FuNGI

A0A316U4N1

Protein Details

Accession

A0A316U4N1

Localization Confidence

Low

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
979-998	IYDLGKKKLLRKCENRGFPT	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

cyto 12, mito 7, cyto_pero 7

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR004871 Cleavage/polyA-sp_fac_asu_C IPR018846 Cleavage/polyA-sp_fac_asu_N IPR015943 WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf IPR036322 WD40_repeat_dom_sf
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003676 F:nucleic acid binding
Pfam	View protein in Pfam PF03178 CPSF_A PF10433 MMS1_N

Amino Acid Sequences

MHLYNATLSPPSAITASVVGQFSGTRQQEIVVCRGGTRLELLRPDTSVTGKAKSIFEQDAFGIVRSLASFRLTGGSKDYLIIGSDSGRITIAELDSRANAFVIVHQETFGRSGSRRIVPGQYLASDPKGRAVMIGAMEKSKLVYILNRDAAANLTISSPLEAHKPNAIIHALVGLDVGFENPTFAALEVDYEEADRDSTGEAYHTTEKLLTYYELDLGLNHVVRRWSSPVDPRSSYLIQVPGGYNQNTERWEGPGGVLVCSEDYITYKHSVGEEHRVAIPRRLNPVEKKEERRGTIVTASVCHRMKNNFFFLVQNEDGDLFKITIDHEDEDIKSLNIKYFDTVPLATSLNILRAGFLFVAAEYGASHLYSFQKLGDDDDIPTYSSTSYPALGMTDTPIEPPTFTPRELENLLLTDNLSALDPILDAQVFNATASDSPQIFTACGRGPRSTFRMLQHGLEVQEAVSSDLPGIPNAIWTTRLRSADEYDSYIVLSFVNGTLILSIGETIEEVNDSGFLTSAPTLAVQQLGADALLQVHPKGIRHIMPDRRVVEWAAPAMPNGEQTTIVAAATNERQVVVALAPTNELVYFEQDMDGQLNEYQERKSMGSRVITLSMADPPEGRQRTPYLAVGCEDSTVRIISLDPESTLASISIQALTAPPNSICVAEMRDVTIDRNHATMFVNIGLRNGVLLRTVLDPISGQLTDTRTRFLGAKPVRLVRVKLQGGEPGVLALGSRPWLNYAHQSRTHFTPLIFDALDHAWTFNAEMCPDGLIGIVGGSLRIFTIPTLGTKLKSDSVPLSYTPRRMTPHPANNGIFYLAEADHRTLSSWEQERRIAAMAKEPKPAQRGVLDLDPADFGPIRAEAGQWSSCIRVVDALSSTTAHRIELENNEAAFSVAVIPFANSAQQSAEDPDLYLVVGTAADTIVTPRTIRQAFLTTYKIIDGGKSLQFVHKTEVEDVPIALRRFQGRLLAGVGSTLRIYDLGKKKLLRKCENRGFPTAITCLHTQGSRIIVGDMQESTMYVTYKSAENRLIIFADDIQPRWTTAVTMLDYDTVAAGDKFGNIFINRLDSGVSQTVDEDPTGLTVLHEKPYLQGAPHRLALQAHYYLGDIVTAIHRVALAPGGRDVILYTCLGGTIGVLIPFVSKEDIEMLSTLEMALRQEASIASASASAAVAASSSLVGRDHLAYRGFYAPVKSVIDGDLCETYGLLNHNRQAALAEQLDRSTAEVNKKLETLRTASAF

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.11
2	0.12
3	0.13
4	0.15
5	0.15
6	0.14
7	0.14
8	0.14
9	0.15
10	0.22
11	0.22
12	0.2
13	0.2
14	0.22
15	0.26
16	0.3
17	0.32
18	0.28
19	0.27
20	0.25
21	0.27
22	0.25
23	0.21
24	0.22
25	0.22
26	0.22
27	0.27
28	0.3
29	0.31
30	0.31
31	0.32
32	0.3
33	0.28
34	0.3
35	0.28
36	0.27
37	0.28
38	0.31
39	0.31
40	0.32
41	0.36
42	0.33
43	0.31
44	0.31
45	0.28
46	0.29
47	0.27
48	0.25
49	0.2
50	0.15
51	0.15
52	0.13
53	0.14
54	0.1
55	0.11
56	0.11
57	0.11
58	0.16
59	0.17
60	0.17
61	0.21
62	0.23
63	0.21
64	0.22
65	0.22
66	0.17
67	0.17
68	0.16
69	0.12
70	0.11
71	0.13
72	0.13
73	0.12
74	0.12
75	0.11
76	0.11
77	0.13
78	0.13
79	0.13
80	0.14
81	0.15
82	0.16
83	0.17
84	0.16
85	0.13
86	0.12
87	0.1
88	0.12
89	0.16
90	0.18
91	0.17
92	0.17
93	0.18
94	0.18
95	0.2
96	0.18
97	0.16
98	0.15
99	0.2
100	0.27
101	0.3
102	0.32
103	0.35
104	0.39
105	0.38
106	0.41
107	0.38
108	0.33
109	0.31
110	0.31
111	0.32
112	0.3
113	0.27
114	0.27
115	0.26
116	0.24
117	0.21
118	0.2
119	0.19
120	0.19
121	0.23
122	0.19
123	0.19
124	0.19
125	0.19
126	0.18
127	0.14
128	0.12
129	0.1
130	0.14
131	0.2
132	0.27
133	0.3
134	0.3
135	0.3
136	0.29
137	0.3
138	0.26
139	0.19
140	0.12
141	0.1
142	0.1
143	0.1
144	0.1
145	0.09
146	0.09
147	0.14
148	0.16
149	0.17
150	0.21
151	0.22
152	0.22
153	0.26
154	0.25
155	0.2
156	0.18
157	0.18
158	0.14
159	0.12
160	0.11
161	0.07
162	0.06
163	0.06
164	0.06
165	0.05
166	0.05
167	0.05
168	0.05
169	0.06
170	0.06
171	0.06
172	0.07
173	0.06
174	0.08
175	0.08
176	0.09
177	0.08
178	0.08
179	0.08
180	0.08
181	0.08
182	0.07
183	0.07
184	0.07
185	0.07
186	0.08
187	0.08
188	0.09
189	0.12
190	0.16
191	0.15
192	0.15
193	0.16
194	0.16
195	0.16
196	0.17
197	0.14
198	0.13
199	0.14
200	0.14
201	0.13
202	0.13
203	0.12
204	0.12
205	0.14
206	0.13
207	0.12
208	0.13
209	0.14
210	0.15
211	0.19
212	0.21
213	0.22
214	0.26
215	0.35
216	0.4
217	0.45
218	0.46
219	0.45
220	0.48
221	0.45
222	0.41
223	0.35
224	0.31
225	0.25
226	0.26
227	0.24
228	0.22
229	0.25
230	0.24
231	0.22
232	0.21
233	0.24
234	0.23
235	0.25
236	0.22
237	0.2
238	0.21
239	0.19
240	0.18
241	0.19
242	0.19
243	0.16
244	0.15
245	0.13
246	0.12
247	0.11
248	0.11
249	0.06
250	0.07
251	0.08
252	0.1
253	0.12
254	0.13
255	0.14
256	0.14
257	0.17
258	0.19
259	0.27
260	0.26
261	0.26
262	0.29
263	0.32
264	0.34
265	0.37
266	0.39
267	0.34
268	0.41
269	0.43
270	0.47
271	0.5
272	0.57
273	0.61
274	0.64
275	0.67
276	0.7
277	0.72
278	0.68
279	0.64
280	0.57
281	0.5
282	0.44
283	0.4
284	0.31
285	0.26
286	0.25
287	0.29
288	0.28
289	0.26
290	0.27
291	0.3
292	0.36
293	0.4
294	0.42
295	0.36
296	0.37
297	0.37
298	0.35
299	0.36
300	0.3
301	0.24
302	0.19
303	0.18
304	0.17
305	0.16
306	0.15
307	0.08
308	0.07
309	0.08
310	0.07
311	0.09
312	0.11
313	0.11
314	0.12
315	0.13
316	0.14
317	0.15
318	0.16
319	0.13
320	0.14
321	0.14
322	0.15
323	0.15
324	0.15
325	0.15
326	0.16
327	0.18
328	0.17
329	0.17
330	0.14
331	0.15
332	0.15
333	0.14
334	0.13
335	0.12
336	0.11
337	0.13
338	0.12
339	0.1
340	0.1
341	0.11
342	0.09
343	0.09
344	0.07
345	0.05
346	0.06
347	0.06
348	0.05
349	0.04
350	0.05
351	0.05
352	0.05
353	0.05
354	0.06
355	0.08
356	0.09
357	0.1
358	0.09
359	0.11
360	0.12
361	0.14
362	0.15
363	0.14
364	0.14
365	0.15
366	0.15
367	0.14
368	0.14
369	0.12
370	0.1
371	0.09
372	0.1
373	0.09
374	0.09
375	0.08
376	0.08
377	0.08
378	0.08
379	0.08
380	0.08
381	0.09
382	0.08
383	0.09
384	0.1
385	0.1
386	0.1
387	0.11
388	0.17
389	0.18
390	0.18
391	0.19
392	0.19
393	0.23
394	0.24
395	0.24
396	0.17
397	0.15
398	0.15
399	0.13
400	0.13
401	0.08
402	0.07
403	0.06
404	0.05
405	0.05
406	0.04
407	0.04
408	0.04
409	0.04
410	0.05
411	0.04
412	0.04
413	0.04
414	0.05
415	0.05
416	0.05
417	0.05
418	0.05
419	0.05
420	0.07
421	0.09
422	0.08
423	0.08
424	0.09
425	0.1
426	0.09
427	0.09
428	0.11
429	0.12
430	0.16
431	0.18
432	0.19
433	0.2
434	0.25
435	0.3
436	0.31
437	0.33
438	0.3
439	0.36
440	0.35
441	0.34
442	0.31
443	0.29
444	0.25
445	0.21
446	0.19
447	0.11
448	0.1
449	0.09
450	0.08
451	0.06
452	0.06
453	0.06
454	0.07
455	0.07
456	0.06
457	0.07
458	0.06
459	0.07
460	0.08
461	0.08
462	0.09
463	0.1
464	0.15
465	0.19
466	0.2
467	0.2
468	0.22
469	0.25
470	0.26
471	0.27
472	0.24
473	0.2
474	0.19
475	0.17
476	0.15
477	0.12
478	0.08
479	0.06
480	0.05
481	0.04
482	0.04
483	0.04
484	0.04
485	0.03
486	0.04
487	0.04
488	0.03
489	0.03
490	0.03
491	0.03
492	0.03
493	0.03
494	0.03
495	0.03
496	0.03
497	0.03
498	0.03
499	0.03
500	0.03
501	0.04
502	0.04
503	0.04
504	0.04
505	0.05
506	0.04
507	0.05
508	0.05
509	0.05
510	0.06
511	0.05
512	0.04
513	0.04
514	0.04
515	0.04
516	0.03
517	0.03
518	0.03
519	0.04
520	0.05
521	0.05
522	0.06
523	0.07
524	0.08
525	0.1
526	0.12
527	0.13
528	0.17
529	0.25
530	0.31
531	0.34
532	0.4
533	0.4
534	0.38
535	0.37
536	0.33
537	0.26
538	0.2
539	0.17
540	0.12
541	0.1
542	0.09
543	0.09
544	0.09
545	0.09
546	0.08
547	0.08
548	0.07
549	0.07
550	0.08
551	0.07
552	0.07
553	0.06
554	0.05
555	0.06
556	0.07
557	0.08
558	0.07
559	0.06
560	0.07
561	0.06
562	0.07
563	0.05
564	0.06
565	0.05
566	0.06
567	0.06
568	0.06
569	0.06
570	0.05
571	0.06
572	0.05
573	0.06
574	0.07
575	0.07
576	0.07
577	0.07
578	0.07
579	0.07
580	0.07
581	0.06
582	0.06
583	0.06
584	0.07
585	0.08
586	0.08
587	0.08
588	0.1
589	0.1
590	0.11
591	0.13
592	0.15
593	0.15
594	0.17
595	0.17
596	0.17
597	0.16
598	0.15
599	0.13
600	0.12
601	0.1
602	0.09
603	0.08
604	0.08
605	0.16
606	0.17
607	0.16
608	0.16
609	0.18
610	0.2
611	0.22
612	0.23
613	0.17
614	0.16
615	0.17
616	0.16
617	0.14
618	0.13
619	0.11
620	0.08
621	0.07
622	0.07
623	0.06
624	0.05
625	0.05
626	0.06
627	0.07
628	0.07
629	0.06
630	0.07
631	0.07
632	0.07
633	0.07
634	0.06
635	0.05
636	0.05
637	0.05
638	0.05
639	0.04
640	0.04
641	0.05
642	0.06
643	0.06
644	0.06
645	0.06
646	0.07
647	0.08
648	0.08
649	0.08
650	0.07
651	0.09
652	0.09
653	0.1
654	0.09
655	0.09
656	0.09
657	0.1
658	0.11
659	0.1
660	0.1
661	0.1
662	0.1
663	0.1
664	0.11
665	0.1
666	0.1
667	0.1
668	0.11
669	0.1
670	0.11
671	0.09
672	0.08
673	0.08
674	0.07
675	0.06
676	0.04
677	0.04
678	0.05
679	0.06
680	0.07
681	0.07
682	0.07
683	0.07
684	0.07
685	0.08
686	0.07
687	0.06
688	0.08
689	0.1
690	0.14
691	0.14
692	0.15
693	0.13
694	0.15
695	0.16
696	0.14
697	0.22
698	0.21
699	0.26
700	0.27
701	0.3
702	0.33
703	0.33
704	0.35
705	0.3
706	0.37
707	0.32
708	0.31
709	0.29
710	0.28
711	0.27
712	0.25
713	0.2
714	0.11
715	0.1
716	0.08
717	0.07
718	0.04
719	0.04
720	0.04
721	0.04
722	0.04
723	0.06
724	0.08
725	0.09
726	0.17
727	0.22
728	0.27
729	0.32
730	0.35
731	0.36
732	0.38
733	0.41
734	0.34
735	0.28
736	0.26
737	0.22
738	0.22
739	0.19
740	0.15
741	0.14
742	0.13
743	0.13
744	0.1
745	0.09
746	0.07
747	0.07
748	0.07
749	0.08
750	0.08
751	0.07
752	0.07
753	0.07
754	0.08
755	0.08
756	0.07
757	0.05
758	0.04
759	0.04
760	0.03
761	0.03
762	0.03
763	0.03
764	0.02
765	0.03
766	0.03
767	0.03
768	0.03
769	0.03
770	0.05
771	0.06
772	0.07
773	0.11
774	0.12
775	0.13
776	0.14
777	0.16
778	0.17
779	0.17
780	0.18
781	0.16
782	0.18
783	0.18
784	0.19
785	0.24
786	0.24
787	0.28
788	0.27
789	0.29
790	0.3
791	0.31
792	0.39
793	0.42
794	0.48
795	0.5
796	0.55
797	0.51
798	0.49
799	0.47
800	0.39
801	0.29
802	0.2
803	0.16
804	0.09
805	0.1
806	0.1
807	0.1
808	0.1
809	0.1
810	0.1
811	0.1
812	0.11
813	0.16
814	0.21
815	0.23
816	0.26
817	0.27
818	0.27
819	0.27
820	0.29
821	0.25
822	0.2
823	0.24
824	0.31
825	0.31
826	0.35
827	0.35
828	0.37
829	0.38
830	0.38
831	0.32
832	0.25
833	0.25
834	0.23
835	0.24
836	0.21
837	0.18
838	0.17
839	0.15
840	0.13
841	0.12
842	0.09
843	0.07
844	0.07
845	0.07
846	0.07
847	0.07
848	0.07
849	0.07
850	0.1
851	0.11
852	0.1
853	0.11
854	0.11
855	0.13
856	0.13
857	0.12
858	0.11
859	0.11
860	0.12
861	0.12
862	0.12
863	0.11
864	0.11
865	0.12
866	0.12
867	0.12
868	0.1
869	0.11
870	0.12
871	0.15
872	0.17
873	0.21
874	0.2
875	0.2
876	0.2
877	0.19
878	0.17
879	0.14
880	0.1
881	0.08
882	0.06
883	0.06
884	0.06
885	0.06
886	0.06
887	0.07
888	0.08
889	0.06
890	0.07
891	0.07
892	0.08
893	0.09
894	0.11
895	0.12
896	0.11
897	0.11
898	0.1
899	0.1
900	0.09
901	0.08
902	0.05
903	0.04
904	0.04
905	0.03
906	0.03
907	0.03
908	0.03
909	0.03
910	0.04
911	0.06
912	0.06
913	0.07
914	0.08
915	0.15
916	0.16
917	0.17
918	0.19
919	0.22
920	0.24
921	0.28
922	0.31
923	0.24
924	0.24
925	0.23
926	0.22
927	0.17
928	0.15
929	0.13
930	0.14
931	0.15
932	0.16
933	0.17
934	0.2
935	0.22
936	0.23
937	0.25
938	0.24
939	0.25
940	0.26
941	0.27
942	0.25
943	0.23
944	0.21
945	0.2
946	0.21
947	0.19
948	0.18
949	0.19
950	0.19
951	0.2
952	0.21
953	0.24
954	0.19
955	0.2
956	0.21
957	0.19
958	0.16
959	0.16
960	0.15
961	0.1
962	0.09
963	0.08
964	0.06
965	0.06
966	0.08
967	0.16
968	0.24
969	0.28
970	0.33
971	0.38
972	0.47
973	0.51
974	0.61
975	0.62
976	0.64
977	0.7
978	0.75
979	0.8
980	0.76
981	0.77
982	0.7
983	0.61
984	0.55
985	0.46
986	0.37
987	0.31
988	0.27
989	0.23
990	0.21
991	0.2
992	0.18
993	0.18
994	0.18
995	0.16
996	0.16
997	0.14
998	0.14
999	0.14
1000	0.15
1001	0.12
1002	0.1
1003	0.09
1004	0.09
1005	0.09
1006	0.1
1007	0.1
1008	0.08
1009	0.09
1010	0.1
1011	0.14
1012	0.16
1013	0.19
1014	0.2
1015	0.22
1016	0.23
1017	0.24
1018	0.23
1019	0.2
1020	0.19
1021	0.16
1022	0.2
1023	0.2
1024	0.19
1025	0.19
1026	0.19
1027	0.19
1028	0.19
1029	0.18
1030	0.12
1031	0.13
1032	0.17
1033	0.16
1034	0.17
1035	0.17
1036	0.16
1037	0.16
1038	0.15
1039	0.13
1040	0.07
1041	0.07
1042	0.06
1043	0.06
1044	0.06
1045	0.07
1046	0.07
1047	0.08
1048	0.11
1049	0.11
1050	0.12
1051	0.12
1052	0.16
1053	0.16
1054	0.16
1055	0.16
1056	0.13
1057	0.17
1058	0.19
1059	0.19
1060	0.15
1061	0.16
1062	0.17
1063	0.17
1064	0.16
1065	0.12
1066	0.09
1067	0.09
1068	0.1
1069	0.09
1070	0.07
1071	0.11
1072	0.14
1073	0.16
1074	0.17
1075	0.16
1076	0.17
1077	0.22
1078	0.24
1079	0.21
1080	0.24
1081	0.27
1082	0.31
1083	0.33
1084	0.33
1085	0.29
1086	0.29
1087	0.29
1088	0.28
1089	0.24
1090	0.21
1091	0.18
1092	0.18
1093	0.17
1094	0.15
1095	0.13
1096	0.08
1097	0.07
1098	0.08
1099	0.08
1100	0.08
1101	0.08
1102	0.08
1103	0.08
1104	0.09
1105	0.12
1106	0.12
1107	0.12
1108	0.13
1109	0.15
1110	0.14
1111	0.14
1112	0.14
1113	0.11
1114	0.12
1115	0.11
1116	0.1
1117	0.09
1118	0.09
1119	0.09
1120	0.08
1121	0.06
1122	0.06
1123	0.07
1124	0.07
1125	0.07
1126	0.07
1127	0.08
1128	0.08
1129	0.09
1130	0.09
1131	0.07
1132	0.08
1133	0.11
1134	0.12
1135	0.13
1136	0.13
1137	0.13
1138	0.11
1139	0.11
1140	0.1
1141	0.08
1142	0.08
1143	0.08
1144	0.09
1145	0.09
1146	0.08
1147	0.09
1148	0.09
1149	0.11
1150	0.11
1151	0.1
1152	0.09
1153	0.09
1154	0.09
1155	0.09
1156	0.09
1157	0.07
1158	0.06
1159	0.05
1160	0.05
1161	0.04
1162	0.05
1163	0.04
1164	0.05
1165	0.06
1166	0.06
1167	0.07
1168	0.09
1169	0.12
1170	0.14
1171	0.17
1172	0.19
1173	0.19
1174	0.22
1175	0.25
1176	0.24
1177	0.23
1178	0.24
1179	0.23
1180	0.25
1181	0.26
1182	0.24
1183	0.22
1184	0.22
1185	0.22
1186	0.19
1187	0.2
1188	0.17
1189	0.15
1190	0.14
1191	0.13
1192	0.11
1193	0.12
1194	0.16
1195	0.18
1196	0.22
1197	0.25
1198	0.29
1199	0.29
1200	0.29
1201	0.28
1202	0.26
1203	0.27
1204	0.25
1205	0.25
1206	0.22
1207	0.22
1208	0.23
1209	0.21
1210	0.21
1211	0.19
1212	0.21
1213	0.26
1214	0.32
1215	0.34
1216	0.35
1217	0.38
1218	0.39
1219	0.39
1220	0.39
1221	0.36

A0A316U4N1

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer