQEDERDWVDERDREREVDEERLRKYRKWAPPPSYATSAGAKQRTAFNGEEEEEEEKLYISPPPPERPAAPQTAPYVQYGQPPPAFVQPARPAPPSFVTASASTAEAGASIGSPYTSQLPPPSRQSETSSTPQRPMTGEEAYQRRLAMSQQAAHASPPVIARASPADASLSRSPLPPAFQGGGEGEGGDVKSSPAPAMDLAARQSAAAAIAARLASIAPPAQPARPGPPPPPPPPLSFVPGGAGSSSALNNDVVPEGEEEEGDFATRLMSKWGHQSGQGLGAEGNQGMTEALVINKVSNSKTGGWRKSADLLGVDGFGPSSSSSTSSGASSMGPRGRYATADPRARADLEKYGQPSEVILLHGLLSPPAKVGGHSSNPKKGEGEGGDVDEALPGEIAEECAKYGYVERVAIYPHISPPLLSGSASFSPSTALDREASGTGGVVFVVFTGLVGAYKAVRELNGRFFSGRKVRARYFPKQAFAKGEDAWREEVRGWLAGGGAGA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.23
2 0.22
3 0.22
4 0.23
5 0.24
6 0.26
7 0.28
8 0.27
9 0.29
10 0.26
11 0.25
12 0.24
13 0.22
14 0.18
15 0.13
16 0.11
17 0.07
18 0.08
19 0.11
20 0.15
21 0.22
22 0.29
23 0.39
24 0.5
25 0.59
26 0.68
27 0.76
28 0.83
29 0.88
30 0.93
31 0.94
32 0.94
33 0.96
34 0.96
35 0.96
36 0.96
37 0.95
38 0.94
39 0.88
40 0.78
41 0.75
42 0.71
43 0.64
44 0.53
45 0.49
46 0.42
47 0.46
48 0.47
49 0.41
50 0.37
51 0.35
52 0.38
53 0.32
54 0.29
55 0.28
56 0.3
57 0.31
58 0.33
59 0.34
60 0.31
61 0.37
62 0.43
63 0.46
64 0.44
65 0.45
66 0.44
67 0.5
68 0.55
69 0.56
70 0.58
71 0.59
72 0.62
73 0.66
74 0.74
75 0.72
76 0.74
77 0.76
78 0.72
79 0.65
80 0.61
81 0.54
82 0.46
83 0.46
84 0.41
85 0.34
86 0.3
87 0.27
88 0.24
89 0.22
90 0.2
91 0.12
92 0.1
93 0.09
94 0.09
95 0.11
96 0.16
97 0.19
98 0.22
99 0.27
100 0.28
101 0.28
102 0.28
103 0.3
104 0.28
105 0.34
106 0.38
107 0.38
108 0.41
109 0.48
110 0.5
111 0.49
112 0.55
113 0.55
114 0.58
115 0.63
116 0.7
117 0.67
118 0.74
119 0.78
120 0.75
121 0.7
122 0.61
123 0.53
124 0.45
125 0.43
126 0.4
127 0.35
128 0.3
129 0.27
130 0.3
131 0.29
132 0.31
133 0.27
134 0.23
135 0.24
136 0.25
137 0.24
138 0.22
139 0.21
140 0.17
141 0.16
142 0.14
143 0.11
144 0.1
145 0.1
146 0.11
147 0.1
148 0.17
149 0.21
150 0.26
151 0.28
152 0.31
153 0.32
154 0.35
155 0.39
156 0.39
157 0.35
158 0.34
159 0.34
160 0.36
161 0.36
162 0.3
163 0.29
164 0.24
165 0.29
166 0.27
167 0.29
168 0.25
169 0.25
170 0.25
171 0.25
172 0.27
173 0.2
174 0.27
175 0.28
176 0.33
177 0.35
178 0.36
179 0.33
180 0.33
181 0.35
182 0.3
183 0.26
184 0.21
185 0.2
186 0.18
187 0.19
188 0.16
189 0.14
190 0.12
191 0.1
192 0.09
193 0.06
194 0.06
195 0.05
196 0.04
197 0.03
198 0.03
199 0.03
200 0.04
201 0.04
202 0.08
203 0.08
204 0.09
205 0.16
206 0.2
207 0.23
208 0.29
209 0.33
210 0.32
211 0.34
212 0.39
213 0.38
214 0.39
215 0.43
216 0.45
217 0.42
218 0.43
219 0.41
220 0.37
221 0.33
222 0.31
223 0.28
224 0.22
225 0.22
226 0.24
227 0.27
228 0.27
229 0.27
230 0.24
231 0.2
232 0.19
233 0.18
234 0.17
235 0.16
236 0.16
237 0.17
238 0.19
239 0.19
240 0.18
241 0.18
242 0.13
243 0.12
244 0.1
245 0.09
246 0.08
247 0.08
248 0.09
249 0.09
250 0.1
251 0.09
252 0.08
253 0.09
254 0.09
255 0.14
256 0.14
257 0.15
258 0.14
259 0.15
260 0.16
261 0.15
262 0.17
263 0.13
264 0.14
265 0.13
266 0.12
267 0.12
268 0.11
269 0.11
270 0.09
271 0.08
272 0.06
273 0.05
274 0.05
275 0.04
276 0.04
277 0.04
278 0.04
279 0.04
280 0.04
281 0.04
282 0.05
283 0.05
284 0.06
285 0.06
286 0.06
287 0.07
288 0.07
289 0.07
290 0.07
291 0.07
292 0.05
293 0.05
294 0.05
295 0.04
296 0.03
297 0.04
298 0.04
299 0.04
300 0.04
301 0.04
302 0.03
303 0.04
304 0.04
305 0.04
306 0.06
307 0.07
308 0.08
309 0.1
310 0.11
311 0.15
312 0.2
313 0.22
314 0.23
315 0.31
316 0.37
317 0.4
318 0.46
319 0.44
320 0.41
321 0.43
322 0.42
323 0.36
324 0.3
325 0.26
326 0.21
327 0.18
328 0.16
329 0.11
330 0.09
331 0.07
332 0.07
333 0.06
334 0.05
335 0.06
336 0.06
337 0.06
338 0.06
339 0.06
340 0.05
341 0.06
342 0.06
343 0.06
344 0.06
345 0.06
346 0.06
347 0.06
348 0.06
349 0.05
350 0.05
351 0.04
352 0.04
353 0.05
354 0.05
355 0.07
356 0.09
357 0.1
358 0.16
359 0.19
360 0.19
361 0.2
362 0.21
363 0.19
364 0.23
365 0.22
366 0.16
367 0.13
368 0.13
369 0.12
370 0.11
371 0.09
372 0.05
373 0.05
374 0.04
375 0.04
376 0.04
377 0.03
378 0.04
379 0.05
380 0.05
381 0.05
382 0.06
383 0.08
384 0.09
385 0.1
386 0.13
387 0.15
388 0.25
389 0.33
390 0.36
391 0.38
392 0.39
393 0.39
394 0.41
395 0.39
396 0.31
397 0.23
398 0.2
399 0.17
400 0.15
401 0.13
402 0.08
403 0.07
404 0.06
405 0.06
406 0.05
407 0.05
408 0.05
409 0.07
410 0.09
411 0.1
412 0.11
413 0.11
414 0.11
415 0.11
416 0.11
417 0.11
418 0.14
419 0.16
420 0.16
421 0.16
422 0.19
423 0.19
424 0.2
425 0.23
426 0.27
427 0.33
428 0.38
429 0.38
430 0.38
431 0.39
432 0.39
433 0.36
434 0.3
435 0.28
436 0.25
437 0.29
438 0.29
439 0.28
440 0.27
441 0.25
442 0.23
443 0.17
444 0.16
445 0.12
446 0.1
447 0.09
448 0.09
449 0.1
450 0.1
451 0.09
452 0.08
453 0.08
454 0.08
455 0.09
456 0.09
457 0.08
458 0.13
459 0.17
460 0.24
461 0.33
462 0.38
463 0.44
464 0.46
465 0.47
466 0.44
467 0.38
468 0.38
469 0.32
470 0.32
471 0.26
472 0.26
473 0.24
474 0.23
475 0.22
476 0.15
477 0.13
478 0.08
479 0.06
480 0.04
481 0.04
482 0.05
483 0.06
484 0.07
485 0.07
486 0.07
487 0.08
488 0.08
489 0.08
490 0.1
491 0.13
492 0.15
493 0.16
494 0.16
495 0.17
496 0.18
497 0.19
498 0.19
499 0.17
500 0.16
501 0.18
502 0.18
503 0.16
504 0.17
505 0.2
506 0.18
507 0.17
508 0.15
509 0.17
510 0.19
511 0.21
512 0.19
513 0.15
514 0.16
515 0.16
516 0.19
517 0.14
518 0.14
519 0.14
520 0.15
521 0.17
522 0.16
523 0.16
524 0.13
525 0.12
526 0.1
527 0.09
528 0.08
529 0.06
530 0.05
531 0.04
532 0.04
533 0.04
534 0.03
535 0.04
536 0.04
537 0.04
538 0.05
539 0.06
540 0.06
541 0.07
542 0.08
543 0.09
544 0.1
545 0.15
546 0.19
547 0.28
548 0.3
549 0.32
550 0.32
551 0.32
552 0.4
553 0.44
554 0.49
555 0.48
556 0.53
557 0.57
558 0.65
559 0.73
560 0.73
561 0.75
562 0.73
563 0.74
564 0.72
565 0.71
566 0.68
567 0.64
568 0.59
569 0.51
570 0.51
571 0.47
572 0.44
573 0.44
574 0.37
575 0.36
576 0.32
577 0.32
578 0.28
579 0.25
580 0.22
581 0.17
582 0.17