Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A316U7S5

Protein Details
Accession A0A316U7S5    Localization Confidence Medium Confidence Score 10
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
235-258MDEAERERKRRWREKVARGREAREBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
240-262RERKRRWREKVARGREAREARLR
Subcellular Location(s) mito 10, cyto 9, cyto_nucl 9, nucl 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR005037  PRP38  
Gene Ontology GO:0071011  C:precatalytic spliceosome  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF03371  PRP38  
Amino Acid Sequences MPAPIPTQETSTAAASSSATAPTSGPPPPREYLGYRAPRSVHGTNPQFLIEKAIRSRIYDCLYWKSVCFGLSAETLVDEAALRLPCVGGSYGGTLKPTEFLCLALKMLQLQPEEGILREYLGAKEFKYLRALTAFYIRLVCPALQVYTLLEPLLSDYRKLRYRSLDGSYRLTHMDTFVDELLTEERVCDVILPRLVKREVLEEREGLPPRGSVLEEALLEGEEGEGEGSGEEGEMDEAERERKRRWREKVARGREAREARLRAEAEREAGVAAPAASNGVGRGEAEPRPPSPVDESEVGYASQEDSEDERERYVSRSPSRSVSPDRQSNRRSVASSASPYRSRSPSPGSGNEA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.18
2 0.15
3 0.14
4 0.14
5 0.12
6 0.11
7 0.11
8 0.12
9 0.13
10 0.16
11 0.2
12 0.25
13 0.27
14 0.32
15 0.34
16 0.37
17 0.39
18 0.4
19 0.41
20 0.46
21 0.52
22 0.49
23 0.51
24 0.48
25 0.48
26 0.52
27 0.48
28 0.44
29 0.45
30 0.48
31 0.46
32 0.46
33 0.43
34 0.37
35 0.34
36 0.34
37 0.26
38 0.26
39 0.26
40 0.32
41 0.31
42 0.33
43 0.35
44 0.34
45 0.36
46 0.34
47 0.35
48 0.35
49 0.38
50 0.36
51 0.34
52 0.31
53 0.29
54 0.25
55 0.22
56 0.16
57 0.15
58 0.14
59 0.14
60 0.11
61 0.1
62 0.09
63 0.08
64 0.08
65 0.05
66 0.05
67 0.08
68 0.08
69 0.08
70 0.08
71 0.08
72 0.08
73 0.09
74 0.09
75 0.06
76 0.07
77 0.09
78 0.11
79 0.12
80 0.13
81 0.12
82 0.11
83 0.13
84 0.13
85 0.12
86 0.11
87 0.12
88 0.13
89 0.14
90 0.14
91 0.13
92 0.13
93 0.13
94 0.14
95 0.16
96 0.14
97 0.14
98 0.14
99 0.14
100 0.14
101 0.12
102 0.11
103 0.08
104 0.08
105 0.08
106 0.09
107 0.08
108 0.1
109 0.11
110 0.1
111 0.15
112 0.16
113 0.17
114 0.2
115 0.2
116 0.19
117 0.2
118 0.2
119 0.16
120 0.2
121 0.19
122 0.16
123 0.17
124 0.15
125 0.15
126 0.15
127 0.14
128 0.09
129 0.1
130 0.09
131 0.08
132 0.08
133 0.08
134 0.08
135 0.08
136 0.07
137 0.06
138 0.05
139 0.07
140 0.1
141 0.09
142 0.1
143 0.11
144 0.17
145 0.23
146 0.25
147 0.27
148 0.29
149 0.33
150 0.37
151 0.4
152 0.41
153 0.37
154 0.39
155 0.36
156 0.33
157 0.29
158 0.24
159 0.2
160 0.14
161 0.12
162 0.08
163 0.08
164 0.07
165 0.06
166 0.06
167 0.06
168 0.06
169 0.06
170 0.06
171 0.05
172 0.05
173 0.05
174 0.05
175 0.05
176 0.06
177 0.08
178 0.11
179 0.12
180 0.12
181 0.16
182 0.17
183 0.17
184 0.17
185 0.21
186 0.21
187 0.24
188 0.26
189 0.23
190 0.25
191 0.3
192 0.31
193 0.25
194 0.22
195 0.17
196 0.16
197 0.16
198 0.14
199 0.09
200 0.09
201 0.09
202 0.09
203 0.09
204 0.08
205 0.07
206 0.06
207 0.06
208 0.05
209 0.03
210 0.03
211 0.03
212 0.02
213 0.02
214 0.02
215 0.03
216 0.03
217 0.03
218 0.03
219 0.03
220 0.03
221 0.03
222 0.03
223 0.04
224 0.05
225 0.09
226 0.12
227 0.15
228 0.2
229 0.29
230 0.39
231 0.48
232 0.57
233 0.64
234 0.72
235 0.81
236 0.86
237 0.88
238 0.88
239 0.82
240 0.76
241 0.74
242 0.68
243 0.63
244 0.6
245 0.53
246 0.44
247 0.47
248 0.44
249 0.36
250 0.36
251 0.31
252 0.25
253 0.23
254 0.22
255 0.15
256 0.14
257 0.13
258 0.08
259 0.07
260 0.05
261 0.05
262 0.05
263 0.05
264 0.05
265 0.05
266 0.05
267 0.05
268 0.06
269 0.07
270 0.11
271 0.12
272 0.17
273 0.2
274 0.2
275 0.25
276 0.24
277 0.26
278 0.28
279 0.29
280 0.28
281 0.27
282 0.29
283 0.25
284 0.26
285 0.23
286 0.18
287 0.16
288 0.12
289 0.1
290 0.08
291 0.08
292 0.1
293 0.15
294 0.18
295 0.18
296 0.19
297 0.2
298 0.21
299 0.22
300 0.26
301 0.3
302 0.35
303 0.4
304 0.42
305 0.46
306 0.5
307 0.54
308 0.56
309 0.57
310 0.59
311 0.63
312 0.66
313 0.71
314 0.7
315 0.71
316 0.69
317 0.65
318 0.58
319 0.51
320 0.51
321 0.48
322 0.51
323 0.51
324 0.5
325 0.49
326 0.5
327 0.54
328 0.53
329 0.51
330 0.5
331 0.51
332 0.53
333 0.57