FuNGI

A1CHW3

Protein Details

Accession

A1CHW3

Localization Confidence

High

Confidence Score

17.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
559-583	GDQARAAKRVRKSRLPKEYDPSKTP	Hydrophilic
587-615	RWLPLRDRSTYRPKGRKGKQRAAERTQGG	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
552-608	ARKRPSGGDQARAAKRVRKSRLPKEYDPSKTPDPERWLPLRDRSTYRPKGRKGKQRA
636-648	GGAGAKKKKKGKR

Subcellular Location(s)

nucl 20.5, cyto_nucl 13, cyto 4.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR013699 Signal_recog_part_SRP72_RNA-bd IPR026270 SRP72 IPR031545 SRP_TPR-like IPR011990 TPR-like_helical_dom_sf
Gene Ontology	GO:0005783 C:endoplasmic reticulum GO:0005786 C:signal recognition particle, endoplasmic reticulum targeting GO:0008312 F:7S RNA binding GO:0006614 P:SRP-dependent cotranslational protein targeting to membrane
KEGG	act:ACLA_049400 -
Pfam	View protein in Pfam PF08492 SRP72 PF17004 SRP_TPR_like

Amino Acid Sequences

MATQSLTSLLQRASIDDHDELLRSANAELSRSKSDLHAQHVKVVALLKLDRYEDCLRVFEENGEALKKKAALEYAYALYKLNRSDEAISVVSGLTSGRGANHLEAQASYRAEKFTRTAQLYEDLAKDKASLGHEENDLRINSWAADAQLQWKGYPEYVRHTRPTRDDLEAFETVYNAACLSIAKGDFAQAEMLLKRAKELCRTSEDLTPEDRAAELLPISVQQLYVLIRQGKSEEAESVLKEISVKDISEFSTRKIAQHNITLVRDTAANPYVLYKALHETPDSTDSDKLFDYQNNVMMGNSHAADLLVQKYDGIIRSASKVLSKAPYPSTEARTNLISVYSAAAHAQGQTGLKALKSTLPVLERRPKDVGLVLTAVQLYVSAGNTTSAISTLEKLLQNLDESISEQEQDVRFNPGLLTVLISLYKLEGRKVQIRSELAKAAKHWRNRAEASQPLLRDAGASLLHSSDPADLTLSGDIFKDLYQKNTNDRFAVAGYVASQATLDYAKIESQLNTLPAVEDLIADVDIAALEQAGVSPSSATAAAAAAAIAGARKRPSGGDQARAAKRVRKSRLPKEYDPSKTPDPERWLPLRDRSTYRPKGRKGKQRAAERTQGGVVNEKAEAATATPVQQQKSGGGAGAKKKKKGKR

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.21
2	0.25
3	0.22
4	0.24
5	0.21
6	0.22
7	0.21
8	0.19
9	0.17
10	0.14
11	0.13
12	0.16
13	0.16
14	0.17
15	0.2
16	0.23
17	0.26
18	0.26
19	0.27
20	0.26
21	0.34
22	0.37
23	0.42
24	0.46
25	0.43
26	0.48
27	0.5
28	0.47
29	0.4
30	0.37
31	0.3
32	0.25
33	0.25
34	0.21
35	0.21
36	0.23
37	0.21
38	0.26
39	0.29
40	0.28
41	0.29
42	0.29
43	0.27
44	0.28
45	0.29
46	0.24
47	0.22
48	0.2
49	0.2
50	0.22
51	0.21
52	0.19
53	0.21
54	0.21
55	0.2
56	0.21
57	0.23
58	0.21
59	0.23
60	0.26
61	0.27
62	0.26
63	0.25
64	0.23
65	0.21
66	0.22
67	0.22
68	0.2
69	0.19
70	0.2
71	0.22
72	0.23
73	0.26
74	0.23
75	0.21
76	0.18
77	0.17
78	0.13
79	0.11
80	0.09
81	0.06
82	0.05
83	0.06
84	0.06
85	0.08
86	0.1
87	0.12
88	0.16
89	0.16
90	0.16
91	0.16
92	0.18
93	0.2
94	0.2
95	0.2
96	0.18
97	0.19
98	0.19
99	0.22
100	0.21
101	0.25
102	0.32
103	0.33
104	0.32
105	0.32
106	0.36
107	0.35
108	0.35
109	0.31
110	0.25
111	0.23
112	0.22
113	0.2
114	0.17
115	0.19
116	0.18
117	0.19
118	0.2
119	0.23
120	0.25
121	0.26
122	0.26
123	0.26
124	0.25
125	0.21
126	0.19
127	0.16
128	0.14
129	0.14
130	0.13
131	0.09
132	0.11
133	0.1
134	0.13
135	0.16
136	0.16
137	0.16
138	0.17
139	0.18
140	0.19
141	0.23
142	0.21
143	0.26
144	0.33
145	0.38
146	0.43
147	0.47
148	0.51
149	0.52
150	0.56
151	0.52
152	0.5
153	0.46
154	0.42
155	0.43
156	0.37
157	0.32
158	0.26
159	0.22
160	0.16
161	0.15
162	0.12
163	0.06
164	0.05
165	0.05
166	0.05
167	0.05
168	0.08
169	0.08
170	0.08
171	0.08
172	0.1
173	0.1
174	0.1
175	0.1
176	0.07
177	0.09
178	0.09
179	0.11
180	0.11
181	0.11
182	0.13
183	0.17
184	0.2
185	0.25
186	0.29
187	0.31
188	0.35
189	0.4
190	0.4
191	0.39
192	0.39
193	0.33
194	0.32
195	0.3
196	0.24
197	0.2
198	0.17
199	0.13
200	0.11
201	0.1
202	0.07
203	0.06
204	0.06
205	0.06
206	0.06
207	0.06
208	0.06
209	0.05
210	0.06
211	0.07
212	0.08
213	0.12
214	0.14
215	0.14
216	0.14
217	0.15
218	0.15
219	0.15
220	0.15
221	0.12
222	0.12
223	0.13
224	0.13
225	0.13
226	0.12
227	0.11
228	0.1
229	0.1
230	0.1
231	0.1
232	0.09
233	0.09
234	0.1
235	0.12
236	0.17
237	0.18
238	0.16
239	0.24
240	0.24
241	0.25
242	0.29
243	0.31
244	0.28
245	0.32
246	0.35
247	0.31
248	0.31
249	0.3
250	0.25
251	0.21
252	0.19
253	0.16
254	0.14
255	0.11
256	0.11
257	0.1
258	0.11
259	0.11
260	0.11
261	0.11
262	0.09
263	0.1
264	0.12
265	0.13
266	0.12
267	0.13
268	0.14
269	0.17
270	0.17
271	0.16
272	0.16
273	0.16
274	0.17
275	0.15
276	0.14
277	0.12
278	0.12
279	0.15
280	0.14
281	0.17
282	0.16
283	0.16
284	0.15
285	0.14
286	0.13
287	0.1
288	0.1
289	0.06
290	0.06
291	0.06
292	0.06
293	0.07
294	0.07
295	0.06
296	0.05
297	0.05
298	0.06
299	0.07
300	0.07
301	0.07
302	0.07
303	0.07
304	0.09
305	0.1
306	0.1
307	0.1
308	0.1
309	0.12
310	0.13
311	0.13
312	0.15
313	0.16
314	0.17
315	0.2
316	0.23
317	0.25
318	0.27
319	0.27
320	0.26
321	0.24
322	0.23
323	0.19
324	0.16
325	0.11
326	0.08
327	0.07
328	0.06
329	0.06
330	0.05
331	0.05
332	0.05
333	0.05
334	0.05
335	0.06
336	0.06
337	0.06
338	0.07
339	0.07
340	0.07
341	0.07
342	0.07
343	0.08
344	0.1
345	0.11
346	0.12
347	0.15
348	0.17
349	0.23
350	0.31
351	0.29
352	0.32
353	0.33
354	0.31
355	0.29
356	0.29
357	0.24
358	0.17
359	0.17
360	0.14
361	0.12
362	0.12
363	0.1
364	0.07
365	0.06
366	0.05
367	0.05
368	0.04
369	0.04
370	0.04
371	0.05
372	0.05
373	0.05
374	0.05
375	0.05
376	0.06
377	0.06
378	0.07
379	0.07
380	0.11
381	0.11
382	0.11
383	0.12
384	0.12
385	0.12
386	0.12
387	0.11
388	0.08
389	0.08
390	0.1
391	0.09
392	0.09
393	0.08
394	0.12
395	0.12
396	0.13
397	0.13
398	0.15
399	0.15
400	0.15
401	0.15
402	0.12
403	0.12
404	0.11
405	0.11
406	0.07
407	0.07
408	0.07
409	0.07
410	0.06
411	0.06
412	0.09
413	0.08
414	0.09
415	0.13
416	0.17
417	0.24
418	0.27
419	0.3
420	0.33
421	0.36
422	0.37
423	0.37
424	0.38
425	0.32
426	0.31
427	0.31
428	0.36
429	0.38
430	0.41
431	0.45
432	0.45
433	0.5
434	0.51
435	0.54
436	0.5
437	0.49
438	0.48
439	0.45
440	0.4
441	0.35
442	0.32
443	0.26
444	0.2
445	0.15
446	0.13
447	0.09
448	0.09
449	0.08
450	0.09
451	0.09
452	0.08
453	0.09
454	0.07
455	0.08
456	0.07
457	0.08
458	0.07
459	0.08
460	0.09
461	0.08
462	0.08
463	0.08
464	0.08
465	0.07
466	0.07
467	0.14
468	0.14
469	0.2
470	0.25
471	0.28
472	0.36
473	0.43
474	0.45
475	0.39
476	0.38
477	0.34
478	0.29
479	0.27
480	0.18
481	0.11
482	0.1
483	0.11
484	0.1
485	0.08
486	0.08
487	0.06
488	0.07
489	0.07
490	0.07
491	0.06
492	0.07
493	0.07
494	0.09
495	0.11
496	0.1
497	0.12
498	0.15
499	0.15
500	0.15
501	0.14
502	0.13
503	0.11
504	0.12
505	0.09
506	0.07
507	0.06
508	0.06
509	0.06
510	0.05
511	0.05
512	0.04
513	0.04
514	0.04
515	0.03
516	0.02
517	0.02
518	0.02
519	0.03
520	0.04
521	0.04
522	0.04
523	0.04
524	0.05
525	0.06
526	0.06
527	0.06
528	0.06
529	0.05
530	0.06
531	0.05
532	0.05
533	0.04
534	0.04
535	0.04
536	0.05
537	0.05
538	0.08
539	0.09
540	0.1
541	0.11
542	0.14
543	0.18
544	0.28
545	0.33
546	0.38
547	0.43
548	0.52
549	0.55
550	0.58
551	0.57
552	0.52
553	0.55
554	0.58
555	0.6
556	0.61
557	0.68
558	0.74
559	0.82
560	0.84
561	0.83
562	0.83
563	0.84
564	0.81
565	0.75
566	0.72
567	0.68
568	0.66
569	0.62
570	0.6
571	0.59
572	0.58
573	0.6
574	0.59
575	0.58
576	0.57
577	0.63
578	0.61
579	0.59
580	0.59
581	0.6
582	0.66
583	0.7
584	0.75
585	0.75
586	0.78
587	0.83
588	0.87
589	0.89
590	0.89
591	0.89
592	0.87
593	0.89
594	0.89
595	0.86
596	0.85
597	0.77
598	0.7
599	0.63
600	0.57
601	0.47
602	0.44
603	0.37
604	0.29
605	0.26
606	0.23
607	0.19
608	0.16
609	0.15
610	0.1
611	0.12
612	0.11
613	0.13
614	0.2
615	0.24
616	0.25
617	0.27
618	0.27
619	0.26
620	0.28
621	0.26
622	0.22
623	0.23
624	0.28
625	0.35
626	0.44
627	0.49
628	0.54

A1CHW3

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer