Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A316UIH2

Protein Details
Accession A0A316UIH2    Localization Confidence High Confidence Score 20.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
6-29SLYNWSRSTRQILKRNRKSPASFYHydrophilic
398-421ANGTVKKSSSKKRKKQDTEPVADEHydrophilic
432-452AVAPKSKKKKTTKAASPPAEKHydrophilic
470-490EPEKKAKSKSKSKKAVATKETHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
404-412KSSSKKRKK
434-484APKSKKKKTTKAASPPAEKEENETPTKGKKSVKSVPEPEKKAKSKSKSKKA
520-543GKGSKKTVAAKKTPAAPAKGKKTQ
Subcellular Location(s) nucl 11, mito 9.5, cyto_mito 8, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR021950  Spt20  
IPR046468  Spt20-like_SEP  
Gene Ontology GO:0000124  C:SAGA complex  
GO:0003712  F:transcription coregulator activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF12090  Spt20  
Amino Acid Sequences MATTGSLYNWSRSTRQILKRNRKSPASFYLHLHPAWFRFEDAKGRLLLEEPIPDDGGSIAGPSRGGKTMTPGRELLKCIRDQTLPNYALDVLDLRRIPFFDGCLIVEIKDHRPPVLPAAPASAVTSRIERRRAEEAELNPASLAARIEGGRYGKGTASLAAKAGQGDVSSSDNADGLGGAAVTPHGPETFRVVLRPNEATLWTDLRAMNEKLSGGTWSEEDALEIEANILTLTSAPLCLTPDPHATRIANIMAASTAPVSSYAPLQSLPHHRTLPPIEPPAALETEAEEEAGKEKSSEEQRETSERRQREAIMRIMQGGWKSAKDKQTPGRAVQANGNASAAPFLPNFHRLGFIERYRANTGRGNGDETAASTAEPAPAEADITDAKKEDAKTNGTTANGTVKKSSSKKRKKQDTEPVADEEEEKTKEEEAAVAPKSKKKKTTKAASPPAEKEENETPTKGKKSVKSVPEPEKKAKSKSKSKKAVATKETEAETAPTPATDAPTPSVNGDVEVVAAPQPGKGSKKTVAAKKTPAAPAKGKKTQAGAAAAAARRQSGTPSVHQASNPQPSPSRHGAASPFVPGTAATTPSPAISQQGVMGAPPFGNLPLGVGLPLSGNAHDASQSHLNLQLPQQQQQQQQQQQQQQQLAAMAAYYGGLQQQAGMGSNGRPASGPALNLPFGQAPMQNGSMAAFPNQQLNNMVRPPVMNFQQQQGANSQLTQLVQHLHQNPNLIHSLPPAMQAQLLHQLNGGGGNGAGRPQQQQGGNGGNRVPSGWPPGQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.45
2 0.53
3 0.59
4 0.67
5 0.75
6 0.83
7 0.86
8 0.86
9 0.86
10 0.82
11 0.8
12 0.79
13 0.76
14 0.69
15 0.65
16 0.64
17 0.59
18 0.53
19 0.47
20 0.4
21 0.34
22 0.35
23 0.32
24 0.27
25 0.25
26 0.29
27 0.35
28 0.35
29 0.36
30 0.32
31 0.32
32 0.3
33 0.28
34 0.27
35 0.21
36 0.22
37 0.19
38 0.2
39 0.2
40 0.19
41 0.17
42 0.15
43 0.13
44 0.09
45 0.08
46 0.07
47 0.07
48 0.08
49 0.09
50 0.11
51 0.13
52 0.15
53 0.15
54 0.22
55 0.31
56 0.34
57 0.36
58 0.36
59 0.38
60 0.4
61 0.44
62 0.44
63 0.41
64 0.41
65 0.4
66 0.42
67 0.42
68 0.42
69 0.43
70 0.46
71 0.4
72 0.37
73 0.36
74 0.32
75 0.28
76 0.25
77 0.21
78 0.12
79 0.16
80 0.17
81 0.16
82 0.17
83 0.18
84 0.2
85 0.19
86 0.2
87 0.17
88 0.18
89 0.18
90 0.19
91 0.19
92 0.16
93 0.18
94 0.2
95 0.21
96 0.24
97 0.25
98 0.23
99 0.26
100 0.27
101 0.32
102 0.34
103 0.31
104 0.26
105 0.29
106 0.28
107 0.26
108 0.27
109 0.2
110 0.16
111 0.16
112 0.21
113 0.23
114 0.29
115 0.35
116 0.34
117 0.38
118 0.45
119 0.46
120 0.47
121 0.48
122 0.43
123 0.47
124 0.46
125 0.41
126 0.32
127 0.3
128 0.24
129 0.18
130 0.16
131 0.07
132 0.08
133 0.08
134 0.09
135 0.13
136 0.14
137 0.14
138 0.15
139 0.15
140 0.14
141 0.15
142 0.15
143 0.15
144 0.16
145 0.15
146 0.15
147 0.15
148 0.16
149 0.14
150 0.14
151 0.11
152 0.09
153 0.08
154 0.09
155 0.1
156 0.1
157 0.1
158 0.1
159 0.09
160 0.09
161 0.08
162 0.07
163 0.05
164 0.04
165 0.04
166 0.03
167 0.03
168 0.04
169 0.04
170 0.04
171 0.04
172 0.05
173 0.06
174 0.07
175 0.13
176 0.17
177 0.18
178 0.19
179 0.22
180 0.25
181 0.28
182 0.29
183 0.24
184 0.21
185 0.21
186 0.21
187 0.21
188 0.2
189 0.16
190 0.18
191 0.17
192 0.18
193 0.22
194 0.21
195 0.2
196 0.19
197 0.18
198 0.16
199 0.15
200 0.14
201 0.1
202 0.1
203 0.09
204 0.09
205 0.1
206 0.1
207 0.09
208 0.09
209 0.09
210 0.08
211 0.07
212 0.06
213 0.05
214 0.05
215 0.05
216 0.04
217 0.03
218 0.03
219 0.04
220 0.04
221 0.04
222 0.04
223 0.05
224 0.07
225 0.07
226 0.09
227 0.12
228 0.19
229 0.22
230 0.23
231 0.27
232 0.25
233 0.26
234 0.27
235 0.24
236 0.18
237 0.15
238 0.13
239 0.09
240 0.09
241 0.08
242 0.06
243 0.05
244 0.04
245 0.05
246 0.05
247 0.06
248 0.07
249 0.07
250 0.08
251 0.08
252 0.09
253 0.13
254 0.21
255 0.24
256 0.27
257 0.28
258 0.28
259 0.33
260 0.36
261 0.36
262 0.33
263 0.33
264 0.3
265 0.28
266 0.29
267 0.26
268 0.22
269 0.18
270 0.12
271 0.1
272 0.1
273 0.1
274 0.09
275 0.07
276 0.07
277 0.08
278 0.09
279 0.08
280 0.06
281 0.07
282 0.12
283 0.19
284 0.22
285 0.24
286 0.26
287 0.29
288 0.36
289 0.41
290 0.44
291 0.45
292 0.43
293 0.43
294 0.42
295 0.43
296 0.42
297 0.43
298 0.4
299 0.37
300 0.35
301 0.33
302 0.31
303 0.3
304 0.23
305 0.2
306 0.15
307 0.12
308 0.14
309 0.19
310 0.25
311 0.27
312 0.33
313 0.38
314 0.46
315 0.48
316 0.48
317 0.51
318 0.46
319 0.44
320 0.41
321 0.39
322 0.3
323 0.27
324 0.25
325 0.17
326 0.15
327 0.14
328 0.1
329 0.07
330 0.06
331 0.07
332 0.08
333 0.11
334 0.12
335 0.11
336 0.13
337 0.12
338 0.17
339 0.21
340 0.21
341 0.24
342 0.24
343 0.27
344 0.29
345 0.3
346 0.28
347 0.26
348 0.27
349 0.26
350 0.25
351 0.24
352 0.21
353 0.2
354 0.17
355 0.14
356 0.14
357 0.09
358 0.08
359 0.06
360 0.06
361 0.06
362 0.06
363 0.06
364 0.05
365 0.05
366 0.05
367 0.04
368 0.05
369 0.05
370 0.06
371 0.07
372 0.07
373 0.07
374 0.1
375 0.11
376 0.13
377 0.15
378 0.18
379 0.18
380 0.2
381 0.22
382 0.19
383 0.19
384 0.16
385 0.21
386 0.2
387 0.19
388 0.18
389 0.17
390 0.23
391 0.29
392 0.38
393 0.41
394 0.51
395 0.59
396 0.69
397 0.79
398 0.81
399 0.86
400 0.87
401 0.85
402 0.81
403 0.74
404 0.66
405 0.56
406 0.48
407 0.38
408 0.28
409 0.21
410 0.16
411 0.14
412 0.12
413 0.11
414 0.11
415 0.1
416 0.1
417 0.08
418 0.12
419 0.12
420 0.17
421 0.18
422 0.23
423 0.3
424 0.33
425 0.42
426 0.46
427 0.55
428 0.6
429 0.69
430 0.75
431 0.78
432 0.84
433 0.81
434 0.78
435 0.7
436 0.65
437 0.58
438 0.47
439 0.41
440 0.36
441 0.34
442 0.3
443 0.29
444 0.25
445 0.28
446 0.31
447 0.31
448 0.31
449 0.31
450 0.38
451 0.45
452 0.51
453 0.54
454 0.6
455 0.65
456 0.69
457 0.7
458 0.68
459 0.7
460 0.67
461 0.67
462 0.67
463 0.66
464 0.68
465 0.73
466 0.77
467 0.78
468 0.79
469 0.8
470 0.8
471 0.81
472 0.75
473 0.7
474 0.61
475 0.54
476 0.5
477 0.41
478 0.32
479 0.24
480 0.2
481 0.15
482 0.13
483 0.09
484 0.09
485 0.09
486 0.11
487 0.09
488 0.1
489 0.1
490 0.12
491 0.12
492 0.12
493 0.13
494 0.11
495 0.11
496 0.1
497 0.08
498 0.08
499 0.07
500 0.07
501 0.06
502 0.06
503 0.06
504 0.06
505 0.07
506 0.09
507 0.12
508 0.14
509 0.19
510 0.22
511 0.3
512 0.37
513 0.43
514 0.48
515 0.51
516 0.54
517 0.53
518 0.56
519 0.54
520 0.51
521 0.49
522 0.5
523 0.53
524 0.56
525 0.59
526 0.55
527 0.51
528 0.5
529 0.48
530 0.44
531 0.38
532 0.3
533 0.25
534 0.27
535 0.24
536 0.23
537 0.19
538 0.15
539 0.14
540 0.13
541 0.14
542 0.15
543 0.18
544 0.19
545 0.27
546 0.29
547 0.3
548 0.3
549 0.33
550 0.35
551 0.39
552 0.38
553 0.33
554 0.35
555 0.36
556 0.43
557 0.43
558 0.39
559 0.31
560 0.33
561 0.33
562 0.31
563 0.3
564 0.25
565 0.2
566 0.18
567 0.17
568 0.14
569 0.15
570 0.12
571 0.13
572 0.11
573 0.12
574 0.13
575 0.13
576 0.14
577 0.11
578 0.12
579 0.1
580 0.1
581 0.1
582 0.11
583 0.11
584 0.1
585 0.1
586 0.08
587 0.08
588 0.08
589 0.07
590 0.06
591 0.06
592 0.06
593 0.06
594 0.07
595 0.07
596 0.06
597 0.06
598 0.06
599 0.06
600 0.07
601 0.07
602 0.06
603 0.07
604 0.07
605 0.08
606 0.09
607 0.09
608 0.12
609 0.16
610 0.16
611 0.16
612 0.19
613 0.2
614 0.21
615 0.24
616 0.28
617 0.26
618 0.31
619 0.37
620 0.4
621 0.46
622 0.53
623 0.61
624 0.6
625 0.66
626 0.69
627 0.71
628 0.71
629 0.7
630 0.64
631 0.55
632 0.48
633 0.4
634 0.32
635 0.24
636 0.16
637 0.1
638 0.07
639 0.06
640 0.05
641 0.04
642 0.04
643 0.05
644 0.05
645 0.05
646 0.06
647 0.07
648 0.08
649 0.08
650 0.09
651 0.1
652 0.15
653 0.15
654 0.14
655 0.13
656 0.13
657 0.18
658 0.18
659 0.18
660 0.18
661 0.21
662 0.22
663 0.22
664 0.23
665 0.18
666 0.17
667 0.18
668 0.16
669 0.15
670 0.17
671 0.18
672 0.16
673 0.16
674 0.16
675 0.15
676 0.15
677 0.15
678 0.14
679 0.13
680 0.2
681 0.21
682 0.21
683 0.24
684 0.26
685 0.29
686 0.29
687 0.3
688 0.24
689 0.25
690 0.27
691 0.3
692 0.32
693 0.34
694 0.33
695 0.35
696 0.42
697 0.42
698 0.39
699 0.36
700 0.36
701 0.29
702 0.28
703 0.25
704 0.2
705 0.19
706 0.18
707 0.17
708 0.16
709 0.17
710 0.24
711 0.29
712 0.32
713 0.34
714 0.39
715 0.37
716 0.38
717 0.39
718 0.32
719 0.27
720 0.24
721 0.26
722 0.21
723 0.24
724 0.2
725 0.19
726 0.19
727 0.19
728 0.19
729 0.25
730 0.25
731 0.22
732 0.21
733 0.21
734 0.2
735 0.2
736 0.18
737 0.08
738 0.07
739 0.08
740 0.08
741 0.09
742 0.11
743 0.12
744 0.15
745 0.18
746 0.24
747 0.26
748 0.29
749 0.33
750 0.4
751 0.4
752 0.4
753 0.38
754 0.34
755 0.32
756 0.3
757 0.26
758 0.2