Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2L2SPQ5

Protein Details
Accession A0A2L2SPQ5    Localization Confidence High Confidence Score 17.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
55-84VYHPTESWLQRRDRKKREKKEKLERLVTEAHydrophilic
135-155TDTHADEKPNKKKKAHRGYAFBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
65-76RRDRKKREKKEK
144-149NKKKKA
236-310KVDVERGRTVKGWRPRRLGGGLGGRGYTRAMASRPMGPGGFGGPGGGGFRGGPRGFDGGRGRGGHRGGFGGRGGG
Subcellular Location(s) nucl 11.5, mito 8, cyto_nucl 8, cyto 3.5, extr 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
IPR022023  U1snRNP70_N  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:1990904  C:ribonucleoprotein complex  
GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PF12220  U1snRNP70_N  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MTDKLPPNLLALFAARPPLRWVEAPDYAPQNRKTAPISGVAQFLPELQKYKETDVYHPTESWLQRRDRKKREKKEKLERLVTEAPEHYRPDKDTNIRGDAFKTLIVARLSYEADEKDLEKEFGRYGPIERIRIVTDTHADEKPNKKKKAHRGYAFVVFEREKDMRAICFLPRMYLLSRGPQACPSLEVYGETSLGPQACPSLPLPFLLSNPFSTRGTIEAALDSCDGMRIKDRRIKVDVERGRTVKGWRPRRLGGGLGGRGYTRAMASRPMGPGGFGGPGGGGFRGGPRGFDGGRGRGGHRGGFGGRGGGFRSGGGDFSRGGDRGGYGAPSDAPSGPGFDRRNGGHGDRDRGDRGDRGDRRGDRGPGGYDSRGGGRSYDDRQGGGHRDGGRFGGDRENRRTGSNNEPIGRREGGYRERDRDFDRPRDDDGGRKRGYDGGYEDPRKLRRY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.23
2 0.2
3 0.21
4 0.24
5 0.27
6 0.28
7 0.29
8 0.33
9 0.33
10 0.39
11 0.4
12 0.42
13 0.45
14 0.46
15 0.51
16 0.48
17 0.46
18 0.42
19 0.44
20 0.42
21 0.4
22 0.38
23 0.37
24 0.38
25 0.34
26 0.35
27 0.31
28 0.28
29 0.23
30 0.23
31 0.2
32 0.18
33 0.2
34 0.19
35 0.25
36 0.26
37 0.31
38 0.36
39 0.35
40 0.39
41 0.43
42 0.47
43 0.44
44 0.41
45 0.39
46 0.4
47 0.41
48 0.43
49 0.42
50 0.46
51 0.51
52 0.62
53 0.7
54 0.74
55 0.81
56 0.85
57 0.89
58 0.92
59 0.95
60 0.95
61 0.96
62 0.96
63 0.94
64 0.92
65 0.83
66 0.79
67 0.74
68 0.65
69 0.57
70 0.49
71 0.42
72 0.37
73 0.39
74 0.33
75 0.3
76 0.32
77 0.34
78 0.4
79 0.42
80 0.45
81 0.48
82 0.51
83 0.49
84 0.47
85 0.42
86 0.36
87 0.3
88 0.23
89 0.19
90 0.14
91 0.17
92 0.16
93 0.15
94 0.13
95 0.15
96 0.15
97 0.14
98 0.16
99 0.12
100 0.13
101 0.14
102 0.14
103 0.14
104 0.15
105 0.16
106 0.14
107 0.15
108 0.15
109 0.15
110 0.16
111 0.15
112 0.15
113 0.23
114 0.27
115 0.27
116 0.27
117 0.28
118 0.27
119 0.27
120 0.26
121 0.19
122 0.18
123 0.2
124 0.23
125 0.22
126 0.22
127 0.28
128 0.36
129 0.45
130 0.51
131 0.55
132 0.58
133 0.66
134 0.76
135 0.81
136 0.81
137 0.78
138 0.75
139 0.73
140 0.74
141 0.66
142 0.56
143 0.48
144 0.38
145 0.31
146 0.29
147 0.24
148 0.17
149 0.16
150 0.17
151 0.14
152 0.16
153 0.17
154 0.14
155 0.18
156 0.17
157 0.16
158 0.16
159 0.17
160 0.16
161 0.2
162 0.2
163 0.19
164 0.24
165 0.24
166 0.24
167 0.24
168 0.24
169 0.19
170 0.2
171 0.18
172 0.14
173 0.13
174 0.13
175 0.12
176 0.11
177 0.11
178 0.09
179 0.08
180 0.08
181 0.08
182 0.07
183 0.06
184 0.07
185 0.06
186 0.08
187 0.08
188 0.09
189 0.09
190 0.1
191 0.12
192 0.11
193 0.12
194 0.13
195 0.13
196 0.12
197 0.14
198 0.16
199 0.14
200 0.14
201 0.14
202 0.13
203 0.13
204 0.13
205 0.11
206 0.09
207 0.09
208 0.09
209 0.09
210 0.07
211 0.06
212 0.07
213 0.07
214 0.06
215 0.12
216 0.13
217 0.18
218 0.23
219 0.26
220 0.29
221 0.32
222 0.35
223 0.34
224 0.42
225 0.43
226 0.43
227 0.45
228 0.42
229 0.4
230 0.38
231 0.37
232 0.34
233 0.38
234 0.43
235 0.46
236 0.5
237 0.51
238 0.53
239 0.52
240 0.46
241 0.42
242 0.38
243 0.32
244 0.27
245 0.25
246 0.21
247 0.19
248 0.17
249 0.13
250 0.07
251 0.07
252 0.07
253 0.1
254 0.12
255 0.15
256 0.15
257 0.16
258 0.15
259 0.14
260 0.14
261 0.12
262 0.1
263 0.07
264 0.06
265 0.05
266 0.05
267 0.05
268 0.05
269 0.04
270 0.04
271 0.05
272 0.09
273 0.09
274 0.1
275 0.11
276 0.14
277 0.14
278 0.2
279 0.22
280 0.2
281 0.24
282 0.25
283 0.25
284 0.26
285 0.27
286 0.23
287 0.2
288 0.2
289 0.17
290 0.17
291 0.16
292 0.13
293 0.13
294 0.12
295 0.13
296 0.12
297 0.11
298 0.1
299 0.11
300 0.1
301 0.1
302 0.1
303 0.1
304 0.09
305 0.11
306 0.13
307 0.12
308 0.12
309 0.11
310 0.1
311 0.11
312 0.11
313 0.09
314 0.08
315 0.08
316 0.08
317 0.09
318 0.11
319 0.09
320 0.11
321 0.1
322 0.13
323 0.13
324 0.2
325 0.21
326 0.22
327 0.26
328 0.25
329 0.28
330 0.29
331 0.31
332 0.32
333 0.35
334 0.39
335 0.38
336 0.42
337 0.41
338 0.39
339 0.4
340 0.34
341 0.35
342 0.39
343 0.39
344 0.41
345 0.47
346 0.48
347 0.51
348 0.54
349 0.52
350 0.45
351 0.44
352 0.42
353 0.37
354 0.39
355 0.34
356 0.29
357 0.27
358 0.26
359 0.25
360 0.22
361 0.18
362 0.18
363 0.22
364 0.25
365 0.31
366 0.28
367 0.27
368 0.28
369 0.33
370 0.34
371 0.31
372 0.33
373 0.31
374 0.31
375 0.32
376 0.31
377 0.29
378 0.24
379 0.24
380 0.28
381 0.31
382 0.37
383 0.43
384 0.49
385 0.48
386 0.49
387 0.53
388 0.48
389 0.52
390 0.53
391 0.54
392 0.51
393 0.53
394 0.52
395 0.52
396 0.49
397 0.4
398 0.35
399 0.35
400 0.39
401 0.45
402 0.51
403 0.52
404 0.53
405 0.57
406 0.58
407 0.61
408 0.61
409 0.61
410 0.61
411 0.58
412 0.6
413 0.62
414 0.59
415 0.58
416 0.59
417 0.59
418 0.53
419 0.51
420 0.48
421 0.46
422 0.45
423 0.41
424 0.37
425 0.37
426 0.45
427 0.47
428 0.5
429 0.52