FuNGI

A1CNH3

Protein Details

Accession

A1CNH3

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

13.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
2-26	ATAISKPTSHPPKMKRPPPPFVPVG	Hydrophilic
414-433	SPLHRDPPPSPKRRKRTVAE	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
424-428	PKRRK

Subcellular Location(s)

mito 14.5, nucl 11, cyto_mito 8.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR021950 Spt20 IPR046468 Spt20-like_SEP
Gene Ontology	GO:0000124 C:SAGA complex GO:0003712 F:transcription coregulator activity
KEGG	act:ACLA_018980 -
Pfam	View protein in Pfam PF12090 Spt20

Amino Acid Sequences

MATAISKPTSHPPKMKRPPPPFVPVGVNGVKSQQSSSSSPPSTSKRLPGTSQPASAPVTNGLAPNGLKGAANSTPLTTNNSSKGSLNRTKKDAPKSGDQAMRLQKHSAKTPTVESDSRLGKICPEPYVKTSSYILKKYSKCPPSLIVHLHPTHFRFEQQDGSFSYNSEMKVVIEHIRAGTVPHDMMEELLRANVRFYEGCLIVRVVDHKSVSAQVRKTSAPLSNDSNTPFSLHNYNEHITPSAYVPYPKQNQLASETSTTKSDSAASGQLDGKGKDEPVGDSQSSKNENDAGSSQKPSPAKPRVFTTVLHPTPRSLQAELILLATTPDPRAAKQPASSSTNRTQQSSSTAPQSPVVATNLPERGHVAKRQKMLVEPQDLLECESRLTRALAPPLFLEPVDNLEAAQDLLRYLESPLHRDPPPSPKRRKRTVAELAADEALAAEEERFMLIMDERLEPATSGGPGGPKSAAVDDTGVGASFEPRFSRFKTLENIRMQHEEKAKREHEIKVKQELAKRQQQEQERERRRLLEQRQAEEHAKEEARRQHLAAQQAQAQLAAQQQNRHAMAQVNGVSQAPQSSPVVRNQTPLNTSSPLVGSTMVSQSGVPMSMTSSAQGAGSPPRPPSALQHGHPNVMSHPMAPSRSQQGQSRHGTPQMTQGTPSMSHATPTMRNVTPTQRMSHGSPSQPTMAPTPVLSQAMMGTPQMGVGMGLTPQQQQILLQRQQMLAQQGQIGHAQFTPQQLAQLQANAHAQQNIQSHQQQMLQAQQQNHQAQQQKMPNTQSYQASLLRNQYHQMQLAQQQQTQGQQPQGQQAQVHQGSPQMTPQQQQMMMAAAAQANAGHMPQNFQGVNMAQRYSQLYQQRLLRLRQEMSTRYMGQYGPPAQYPPQIAQQYSVGLERSAKAWVQEIIRREREAAHQQRASQVAAVQAQVMQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQNMMQNVMGK

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.77
2	0.84
3	0.84
4	0.84
5	0.86
6	0.84
7	0.83
8	0.74
9	0.68
10	0.65
11	0.56
12	0.54
13	0.48
14	0.42
15	0.35
16	0.35
17	0.33
18	0.28
19	0.27
20	0.24
21	0.25
22	0.28
23	0.33
24	0.39
25	0.38
26	0.4
27	0.45
28	0.47
29	0.5
30	0.52
31	0.54
32	0.53
33	0.56
34	0.58
35	0.61
36	0.64
37	0.6
38	0.59
39	0.52
40	0.47
41	0.45
42	0.42
43	0.34
44	0.26
45	0.24
46	0.22
47	0.21
48	0.18
49	0.18
50	0.17
51	0.16
52	0.15
53	0.13
54	0.12
55	0.12
56	0.16
57	0.14
58	0.18
59	0.17
60	0.18
61	0.2
62	0.21
63	0.28
64	0.27
65	0.29
66	0.31
67	0.33
68	0.33
69	0.34
70	0.39
71	0.42
72	0.47
73	0.53
74	0.54
75	0.59
76	0.66
77	0.71
78	0.74
79	0.74
80	0.7
81	0.7
82	0.7
83	0.71
84	0.67
85	0.61
86	0.59
87	0.6
88	0.6
89	0.52
90	0.51
91	0.48
92	0.48
93	0.54
94	0.52
95	0.47
96	0.45
97	0.48
98	0.49
99	0.5
100	0.47
101	0.41
102	0.42
103	0.4
104	0.39
105	0.35
106	0.29
107	0.28
108	0.32
109	0.32
110	0.32
111	0.34
112	0.36
113	0.37
114	0.44
115	0.4
116	0.37
117	0.37
118	0.4
119	0.42
120	0.43
121	0.45
122	0.47
123	0.51
124	0.54
125	0.61
126	0.59
127	0.55
128	0.55
129	0.56
130	0.53
131	0.56
132	0.56
133	0.5
134	0.52
135	0.51
136	0.5
137	0.48
138	0.43
139	0.41
140	0.35
141	0.33
142	0.29
143	0.3
144	0.36
145	0.32
146	0.34
147	0.32
148	0.35
149	0.32
150	0.29
151	0.28
152	0.23
153	0.22
154	0.19
155	0.17
156	0.12
157	0.14
158	0.16
159	0.17
160	0.15
161	0.16
162	0.15
163	0.15
164	0.15
165	0.15
166	0.14
167	0.12
168	0.11
169	0.1
170	0.1
171	0.1
172	0.11
173	0.11
174	0.1
175	0.08
176	0.1
177	0.1
178	0.1
179	0.11
180	0.1
181	0.12
182	0.11
183	0.13
184	0.16
185	0.16
186	0.17
187	0.18
188	0.17
189	0.15
190	0.16
191	0.17
192	0.14
193	0.16
194	0.16
195	0.15
196	0.16
197	0.21
198	0.25
199	0.29
200	0.3
201	0.3
202	0.33
203	0.33
204	0.34
205	0.33
206	0.33
207	0.3
208	0.31
209	0.33
210	0.32
211	0.34
212	0.34
213	0.32
214	0.27
215	0.26
216	0.23
217	0.2
218	0.22
219	0.21
220	0.23
221	0.25
222	0.26
223	0.25
224	0.26
225	0.24
226	0.2
227	0.2
228	0.17
229	0.15
230	0.15
231	0.15
232	0.17
233	0.24
234	0.29
235	0.31
236	0.34
237	0.33
238	0.34
239	0.37
240	0.38
241	0.32
242	0.31
243	0.3
244	0.27
245	0.27
246	0.26
247	0.21
248	0.18
249	0.16
250	0.13
251	0.13
252	0.15
253	0.14
254	0.16
255	0.16
256	0.2
257	0.21
258	0.2
259	0.19
260	0.17
261	0.17
262	0.17
263	0.17
264	0.15
265	0.16
266	0.2
267	0.19
268	0.2
269	0.21
270	0.24
271	0.27
272	0.25
273	0.22
274	0.21
275	0.2
276	0.2
277	0.21
278	0.21
279	0.21
280	0.23
281	0.22
282	0.25
283	0.26
284	0.27
285	0.35
286	0.38
287	0.41
288	0.41
289	0.45
290	0.46
291	0.47
292	0.45
293	0.42
294	0.43
295	0.41
296	0.42
297	0.38
298	0.33
299	0.34
300	0.39
301	0.35
302	0.25
303	0.23
304	0.21
305	0.22
306	0.21
307	0.17
308	0.12
309	0.09
310	0.08
311	0.08
312	0.07
313	0.06
314	0.09
315	0.09
316	0.1
317	0.16
318	0.19
319	0.22
320	0.24
321	0.28
322	0.3
323	0.35
324	0.36
325	0.37
326	0.4
327	0.45
328	0.43
329	0.4
330	0.36
331	0.32
332	0.36
333	0.33
334	0.29
335	0.27
336	0.28
337	0.26
338	0.26
339	0.26
340	0.21
341	0.18
342	0.18
343	0.14
344	0.13
345	0.16
346	0.18
347	0.17
348	0.17
349	0.17
350	0.19
351	0.22
352	0.28
353	0.32
354	0.34
355	0.37
356	0.4
357	0.39
358	0.38
359	0.41
360	0.41
361	0.37
362	0.32
363	0.29
364	0.28
365	0.27
366	0.26
367	0.2
368	0.14
369	0.1
370	0.1
371	0.1
372	0.09
373	0.11
374	0.11
375	0.12
376	0.18
377	0.17
378	0.18
379	0.18
380	0.18
381	0.17
382	0.15
383	0.13
384	0.08
385	0.1
386	0.1
387	0.09
388	0.08
389	0.07
390	0.08
391	0.07
392	0.07
393	0.05
394	0.04
395	0.04
396	0.04
397	0.05
398	0.05
399	0.09
400	0.09
401	0.14
402	0.16
403	0.2
404	0.21
405	0.22
406	0.25
407	0.32
408	0.41
409	0.47
410	0.55
411	0.61
412	0.69
413	0.76
414	0.82
415	0.76
416	0.76
417	0.76
418	0.73
419	0.66
420	0.58
421	0.5
422	0.41
423	0.36
424	0.25
425	0.15
426	0.07
427	0.05
428	0.04
429	0.03
430	0.03
431	0.03
432	0.03
433	0.03
434	0.03
435	0.03
436	0.04
437	0.05
438	0.07
439	0.07
440	0.08
441	0.08
442	0.08
443	0.07
444	0.08
445	0.07
446	0.05
447	0.05
448	0.05
449	0.06
450	0.07
451	0.08
452	0.07
453	0.06
454	0.07
455	0.07
456	0.07
457	0.07
458	0.07
459	0.06
460	0.07
461	0.07
462	0.06
463	0.05
464	0.05
465	0.05
466	0.05
467	0.05
468	0.05
469	0.08
470	0.1
471	0.12
472	0.18
473	0.18
474	0.21
475	0.28
476	0.33
477	0.39
478	0.41
479	0.42
480	0.38
481	0.42
482	0.39
483	0.37
484	0.39
485	0.36
486	0.35
487	0.4
488	0.38
489	0.37
490	0.4
491	0.41
492	0.42
493	0.45
494	0.46
495	0.45
496	0.49
497	0.49
498	0.5
499	0.52
500	0.49
501	0.49
502	0.47
503	0.46
504	0.47
505	0.51
506	0.55
507	0.56
508	0.6
509	0.6
510	0.62
511	0.59
512	0.56
513	0.53
514	0.53
515	0.5
516	0.49
517	0.46
518	0.45
519	0.46
520	0.47
521	0.45
522	0.36
523	0.31
524	0.26
525	0.22
526	0.2
527	0.23
528	0.25
529	0.27
530	0.28
531	0.27
532	0.3
533	0.32
534	0.36
535	0.34
536	0.29
537	0.29
538	0.29
539	0.28
540	0.22
541	0.18
542	0.14
543	0.15
544	0.18
545	0.16
546	0.17
547	0.18
548	0.23
549	0.24
550	0.22
551	0.2
552	0.18
553	0.17
554	0.19
555	0.19
556	0.15
557	0.15
558	0.15
559	0.13
560	0.11
561	0.11
562	0.07
563	0.08
564	0.08
565	0.11
566	0.13
567	0.17
568	0.24
569	0.24
570	0.26
571	0.26
572	0.29
573	0.27
574	0.27
575	0.25
576	0.2
577	0.2
578	0.19
579	0.17
580	0.14
581	0.13
582	0.11
583	0.09
584	0.08
585	0.09
586	0.08
587	0.08
588	0.07
589	0.07
590	0.07
591	0.07
592	0.05
593	0.05
594	0.05
595	0.07
596	0.07
597	0.07
598	0.07
599	0.07
600	0.07
601	0.07
602	0.07
603	0.1
604	0.12
605	0.14
606	0.14
607	0.15
608	0.16
609	0.17
610	0.21
611	0.27
612	0.3
613	0.29
614	0.39
615	0.39
616	0.4
617	0.39
618	0.35
619	0.26
620	0.25
621	0.24
622	0.14
623	0.15
624	0.16
625	0.17
626	0.17
627	0.19
628	0.2
629	0.25
630	0.28
631	0.32
632	0.36
633	0.43
634	0.46
635	0.48
636	0.45
637	0.44
638	0.42
639	0.36
640	0.39
641	0.35
642	0.31
643	0.28
644	0.26
645	0.24
646	0.24
647	0.25
648	0.2
649	0.15
650	0.15
651	0.16
652	0.18
653	0.19
654	0.21
655	0.24
656	0.21
657	0.23
658	0.25
659	0.3
660	0.35
661	0.35
662	0.35
663	0.32
664	0.35
665	0.36
666	0.41
667	0.39
668	0.35
669	0.35
670	0.35
671	0.34
672	0.32
673	0.31
674	0.25
675	0.21
676	0.19
677	0.17
678	0.17
679	0.16
680	0.16
681	0.14
682	0.12
683	0.11
684	0.11
685	0.11
686	0.09
687	0.07
688	0.06
689	0.06
690	0.06
691	0.05
692	0.04
693	0.04
694	0.04
695	0.04
696	0.06
697	0.07
698	0.08
699	0.08
700	0.09
701	0.09
702	0.1
703	0.16
704	0.24
705	0.27
706	0.29
707	0.31
708	0.31
709	0.33
710	0.34
711	0.31
712	0.24
713	0.21
714	0.2
715	0.18
716	0.19
717	0.19
718	0.16
719	0.14
720	0.13
721	0.13
722	0.13
723	0.14
724	0.16
725	0.14
726	0.15
727	0.15
728	0.17
729	0.17
730	0.18
731	0.16
732	0.17
733	0.19
734	0.19
735	0.19
736	0.18
737	0.17
738	0.2
739	0.23
740	0.23
741	0.25
742	0.26
743	0.27
744	0.28
745	0.3
746	0.27
747	0.26
748	0.3
749	0.31
750	0.33
751	0.34
752	0.36
753	0.42
754	0.42
755	0.42
756	0.41
757	0.42
758	0.41
759	0.47
760	0.49
761	0.47
762	0.49
763	0.52
764	0.51
765	0.47
766	0.49
767	0.43
768	0.39
769	0.37
770	0.37
771	0.35
772	0.34
773	0.37
774	0.36
775	0.35
776	0.34
777	0.34
778	0.33
779	0.32
780	0.31
781	0.28
782	0.32
783	0.39
784	0.41
785	0.38
786	0.36
787	0.36
788	0.38
789	0.39
790	0.36
791	0.32
792	0.33
793	0.34
794	0.4
795	0.4
796	0.39
797	0.34
798	0.33
799	0.38
800	0.34
801	0.33
802	0.25
803	0.26
804	0.25
805	0.25
806	0.27
807	0.24
808	0.25
809	0.27
810	0.3
811	0.32
812	0.3
813	0.3
814	0.26
815	0.22
816	0.2
817	0.18
818	0.15
819	0.1
820	0.09
821	0.09
822	0.08
823	0.06
824	0.06
825	0.07
826	0.09
827	0.09
828	0.11
829	0.12
830	0.18
831	0.18
832	0.18
833	0.21
834	0.19
835	0.24
836	0.23
837	0.23
838	0.18
839	0.2
840	0.25
841	0.23
842	0.28
843	0.31
844	0.32
845	0.37
846	0.42
847	0.49
848	0.5
849	0.53
850	0.53
851	0.52
852	0.51
853	0.51
854	0.52
855	0.47
856	0.46
857	0.48
858	0.43
859	0.38
860	0.38
861	0.33
862	0.29
863	0.33
864	0.32
865	0.28
866	0.27
867	0.29
868	0.28
869	0.32
870	0.34
871	0.29
872	0.34
873	0.35
874	0.34
875	0.34
876	0.33
877	0.31
878	0.29
879	0.28
880	0.19
881	0.17
882	0.18
883	0.17
884	0.16
885	0.17
886	0.16
887	0.15
888	0.17
889	0.21
890	0.24
891	0.28
892	0.34
893	0.4
894	0.44
895	0.44
896	0.43
897	0.42
898	0.45
899	0.52
900	0.54
901	0.54
902	0.53
903	0.54
904	0.58
905	0.57
906	0.5
907	0.4
908	0.33
909	0.28
910	0.26
911	0.24
912	0.19
913	0.17
914	0.17
915	0.19
916	0.19
917	0.17
918	0.19
919	0.27
920	0.33
921	0.4
922	0.46
923	0.51
924	0.59
925	0.65
926	0.71
927	0.72
928	0.75
929	0.76
930	0.77
931	0.78
932	0.78
933	0.78
934	0.78
935	0.78
936	0.78
937	0.78
938	0.79
939	0.78
940	0.74
941	0.72
942	0.69
943	0.68
944	0.62
945	0.54

A1CNH3

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer