Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2L2TMC8

Protein Details
Accession A0A2L2TMC8    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
38-57RTMSTTKKPRGRPPGSASKIHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
44-63KKPRGRPPGSASKITKPAQR
130-134RGRPK
Subcellular Location(s) nucl 17.5, cyto_nucl 13.5, cyto 8.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017956  AT_hook_DNA-bd_motif  
IPR040349  Csm1/Pcs1  
IPR020981  Csm1/Pcs1_C  
IPR038608  Csm1/Pcs1_C_sf  
Gene Ontology GO:0033551  C:monopolin complex  
GO:0003677  F:DNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF12539  Csm1  
Amino Acid Sequences MPPRARAKPVAEPTGPAASDSEPDLDMFDKSDLQAAMRTMSTTKKPRGRPPGSASKITKPAQRATRRTGTEKLPAVPEVVAQPDTAFKANGSGTNATRKVQQMAPDETVTFEDIEGPSSVPATDVKKGTRGRPKKSNGDSSVLVPESTVKRRGRPPRQPGTLIAEVPETQQDDPMELDPVLEESENDNAGAIPEVETIVPWSSYDTSDDSTRWQLEDLTKKYTALEASHRDLREVGVREAERNFERLKKQAEERTAAATKLIAELKAELAAQTALANESEELRKQLEANETETENLEKTVKTLSNSLTEARSEIKSLSTKLAAARSNDTNPRVPGSAIKAGGLMNRNTQAGVAHAAQVAAQAKERLYADLTDLILRGVKQDEVEDTFDCIQTGRNGTLHFKLAVENDASDSYEDVSFTYQPQLDTGRDHDLIDVLPGYLTEEITFPRSQAPKFYARVNKSLTEDLTRQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.51
2 0.45
3 0.35
4 0.29
5 0.22
6 0.22
7 0.22
8 0.19
9 0.13
10 0.14
11 0.14
12 0.13
13 0.13
14 0.13
15 0.13
16 0.12
17 0.12
18 0.16
19 0.15
20 0.15
21 0.18
22 0.17
23 0.17
24 0.17
25 0.18
26 0.16
27 0.21
28 0.29
29 0.35
30 0.43
31 0.5
32 0.58
33 0.67
34 0.76
35 0.78
36 0.78
37 0.78
38 0.8
39 0.78
40 0.78
41 0.73
42 0.69
43 0.71
44 0.66
45 0.63
46 0.56
47 0.59
48 0.6
49 0.65
50 0.65
51 0.64
52 0.69
53 0.69
54 0.7
55 0.67
56 0.62
57 0.61
58 0.57
59 0.52
60 0.46
61 0.41
62 0.37
63 0.31
64 0.27
65 0.2
66 0.19
67 0.16
68 0.13
69 0.13
70 0.13
71 0.15
72 0.15
73 0.13
74 0.11
75 0.14
76 0.15
77 0.17
78 0.19
79 0.2
80 0.21
81 0.3
82 0.31
83 0.29
84 0.32
85 0.32
86 0.32
87 0.31
88 0.36
89 0.34
90 0.38
91 0.4
92 0.37
93 0.35
94 0.31
95 0.29
96 0.23
97 0.17
98 0.12
99 0.11
100 0.1
101 0.11
102 0.11
103 0.1
104 0.09
105 0.09
106 0.09
107 0.08
108 0.11
109 0.12
110 0.16
111 0.18
112 0.2
113 0.27
114 0.31
115 0.39
116 0.47
117 0.53
118 0.57
119 0.64
120 0.71
121 0.74
122 0.78
123 0.79
124 0.72
125 0.68
126 0.61
127 0.53
128 0.5
129 0.4
130 0.32
131 0.21
132 0.22
133 0.21
134 0.23
135 0.29
136 0.27
137 0.32
138 0.42
139 0.53
140 0.59
141 0.65
142 0.72
143 0.74
144 0.78
145 0.75
146 0.69
147 0.66
148 0.58
149 0.47
150 0.38
151 0.29
152 0.23
153 0.21
154 0.19
155 0.13
156 0.1
157 0.12
158 0.11
159 0.11
160 0.12
161 0.11
162 0.11
163 0.09
164 0.09
165 0.07
166 0.07
167 0.07
168 0.06
169 0.06
170 0.06
171 0.07
172 0.07
173 0.07
174 0.07
175 0.06
176 0.06
177 0.06
178 0.05
179 0.04
180 0.04
181 0.05
182 0.05
183 0.05
184 0.05
185 0.06
186 0.05
187 0.05
188 0.06
189 0.07
190 0.08
191 0.09
192 0.1
193 0.11
194 0.12
195 0.12
196 0.13
197 0.15
198 0.15
199 0.13
200 0.12
201 0.13
202 0.17
203 0.25
204 0.25
205 0.27
206 0.26
207 0.26
208 0.26
209 0.26
210 0.22
211 0.15
212 0.19
213 0.18
214 0.22
215 0.26
216 0.26
217 0.25
218 0.24
219 0.22
220 0.22
221 0.21
222 0.18
223 0.18
224 0.18
225 0.19
226 0.2
227 0.22
228 0.17
229 0.17
230 0.18
231 0.18
232 0.2
233 0.24
234 0.27
235 0.28
236 0.33
237 0.36
238 0.39
239 0.37
240 0.36
241 0.37
242 0.34
243 0.3
244 0.24
245 0.19
246 0.15
247 0.15
248 0.14
249 0.09
250 0.08
251 0.08
252 0.08
253 0.09
254 0.08
255 0.06
256 0.05
257 0.05
258 0.05
259 0.05
260 0.05
261 0.04
262 0.05
263 0.05
264 0.04
265 0.06
266 0.07
267 0.08
268 0.09
269 0.09
270 0.1
271 0.1
272 0.14
273 0.18
274 0.18
275 0.21
276 0.22
277 0.21
278 0.21
279 0.21
280 0.19
281 0.13
282 0.12
283 0.1
284 0.08
285 0.09
286 0.12
287 0.14
288 0.14
289 0.17
290 0.18
291 0.2
292 0.22
293 0.23
294 0.2
295 0.18
296 0.18
297 0.17
298 0.16
299 0.13
300 0.13
301 0.15
302 0.16
303 0.17
304 0.19
305 0.17
306 0.18
307 0.19
308 0.24
309 0.23
310 0.23
311 0.26
312 0.27
313 0.31
314 0.35
315 0.36
316 0.35
317 0.33
318 0.33
319 0.29
320 0.26
321 0.25
322 0.25
323 0.27
324 0.24
325 0.23
326 0.21
327 0.21
328 0.24
329 0.24
330 0.19
331 0.18
332 0.19
333 0.19
334 0.18
335 0.18
336 0.14
337 0.12
338 0.14
339 0.12
340 0.11
341 0.11
342 0.11
343 0.11
344 0.13
345 0.14
346 0.11
347 0.12
348 0.12
349 0.12
350 0.15
351 0.16
352 0.14
353 0.14
354 0.14
355 0.15
356 0.17
357 0.17
358 0.15
359 0.14
360 0.13
361 0.13
362 0.12
363 0.12
364 0.1
365 0.11
366 0.1
367 0.12
368 0.14
369 0.16
370 0.19
371 0.17
372 0.19
373 0.2
374 0.19
375 0.18
376 0.16
377 0.15
378 0.16
379 0.18
380 0.17
381 0.18
382 0.2
383 0.24
384 0.27
385 0.27
386 0.24
387 0.22
388 0.22
389 0.22
390 0.23
391 0.2
392 0.18
393 0.17
394 0.17
395 0.17
396 0.15
397 0.14
398 0.12
399 0.12
400 0.11
401 0.1
402 0.11
403 0.11
404 0.12
405 0.17
406 0.17
407 0.17
408 0.19
409 0.22
410 0.21
411 0.24
412 0.26
413 0.27
414 0.27
415 0.27
416 0.25
417 0.23
418 0.21
419 0.19
420 0.16
421 0.1
422 0.09
423 0.08
424 0.1
425 0.09
426 0.09
427 0.08
428 0.09
429 0.11
430 0.15
431 0.15
432 0.14
433 0.21
434 0.26
435 0.27
436 0.33
437 0.37
438 0.41
439 0.44
440 0.53
441 0.55
442 0.55
443 0.61
444 0.59
445 0.59
446 0.56
447 0.58
448 0.52