FuNGI

A0A2L2THU6

Protein Details

Accession

A0A2L2THU6

Localization Confidence

High

Confidence Score

23.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
466-499	EAPASSTKAEKKEKKRKSKETSEKKQKKMTLPER	Basic
534-557	QAEARSAAKKSKKQKTDRVGSPDL	Hydrophilic
615-648	SRAPSSPIRAKEKRSKKSKDSKKAASSKRETPVP	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
473-494	KAEKKEKKRKSKETSEKKQKKM
543-545	KSK
606-643	RSSPAPAPASRAPSSPIRAKEKRSKKSKDSKKAASSKR

Subcellular Location(s)

nucl 24.5, cyto_nucl 13.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR013240 DNA-dir_RNA_pol1_su_RPA34
Gene Ontology	GO:0006360 P:transcription by RNA polymerase I
Pfam	View protein in Pfam PF08208 RNA_polI_A34

Amino Acid Sequences

MAPKEPFKVHSLSKHIENTKKGLSADSQTNRRLAGRSTVVKKESSDPNKIFANNDDDEGSGSDSDSDSSSDEAPGSFLERLTAGTKSAPAKPTPVKSTPQSARRRSKDEEIADSDDERKAFNNKASSKKSAPKPESSSDSSSESDSDDEKANTKANGTIPAKDADSSSSSSESDSDSESDEEDKEKAPAAKISAEKKDDSESSSSESESEDEAESKSKPAVNGTAATATSDSESESSDSESESEKEQPAKPTTKAVSKPAAKPAAKSTATVSDSSSSEEDSDDEMVDESMHIEDREGQVAIPNFIAPDFVLRKGDDGTSGKDVAEVCNKANLEGKQFWYFTVPSDVPISVIQNLEIPMNQSSAGNKLFSHGGDDYGFSFECIAPKSNIQIMIPSSDASQYQSAPKQIDQMMQIKKITPLGANRSVGPTPKPAPRAQPAGLKARYQPIGVNEPMGTISDGEDVEMAEAPASSTKAEKKEKKRKSKETSEKKQKKMTLPERPSAQSVEEPTPDTRKNKRKLAASEDDAAAATEQLQAEARSAAKKSKKQKTDRVGSPDLGSEPASVAKKQTPVLPPTFPTAGTPTSKQKKVKESAVPIPSIPHSSPPRSSPAPAPASRAPSSPIRAKEKRSKKSKDSKKAASSKRETPVPPPVPGSSSE

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.6
2	0.64
3	0.66
4	0.64
5	0.61
6	0.58
7	0.57
8	0.51
9	0.45
10	0.41
11	0.39
12	0.45
13	0.47
14	0.49
15	0.48
16	0.49
17	0.48
18	0.46
19	0.43
20	0.36
21	0.36
22	0.37
23	0.43
24	0.48
25	0.54
26	0.54
27	0.53
28	0.53
29	0.52
30	0.54
31	0.53
32	0.56
33	0.5
34	0.52
35	0.55
36	0.53
37	0.48
38	0.42
39	0.42
40	0.33
41	0.33
42	0.29
43	0.24
44	0.24
45	0.22
46	0.19
47	0.13
48	0.12
49	0.11
50	0.1
51	0.11
52	0.1
53	0.1
54	0.09
55	0.11
56	0.11
57	0.11
58	0.11
59	0.11
60	0.1
61	0.1
62	0.12
63	0.11
64	0.1
65	0.11
66	0.1
67	0.12
68	0.14
69	0.14
70	0.12
71	0.13
72	0.17
73	0.2
74	0.26
75	0.27
76	0.27
77	0.34
78	0.4
79	0.46
80	0.49
81	0.5
82	0.5
83	0.5
84	0.59
85	0.6
86	0.62
87	0.66
88	0.68
89	0.74
90	0.76
91	0.79
92	0.75
93	0.76
94	0.75
95	0.7
96	0.67
97	0.61
98	0.58
99	0.52
100	0.48
101	0.41
102	0.34
103	0.29
104	0.22
105	0.19
106	0.19
107	0.22
108	0.26
109	0.33
110	0.37
111	0.47
112	0.52
113	0.57
114	0.6
115	0.65
116	0.69
117	0.7
118	0.69
119	0.68
120	0.69
121	0.68
122	0.68
123	0.64
124	0.59
125	0.5
126	0.48
127	0.41
128	0.35
129	0.29
130	0.24
131	0.2
132	0.17
133	0.16
134	0.15
135	0.15
136	0.16
137	0.17
138	0.19
139	0.18
140	0.18
141	0.19
142	0.18
143	0.27
144	0.27
145	0.27
146	0.27
147	0.28
148	0.28
149	0.25
150	0.23
151	0.17
152	0.17
153	0.16
154	0.16
155	0.16
156	0.15
157	0.15
158	0.15
159	0.14
160	0.13
161	0.12
162	0.11
163	0.12
164	0.12
165	0.12
166	0.13
167	0.12
168	0.12
169	0.12
170	0.12
171	0.11
172	0.14
173	0.15
174	0.15
175	0.17
176	0.17
177	0.22
178	0.26
179	0.31
180	0.35
181	0.35
182	0.35
183	0.34
184	0.36
185	0.31
186	0.29
187	0.26
188	0.21
189	0.22
190	0.22
191	0.2
192	0.17
193	0.17
194	0.15
195	0.13
196	0.13
197	0.09
198	0.09
199	0.1
200	0.11
201	0.11
202	0.11
203	0.12
204	0.13
205	0.13
206	0.14
207	0.16
208	0.16
209	0.17
210	0.17
211	0.17
212	0.15
213	0.16
214	0.14
215	0.11
216	0.09
217	0.08
218	0.07
219	0.06
220	0.07
221	0.07
222	0.07
223	0.08
224	0.08
225	0.08
226	0.08
227	0.09
228	0.1
229	0.11
230	0.13
231	0.14
232	0.18
233	0.2
234	0.25
235	0.29
236	0.32
237	0.31
238	0.35
239	0.36
240	0.39
241	0.4
242	0.39
243	0.43
244	0.44
245	0.46
246	0.48
247	0.53
248	0.46
249	0.45
250	0.44
251	0.44
252	0.4
253	0.37
254	0.31
255	0.3
256	0.31
257	0.29
258	0.26
259	0.19
260	0.19
261	0.2
262	0.18
263	0.12
264	0.11
265	0.1
266	0.1
267	0.09
268	0.09
269	0.07
270	0.07
271	0.07
272	0.06
273	0.06
274	0.05
275	0.04
276	0.04
277	0.05
278	0.04
279	0.04
280	0.06
281	0.07
282	0.08
283	0.08
284	0.08
285	0.1
286	0.11
287	0.11
288	0.09
289	0.08
290	0.07
291	0.07
292	0.07
293	0.04
294	0.08
295	0.08
296	0.09
297	0.11
298	0.11
299	0.12
300	0.12
301	0.13
302	0.12
303	0.12
304	0.14
305	0.14
306	0.15
307	0.14
308	0.14
309	0.14
310	0.13
311	0.16
312	0.14
313	0.13
314	0.15
315	0.15
316	0.15
317	0.19
318	0.18
319	0.18
320	0.19
321	0.22
322	0.22
323	0.22
324	0.21
325	0.19
326	0.19
327	0.15
328	0.18
329	0.15
330	0.14
331	0.15
332	0.14
333	0.13
334	0.13
335	0.13
336	0.09
337	0.09
338	0.08
339	0.08
340	0.09
341	0.08
342	0.08
343	0.08
344	0.07
345	0.08
346	0.08
347	0.07
348	0.07
349	0.1
350	0.11
351	0.1
352	0.1
353	0.1
354	0.11
355	0.11
356	0.14
357	0.11
358	0.11
359	0.11
360	0.11
361	0.11
362	0.11
363	0.11
364	0.08
365	0.08
366	0.07
367	0.09
368	0.1
369	0.11
370	0.1
371	0.11
372	0.13
373	0.14
374	0.15
375	0.14
376	0.14
377	0.13
378	0.14
379	0.14
380	0.12
381	0.1
382	0.1
383	0.1
384	0.1
385	0.1
386	0.1
387	0.13
388	0.15
389	0.17
390	0.18
391	0.18
392	0.21
393	0.21
394	0.23
395	0.23
396	0.28
397	0.29
398	0.3
399	0.3
400	0.27
401	0.27
402	0.26
403	0.23
404	0.19
405	0.2
406	0.24
407	0.29
408	0.29
409	0.29
410	0.3
411	0.3
412	0.29
413	0.26
414	0.24
415	0.23
416	0.27
417	0.31
418	0.3
419	0.36
420	0.39
421	0.43
422	0.41
423	0.43
424	0.42
425	0.47
426	0.47
427	0.42
428	0.39
429	0.38
430	0.37
431	0.31
432	0.29
433	0.24
434	0.27
435	0.26
436	0.25
437	0.19
438	0.18
439	0.18
440	0.16
441	0.12
442	0.07
443	0.08
444	0.08
445	0.08
446	0.07
447	0.07
448	0.06
449	0.07
450	0.07
451	0.06
452	0.04
453	0.04
454	0.04
455	0.05
456	0.06
457	0.06
458	0.08
459	0.13
460	0.21
461	0.31
462	0.4
463	0.51
464	0.61
465	0.72
466	0.81
467	0.87
468	0.9
469	0.9
470	0.92
471	0.92
472	0.93
473	0.94
474	0.94
475	0.93
476	0.89
477	0.88
478	0.84
479	0.81
480	0.81
481	0.8
482	0.8
483	0.76
484	0.75
485	0.71
486	0.66
487	0.6
488	0.5
489	0.42
490	0.34
491	0.32
492	0.3
493	0.26
494	0.26
495	0.27
496	0.31
497	0.34
498	0.37
499	0.43
500	0.5
501	0.57
502	0.63
503	0.67
504	0.7
505	0.72
506	0.75
507	0.73
508	0.67
509	0.63
510	0.54
511	0.48
512	0.39
513	0.32
514	0.22
515	0.14
516	0.1
517	0.08
518	0.08
519	0.08
520	0.09
521	0.09
522	0.1
523	0.11
524	0.13
525	0.13
526	0.15
527	0.23
528	0.31
529	0.39
530	0.48
531	0.57
532	0.66
533	0.72
534	0.81
535	0.83
536	0.85
537	0.86
538	0.84
539	0.79
540	0.71
541	0.62
542	0.54
543	0.44
544	0.35
545	0.27
546	0.19
547	0.15
548	0.18
549	0.18
550	0.17
551	0.19
552	0.22
553	0.24
554	0.26
555	0.32
556	0.34
557	0.38
558	0.42
559	0.43
560	0.41
561	0.43
562	0.42
563	0.35
564	0.31
565	0.29
566	0.28
567	0.28
568	0.31
569	0.36
570	0.44
571	0.51
572	0.56
573	0.6
574	0.66
575	0.7
576	0.74
577	0.73
578	0.72
579	0.74
580	0.72
581	0.66
582	0.56
583	0.52
584	0.45
585	0.41
586	0.33
587	0.33
588	0.34
589	0.38
590	0.41
591	0.42
592	0.47
593	0.45
594	0.48
595	0.46
596	0.48
597	0.51
598	0.49
599	0.52
600	0.5
601	0.53
602	0.51
603	0.46
604	0.41
605	0.39
606	0.44
607	0.45
608	0.48
609	0.51
610	0.56
611	0.64
612	0.71
613	0.75
614	0.79
615	0.82
616	0.84
617	0.85
618	0.9
619	0.92
620	0.92
621	0.92
622	0.91
623	0.92
624	0.92
625	0.91
626	0.9
627	0.86
628	0.84
629	0.81
630	0.79
631	0.71
632	0.67
633	0.69
634	0.63
635	0.59
636	0.55
637	0.5

A0A2L2THU6

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer