FuNGI

A0A2L2SQK7

Protein Details

Accession

A0A2L2SQK7

Localization Confidence

Low

Confidence Score

9.6

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
96-119	AADERKARGRSRFRSKRSRGDAMG	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
95-117	RAADERKARGRSRFRSKRSRGDA

Subcellular Location(s)

mito 21, nucl 4.5, cyto_nucl 3.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007811 RPC4
Gene Ontology	GO:0005666 C:RNA polymerase III complex GO:0003677 F:DNA binding GO:0006383 P:transcription by RNA polymerase III
Pfam	View protein in Pfam PF05132 RNA_pol_Rpc4

Amino Acid Sequences

MNRGRASARGTRRGAAAAGSRATDESSAGPSTTQANSGSATPAPQSTSSTPTRGGTTARATRAPAAGRFRPKNVRRDEAERDTLARQEEQKASERAADERKARGRSRFRSKRSRGDAMGRGGFGRVISGASGPFSSGAGAIGSGGRGGGGWFGGGGGGGAGGGRGFKSDSKTGFAQATRNREARINADKLHIHTPDEDLDSEDEAMMEALNSRAVSVLPMGIYRREHKDEGIIVATTAELEAAENAQAVPPPQSKEVEESLWVDGEAGELPPMGENREDGGIWDNDSKPTVVKKEQDESMDLDLENKVDIETESKDTSTTPVPQTKKPAQETEEAMIRSDLEILANELGAVEISDSAEGEGAKTQGPSNKDGRMYLFQFPPVLPPLKQIAQPKSNKIKSEPTEGEDNVLESTPAAADASPVDLTNDTNTGFNIPGFEDPEQKAGFMSSLLSSGGMVGQLKVRKSGRVEMDWGGSTMELSPAVGMNFLTTAVIVEENDEKPRPGVVGGESIGMGKIMGRFVLAPKWDEEEEWEVSSEDLRI

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.44
2	0.38
3	0.35
4	0.3
5	0.28
6	0.26
7	0.25
8	0.23
9	0.23
10	0.19
11	0.15
12	0.12
13	0.14
14	0.15
15	0.14
16	0.14
17	0.14
18	0.17
19	0.17
20	0.18
21	0.15
22	0.16
23	0.17
24	0.18
25	0.19
26	0.16
27	0.16
28	0.15
29	0.16
30	0.17
31	0.17
32	0.21
33	0.21
34	0.27
35	0.29
36	0.3
37	0.32
38	0.31
39	0.33
40	0.29
41	0.29
42	0.28
43	0.33
44	0.37
45	0.38
46	0.38
47	0.37
48	0.39
49	0.41
50	0.4
51	0.37
52	0.39
53	0.43
54	0.51
55	0.53
56	0.57
57	0.64
58	0.67
59	0.7
60	0.71
61	0.71
62	0.67
63	0.71
64	0.73
65	0.7
66	0.68
67	0.6
68	0.55
69	0.48
70	0.45
71	0.4
72	0.34
73	0.29
74	0.3
75	0.32
76	0.33
77	0.38
78	0.36
79	0.35
80	0.35
81	0.34
82	0.33
83	0.36
84	0.38
85	0.35
86	0.42
87	0.48
88	0.51
89	0.55
90	0.59
91	0.63
92	0.67
93	0.74
94	0.77
95	0.79
96	0.83
97	0.86
98	0.87
99	0.85
100	0.83
101	0.77
102	0.75
103	0.73
104	0.68
105	0.62
106	0.51
107	0.43
108	0.36
109	0.3
110	0.22
111	0.15
112	0.09
113	0.07
114	0.06
115	0.07
116	0.07
117	0.07
118	0.07
119	0.07
120	0.07
121	0.07
122	0.06
123	0.06
124	0.06
125	0.05
126	0.05
127	0.05
128	0.05
129	0.04
130	0.04
131	0.04
132	0.03
133	0.03
134	0.03
135	0.03
136	0.03
137	0.03
138	0.03
139	0.03
140	0.03
141	0.03
142	0.03
143	0.02
144	0.02
145	0.02
146	0.02
147	0.02
148	0.02
149	0.03
150	0.03
151	0.03
152	0.05
153	0.07
154	0.12
155	0.16
156	0.18
157	0.21
158	0.22
159	0.24
160	0.26
161	0.26
162	0.29
163	0.3
164	0.36
165	0.37
166	0.38
167	0.37
168	0.37
169	0.37
170	0.37
171	0.39
172	0.35
173	0.32
174	0.34
175	0.34
176	0.34
177	0.37
178	0.31
179	0.25
180	0.22
181	0.22
182	0.2
183	0.2
184	0.18
185	0.14
186	0.14
187	0.13
188	0.12
189	0.1
190	0.08
191	0.06
192	0.06
193	0.04
194	0.04
195	0.03
196	0.03
197	0.04
198	0.04
199	0.04
200	0.04
201	0.05
202	0.05
203	0.05
204	0.05
205	0.05
206	0.06
207	0.07
208	0.09
209	0.11
210	0.14
211	0.19
212	0.23
213	0.23
214	0.23
215	0.25
216	0.24
217	0.24
218	0.22
219	0.16
220	0.12
221	0.11
222	0.1
223	0.07
224	0.06
225	0.04
226	0.02
227	0.03
228	0.03
229	0.03
230	0.03
231	0.03
232	0.03
233	0.04
234	0.04
235	0.04
236	0.07
237	0.09
238	0.11
239	0.13
240	0.14
241	0.15
242	0.18
243	0.19
244	0.17
245	0.16
246	0.15
247	0.14
248	0.13
249	0.12
250	0.09
251	0.07
252	0.06
253	0.05
254	0.04
255	0.04
256	0.03
257	0.03
258	0.04
259	0.04
260	0.05
261	0.05
262	0.05
263	0.06
264	0.07
265	0.06
266	0.06
267	0.09
268	0.08
269	0.09
270	0.11
271	0.11
272	0.11
273	0.12
274	0.11
275	0.1
276	0.12
277	0.15
278	0.17
279	0.21
280	0.24
281	0.27
282	0.3
283	0.3
284	0.29
285	0.27
286	0.25
287	0.21
288	0.18
289	0.15
290	0.12
291	0.11
292	0.09
293	0.07
294	0.05
295	0.05
296	0.05
297	0.06
298	0.08
299	0.1
300	0.11
301	0.11
302	0.11
303	0.11
304	0.13
305	0.13
306	0.16
307	0.18
308	0.24
309	0.27
310	0.3
311	0.38
312	0.42
313	0.48
314	0.48
315	0.49
316	0.44
317	0.45
318	0.45
319	0.4
320	0.38
321	0.31
322	0.27
323	0.22
324	0.19
325	0.15
326	0.12
327	0.09
328	0.05
329	0.05
330	0.06
331	0.06
332	0.05
333	0.05
334	0.04
335	0.04
336	0.04
337	0.04
338	0.03
339	0.03
340	0.03
341	0.03
342	0.03
343	0.03
344	0.04
345	0.04
346	0.05
347	0.05
348	0.06
349	0.07
350	0.07
351	0.09
352	0.13
353	0.15
354	0.19
355	0.22
356	0.26
357	0.26
358	0.27
359	0.29
360	0.31
361	0.32
362	0.33
363	0.3
364	0.27
365	0.27
366	0.26
367	0.25
368	0.23
369	0.22
370	0.17
371	0.19
372	0.23
373	0.24
374	0.29
375	0.33
376	0.37
377	0.43
378	0.48
379	0.54
380	0.6
381	0.62
382	0.61
383	0.58
384	0.6
385	0.55
386	0.6
387	0.53
388	0.46
389	0.47
390	0.44
391	0.42
392	0.32
393	0.29
394	0.2
395	0.17
396	0.14
397	0.08
398	0.08
399	0.06
400	0.06
401	0.05
402	0.04
403	0.05
404	0.05
405	0.07
406	0.07
407	0.07
408	0.08
409	0.08
410	0.09
411	0.1
412	0.11
413	0.1
414	0.1
415	0.1
416	0.11
417	0.11
418	0.1
419	0.1
420	0.1
421	0.11
422	0.14
423	0.15
424	0.19
425	0.19
426	0.24
427	0.23
428	0.21
429	0.2
430	0.17
431	0.16
432	0.11
433	0.12
434	0.07
435	0.08
436	0.08
437	0.08
438	0.07
439	0.07
440	0.07
441	0.07
442	0.07
443	0.07
444	0.12
445	0.15
446	0.16
447	0.23
448	0.24
449	0.28
450	0.32
451	0.39
452	0.41
453	0.42
454	0.45
455	0.41
456	0.43
457	0.39
458	0.35
459	0.27
460	0.2
461	0.16
462	0.13
463	0.11
464	0.07
465	0.07
466	0.07
467	0.07
468	0.07
469	0.08
470	0.07
471	0.06
472	0.07
473	0.07
474	0.06
475	0.05
476	0.06
477	0.06
478	0.07
479	0.06
480	0.08
481	0.12
482	0.14
483	0.18
484	0.19
485	0.19
486	0.19
487	0.21
488	0.19
489	0.16
490	0.17
491	0.15
492	0.19
493	0.19
494	0.19
495	0.18
496	0.17
497	0.16
498	0.13
499	0.11
500	0.08
501	0.09
502	0.08
503	0.08
504	0.09
505	0.1
506	0.13
507	0.19
508	0.2
509	0.21
510	0.22
511	0.27
512	0.27
513	0.26
514	0.29
515	0.28
516	0.28
517	0.27
518	0.26
519	0.21
520	0.21

A0A2L2SQK7

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer