Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q2U572

Protein Details
Accession Q2U572    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
209-237LSDELQKLLTRRKKRKRKQSTASVEKSCAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
219-226RRKKRKRK
Subcellular Location(s) nucl 11.5, mito 11, cyto_nucl 7.5, cyto 2.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000014  PAS  
IPR035965  PAS-like_dom_sf  
IPR000679  Znf_GATA  
IPR013088  Znf_NHR/GATA  
Gene Ontology GO:0043565  F:sequence-specific DNA binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
Pfam View protein in Pfam  
PF00320  GATA  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00344  GATA_ZN_FINGER_1  
PS50114  GATA_ZN_FINGER_2  
CDD cd00130  PAS  
cd00202  ZnF_GATA  
Amino Acid Sequences MVLVGRPRFVYCLDHIASIGHGSLAETDVWAKLSKSGIVLFMTSKARPVLGRMPDELIGKSLQDLMDSRAEAQKALGVARTGQRVTFSHKIRHKKGHMLPAQTTLHPGDTKEGVRPSFLVAHISFPKPPQGGNDELNSAPPPNRNLAVSKIHRQAVSGVSGVAGQNMLASVKQANPQIQKLPFFTELVPTRGSSWQVELRELEKQNRTLSDELQKLLTRRKKRKRKQSTASVEKSCAICQTKKTPEWRRGPSGERDLCNSCGLRWAKQVRNAAQVAGRPNAY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.28
2 0.27
3 0.25
4 0.24
5 0.2
6 0.17
7 0.09
8 0.07
9 0.07
10 0.08
11 0.08
12 0.08
13 0.07
14 0.08
15 0.08
16 0.1
17 0.1
18 0.1
19 0.12
20 0.13
21 0.14
22 0.15
23 0.16
24 0.17
25 0.16
26 0.17
27 0.15
28 0.18
29 0.2
30 0.18
31 0.19
32 0.18
33 0.18
34 0.18
35 0.22
36 0.25
37 0.29
38 0.32
39 0.31
40 0.33
41 0.34
42 0.35
43 0.3
44 0.24
45 0.18
46 0.15
47 0.14
48 0.13
49 0.11
50 0.1
51 0.11
52 0.12
53 0.15
54 0.15
55 0.16
56 0.17
57 0.18
58 0.17
59 0.16
60 0.14
61 0.12
62 0.12
63 0.12
64 0.09
65 0.11
66 0.14
67 0.17
68 0.16
69 0.15
70 0.18
71 0.18
72 0.25
73 0.31
74 0.31
75 0.37
76 0.44
77 0.53
78 0.58
79 0.66
80 0.64
81 0.66
82 0.69
83 0.7
84 0.68
85 0.64
86 0.58
87 0.55
88 0.52
89 0.42
90 0.37
91 0.28
92 0.24
93 0.2
94 0.18
95 0.14
96 0.15
97 0.15
98 0.17
99 0.19
100 0.17
101 0.17
102 0.17
103 0.17
104 0.16
105 0.16
106 0.16
107 0.13
108 0.16
109 0.18
110 0.19
111 0.18
112 0.16
113 0.2
114 0.17
115 0.17
116 0.16
117 0.17
118 0.2
119 0.21
120 0.21
121 0.19
122 0.19
123 0.19
124 0.17
125 0.14
126 0.11
127 0.11
128 0.12
129 0.12
130 0.12
131 0.13
132 0.14
133 0.17
134 0.24
135 0.25
136 0.3
137 0.33
138 0.34
139 0.33
140 0.32
141 0.3
142 0.24
143 0.22
144 0.16
145 0.12
146 0.1
147 0.1
148 0.1
149 0.07
150 0.06
151 0.04
152 0.03
153 0.04
154 0.04
155 0.03
156 0.04
157 0.05
158 0.06
159 0.1
160 0.12
161 0.17
162 0.2
163 0.22
164 0.27
165 0.29
166 0.3
167 0.28
168 0.3
169 0.27
170 0.25
171 0.23
172 0.24
173 0.24
174 0.24
175 0.24
176 0.2
177 0.2
178 0.21
179 0.23
180 0.17
181 0.18
182 0.21
183 0.21
184 0.23
185 0.22
186 0.21
187 0.27
188 0.29
189 0.31
190 0.31
191 0.33
192 0.34
193 0.35
194 0.37
195 0.32
196 0.33
197 0.35
198 0.33
199 0.31
200 0.31
201 0.31
202 0.3
203 0.38
204 0.43
205 0.45
206 0.54
207 0.64
208 0.73
209 0.81
210 0.9
211 0.92
212 0.94
213 0.94
214 0.94
215 0.94
216 0.93
217 0.91
218 0.83
219 0.74
220 0.66
221 0.57
222 0.47
223 0.43
224 0.37
225 0.32
226 0.34
227 0.42
228 0.47
229 0.52
230 0.61
231 0.65
232 0.7
233 0.76
234 0.78
235 0.77
236 0.75
237 0.75
238 0.73
239 0.74
240 0.71
241 0.63
242 0.61
243 0.56
244 0.51
245 0.5
246 0.42
247 0.31
248 0.33
249 0.34
250 0.32
251 0.37
252 0.45
253 0.47
254 0.54
255 0.63
256 0.59
257 0.65
258 0.62
259 0.56
260 0.5
261 0.47
262 0.44