Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C4R242

Protein Details
Accession C4R242    Localization Confidence Low Confidence Score 9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
21-43QSDSERPHKRAKLDQKNPIENDGHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 17, cyto_nucl 12.833, cyto 6.5, cyto_mito 5.666
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR038765  Papain-like_cys_pep_sf  
IPR028889  USP_dom  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
IPR001607  Znf_UBP  
Gene Ontology GO:0008270  F:zinc ion binding  
KEGG ppa:PAS_chr2-2_0340  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF02148  zf-UBP  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50235  USP_3  
PS50271  ZF_UBP  
Amino Acid Sequences MFPMVTLKIGDRYLFSCLMPQSDSERPHKRAKLDQKNPIENDGENDNDIGKHANDGETNRLSQVRNLYFNTINRHKLDFDFEKKCQVTLSKSNVYCCLVCGKYLQGRSPTSQAYLHSLDVNHHLFISFSTLKTFALPEGFEVKDHDGSLDDIKELISPAYTKDQVASLDKQTTTARDIDGNPYRPGFIGLNNVKGFNDYSNTVLLALGHIKAVRNYYLLNSFKDSFNQELGLFIRRMWSSKQFRPHISPAEIMRVVTEESKNRFNLTQQKTPRDFFLFLLHLMPHRVRKSFRGAAGGSSFLMIPLKLPRTTVFNDETPQINLQTLINQFEKDKPVKEAPRVLLLHFDRNQQDIQLDSVSGSAINNTIINFPQDLQFNQTYKLVANIVQDVVPGSSGEDTIAYKIQLYDKGRDQWLQIHDLKVQEIERELLFLHQSVLQVWERKI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.24
2 0.22
3 0.23
4 0.22
5 0.24
6 0.23
7 0.23
8 0.25
9 0.3
10 0.36
11 0.4
12 0.48
13 0.51
14 0.6
15 0.64
16 0.64
17 0.68
18 0.73
19 0.76
20 0.76
21 0.81
22 0.82
23 0.85
24 0.81
25 0.75
26 0.66
27 0.55
28 0.49
29 0.42
30 0.34
31 0.25
32 0.23
33 0.19
34 0.16
35 0.17
36 0.16
37 0.12
38 0.12
39 0.13
40 0.14
41 0.17
42 0.19
43 0.25
44 0.26
45 0.26
46 0.26
47 0.29
48 0.27
49 0.28
50 0.35
51 0.33
52 0.36
53 0.37
54 0.4
55 0.41
56 0.44
57 0.49
58 0.47
59 0.48
60 0.45
61 0.46
62 0.43
63 0.4
64 0.44
65 0.43
66 0.45
67 0.46
68 0.45
69 0.51
70 0.49
71 0.48
72 0.42
73 0.39
74 0.38
75 0.39
76 0.46
77 0.45
78 0.47
79 0.49
80 0.49
81 0.48
82 0.4
83 0.33
84 0.31
85 0.23
86 0.22
87 0.21
88 0.23
89 0.26
90 0.29
91 0.33
92 0.32
93 0.35
94 0.37
95 0.4
96 0.36
97 0.32
98 0.31
99 0.28
100 0.27
101 0.26
102 0.24
103 0.22
104 0.21
105 0.2
106 0.24
107 0.24
108 0.18
109 0.16
110 0.15
111 0.13
112 0.13
113 0.18
114 0.14
115 0.13
116 0.14
117 0.15
118 0.15
119 0.16
120 0.16
121 0.1
122 0.11
123 0.11
124 0.11
125 0.14
126 0.14
127 0.14
128 0.16
129 0.17
130 0.17
131 0.16
132 0.15
133 0.11
134 0.13
135 0.14
136 0.12
137 0.1
138 0.09
139 0.09
140 0.09
141 0.09
142 0.07
143 0.06
144 0.06
145 0.07
146 0.12
147 0.13
148 0.12
149 0.13
150 0.14
151 0.15
152 0.19
153 0.2
154 0.18
155 0.21
156 0.21
157 0.22
158 0.21
159 0.21
160 0.19
161 0.18
162 0.16
163 0.15
164 0.16
165 0.22
166 0.27
167 0.29
168 0.28
169 0.27
170 0.26
171 0.23
172 0.24
173 0.17
174 0.13
175 0.19
176 0.19
177 0.24
178 0.24
179 0.25
180 0.22
181 0.22
182 0.22
183 0.13
184 0.14
185 0.09
186 0.1
187 0.1
188 0.1
189 0.09
190 0.09
191 0.08
192 0.06
193 0.06
194 0.05
195 0.06
196 0.06
197 0.06
198 0.07
199 0.09
200 0.09
201 0.08
202 0.09
203 0.1
204 0.16
205 0.18
206 0.18
207 0.2
208 0.21
209 0.2
210 0.22
211 0.22
212 0.16
213 0.15
214 0.15
215 0.12
216 0.12
217 0.13
218 0.13
219 0.12
220 0.1
221 0.13
222 0.12
223 0.14
224 0.15
225 0.23
226 0.28
227 0.33
228 0.42
229 0.43
230 0.47
231 0.51
232 0.54
233 0.5
234 0.45
235 0.43
236 0.35
237 0.36
238 0.32
239 0.26
240 0.21
241 0.16
242 0.15
243 0.14
244 0.15
245 0.14
246 0.17
247 0.21
248 0.22
249 0.22
250 0.22
251 0.25
252 0.33
253 0.36
254 0.41
255 0.44
256 0.52
257 0.55
258 0.55
259 0.53
260 0.47
261 0.42
262 0.34
263 0.33
264 0.25
265 0.22
266 0.23
267 0.19
268 0.16
269 0.17
270 0.18
271 0.19
272 0.21
273 0.24
274 0.25
275 0.29
276 0.37
277 0.4
278 0.4
279 0.39
280 0.37
281 0.36
282 0.35
283 0.32
284 0.23
285 0.18
286 0.16
287 0.1
288 0.1
289 0.07
290 0.07
291 0.11
292 0.14
293 0.14
294 0.15
295 0.16
296 0.21
297 0.23
298 0.27
299 0.26
300 0.25
301 0.26
302 0.27
303 0.28
304 0.24
305 0.23
306 0.19
307 0.16
308 0.14
309 0.13
310 0.16
311 0.15
312 0.17
313 0.17
314 0.17
315 0.19
316 0.22
317 0.28
318 0.27
319 0.28
320 0.29
321 0.37
322 0.43
323 0.47
324 0.51
325 0.46
326 0.51
327 0.5
328 0.45
329 0.45
330 0.41
331 0.44
332 0.38
333 0.42
334 0.35
335 0.36
336 0.36
337 0.28
338 0.27
339 0.2
340 0.2
341 0.15
342 0.13
343 0.1
344 0.1
345 0.09
346 0.08
347 0.07
348 0.06
349 0.06
350 0.07
351 0.07
352 0.08
353 0.09
354 0.1
355 0.12
356 0.12
357 0.12
358 0.15
359 0.17
360 0.17
361 0.21
362 0.26
363 0.26
364 0.27
365 0.27
366 0.25
367 0.23
368 0.24
369 0.19
370 0.17
371 0.18
372 0.18
373 0.18
374 0.17
375 0.17
376 0.15
377 0.14
378 0.11
379 0.09
380 0.08
381 0.07
382 0.07
383 0.08
384 0.08
385 0.09
386 0.1
387 0.12
388 0.11
389 0.11
390 0.13
391 0.17
392 0.23
393 0.26
394 0.3
395 0.36
396 0.42
397 0.45
398 0.45
399 0.44
400 0.44
401 0.44
402 0.45
403 0.42
404 0.39
405 0.38
406 0.38
407 0.37
408 0.33
409 0.3
410 0.25
411 0.23
412 0.23
413 0.19
414 0.19
415 0.18
416 0.17
417 0.17
418 0.15
419 0.15
420 0.14
421 0.15
422 0.15
423 0.19
424 0.22