Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A316TZW2

Protein Details
Accession A0A316TZW2    Localization Confidence Low Confidence Score 9.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
688-711SDSSKNYRLRARDRQRRNNDEPGTHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 15, cyto_nucl 11, cyto 5, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
IPR007275  YTH_domain  
IPR045168  YTH_prot  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF04146  YTH  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
PS50882  YTH  
CDD cd00590  RRM_SF  
cd21134  YTH  
Amino Acid Sequences MATPPGPPTQSYHMSSQIQPSEQLEAPQIDSQGGLKGQQQQTTYRPGDVETGMRPGAAPLAYSGPTSSGGPPKPTTSPGLQPLSTANPPMSGYMEPRPTQPATSVARGDAPQHTTFDSGAKYGTRLPSQSFMTGNTFPGAPPEQTPAYYGFANFQPYPAYYASATPGNVAMAPQVQQMQSTGLGVPQGLVYGQQYPSYYNEGQLHAGYGAVHPAPADYQNWHTGSNLVYSGNANVMSHQRQGSFTEDPLDPSFGGQVLGQTPYASAFNSNTPQLQQTGTMQTQRRTSPLSTSGRRSEHRPADTRSEHVMWVGNVPTDATQEELWSIFSTLPPLPQQDQEGEQERERWPHGILSIFIIARSNCAFVNYTTPDYLTRAVEFFHGKSLRPHDARCPKLVCRIRKKDEEAAAGVAGQRGKGIHVAWLKEHNRRLETSRRTDPASSSQSPSTSTAAVQVSGGLAPPHERFLSESASVEPSSGTATPRSGPRAPPAAEASSFERTAFDQTQSASDPSYASTNSEVLSHRAFSKRYFHLKSHNVEELDRAVETKTWTTQPHNESFLDQAFRHSEVVYLFFSANQSGRFYGYARMTGGIPSDAKQQGLTVSGLSHPSVDTLAPTTVVKDSPPPMTPPEELETPASTEVKMSSEEAEKPLTQTWPIGREVRERKTSSADGAADISGDSSAGGGIVHSDSSKNYRLRARDRQRRNNDEPGTSKADEVKGDSPQKASVASGLDPVSPQSSDRRPSSGGRPSSWTSSADLVEDLDRTLDFSSSPRESRAAEQHITRSLIHNLRLDQIDSQEKVLRLQRTLDEPHGQSVDAADEGQGQRGLSTASPVGSGKATPLSPAHPFTIEWLQTIPLPFGVVKHLRNPWNENKSVRVGRDGTELAVETGAELLRIWDDHVGKQEVSNSRRES
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.45
2 0.46
3 0.49
4 0.47
5 0.41
6 0.4
7 0.38
8 0.36
9 0.33
10 0.32
11 0.28
12 0.24
13 0.26
14 0.26
15 0.25
16 0.19
17 0.19
18 0.18
19 0.17
20 0.16
21 0.15
22 0.17
23 0.26
24 0.3
25 0.34
26 0.35
27 0.37
28 0.41
29 0.49
30 0.47
31 0.39
32 0.36
33 0.33
34 0.35
35 0.31
36 0.31
37 0.23
38 0.25
39 0.23
40 0.22
41 0.21
42 0.17
43 0.18
44 0.14
45 0.13
46 0.1
47 0.14
48 0.15
49 0.15
50 0.15
51 0.13
52 0.15
53 0.16
54 0.19
55 0.23
56 0.26
57 0.31
58 0.33
59 0.36
60 0.37
61 0.39
62 0.4
63 0.37
64 0.4
65 0.43
66 0.46
67 0.42
68 0.4
69 0.4
70 0.41
71 0.37
72 0.32
73 0.24
74 0.21
75 0.21
76 0.22
77 0.21
78 0.17
79 0.19
80 0.24
81 0.3
82 0.3
83 0.31
84 0.35
85 0.34
86 0.34
87 0.32
88 0.32
89 0.31
90 0.35
91 0.34
92 0.29
93 0.31
94 0.31
95 0.32
96 0.29
97 0.29
98 0.26
99 0.27
100 0.27
101 0.25
102 0.25
103 0.24
104 0.21
105 0.16
106 0.16
107 0.15
108 0.15
109 0.19
110 0.23
111 0.24
112 0.25
113 0.27
114 0.31
115 0.32
116 0.34
117 0.3
118 0.28
119 0.3
120 0.29
121 0.27
122 0.23
123 0.21
124 0.17
125 0.21
126 0.21
127 0.17
128 0.17
129 0.21
130 0.21
131 0.21
132 0.23
133 0.21
134 0.21
135 0.2
136 0.19
137 0.17
138 0.18
139 0.23
140 0.21
141 0.19
142 0.19
143 0.18
144 0.22
145 0.2
146 0.2
147 0.15
148 0.16
149 0.18
150 0.18
151 0.18
152 0.15
153 0.15
154 0.13
155 0.12
156 0.11
157 0.1
158 0.08
159 0.09
160 0.1
161 0.12
162 0.12
163 0.12
164 0.13
165 0.13
166 0.12
167 0.12
168 0.11
169 0.09
170 0.09
171 0.09
172 0.08
173 0.06
174 0.06
175 0.05
176 0.06
177 0.06
178 0.09
179 0.1
180 0.12
181 0.12
182 0.14
183 0.16
184 0.22
185 0.21
186 0.23
187 0.25
188 0.25
189 0.26
190 0.24
191 0.23
192 0.16
193 0.16
194 0.12
195 0.09
196 0.09
197 0.08
198 0.08
199 0.07
200 0.07
201 0.08
202 0.09
203 0.1
204 0.11
205 0.14
206 0.2
207 0.21
208 0.22
209 0.21
210 0.21
211 0.2
212 0.19
213 0.17
214 0.12
215 0.11
216 0.11
217 0.11
218 0.11
219 0.11
220 0.08
221 0.09
222 0.14
223 0.16
224 0.18
225 0.19
226 0.19
227 0.2
228 0.23
229 0.26
230 0.23
231 0.21
232 0.22
233 0.21
234 0.23
235 0.23
236 0.22
237 0.17
238 0.15
239 0.15
240 0.11
241 0.11
242 0.08
243 0.08
244 0.08
245 0.09
246 0.09
247 0.08
248 0.08
249 0.09
250 0.09
251 0.08
252 0.08
253 0.09
254 0.12
255 0.14
256 0.15
257 0.15
258 0.16
259 0.17
260 0.17
261 0.16
262 0.14
263 0.14
264 0.19
265 0.2
266 0.25
267 0.27
268 0.29
269 0.33
270 0.33
271 0.33
272 0.31
273 0.3
274 0.29
275 0.34
276 0.39
277 0.39
278 0.43
279 0.47
280 0.48
281 0.49
282 0.5
283 0.51
284 0.51
285 0.53
286 0.53
287 0.51
288 0.55
289 0.55
290 0.52
291 0.47
292 0.41
293 0.34
294 0.29
295 0.27
296 0.18
297 0.18
298 0.16
299 0.11
300 0.1
301 0.1
302 0.09
303 0.08
304 0.08
305 0.08
306 0.07
307 0.07
308 0.08
309 0.07
310 0.08
311 0.07
312 0.08
313 0.07
314 0.07
315 0.09
316 0.09
317 0.11
318 0.12
319 0.14
320 0.15
321 0.16
322 0.18
323 0.17
324 0.19
325 0.21
326 0.25
327 0.25
328 0.24
329 0.26
330 0.26
331 0.27
332 0.26
333 0.23
334 0.18
335 0.17
336 0.18
337 0.15
338 0.14
339 0.13
340 0.14
341 0.13
342 0.12
343 0.12
344 0.1
345 0.11
346 0.11
347 0.1
348 0.08
349 0.1
350 0.11
351 0.1
352 0.15
353 0.16
354 0.17
355 0.16
356 0.17
357 0.16
358 0.17
359 0.18
360 0.13
361 0.12
362 0.11
363 0.11
364 0.12
365 0.13
366 0.12
367 0.17
368 0.17
369 0.17
370 0.21
371 0.26
372 0.31
373 0.32
374 0.33
375 0.36
376 0.45
377 0.47
378 0.48
379 0.46
380 0.4
381 0.48
382 0.54
383 0.54
384 0.55
385 0.63
386 0.64
387 0.67
388 0.7
389 0.67
390 0.65
391 0.58
392 0.48
393 0.39
394 0.32
395 0.26
396 0.21
397 0.15
398 0.1
399 0.07
400 0.06
401 0.06
402 0.06
403 0.07
404 0.07
405 0.11
406 0.14
407 0.15
408 0.16
409 0.24
410 0.27
411 0.31
412 0.35
413 0.33
414 0.33
415 0.34
416 0.37
417 0.39
418 0.43
419 0.44
420 0.45
421 0.44
422 0.44
423 0.43
424 0.4
425 0.38
426 0.38
427 0.33
428 0.3
429 0.29
430 0.27
431 0.28
432 0.27
433 0.21
434 0.15
435 0.13
436 0.14
437 0.13
438 0.13
439 0.11
440 0.09
441 0.08
442 0.07
443 0.07
444 0.04
445 0.04
446 0.05
447 0.06
448 0.07
449 0.07
450 0.08
451 0.09
452 0.11
453 0.14
454 0.12
455 0.12
456 0.12
457 0.14
458 0.13
459 0.12
460 0.1
461 0.07
462 0.08
463 0.08
464 0.08
465 0.07
466 0.08
467 0.1
468 0.12
469 0.16
470 0.17
471 0.18
472 0.21
473 0.27
474 0.27
475 0.27
476 0.28
477 0.25
478 0.23
479 0.23
480 0.23
481 0.19
482 0.19
483 0.16
484 0.14
485 0.13
486 0.17
487 0.16
488 0.14
489 0.12
490 0.13
491 0.14
492 0.15
493 0.14
494 0.11
495 0.1
496 0.09
497 0.09
498 0.1
499 0.08
500 0.08
501 0.09
502 0.09
503 0.09
504 0.1
505 0.11
506 0.11
507 0.12
508 0.12
509 0.14
510 0.16
511 0.17
512 0.18
513 0.24
514 0.28
515 0.36
516 0.39
517 0.39
518 0.45
519 0.51
520 0.53
521 0.51
522 0.49
523 0.41
524 0.37
525 0.36
526 0.28
527 0.22
528 0.18
529 0.13
530 0.09
531 0.09
532 0.1
533 0.1
534 0.11
535 0.13
536 0.16
537 0.19
538 0.26
539 0.29
540 0.32
541 0.33
542 0.32
543 0.3
544 0.29
545 0.28
546 0.24
547 0.19
548 0.18
549 0.16
550 0.17
551 0.17
552 0.15
553 0.14
554 0.12
555 0.14
556 0.12
557 0.11
558 0.1
559 0.1
560 0.1
561 0.1
562 0.11
563 0.09
564 0.1
565 0.1
566 0.11
567 0.11
568 0.12
569 0.15
570 0.15
571 0.16
572 0.15
573 0.16
574 0.15
575 0.15
576 0.14
577 0.11
578 0.1
579 0.1
580 0.16
581 0.15
582 0.15
583 0.15
584 0.14
585 0.13
586 0.15
587 0.14
588 0.08
589 0.08
590 0.09
591 0.1
592 0.1
593 0.09
594 0.07
595 0.08
596 0.08
597 0.07
598 0.07
599 0.07
600 0.08
601 0.08
602 0.08
603 0.09
604 0.1
605 0.1
606 0.1
607 0.12
608 0.14
609 0.16
610 0.18
611 0.19
612 0.2
613 0.24
614 0.24
615 0.24
616 0.25
617 0.23
618 0.23
619 0.23
620 0.2
621 0.18
622 0.19
623 0.16
624 0.12
625 0.12
626 0.11
627 0.1
628 0.11
629 0.1
630 0.11
631 0.13
632 0.15
633 0.16
634 0.18
635 0.17
636 0.17
637 0.19
638 0.18
639 0.16
640 0.17
641 0.18
642 0.19
643 0.22
644 0.25
645 0.25
646 0.33
647 0.4
648 0.44
649 0.49
650 0.48
651 0.48
652 0.5
653 0.49
654 0.42
655 0.39
656 0.32
657 0.25
658 0.24
659 0.21
660 0.15
661 0.13
662 0.11
663 0.06
664 0.05
665 0.04
666 0.03
667 0.03
668 0.03
669 0.03
670 0.03
671 0.04
672 0.04
673 0.05
674 0.05
675 0.06
676 0.07
677 0.12
678 0.19
679 0.2
680 0.25
681 0.31
682 0.39
683 0.47
684 0.57
685 0.64
686 0.67
687 0.77
688 0.83
689 0.87
690 0.89
691 0.87
692 0.87
693 0.8
694 0.75
695 0.68
696 0.62
697 0.59
698 0.49
699 0.43
700 0.36
701 0.34
702 0.29
703 0.29
704 0.27
705 0.27
706 0.31
707 0.31
708 0.29
709 0.28
710 0.28
711 0.25
712 0.22
713 0.18
714 0.15
715 0.14
716 0.16
717 0.15
718 0.15
719 0.14
720 0.15
721 0.14
722 0.12
723 0.13
724 0.17
725 0.22
726 0.28
727 0.3
728 0.33
729 0.35
730 0.39
731 0.46
732 0.49
733 0.47
734 0.44
735 0.47
736 0.47
737 0.48
738 0.46
739 0.39
740 0.32
741 0.3
742 0.28
743 0.23
744 0.2
745 0.16
746 0.15
747 0.14
748 0.11
749 0.09
750 0.08
751 0.08
752 0.09
753 0.08
754 0.08
755 0.09
756 0.16
757 0.19
758 0.21
759 0.22
760 0.23
761 0.25
762 0.31
763 0.38
764 0.38
765 0.38
766 0.4
767 0.42
768 0.44
769 0.44
770 0.39
771 0.34
772 0.35
773 0.36
774 0.37
775 0.37
776 0.34
777 0.37
778 0.37
779 0.35
780 0.28
781 0.29
782 0.31
783 0.28
784 0.29
785 0.29
786 0.28
787 0.32
788 0.36
789 0.35
790 0.3
791 0.34
792 0.35
793 0.36
794 0.41
795 0.41
796 0.42
797 0.39
798 0.42
799 0.39
800 0.35
801 0.29
802 0.25
803 0.2
804 0.14
805 0.13
806 0.08
807 0.13
808 0.13
809 0.15
810 0.15
811 0.14
812 0.13
813 0.14
814 0.15
815 0.1
816 0.13
817 0.12
818 0.11
819 0.13
820 0.13
821 0.14
822 0.14
823 0.14
824 0.13
825 0.15
826 0.15
827 0.16
828 0.18
829 0.2
830 0.24
831 0.27
832 0.27
833 0.25
834 0.25
835 0.27
836 0.34
837 0.31
838 0.27
839 0.25
840 0.24
841 0.24
842 0.26
843 0.21
844 0.13
845 0.14
846 0.13
847 0.13
848 0.2
849 0.24
850 0.26
851 0.32
852 0.4
853 0.45
854 0.51
855 0.58
856 0.61
857 0.63
858 0.67
859 0.63
860 0.6
861 0.64
862 0.64
863 0.58
864 0.55
865 0.48
866 0.44
867 0.47
868 0.42
869 0.34
870 0.29
871 0.27
872 0.21
873 0.19
874 0.16
875 0.1
876 0.1
877 0.09
878 0.07
879 0.07
880 0.07
881 0.08
882 0.08
883 0.09
884 0.14
885 0.16
886 0.19
887 0.26
888 0.29
889 0.28
890 0.3
891 0.36
892 0.39
893 0.4