FuNGI

A0A316U7Y4

Protein Details

Accession

A0A316U7Y4

Localization Confidence

High

Confidence Score

18.6

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
84-113	SSATAAPARNTKKNKKKKKEEGAEARVKLK	Hydrophilic
527-546	GPKSDNKKQKGPSKKSTAGQ	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
28-40	RGGKRGRGRGGSK
91-113	ARNTKKNKKKKKEEGAEARVKLK
401-431	KKAEAASKASARGKGASGSGAAGAKGKSGKG
451-457	KEKGKGK
481-484	KKDK
602-632	PKNAGRGGRGGRAGGGGGAGRGGGGRGGGTG

Subcellular Location(s)

nucl 16, cyto_nucl 10, mito 9

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR012677 Nucleotide-bd_a/b_plait_sf IPR035979 RBD_domain_sf IPR039722 Upf3 IPR005120 UPF3_dom
Gene Ontology	GO:0003676 F:nucleic acid binding GO:0000184 P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay
Pfam	View protein in Pfam PF03467 Smg4_UPF3
CDD	cd12455 RRM_like_Smg4_UPF3

Amino Acid Sequences

MPRPRPEQPVGTNGAASPPNGAAATSGRGGKRGRGRGGSKLEPPFPHAASNPQGGRASVSNGDSIPKTNPSASKGLNKAGAANSSATAAPARNTKKNKKKKKEEGAEARVKLKVVVRRLPPHLPEEIFWRSVEPWTGKQTLEGKKPPVGQAAKGKETKVKQPEATQAAAEESSTTAAGQDTEMKDGEAKIAPDATPTTTEAKPIPVKSGPLIDLGSPGQDKLAWRRYLPGKFKSSGPSFGSASASGSASTSAAAASRDPSILHTYSRAYLRFKTLPDLVEFHRNFDGHVFRDAAGNQSVALVEWAPYQKCPPLGATAGGGKKRDKKEGSIEEDPDYLEFIKTLAGPGGGGDGSEAGAAGEKSREKTDTELMAHLTSSHASRDALQEASKHTPLLEHLRNQKKAEAASKASARGKGASGSGAAGAKGKSGKGIASQTSAAANALAHRAGQSKEKGKGKASNIAHSTTGGAAPAIPTGPKSVKKDKSKVKSSGATPVVSKNKSQHENDTSSTSIKIDAATASALPTPIGPKSDNKKQKGPSKKSTAGQAGAAAPQSQSQAQPVILKRAEGQESAGVPANTTAATSAGGSGEIQDSQARLPPTGPKNAGRGGRGGRAGGGGGAGRGGGGRGGGTGGAGGGGGPAPT

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.39
2	0.32
3	0.27
4	0.22
5	0.16
6	0.16
7	0.15
8	0.15
9	0.12
10	0.13
11	0.16
12	0.16
13	0.2
14	0.19
15	0.24
16	0.26
17	0.32
18	0.4
19	0.46
20	0.51
21	0.55
22	0.59
23	0.63
24	0.7
25	0.69
26	0.67
27	0.65
28	0.64
29	0.57
30	0.58
31	0.55
32	0.47
33	0.45
34	0.39
35	0.38
36	0.37
37	0.42
38	0.38
39	0.36
40	0.36
41	0.32
42	0.34
43	0.28
44	0.28
45	0.24
46	0.24
47	0.21
48	0.2
49	0.23
50	0.21
51	0.22
52	0.21
53	0.21
54	0.23
55	0.25
56	0.29
57	0.31
58	0.36
59	0.38
60	0.43
61	0.44
62	0.46
63	0.45
64	0.42
65	0.41
66	0.37
67	0.35
68	0.28
69	0.25
70	0.2
71	0.18
72	0.17
73	0.14
74	0.13
75	0.12
76	0.13
77	0.2
78	0.26
79	0.33
80	0.43
81	0.54
82	0.63
83	0.74
84	0.83
85	0.86
86	0.91
87	0.93
88	0.95
89	0.95
90	0.95
91	0.95
92	0.93
93	0.91
94	0.83
95	0.74
96	0.64
97	0.54
98	0.46
99	0.4
100	0.36
101	0.34
102	0.39
103	0.44
104	0.5
105	0.55
106	0.59
107	0.56
108	0.54
109	0.52
110	0.45
111	0.38
112	0.38
113	0.36
114	0.31
115	0.28
116	0.26
117	0.22
118	0.22
119	0.27
120	0.24
121	0.24
122	0.28
123	0.3
124	0.28
125	0.33
126	0.39
127	0.42
128	0.47
129	0.48
130	0.46
131	0.49
132	0.53
133	0.5
134	0.5
135	0.45
136	0.41
137	0.45
138	0.48
139	0.5
140	0.49
141	0.48
142	0.46
143	0.47
144	0.51
145	0.5
146	0.5
147	0.46
148	0.48
149	0.55
150	0.52
151	0.5
152	0.41
153	0.33
154	0.28
155	0.25
156	0.2
157	0.12
158	0.08
159	0.07
160	0.07
161	0.06
162	0.05
163	0.06
164	0.06
165	0.06
166	0.11
167	0.11
168	0.13
169	0.13
170	0.13
171	0.14
172	0.14
173	0.15
174	0.12
175	0.12
176	0.11
177	0.12
178	0.11
179	0.12
180	0.13
181	0.12
182	0.11
183	0.13
184	0.17
185	0.16
186	0.18
187	0.17
188	0.22
189	0.25
190	0.24
191	0.27
192	0.24
193	0.25
194	0.24
195	0.27
196	0.22
197	0.19
198	0.19
199	0.15
200	0.15
201	0.14
202	0.14
203	0.11
204	0.1
205	0.08
206	0.09
207	0.1
208	0.16
209	0.25
210	0.25
211	0.25
212	0.32
213	0.39
214	0.46
215	0.52
216	0.52
217	0.49
218	0.49
219	0.51
220	0.52
221	0.47
222	0.45
223	0.39
224	0.35
225	0.31
226	0.3
227	0.29
228	0.22
229	0.2
230	0.15
231	0.13
232	0.09
233	0.09
234	0.08
235	0.06
236	0.06
237	0.05
238	0.04
239	0.05
240	0.05
241	0.05
242	0.06
243	0.07
244	0.07
245	0.07
246	0.09
247	0.12
248	0.13
249	0.13
250	0.13
251	0.14
252	0.17
253	0.19
254	0.2
255	0.19
256	0.19
257	0.25
258	0.26
259	0.26
260	0.27
261	0.26
262	0.25
263	0.24
264	0.25
265	0.21
266	0.28
267	0.27
268	0.26
269	0.26
270	0.24
271	0.23
272	0.23
273	0.25
274	0.16
275	0.18
276	0.17
277	0.14
278	0.16
279	0.16
280	0.15
281	0.13
282	0.11
283	0.09
284	0.08
285	0.08
286	0.06
287	0.06
288	0.04
289	0.04
290	0.06
291	0.08
292	0.08
293	0.08
294	0.09
295	0.11
296	0.12
297	0.12
298	0.11
299	0.12
300	0.13
301	0.13
302	0.13
303	0.15
304	0.18
305	0.19
306	0.19
307	0.2
308	0.27
309	0.29
310	0.36
311	0.33
312	0.34
313	0.41
314	0.47
315	0.52
316	0.48
317	0.47
318	0.41
319	0.39
320	0.35
321	0.26
322	0.19
323	0.12
324	0.08
325	0.06
326	0.05
327	0.05
328	0.05
329	0.05
330	0.05
331	0.04
332	0.04
333	0.04
334	0.05
335	0.04
336	0.04
337	0.03
338	0.03
339	0.03
340	0.03
341	0.03
342	0.02
343	0.03
344	0.03
345	0.04
346	0.05
347	0.06
348	0.08
349	0.09
350	0.11
351	0.11
352	0.14
353	0.18
354	0.2
355	0.2
356	0.2
357	0.2
358	0.19
359	0.18
360	0.15
361	0.11
362	0.09
363	0.08
364	0.07
365	0.07
366	0.07
367	0.09
368	0.11
369	0.12
370	0.12
371	0.13
372	0.13
373	0.16
374	0.2
375	0.19
376	0.17
377	0.15
378	0.15
379	0.17
380	0.24
381	0.24
382	0.26
383	0.35
384	0.44
385	0.48
386	0.49
387	0.48
388	0.43
389	0.42
390	0.41
391	0.37
392	0.31
393	0.32
394	0.32
395	0.35
396	0.35
397	0.33
398	0.29
399	0.25
400	0.23
401	0.2
402	0.18
403	0.14
404	0.12
405	0.1
406	0.1
407	0.09
408	0.08
409	0.09
410	0.08
411	0.09
412	0.1
413	0.1
414	0.09
415	0.1
416	0.1
417	0.13
418	0.16
419	0.16
420	0.18
421	0.18
422	0.17
423	0.17
424	0.17
425	0.13
426	0.09
427	0.08
428	0.07
429	0.08
430	0.07
431	0.06
432	0.07
433	0.1
434	0.11
435	0.16
436	0.22
437	0.27
438	0.34
439	0.41
440	0.43
441	0.46
442	0.52
443	0.5
444	0.53
445	0.5
446	0.5
447	0.46
448	0.44
449	0.4
450	0.33
451	0.3
452	0.21
453	0.18
454	0.11
455	0.08
456	0.07
457	0.06
458	0.06
459	0.06
460	0.05
461	0.06
462	0.1
463	0.14
464	0.2
465	0.27
466	0.37
467	0.46
468	0.55
469	0.64
470	0.71
471	0.76
472	0.79
473	0.8
474	0.77
475	0.74
476	0.67
477	0.67
478	0.6
479	0.52
480	0.44
481	0.45
482	0.45
483	0.4
484	0.41
485	0.37
486	0.43
487	0.49
488	0.5
489	0.52
490	0.51
491	0.54
492	0.53
493	0.51
494	0.44
495	0.38
496	0.35
497	0.26
498	0.2
499	0.16
500	0.14
501	0.11
502	0.1
503	0.09
504	0.09
505	0.09
506	0.09
507	0.09
508	0.09
509	0.08
510	0.08
511	0.1
512	0.1
513	0.13
514	0.14
515	0.22
516	0.3
517	0.4
518	0.49
519	0.53
520	0.61
521	0.67
522	0.75
523	0.78
524	0.79
525	0.79
526	0.79
527	0.81
528	0.76
529	0.76
530	0.72
531	0.63
532	0.55
533	0.47
534	0.38
535	0.32
536	0.29
537	0.21
538	0.15
539	0.14
540	0.15
541	0.14
542	0.13
543	0.14
544	0.15
545	0.16
546	0.23
547	0.24
548	0.3
549	0.29
550	0.3
551	0.3
552	0.34
553	0.35
554	0.29
555	0.29
556	0.24
557	0.25
558	0.26
559	0.28
560	0.21
561	0.19
562	0.19
563	0.17
564	0.13
565	0.12
566	0.1
567	0.06
568	0.07
569	0.07
570	0.07
571	0.07
572	0.07
573	0.07
574	0.08
575	0.09
576	0.08
577	0.09
578	0.1
579	0.1
580	0.11
581	0.16
582	0.16
583	0.15
584	0.17
585	0.26
586	0.3
587	0.38
588	0.42
589	0.42
590	0.46
591	0.52
592	0.55
593	0.48
594	0.49
595	0.45
596	0.47
597	0.44
598	0.39
599	0.33
600	0.29
601	0.27
602	0.2
603	0.17
604	0.11
605	0.09
606	0.08
607	0.07
608	0.06
609	0.06
610	0.06
611	0.05
612	0.05
613	0.05
614	0.05
615	0.06
616	0.06
617	0.06
618	0.05
619	0.05
620	0.05
621	0.04
622	0.04
623	0.04

A0A316U7Y4

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer