FuNGI

A0A316UBA1

Protein Details

Accession

A0A316UBA1

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

14.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
398-425	VVLVKKSYPDSKKRSKNRAWRLKSIAKE	Hydrophilic
480-504	DAEDRLRRKREAKARRKAKQSVADA	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
409-420	KKRSKNRAWRLK
484-498	RLRRKREAKARRKAK

Subcellular Location(s)

cyto_nucl 12.5, cyto 12, nucl 11, pero 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR039768 Nmd3 IPR007064 Nmd3_N
Gene Ontology	GO:0005737 C:cytoplasm GO:0005634 C:nucleus GO:0043023 F:ribosomal large subunit binding GO:0015031 P:protein transport
Pfam	View protein in Pfam PF04981 NMD3

Amino Acid Sequences

MEYLQPQDPAKLDQGLVLCADCGTAIPPNSANLCISCLRNSVDITEGIPKQATVNFCKNCERYLNPPQSWVLAQLESRELLAICLKKLRGLNKVRLIDAGFIWTEPHSKRLRVKLTVQKEVLVNTILQQVFEVEYVVQYGQCPDCTRLAAKNTWKAQVQVRQKVPHKRTFLYLEQLILKHNAHKDTINISEKKDGLDFYFVQRSHAVKMCEFLASVVPIRVTASSSVISMDIHSSTSNNKFTYSVEIAPICKDDLVCLPKSTAKALGQLPQVVLCSRITNSIRFLDPSTLHYADIPAEKYFRDPIQPLCAIPELVEFLVLDIEPTGQTSANGKFMTADAQVSPMNATTFGQADAVFHTRTHLGNLLQPGDIAMGYHLGLANFNSEIWDSIPAERLPDVVLVKKSYPDSKKRSKNRAWRLKSIAKEAATDDTKAEGGGRGALGRKGGLDGQKVEAAYEWFLRELEEDEEMRSGVNLYRDKDAEDRLRRKREAKARRKAKQSVADAAAVDEDGDAEMGAEGGAGEVADVDDGMTDDGFTTDGESEFGDDEDVPRIRMEELLDDMDGECDSALTKTKKSSCLY

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.25
2	0.23
3	0.22
4	0.18
5	0.15
6	0.12
7	0.12
8	0.08
9	0.07
10	0.07
11	0.11
12	0.12
13	0.15
14	0.16
15	0.19
16	0.21
17	0.22
18	0.22
19	0.18
20	0.2
21	0.21
22	0.23
23	0.22
24	0.23
25	0.24
26	0.26
27	0.26
28	0.24
29	0.23
30	0.22
31	0.21
32	0.25
33	0.24
34	0.22
35	0.21
36	0.2
37	0.19
38	0.22
39	0.25
40	0.25
41	0.35
42	0.37
43	0.4
44	0.49
45	0.48
46	0.48
47	0.5
48	0.48
49	0.47
50	0.54
51	0.61
52	0.53
53	0.55
54	0.52
55	0.48
56	0.44
57	0.39
58	0.31
59	0.23
60	0.23
61	0.21
62	0.22
63	0.19
64	0.19
65	0.16
66	0.13
67	0.12
68	0.17
69	0.17
70	0.16
71	0.21
72	0.21
73	0.24
74	0.29
75	0.34
76	0.38
77	0.45
78	0.53
79	0.57
80	0.6
81	0.56
82	0.54
83	0.49
84	0.42
85	0.34
86	0.27
87	0.18
88	0.15
89	0.15
90	0.13
91	0.17
92	0.16
93	0.23
94	0.24
95	0.3
96	0.37
97	0.46
98	0.53
99	0.53
100	0.62
101	0.65
102	0.69
103	0.72
104	0.65
105	0.59
106	0.52
107	0.47
108	0.39
109	0.3
110	0.22
111	0.15
112	0.21
113	0.18
114	0.16
115	0.15
116	0.14
117	0.14
118	0.14
119	0.13
120	0.06
121	0.06
122	0.07
123	0.07
124	0.07
125	0.06
126	0.09
127	0.1
128	0.12
129	0.14
130	0.15
131	0.17
132	0.19
133	0.21
134	0.23
135	0.27
136	0.32
137	0.37
138	0.43
139	0.45
140	0.47
141	0.46
142	0.44
143	0.46
144	0.48
145	0.51
146	0.51
147	0.54
148	0.58
149	0.65
150	0.72
151	0.72
152	0.72
153	0.68
154	0.61
155	0.6
156	0.58
157	0.54
158	0.5
159	0.44
160	0.37
161	0.34
162	0.33
163	0.29
164	0.25
165	0.22
166	0.2
167	0.23
168	0.23
169	0.21
170	0.22
171	0.23
172	0.24
173	0.3
174	0.33
175	0.31
176	0.31
177	0.34
178	0.34
179	0.32
180	0.29
181	0.23
182	0.17
183	0.19
184	0.18
185	0.17
186	0.24
187	0.22
188	0.23
189	0.25
190	0.25
191	0.25
192	0.28
193	0.26
194	0.2
195	0.22
196	0.2
197	0.18
198	0.17
199	0.13
200	0.1
201	0.09
202	0.1
203	0.09
204	0.08
205	0.08
206	0.08
207	0.08
208	0.08
209	0.07
210	0.08
211	0.08
212	0.08
213	0.09
214	0.08
215	0.08
216	0.08
217	0.08
218	0.06
219	0.07
220	0.07
221	0.07
222	0.1
223	0.15
224	0.18
225	0.17
226	0.17
227	0.18
228	0.18
229	0.24
230	0.23
231	0.19
232	0.18
233	0.18
234	0.18
235	0.18
236	0.18
237	0.12
238	0.1
239	0.09
240	0.08
241	0.12
242	0.15
243	0.15
244	0.15
245	0.16
246	0.18
247	0.19
248	0.19
249	0.18
250	0.15
251	0.19
252	0.2
253	0.24
254	0.22
255	0.22
256	0.21
257	0.18
258	0.18
259	0.13
260	0.13
261	0.08
262	0.08
263	0.08
264	0.14
265	0.14
266	0.15
267	0.17
268	0.18
269	0.18
270	0.18
271	0.19
272	0.16
273	0.15
274	0.17
275	0.2
276	0.18
277	0.18
278	0.17
279	0.16
280	0.15
281	0.16
282	0.14
283	0.09
284	0.09
285	0.09
286	0.1
287	0.12
288	0.11
289	0.13
290	0.13
291	0.14
292	0.19
293	0.2
294	0.19
295	0.19
296	0.18
297	0.15
298	0.14
299	0.13
300	0.08
301	0.07
302	0.07
303	0.05
304	0.05
305	0.05
306	0.05
307	0.04
308	0.03
309	0.04
310	0.03
311	0.04
312	0.04
313	0.04
314	0.05
315	0.08
316	0.09
317	0.12
318	0.12
319	0.12
320	0.12
321	0.12
322	0.14
323	0.12
324	0.11
325	0.07
326	0.09
327	0.1
328	0.09
329	0.09
330	0.08
331	0.07
332	0.07
333	0.07
334	0.06
335	0.07
336	0.07
337	0.07
338	0.07
339	0.07
340	0.09
341	0.11
342	0.1
343	0.1
344	0.11
345	0.12
346	0.12
347	0.13
348	0.14
349	0.12
350	0.15
351	0.17
352	0.17
353	0.15
354	0.15
355	0.14
356	0.11
357	0.1
358	0.07
359	0.05
360	0.04
361	0.04
362	0.05
363	0.05
364	0.05
365	0.05
366	0.05
367	0.06
368	0.06
369	0.06
370	0.06
371	0.06
372	0.07
373	0.07
374	0.09
375	0.09
376	0.1
377	0.14
378	0.13
379	0.14
380	0.13
381	0.13
382	0.11
383	0.13
384	0.13
385	0.14
386	0.16
387	0.16
388	0.17
389	0.19
390	0.21
391	0.27
392	0.33
393	0.39
394	0.46
395	0.55
396	0.65
397	0.72
398	0.8
399	0.82
400	0.86
401	0.87
402	0.9
403	0.86
404	0.85
405	0.84
406	0.8
407	0.75
408	0.71
409	0.66
410	0.55
411	0.5
412	0.42
413	0.4
414	0.34
415	0.3
416	0.23
417	0.19
418	0.18
419	0.16
420	0.15
421	0.09
422	0.08
423	0.09
424	0.09
425	0.09
426	0.11
427	0.12
428	0.12
429	0.11
430	0.11
431	0.11
432	0.14
433	0.16
434	0.18
435	0.19
436	0.2
437	0.22
438	0.22
439	0.21
440	0.18
441	0.16
442	0.14
443	0.14
444	0.12
445	0.11
446	0.11
447	0.11
448	0.11
449	0.12
450	0.12
451	0.13
452	0.13
453	0.13
454	0.14
455	0.14
456	0.12
457	0.11
458	0.1
459	0.1
460	0.16
461	0.19
462	0.21
463	0.25
464	0.25
465	0.28
466	0.3
467	0.35
468	0.38
469	0.45
470	0.52
471	0.58
472	0.66
473	0.7
474	0.72
475	0.75
476	0.76
477	0.77
478	0.78
479	0.79
480	0.81
481	0.84
482	0.89
483	0.87
484	0.86
485	0.84
486	0.79
487	0.76
488	0.68
489	0.61
490	0.52
491	0.44
492	0.34
493	0.24
494	0.18
495	0.1
496	0.07
497	0.05
498	0.05
499	0.04
500	0.04
501	0.04
502	0.04
503	0.04
504	0.03
505	0.03
506	0.03
507	0.03
508	0.03
509	0.03
510	0.03
511	0.03
512	0.03
513	0.03
514	0.03
515	0.03
516	0.04
517	0.05
518	0.04
519	0.04
520	0.05
521	0.05
522	0.06
523	0.05
524	0.07
525	0.08
526	0.08
527	0.09
528	0.09
529	0.1
530	0.1
531	0.1
532	0.1
533	0.09
534	0.1
535	0.16
536	0.16
537	0.16
538	0.15
539	0.16
540	0.16
541	0.18
542	0.18
543	0.15
544	0.18
545	0.19
546	0.19
547	0.18
548	0.18
549	0.17
550	0.15
551	0.11
552	0.08
553	0.06
554	0.07
555	0.07
556	0.15
557	0.18
558	0.21
559	0.3
560	0.36

A0A316UBA1

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer