FuNGI

A0A316TWC9

Protein Details

Accession

A0A316TWC9

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
399-419	EAKKAGKQQQRRSNTQRRNGA	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
239-260	TIRRQKGLKGKAARKQKGSAAR
332-353	KKGIRAAREAKEKRESEARRRE
391-409	KEAKKVKDEAKKAGKQQQR

Subcellular Location(s)

mito 20, cyto 4.5, cyto_nucl 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR039905 CD2BP2/Lin1 IPR003169 GYF
Gene Ontology	GO:0005682 C:U5 snRNP
PROSITE	View protein in PROSITE PS50829 GYF

Amino Acid Sequences

MSSSSKRKLPLSATAGLSTSEQAGQPGGAPSTSSLKRSKVSFATDTGPLNDDGSLDTGKDADLTGTDLDLEEQDRKRNQQGRKGRVVTEGYDSEDSDEEEEEEEEEEQVNAAAQAGDGGEEDDDMFEVKDSSGQTGSKGATAAPTTAAGPTSGKGKGAERYLSLGEIEGQEFQSGPSGALSDESDDEDRDPDLELEDEDEDEDEEGDEENIEDDPVAAGERTPPLSPGGTTVLPRDLKTIRRQKGLKGKAARKQKGSAARGTSSNLPAGRPGEGKSQAQMDFDDAAMGFKLDGFNMKSEMTSGRFDEEGNYIPNAKDPLAQHDKWLEGNYSKKGIRAAREAKEKRESEARRREREEEMLAGAGGMEGVQMRLLEYMEKGESVLETLQRLGKEAKKVKDEAKKAGKQQQRRSNTQRRNGAAAAAVDDVPPVASTSSSTSNPAQNGHSQTQTSTPTPSSASTPSVIKAIETFTSLISMLMDQFSQVNIYEEEYEGLLRSVRKSGLVAEDWDPARSRGDEVEQEEADVHGGAAAAEPEAESGVLYEYRWSPSYLQATSTSTSTEDPSTETPVETFGPYDLPTLRAWREAGYFGDVGPQGRGMGTERILLRRVGGEAGGGGEWKSWSELLGDR

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.47
2	0.44
3	0.38
4	0.34
5	0.24
6	0.2
7	0.15
8	0.13
9	0.12
10	0.12
11	0.11
12	0.12
13	0.13
14	0.13
15	0.11
16	0.11
17	0.13
18	0.2
19	0.22
20	0.25
21	0.28
22	0.32
23	0.36
24	0.38
25	0.44
26	0.42
27	0.46
28	0.45
29	0.44
30	0.43
31	0.43
32	0.42
33	0.36
34	0.32
35	0.26
36	0.23
37	0.2
38	0.16
39	0.13
40	0.14
41	0.12
42	0.1
43	0.1
44	0.09
45	0.09
46	0.09
47	0.08
48	0.06
49	0.06
50	0.08
51	0.08
52	0.08
53	0.08
54	0.08
55	0.08
56	0.09
57	0.11
58	0.15
59	0.17
60	0.25
61	0.29
62	0.33
63	0.42
64	0.49
65	0.55
66	0.59
67	0.67
68	0.7
69	0.76
70	0.76
71	0.69
72	0.68
73	0.63
74	0.55
75	0.51
76	0.43
77	0.36
78	0.33
79	0.3
80	0.25
81	0.22
82	0.2
83	0.15
84	0.14
85	0.11
86	0.11
87	0.11
88	0.09
89	0.09
90	0.09
91	0.09
92	0.09
93	0.08
94	0.07
95	0.07
96	0.06
97	0.05
98	0.05
99	0.05
100	0.04
101	0.05
102	0.04
103	0.05
104	0.04
105	0.05
106	0.04
107	0.05
108	0.05
109	0.05
110	0.05
111	0.05
112	0.05
113	0.05
114	0.06
115	0.05
116	0.08
117	0.09
118	0.11
119	0.13
120	0.13
121	0.13
122	0.16
123	0.17
124	0.15
125	0.15
126	0.13
127	0.13
128	0.14
129	0.13
130	0.11
131	0.11
132	0.1
133	0.11
134	0.11
135	0.09
136	0.09
137	0.09
138	0.12
139	0.12
140	0.12
141	0.14
142	0.16
143	0.2
144	0.23
145	0.25
146	0.22
147	0.25
148	0.24
149	0.23
150	0.2
151	0.16
152	0.13
153	0.12
154	0.12
155	0.09
156	0.09
157	0.09
158	0.09
159	0.08
160	0.09
161	0.09
162	0.08
163	0.07
164	0.08
165	0.07
166	0.08
167	0.09
168	0.07
169	0.08
170	0.1
171	0.1
172	0.1
173	0.11
174	0.11
175	0.1
176	0.09
177	0.1
178	0.08
179	0.08
180	0.08
181	0.07
182	0.08
183	0.08
184	0.08
185	0.07
186	0.07
187	0.06
188	0.06
189	0.06
190	0.05
191	0.05
192	0.05
193	0.05
194	0.05
195	0.04
196	0.05
197	0.05
198	0.05
199	0.04
200	0.04
201	0.04
202	0.04
203	0.04
204	0.04
205	0.04
206	0.05
207	0.07
208	0.08
209	0.08
210	0.09
211	0.1
212	0.11
213	0.11
214	0.12
215	0.14
216	0.13
217	0.14
218	0.14
219	0.19
220	0.19
221	0.19
222	0.21
223	0.21
224	0.25
225	0.34
226	0.43
227	0.42
228	0.5
229	0.51
230	0.55
231	0.63
232	0.65
233	0.63
234	0.63
235	0.66
236	0.65
237	0.74
238	0.71
239	0.65
240	0.61
241	0.59
242	0.59
243	0.55
244	0.53
245	0.46
246	0.42
247	0.39
248	0.38
249	0.34
250	0.26
251	0.25
252	0.2
253	0.16
254	0.16
255	0.16
256	0.16
257	0.14
258	0.15
259	0.17
260	0.2
261	0.2
262	0.19
263	0.22
264	0.21
265	0.2
266	0.19
267	0.15
268	0.12
269	0.12
270	0.11
271	0.07
272	0.07
273	0.06
274	0.06
275	0.04
276	0.04
277	0.04
278	0.04
279	0.06
280	0.06
281	0.07
282	0.09
283	0.09
284	0.08
285	0.09
286	0.11
287	0.11
288	0.12
289	0.12
290	0.11
291	0.12
292	0.12
293	0.12
294	0.12
295	0.11
296	0.11
297	0.11
298	0.1
299	0.1
300	0.11
301	0.11
302	0.1
303	0.12
304	0.11
305	0.19
306	0.25
307	0.25
308	0.25
309	0.26
310	0.26
311	0.24
312	0.24
313	0.18
314	0.14
315	0.17
316	0.18
317	0.21
318	0.2
319	0.2
320	0.24
321	0.26
322	0.26
323	0.32
324	0.37
325	0.39
326	0.49
327	0.5
328	0.5
329	0.56
330	0.53
331	0.47
332	0.49
333	0.49
334	0.48
335	0.57
336	0.61
337	0.59
338	0.63
339	0.64
340	0.58
341	0.57
342	0.48
343	0.38
344	0.3
345	0.23
346	0.19
347	0.15
348	0.11
349	0.07
350	0.05
351	0.03
352	0.02
353	0.02
354	0.02
355	0.03
356	0.03
357	0.03
358	0.04
359	0.04
360	0.05
361	0.05
362	0.06
363	0.06
364	0.06
365	0.06
366	0.06
367	0.06
368	0.06
369	0.07
370	0.06
371	0.07
372	0.08
373	0.1
374	0.1
375	0.12
376	0.15
377	0.18
378	0.26
379	0.33
380	0.37
381	0.39
382	0.42
383	0.49
384	0.54
385	0.54
386	0.55
387	0.58
388	0.58
389	0.6
390	0.66
391	0.66
392	0.66
393	0.72
394	0.72
395	0.7
396	0.73
397	0.77
398	0.79
399	0.81
400	0.8
401	0.78
402	0.71
403	0.69
404	0.6
405	0.5
406	0.41
407	0.32
408	0.25
409	0.18
410	0.15
411	0.1
412	0.09
413	0.08
414	0.06
415	0.06
416	0.05
417	0.04
418	0.04
419	0.05
420	0.08
421	0.12
422	0.13
423	0.16
424	0.17
425	0.21
426	0.22
427	0.23
428	0.23
429	0.25
430	0.29
431	0.29
432	0.29
433	0.26
434	0.26
435	0.28
436	0.29
437	0.25
438	0.22
439	0.2
440	0.19
441	0.2
442	0.2
443	0.19
444	0.18
445	0.19
446	0.18
447	0.19
448	0.18
449	0.18
450	0.17
451	0.14
452	0.13
453	0.12
454	0.11
455	0.12
456	0.12
457	0.1
458	0.11
459	0.11
460	0.1
461	0.08
462	0.08
463	0.07
464	0.07
465	0.07
466	0.06
467	0.06
468	0.06
469	0.07
470	0.07
471	0.08
472	0.08
473	0.1
474	0.11
475	0.11
476	0.11
477	0.1
478	0.1
479	0.09
480	0.09
481	0.09
482	0.1
483	0.11
484	0.13
485	0.14
486	0.15
487	0.15
488	0.18
489	0.21
490	0.21
491	0.23
492	0.22
493	0.27
494	0.26
495	0.27
496	0.25
497	0.21
498	0.22
499	0.2
500	0.19
501	0.16
502	0.2
503	0.24
504	0.25
505	0.3
506	0.27
507	0.26
508	0.25
509	0.23
510	0.19
511	0.13
512	0.1
513	0.05
514	0.05
515	0.05
516	0.05
517	0.05
518	0.04
519	0.04
520	0.04
521	0.04
522	0.04
523	0.04
524	0.04
525	0.04
526	0.06
527	0.06
528	0.07
529	0.09
530	0.11
531	0.14
532	0.16
533	0.17
534	0.17
535	0.24
536	0.3
537	0.28
538	0.29
539	0.29
540	0.31
541	0.31
542	0.29
543	0.23
544	0.19
545	0.19
546	0.19
547	0.17
548	0.15
549	0.17
550	0.18
551	0.23
552	0.22
553	0.21
554	0.19
555	0.2
556	0.21
557	0.18
558	0.16
559	0.12
560	0.13
561	0.13
562	0.16
563	0.15
564	0.15
565	0.16
566	0.21
567	0.22
568	0.23
569	0.24
570	0.23
571	0.25
572	0.25
573	0.25
574	0.24
575	0.23
576	0.19
577	0.24
578	0.23
579	0.21
580	0.2
581	0.18
582	0.14
583	0.14
584	0.15
585	0.13
586	0.16
587	0.16
588	0.21
589	0.23
590	0.27
591	0.29
592	0.28
593	0.26
594	0.24
595	0.24
596	0.2
597	0.17
598	0.14
599	0.12
600	0.13
601	0.12
602	0.1
603	0.09
604	0.09
605	0.09
606	0.09
607	0.11
608	0.1
609	0.1

A0A316TWC9

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer