Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q2UBL4

Protein Details
Accession Q2UBL4    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
298-323ITLLKAKPAEKKDNKRPKRDQSSDETHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
183-196DKHERREGRIARKR
304-316KPAEKKDNKRPKR
Subcellular Location(s) nucl 13, mito 11, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR022801  Ribosomal_S4/S9  
IPR018079  Ribosomal_S4_CS  
IPR002942  S4_RNA-bd  
IPR036986  S4_RNA-bd_sf  
Gene Ontology GO:0015935  C:small ribosomal subunit  
GO:0019843  F:rRNA binding  
GO:0003735  F:structural constituent of ribosome  
KEGG aor:AO090012000950  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01479  S4  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00632  RIBOSOMAL_S4  
PS50889  S4  
CDD cd00165  S4  
Amino Acid Sequences MRNRATTPLSKPKLRQSWSKYNLFNLQRLRNPPTGSKTFFQQKWTAKSMARSYHGEQVRESQWARMFSRRIRSVVPMSPARLAQDDGSGMSAGRGAGVEGTKDFPRLTPFTQMTFAPLERRLDVAIFRAMFASSARQARQFVVHGAVTVNGKQMRYPGYLLNPGDLFQVDPERVMYATGAPKDKHERREGRIARKRSAEAQEAEAEAKEEGATEESGENKEAESEEQGQKKENDDPRETLKVLLAQAKTIMAGSKDVLPAKRKQELRGFQKAVKRVLSRSDSSTVLADNLESQFSELITLLKAKPAEKKDNKRPKRDQSSDETQNVSESASESATASESQPGEALTEAFRQAAENPEEEVDTSELTDEELDVLKRALVQMRDNPIDSTKPYATPWRPRDYMSAFAFIPRYLEVNHNICAAVYLRHPVARPGYSEVPTPFGEPVGTAAFAWYLRRR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.72
2 0.73
3 0.72
4 0.76
5 0.76
6 0.79
7 0.72
8 0.68
9 0.73
10 0.67
11 0.65
12 0.62
13 0.62
14 0.61
15 0.65
16 0.65
17 0.61
18 0.61
19 0.61
20 0.61
21 0.6
22 0.58
23 0.53
24 0.54
25 0.58
26 0.57
27 0.55
28 0.56
29 0.56
30 0.58
31 0.62
32 0.58
33 0.52
34 0.57
35 0.59
36 0.57
37 0.54
38 0.52
39 0.5
40 0.54
41 0.56
42 0.49
43 0.43
44 0.42
45 0.39
46 0.4
47 0.37
48 0.33
49 0.33
50 0.38
51 0.39
52 0.4
53 0.44
54 0.45
55 0.54
56 0.53
57 0.52
58 0.49
59 0.52
60 0.51
61 0.5
62 0.51
63 0.44
64 0.42
65 0.41
66 0.39
67 0.35
68 0.3
69 0.26
70 0.2
71 0.18
72 0.16
73 0.14
74 0.14
75 0.12
76 0.1
77 0.09
78 0.09
79 0.07
80 0.06
81 0.06
82 0.05
83 0.06
84 0.07
85 0.08
86 0.08
87 0.11
88 0.11
89 0.13
90 0.13
91 0.13
92 0.18
93 0.21
94 0.23
95 0.28
96 0.29
97 0.3
98 0.32
99 0.3
100 0.28
101 0.27
102 0.25
103 0.21
104 0.22
105 0.22
106 0.21
107 0.22
108 0.2
109 0.18
110 0.18
111 0.16
112 0.17
113 0.15
114 0.15
115 0.14
116 0.13
117 0.13
118 0.12
119 0.13
120 0.13
121 0.17
122 0.18
123 0.2
124 0.21
125 0.22
126 0.25
127 0.23
128 0.2
129 0.19
130 0.18
131 0.16
132 0.15
133 0.15
134 0.13
135 0.13
136 0.15
137 0.14
138 0.14
139 0.14
140 0.16
141 0.18
142 0.19
143 0.2
144 0.19
145 0.21
146 0.27
147 0.26
148 0.26
149 0.22
150 0.2
151 0.19
152 0.16
153 0.13
154 0.08
155 0.1
156 0.08
157 0.08
158 0.08
159 0.08
160 0.08
161 0.08
162 0.07
163 0.08
164 0.11
165 0.14
166 0.17
167 0.17
168 0.2
169 0.3
170 0.35
171 0.39
172 0.45
173 0.49
174 0.5
175 0.61
176 0.65
177 0.66
178 0.7
179 0.69
180 0.64
181 0.62
182 0.59
183 0.54
184 0.52
185 0.46
186 0.38
187 0.35
188 0.32
189 0.28
190 0.27
191 0.2
192 0.16
193 0.1
194 0.09
195 0.06
196 0.05
197 0.04
198 0.05
199 0.05
200 0.05
201 0.06
202 0.07
203 0.08
204 0.08
205 0.08
206 0.07
207 0.07
208 0.07
209 0.07
210 0.08
211 0.12
212 0.16
213 0.19
214 0.19
215 0.21
216 0.22
217 0.23
218 0.29
219 0.3
220 0.31
221 0.31
222 0.33
223 0.35
224 0.37
225 0.36
226 0.29
227 0.24
228 0.2
229 0.19
230 0.22
231 0.18
232 0.14
233 0.14
234 0.14
235 0.13
236 0.11
237 0.1
238 0.05
239 0.06
240 0.06
241 0.08
242 0.1
243 0.12
244 0.15
245 0.18
246 0.23
247 0.27
248 0.33
249 0.34
250 0.37
251 0.45
252 0.51
253 0.55
254 0.6
255 0.58
256 0.56
257 0.59
258 0.58
259 0.53
260 0.49
261 0.44
262 0.36
263 0.39
264 0.4
265 0.36
266 0.35
267 0.34
268 0.29
269 0.28
270 0.27
271 0.2
272 0.16
273 0.13
274 0.1
275 0.08
276 0.08
277 0.07
278 0.07
279 0.07
280 0.06
281 0.06
282 0.07
283 0.05
284 0.06
285 0.06
286 0.08
287 0.08
288 0.11
289 0.12
290 0.14
291 0.21
292 0.27
293 0.38
294 0.46
295 0.56
296 0.65
297 0.75
298 0.81
299 0.85
300 0.88
301 0.88
302 0.89
303 0.86
304 0.81
305 0.78
306 0.79
307 0.75
308 0.68
309 0.59
310 0.48
311 0.41
312 0.36
313 0.27
314 0.18
315 0.11
316 0.09
317 0.08
318 0.08
319 0.07
320 0.08
321 0.09
322 0.09
323 0.09
324 0.11
325 0.11
326 0.11
327 0.11
328 0.11
329 0.11
330 0.1
331 0.1
332 0.08
333 0.1
334 0.1
335 0.1
336 0.1
337 0.1
338 0.11
339 0.17
340 0.17
341 0.16
342 0.17
343 0.18
344 0.18
345 0.17
346 0.18
347 0.12
348 0.1
349 0.09
350 0.09
351 0.08
352 0.08
353 0.08
354 0.06
355 0.06
356 0.08
357 0.08
358 0.08
359 0.09
360 0.09
361 0.09
362 0.11
363 0.15
364 0.16
365 0.21
366 0.27
367 0.35
368 0.37
369 0.38
370 0.37
371 0.35
372 0.35
373 0.32
374 0.32
375 0.26
376 0.25
377 0.27
378 0.35
379 0.41
380 0.48
381 0.54
382 0.56
383 0.56
384 0.57
385 0.62
386 0.57
387 0.57
388 0.5
389 0.46
390 0.37
391 0.38
392 0.37
393 0.29
394 0.26
395 0.18
396 0.17
397 0.15
398 0.2
399 0.24
400 0.26
401 0.27
402 0.26
403 0.25
404 0.23
405 0.23
406 0.2
407 0.15
408 0.14
409 0.17
410 0.18
411 0.21
412 0.22
413 0.25
414 0.31
415 0.31
416 0.32
417 0.35
418 0.39
419 0.38
420 0.42
421 0.39
422 0.36
423 0.34
424 0.33
425 0.27
426 0.21
427 0.2
428 0.15
429 0.16
430 0.14
431 0.14
432 0.12
433 0.12
434 0.13
435 0.13