FuNGI

A0A316U727

Protein Details

Accession

A0A316U727

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

11.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
91-114	SQSGAKASPRQRQRKEVKVPTEVR	Hydrophilic
500-527	FDRSRPSLSSKPKRSTPRQIPNPQRVVV	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 17, cyto_nucl 11.5, mito 6, cyto 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR039024 RTC4 IPR028094 RTC4_C
Gene Ontology	GO:0005737 C:cytoplasm GO:0005634 C:nucleus
Pfam	View protein in Pfam PF14474 RTC4

Amino Acid Sequences

MSFGPGRRVISSNSIFSPENYTETSSLLSSQPTQSQAGPSTPTKRARTGIVLPSKNGQGTGSQKSSQESHDDGIKLAEEPESQWDMLIAASQSGAKASPRQRQRKEVKVPTEVRLLRLCPFCEAAMPRRVSLECCEMMQPWLDRYHSGKPIKVTDTAAVCEKHRAESDIIPRGKKQGWPTTLDLDKLAQRLEGGQGRDSMTELLRAPRESPFFKSAMQRRAARTHKMDRSPAESLDVQAGYYGETGYELLRKTLTSWFYFQPLDEGCNLQSVALLEVIKPLTSVEFIGDVLVPELACRLIVEDYDRRKGVNKRTLSFEEAREIKLDSAPYGIAMFPAEGAGAGDDLFAKAGQQGSKTLGSYSNSPSAGRRAPSVPSVATTTASRSPRRAVDSALNAPTMAVKAKARPFLQRSPSSSAPTPLSGGSALPANGASTSFLDMIRPVRPRPAHALSQPVGGSGTGTLDESKRGLNKRSILVSDDERERHKDDDDDDDDDDDDFFDRSRPSLSSKPKRSTPRQIPNPQRVVVDLRDDDDDDDDDLRGWMAGKGREEAPLLPSSADVTAAEQTKEDGDEQNSSHRNGSGAVPSTTGTTLQT

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.38
2	0.35
3	0.34
4	0.38
5	0.3
6	0.29
7	0.27
8	0.28
9	0.25
10	0.25
11	0.25
12	0.19
13	0.19
14	0.17
15	0.18
16	0.17
17	0.2
18	0.23
19	0.24
20	0.26
21	0.26
22	0.29
23	0.29
24	0.29
25	0.31
26	0.33
27	0.37
28	0.42
29	0.49
30	0.49
31	0.52
32	0.52
33	0.52
34	0.54
35	0.55
36	0.57
37	0.58
38	0.56
39	0.52
40	0.53
41	0.51
42	0.45
43	0.37
44	0.28
45	0.25
46	0.28
47	0.34
48	0.35
49	0.34
50	0.35
51	0.38
52	0.39
53	0.35
54	0.35
55	0.3
56	0.28
57	0.31
58	0.3
59	0.27
60	0.26
61	0.24
62	0.19
63	0.17
64	0.16
65	0.11
66	0.11
67	0.16
68	0.18
69	0.17
70	0.16
71	0.15
72	0.14
73	0.13
74	0.14
75	0.09
76	0.06
77	0.07
78	0.07
79	0.07
80	0.07
81	0.08
82	0.08
83	0.16
84	0.24
85	0.32
86	0.42
87	0.53
88	0.6
89	0.7
90	0.77
91	0.8
92	0.83
93	0.85
94	0.82
95	0.81
96	0.78
97	0.71
98	0.72
99	0.62
100	0.55
101	0.49
102	0.43
103	0.39
104	0.39
105	0.36
106	0.29
107	0.3
108	0.26
109	0.27
110	0.29
111	0.29
112	0.33
113	0.34
114	0.31
115	0.33
116	0.33
117	0.31
118	0.31
119	0.31
120	0.23
121	0.23
122	0.24
123	0.21
124	0.22
125	0.23
126	0.2
127	0.17
128	0.19
129	0.19
130	0.2
131	0.23
132	0.3
133	0.35
134	0.37
135	0.38
136	0.38
137	0.43
138	0.44
139	0.42
140	0.37
141	0.32
142	0.31
143	0.29
144	0.29
145	0.25
146	0.23
147	0.26
148	0.25
149	0.23
150	0.22
151	0.24
152	0.23
153	0.27
154	0.34
155	0.38
156	0.4
157	0.39
158	0.38
159	0.4
160	0.4
161	0.39
162	0.39
163	0.4
164	0.4
165	0.43
166	0.46
167	0.47
168	0.46
169	0.42
170	0.35
171	0.28
172	0.27
173	0.23
174	0.2
175	0.13
176	0.12
177	0.12
178	0.15
179	0.17
180	0.16
181	0.17
182	0.18
183	0.19
184	0.19
185	0.19
186	0.16
187	0.12
188	0.13
189	0.12
190	0.14
191	0.15
192	0.16
193	0.16
194	0.19
195	0.23
196	0.23
197	0.27
198	0.27
199	0.26
200	0.28
201	0.36
202	0.39
203	0.42
204	0.46
205	0.45
206	0.46
207	0.54
208	0.56
209	0.54
210	0.54
211	0.57
212	0.58
213	0.59
214	0.6
215	0.53
216	0.54
217	0.49
218	0.42
219	0.36
220	0.29
221	0.24
222	0.21
223	0.19
224	0.13
225	0.11
226	0.1
227	0.07
228	0.07
229	0.06
230	0.04
231	0.04
232	0.05
233	0.05
234	0.07
235	0.07
236	0.07
237	0.08
238	0.08
239	0.09
240	0.14
241	0.16
242	0.16
243	0.19
244	0.19
245	0.22
246	0.22
247	0.2
248	0.18
249	0.16
250	0.15
251	0.13
252	0.13
253	0.1
254	0.11
255	0.11
256	0.08
257	0.08
258	0.07
259	0.07
260	0.07
261	0.07
262	0.06
263	0.07
264	0.08
265	0.07
266	0.06
267	0.06
268	0.05
269	0.05
270	0.05
271	0.04
272	0.05
273	0.05
274	0.05
275	0.05
276	0.05
277	0.05
278	0.05
279	0.04
280	0.03
281	0.04
282	0.03
283	0.03
284	0.03
285	0.04
286	0.04
287	0.04
288	0.08
289	0.13
290	0.16
291	0.2
292	0.2
293	0.19
294	0.25
295	0.31
296	0.38
297	0.41
298	0.43
299	0.42
300	0.48
301	0.5
302	0.49
303	0.45
304	0.37
305	0.34
306	0.3
307	0.29
308	0.23
309	0.21
310	0.17
311	0.16
312	0.15
313	0.09
314	0.09
315	0.08
316	0.07
317	0.07
318	0.07
319	0.05
320	0.05
321	0.05
322	0.04
323	0.04
324	0.04
325	0.03
326	0.03
327	0.03
328	0.03
329	0.03
330	0.03
331	0.03
332	0.03
333	0.03
334	0.03
335	0.03
336	0.04
337	0.06
338	0.07
339	0.08
340	0.09
341	0.12
342	0.13
343	0.13
344	0.13
345	0.14
346	0.15
347	0.17
348	0.19
349	0.2
350	0.2
351	0.2
352	0.2
353	0.22
354	0.24
355	0.22
356	0.21
357	0.19
358	0.2
359	0.22
360	0.23
361	0.18
362	0.17
363	0.18
364	0.16
365	0.16
366	0.14
367	0.15
368	0.19
369	0.24
370	0.24
371	0.24
372	0.27
373	0.31
374	0.35
375	0.34
376	0.3
377	0.32
378	0.35
379	0.38
380	0.36
381	0.31
382	0.26
383	0.25
384	0.22
385	0.17
386	0.12
387	0.09
388	0.09
389	0.15
390	0.19
391	0.26
392	0.27
393	0.34
394	0.4
395	0.46
396	0.53
397	0.53
398	0.54
399	0.55
400	0.57
401	0.53
402	0.48
403	0.43
404	0.37
405	0.32
406	0.28
407	0.21
408	0.18
409	0.14
410	0.12
411	0.1
412	0.09
413	0.08
414	0.07
415	0.07
416	0.07
417	0.06
418	0.07
419	0.07
420	0.06
421	0.08
422	0.09
423	0.09
424	0.09
425	0.1
426	0.13
427	0.17
428	0.19
429	0.19
430	0.27
431	0.28
432	0.32
433	0.38
434	0.41
435	0.42
436	0.42
437	0.48
438	0.41
439	0.43
440	0.39
441	0.31
442	0.26
443	0.2
444	0.17
445	0.1
446	0.09
447	0.06
448	0.07
449	0.08
450	0.08
451	0.09
452	0.1
453	0.13
454	0.18
455	0.22
456	0.27
457	0.32
458	0.37
459	0.41
460	0.44
461	0.43
462	0.39
463	0.39
464	0.38
465	0.37
466	0.37
467	0.35
468	0.34
469	0.37
470	0.37
471	0.35
472	0.32
473	0.31
474	0.28
475	0.34
476	0.34
477	0.33
478	0.31
479	0.3
480	0.28
481	0.24
482	0.22
483	0.13
484	0.11
485	0.08
486	0.07
487	0.09
488	0.09
489	0.1
490	0.12
491	0.14
492	0.2
493	0.29
494	0.4
495	0.48
496	0.57
497	0.64
498	0.7
499	0.79
500	0.82
501	0.84
502	0.84
503	0.84
504	0.86
505	0.89
506	0.91
507	0.91
508	0.88
509	0.79
510	0.68
511	0.6
512	0.54
513	0.47
514	0.43
515	0.34
516	0.29
517	0.29
518	0.28
519	0.26
520	0.23
521	0.21
522	0.16
523	0.15
524	0.14
525	0.12
526	0.11
527	0.11
528	0.09
529	0.09
530	0.1
531	0.14
532	0.18
533	0.2
534	0.23
535	0.24
536	0.26
537	0.27
538	0.26
539	0.25
540	0.23
541	0.22
542	0.19
543	0.18
544	0.17
545	0.16
546	0.15
547	0.11
548	0.11
549	0.15
550	0.17
551	0.17
552	0.15
553	0.16
554	0.17
555	0.18
556	0.18
557	0.18
558	0.18
559	0.22
560	0.23
561	0.31
562	0.34
563	0.34
564	0.35
565	0.31
566	0.29
567	0.27
568	0.3
569	0.28
570	0.28
571	0.27
572	0.25
573	0.25
574	0.26
575	0.25

A0A316U727

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer