FuNGI

A1CSY3

Protein Details

Accession

A1CSY3

Localization Confidence

High

Confidence Score

15.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
29-64	HEPSAGKRKDQSKDHEKKKNKKRKHEESTKAPSQPA	Basic
90-117	NGSTHNDRSNKKPKPKTKAFQDTRQNFA	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
34-53	GKRKDQSKDHEKKKNKKRKH
100-105	KKPKPK

Subcellular Location(s)

nucl 17.5, cyto_nucl 13.833, mito_nucl 10.166, cyto 8

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR011709 DEAD-box_helicase_OB_fold IPR002464 DNA/RNA_helicase_DEAH_CS IPR007502 Helicase-assoc_dom IPR014001 Helicase_ATP-bd IPR001650 Helicase_C IPR027417 P-loop_NTPase
Gene Ontology	GO:0005730 C:nucleolus GO:0032040 C:small-subunit processome GO:0005524 F:ATP binding GO:0016787 F:hydrolase activity GO:0042802 F:identical protein binding GO:0003724 F:RNA helicase activity GO:0000462 P:maturation of SSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)
KEGG	act:ACLA_081040 -
Pfam	View protein in Pfam PF04408 HA2 PF00271 Helicase_C PF07717 OB_NTP_bind
PROSITE	View protein in PROSITE PS00690 DEAH_ATP_HELICASE PS51192 HELICASE_ATP_BIND_1 PS51194 HELICASE_CTER
CDD	cd17917 DEXHc_RHA-like cd18791 SF2_C_RHA

Amino Acid Sequences

MPERVRTVFEDEDDVPVTAPKVLETKQSHEPSAGKRKDQSKDHEKKKNKKRKHEESTKAPSQPAVSIIEVPEAPTPHTIDEKDAPPSTANGSTHNDRSNKKPKPKTKAFQDTRQNFAPLREKAKALYEIRKGLPIFPHGDEIRQNLRKNDVMLLVGETGSGKSTQIPQFLVDEKWCRPTKATVTQEDGSRKEITVGGCIAITQPRRVAAISLARRVAEEMGTPLGSSSPASKVGYSVRFDTSTSPSTRIKFLTEGMLLQEMLHDPWLTKYSAIVVDEVHERGVNVDLVLGFLRNLVSGKREGRGGVPLKVVVMSATADMESLMDFFQEGLQTRKATKPSEDKSTTSSASQQDSAPVTDDKISVCHIKGRQFPVKTIYAPAPVHDFVDAALKVIFQIHYKEPMPGDILVFLTGQETVEALEQLVNEYATGMDPALPKIQVLPLFAALPQVAQQRVFLPAPPRTRKIILATNIAETSVTVSGVRFVVDCGKAKVKQFRTRLGLDSLLVKPISKSAAIQRKGRAGREAPGQCYRLYTEKDYLALDETNTPEILRCDLSQALLNMKARGVDNVMGFPFLTRPPRDSLEKALLQLLSIDALEESGSISSVGRHIAKLPLTPTLGRVLLAASEHGEGCLLDVIDIISCLSVENIFLNTLSEEKKEEAEKARRDLYRREGDHLTMLATVQAYAAENSDRKAWAERHLVSHRAMQSVMDVRKQLTMQCRQAKLLPSASDSRNGPTNSIIREPSPVLILKSFLRGFSTNTARLVPDGSYRTVVGNQTVAIHPSSVLFGKKVEAIMYNEFVFTNRSYARGVSAVQMDWVGEALTGA

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.27
2	0.21
3	0.19
4	0.18
5	0.15
6	0.14
7	0.13
8	0.16
9	0.17
10	0.26
11	0.29
12	0.34
13	0.42
14	0.46
15	0.46
16	0.46
17	0.5
18	0.51
19	0.57
20	0.58
21	0.54
22	0.57
23	0.65
24	0.69
25	0.72
26	0.73
27	0.73
28	0.78
29	0.82
30	0.85
31	0.87
32	0.89
33	0.92
34	0.93
35	0.92
36	0.93
37	0.93
38	0.94
39	0.95
40	0.95
41	0.94
42	0.93
43	0.93
44	0.9
45	0.82
46	0.72
47	0.63
48	0.54
49	0.46
50	0.38
51	0.31
52	0.24
53	0.22
54	0.22
55	0.22
56	0.2
57	0.19
58	0.2
59	0.17
60	0.17
61	0.18
62	0.19
63	0.18
64	0.23
65	0.22
66	0.24
67	0.28
68	0.3
69	0.33
70	0.33
71	0.32
72	0.29
73	0.3
74	0.28
75	0.29
76	0.27
77	0.25
78	0.3
79	0.34
80	0.38
81	0.44
82	0.46
83	0.44
84	0.53
85	0.59
86	0.63
87	0.69
88	0.74
89	0.78
90	0.82
91	0.9
92	0.9
93	0.9
94	0.91
95	0.88
96	0.87
97	0.88
98	0.83
99	0.78
100	0.72
101	0.64
102	0.54
103	0.53
104	0.52
105	0.46
106	0.48
107	0.45
108	0.42
109	0.4
110	0.45
111	0.46
112	0.43
113	0.46
114	0.45
115	0.48
116	0.48
117	0.52
118	0.47
119	0.42
120	0.4
121	0.36
122	0.34
123	0.3
124	0.35
125	0.3
126	0.32
127	0.31
128	0.33
129	0.38
130	0.41
131	0.43
132	0.39
133	0.44
134	0.43
135	0.42
136	0.4
137	0.32
138	0.26
139	0.24
140	0.22
141	0.18
142	0.15
143	0.13
144	0.1
145	0.08
146	0.08
147	0.08
148	0.07
149	0.08
150	0.16
151	0.19
152	0.21
153	0.22
154	0.22
155	0.25
156	0.27
157	0.27
158	0.25
159	0.26
160	0.25
161	0.33
162	0.34
163	0.33
164	0.33
165	0.38
166	0.42
167	0.48
168	0.52
169	0.48
170	0.53
171	0.54
172	0.56
173	0.54
174	0.47
175	0.4
176	0.35
177	0.3
178	0.25
179	0.26
180	0.21
181	0.19
182	0.18
183	0.15
184	0.13
185	0.13
186	0.13
187	0.15
188	0.16
189	0.15
190	0.16
191	0.16
192	0.17
193	0.18
194	0.18
195	0.17
196	0.25
197	0.27
198	0.3
199	0.3
200	0.29
201	0.29
202	0.29
203	0.25
204	0.16
205	0.13
206	0.1
207	0.11
208	0.11
209	0.1
210	0.09
211	0.09
212	0.08
213	0.08
214	0.08
215	0.09
216	0.12
217	0.13
218	0.13
219	0.14
220	0.2
221	0.24
222	0.24
223	0.25
224	0.24
225	0.24
226	0.25
227	0.26
228	0.26
229	0.26
230	0.26
231	0.27
232	0.28
233	0.29
234	0.32
235	0.29
236	0.27
237	0.24
238	0.23
239	0.23
240	0.2
241	0.19
242	0.17
243	0.17
244	0.14
245	0.12
246	0.12
247	0.08
248	0.08
249	0.08
250	0.07
251	0.06
252	0.08
253	0.1
254	0.1
255	0.09
256	0.09
257	0.11
258	0.13
259	0.13
260	0.12
261	0.1
262	0.12
263	0.13
264	0.13
265	0.11
266	0.09
267	0.08
268	0.09
269	0.1
270	0.08
271	0.06
272	0.06
273	0.06
274	0.07
275	0.07
276	0.06
277	0.05
278	0.05
279	0.05
280	0.05
281	0.05
282	0.05
283	0.08
284	0.12
285	0.14
286	0.14
287	0.15
288	0.16
289	0.17
290	0.24
291	0.24
292	0.23
293	0.22
294	0.21
295	0.2
296	0.19
297	0.18
298	0.1
299	0.08
300	0.06
301	0.05
302	0.05
303	0.05
304	0.05
305	0.05
306	0.05
307	0.04
308	0.04
309	0.04
310	0.03
311	0.03
312	0.03
313	0.04
314	0.05
315	0.06
316	0.09
317	0.11
318	0.12
319	0.14
320	0.18
321	0.22
322	0.22
323	0.27
324	0.34
325	0.36
326	0.44
327	0.45
328	0.42
329	0.42
330	0.44
331	0.39
332	0.31
333	0.31
334	0.25
335	0.24
336	0.23
337	0.2
338	0.19
339	0.19
340	0.18
341	0.16
342	0.13
343	0.12
344	0.12
345	0.12
346	0.1
347	0.09
348	0.11
349	0.11
350	0.11
351	0.15
352	0.17
353	0.22
354	0.28
355	0.33
356	0.39
357	0.38
358	0.39
359	0.39
360	0.38
361	0.33
362	0.3
363	0.25
364	0.24
365	0.23
366	0.22
367	0.21
368	0.18
369	0.18
370	0.16
371	0.14
372	0.09
373	0.13
374	0.12
375	0.09
376	0.08
377	0.08
378	0.08
379	0.09
380	0.09
381	0.06
382	0.09
383	0.09
384	0.13
385	0.14
386	0.15
387	0.15
388	0.15
389	0.16
390	0.13
391	0.12
392	0.09
393	0.09
394	0.08
395	0.08
396	0.07
397	0.05
398	0.05
399	0.05
400	0.04
401	0.04
402	0.04
403	0.04
404	0.04
405	0.04
406	0.04
407	0.04
408	0.05
409	0.05
410	0.04
411	0.04
412	0.04
413	0.04
414	0.04
415	0.04
416	0.03
417	0.05
418	0.06
419	0.07
420	0.08
421	0.08
422	0.07
423	0.08
424	0.1
425	0.09
426	0.1
427	0.09
428	0.09
429	0.1
430	0.1
431	0.1
432	0.07
433	0.06
434	0.08
435	0.09
436	0.09
437	0.09
438	0.1
439	0.1
440	0.13
441	0.13
442	0.13
443	0.15
444	0.21
445	0.3
446	0.33
447	0.35
448	0.36
449	0.38
450	0.38
451	0.38
452	0.38
453	0.33
454	0.34
455	0.32
456	0.3
457	0.28
458	0.26
459	0.21
460	0.14
461	0.13
462	0.07
463	0.07
464	0.05
465	0.05
466	0.06
467	0.07
468	0.07
469	0.05
470	0.05
471	0.1
472	0.12
473	0.13
474	0.14
475	0.18
476	0.21
477	0.25
478	0.34
479	0.38
480	0.45
481	0.48
482	0.53
483	0.54
484	0.54
485	0.52
486	0.46
487	0.39
488	0.3
489	0.3
490	0.23
491	0.2
492	0.17
493	0.15
494	0.12
495	0.12
496	0.13
497	0.09
498	0.1
499	0.17
500	0.26
501	0.31
502	0.35
503	0.36
504	0.43
505	0.47
506	0.47
507	0.44
508	0.37
509	0.36
510	0.41
511	0.42
512	0.38
513	0.4
514	0.39
515	0.33
516	0.33
517	0.31
518	0.27
519	0.27
520	0.26
521	0.25
522	0.24
523	0.25
524	0.24
525	0.23
526	0.19
527	0.16
528	0.14
529	0.12
530	0.13
531	0.12
532	0.12
533	0.11
534	0.1
535	0.11
536	0.12
537	0.11
538	0.1
539	0.11
540	0.12
541	0.13
542	0.14
543	0.14
544	0.14
545	0.16
546	0.18
547	0.16
548	0.15
549	0.16
550	0.15
551	0.15
552	0.15
553	0.14
554	0.13
555	0.14
556	0.14
557	0.13
558	0.12
559	0.12
560	0.11
561	0.11
562	0.16
563	0.16
564	0.19
565	0.22
566	0.27
567	0.31
568	0.32
569	0.35
570	0.37
571	0.37
572	0.35
573	0.34
574	0.29
575	0.24
576	0.22
577	0.16
578	0.09
579	0.08
580	0.07
581	0.04
582	0.04
583	0.04
584	0.04
585	0.04
586	0.04
587	0.04
588	0.04
589	0.04
590	0.05
591	0.06
592	0.09
593	0.09
594	0.1
595	0.11
596	0.15
597	0.17
598	0.19
599	0.19
600	0.2
601	0.22
602	0.22
603	0.21
604	0.21
605	0.2
606	0.17
607	0.16
608	0.12
609	0.11
610	0.11
611	0.1
612	0.08
613	0.08
614	0.08
615	0.08
616	0.08
617	0.07
618	0.07
619	0.08
620	0.06
621	0.05
622	0.06
623	0.06
624	0.06
625	0.06
626	0.05
627	0.04
628	0.04
629	0.04
630	0.04
631	0.04
632	0.05
633	0.05
634	0.06
635	0.07
636	0.07
637	0.07
638	0.08
639	0.1
640	0.11
641	0.11
642	0.13
643	0.14
644	0.17
645	0.18
646	0.22
647	0.29
648	0.37
649	0.41
650	0.44
651	0.51
652	0.52
653	0.54
654	0.57
655	0.57
656	0.58
657	0.55
658	0.55
659	0.51
660	0.48
661	0.47
662	0.4
663	0.31
664	0.21
665	0.19
666	0.14
667	0.11
668	0.1
669	0.07
670	0.07
671	0.07
672	0.07
673	0.08
674	0.1
675	0.11
676	0.12
677	0.15
678	0.15
679	0.16
680	0.22
681	0.23
682	0.28
683	0.35
684	0.37
685	0.42
686	0.47
687	0.49
688	0.44
689	0.49
690	0.44
691	0.37
692	0.35
693	0.27
694	0.27
695	0.31
696	0.32
697	0.28
698	0.27
699	0.26
700	0.3
701	0.3
702	0.31
703	0.31
704	0.38
705	0.44
706	0.51
707	0.53
708	0.52
709	0.57
710	0.57
711	0.54
712	0.51
713	0.43
714	0.4
715	0.43
716	0.42
717	0.42
718	0.38
719	0.35
720	0.37
721	0.35
722	0.32
723	0.31
724	0.34
725	0.33
726	0.36
727	0.35
728	0.28
729	0.32
730	0.32
731	0.28
732	0.26
733	0.24
734	0.22
735	0.21
736	0.22
737	0.2
738	0.25
739	0.25
740	0.22
741	0.25
742	0.24
743	0.26
744	0.32
745	0.38
746	0.34
747	0.35
748	0.36
749	0.32
750	0.32
751	0.3
752	0.23
753	0.23
754	0.23
755	0.24
756	0.24
757	0.24
758	0.25
759	0.27
760	0.27
761	0.23
762	0.2
763	0.19
764	0.2
765	0.2
766	0.2
767	0.17
768	0.16
769	0.14
770	0.13
771	0.15
772	0.15
773	0.16
774	0.15
775	0.15
776	0.17
777	0.19
778	0.19
779	0.18
780	0.19
781	0.22
782	0.26
783	0.28
784	0.26
785	0.25
786	0.24
787	0.23
788	0.22
789	0.18
790	0.2
791	0.18
792	0.19
793	0.2
794	0.21
795	0.23
796	0.23
797	0.23
798	0.21
799	0.24
800	0.22
801	0.21
802	0.2
803	0.17
804	0.15
805	0.14
806	0.1

A1CSY3

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer