FuNGI

A0A2L2TSH6

Protein Details

Accession

A0A2L2TSH6

Localization Confidence

High

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
123-150	IDATEDKSNKERKRKRKKDNDDLEGKYL	Basic
417-436	FPPMLPRKLRVTRAKDPRKT	Hydrophilic
523-555	ARDGLPKDLKQKQKGKGKGKSGKPQNHGTKRAA	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
131-140	NKERKRKRKK
422-435	PRKLRVTRAKDPRK
521-562	ASARDGLPKDLKQKQKGKGKGKSGKPQNHGTKRAAEWKKKKN

Subcellular Location(s)

nucl 19, mito 4.5, cyto_mito 4.5, cyto 3.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR012677 Nucleotide-bd_a/b_plait_sf IPR035979 RBD_domain_sf IPR000504 RRM_dom
Gene Ontology	GO:0003723 F:RNA binding
Pfam	View protein in Pfam PF00076 RRM_1
PROSITE	View protein in PROSITE PS50102 RRM

Amino Acid Sequences

MAKGSKGLRASSKAVDPTLDALFASSAGPVQAPTKSRYSTLLDQKVREPAKPKVQLEEDDEVLSEISEELSFEEDGPSDEDEDEDDSEQEDESGDEQEKEDEEESEGADEPMKDAPVELDDIIDATEDKSNKERKRKRKKDNDDLEGKYLDKMAAEEEAERAGKRQKNDALTKTDKKSTADEEDAGNESDIPVHETLAKDSKTSDLEKAARTVFLANVSTEAISSKSAKKTLMAHLSSVLEKDATPPQTIESLRFRSVAFAGGSLPKRAAYITKSLMDSTTKSANAYVVYSTTAAARAAATKLNGTQVLDRHLRVDSVAHPSPTDHRRCVFVGNLGFVDDETVLNTNAEGETTEKKRNKIPSDIEEGLWRTFSTQGKVENVRVVRDSKTRVGKGFAYVQFYDGNDVEAALLLDGKKFPPMLPRKLRVTRAKDPRKTVLAQERASGKHIVHNGAPKSTKYKHKATPEEQSMAGRTSKLLGRSAAVQQRHKKRPSAHGESREAENPVPEIKGPEQFVFEGRRASARDGLPKDLKQKQKGKGKGKSGKPQNHGTKRAAEWKKKKN

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.42
2	0.38
3	0.33
4	0.31
5	0.27
6	0.23
7	0.16
8	0.13
9	0.12
10	0.12
11	0.1
12	0.07
13	0.07
14	0.07
15	0.07
16	0.07
17	0.09
18	0.14
19	0.17
20	0.21
21	0.26
22	0.28
23	0.29
24	0.33
25	0.38
26	0.43
27	0.5
28	0.56
29	0.56
30	0.57
31	0.59
32	0.63
33	0.58
34	0.54
35	0.5
36	0.48
37	0.54
38	0.6
39	0.58
40	0.57
41	0.6
42	0.59
43	0.6
44	0.55
45	0.46
46	0.37
47	0.35
48	0.27
49	0.22
50	0.18
51	0.11
52	0.07
53	0.06
54	0.06
55	0.06
56	0.06
57	0.08
58	0.08
59	0.08
60	0.09
61	0.09
62	0.1
63	0.12
64	0.12
65	0.11
66	0.11
67	0.11
68	0.11
69	0.12
70	0.12
71	0.11
72	0.11
73	0.1
74	0.1
75	0.1
76	0.09
77	0.08
78	0.07
79	0.07
80	0.09
81	0.1
82	0.1
83	0.11
84	0.12
85	0.12
86	0.14
87	0.14
88	0.12
89	0.13
90	0.13
91	0.12
92	0.12
93	0.12
94	0.1
95	0.11
96	0.1
97	0.1
98	0.11
99	0.11
100	0.09
101	0.09
102	0.09
103	0.09
104	0.11
105	0.09
106	0.08
107	0.08
108	0.08
109	0.08
110	0.07
111	0.06
112	0.06
113	0.09
114	0.1
115	0.12
116	0.19
117	0.28
118	0.36
119	0.47
120	0.56
121	0.64
122	0.75
123	0.84
124	0.88
125	0.91
126	0.94
127	0.94
128	0.94
129	0.92
130	0.9
131	0.82
132	0.74
133	0.64
134	0.54
135	0.43
136	0.33
137	0.24
138	0.15
139	0.12
140	0.09
141	0.09
142	0.09
143	0.09
144	0.09
145	0.1
146	0.11
147	0.11
148	0.12
149	0.18
150	0.21
151	0.23
152	0.3
153	0.34
154	0.42
155	0.49
156	0.52
157	0.53
158	0.58
159	0.63
160	0.6
161	0.6
162	0.54
163	0.48
164	0.47
165	0.43
166	0.41
167	0.36
168	0.33
169	0.28
170	0.27
171	0.27
172	0.23
173	0.18
174	0.12
175	0.09
176	0.09
177	0.09
178	0.09
179	0.08
180	0.07
181	0.09
182	0.1
183	0.13
184	0.17
185	0.17
186	0.15
187	0.16
188	0.18
189	0.19
190	0.21
191	0.21
192	0.21
193	0.24
194	0.24
195	0.27
196	0.24
197	0.21
198	0.2
199	0.19
200	0.13
201	0.12
202	0.12
203	0.09
204	0.1
205	0.1
206	0.09
207	0.08
208	0.08
209	0.07
210	0.07
211	0.1
212	0.13
213	0.16
214	0.18
215	0.18
216	0.2
217	0.23
218	0.29
219	0.35
220	0.31
221	0.29
222	0.29
223	0.3
224	0.28
225	0.24
226	0.17
227	0.09
228	0.08
229	0.1
230	0.13
231	0.13
232	0.14
233	0.14
234	0.14
235	0.18
236	0.19
237	0.2
238	0.21
239	0.22
240	0.23
241	0.24
242	0.23
243	0.2
244	0.2
245	0.19
246	0.14
247	0.11
248	0.11
249	0.14
250	0.15
251	0.14
252	0.14
253	0.11
254	0.11
255	0.11
256	0.12
257	0.1
258	0.14
259	0.16
260	0.18
261	0.18
262	0.18
263	0.19
264	0.18
265	0.17
266	0.15
267	0.15
268	0.13
269	0.13
270	0.13
271	0.13
272	0.12
273	0.11
274	0.09
275	0.07
276	0.07
277	0.07
278	0.07
279	0.06
280	0.06
281	0.06
282	0.06
283	0.05
284	0.06
285	0.06
286	0.07
287	0.07
288	0.07
289	0.08
290	0.09
291	0.1
292	0.09
293	0.11
294	0.11
295	0.16
296	0.17
297	0.16
298	0.16
299	0.16
300	0.15
301	0.13
302	0.14
303	0.12
304	0.17
305	0.18
306	0.17
307	0.17
308	0.17
309	0.24
310	0.29
311	0.31
312	0.27
313	0.27
314	0.3
315	0.3
316	0.32
317	0.27
318	0.25
319	0.21
320	0.2
321	0.19
322	0.16
323	0.15
324	0.12
325	0.12
326	0.07
327	0.06
328	0.05
329	0.06
330	0.06
331	0.06
332	0.06
333	0.06
334	0.05
335	0.05
336	0.05
337	0.06
338	0.11
339	0.15
340	0.24
341	0.27
342	0.29
343	0.35
344	0.43
345	0.46
346	0.49
347	0.52
348	0.49
349	0.54
350	0.53
351	0.48
352	0.42
353	0.39
354	0.31
355	0.25
356	0.2
357	0.13
358	0.16
359	0.17
360	0.17
361	0.18
362	0.2
363	0.25
364	0.28
365	0.29
366	0.29
367	0.29
368	0.28
369	0.27
370	0.27
371	0.25
372	0.27
373	0.3
374	0.31
375	0.38
376	0.4
377	0.39
378	0.4
379	0.38
380	0.37
381	0.4
382	0.36
383	0.33
384	0.3
385	0.3
386	0.28
387	0.27
388	0.26
389	0.18
390	0.17
391	0.11
392	0.11
393	0.09
394	0.08
395	0.08
396	0.05
397	0.06
398	0.05
399	0.06
400	0.07
401	0.07
402	0.08
403	0.09
404	0.1
405	0.19
406	0.27
407	0.37
408	0.45
409	0.51
410	0.59
411	0.65
412	0.74
413	0.73
414	0.74
415	0.74
416	0.76
417	0.81
418	0.79
419	0.78
420	0.76
421	0.72
422	0.65
423	0.64
424	0.63
425	0.61
426	0.54
427	0.52
428	0.5
429	0.46
430	0.46
431	0.4
432	0.3
433	0.28
434	0.3
435	0.29
436	0.27
437	0.33
438	0.32
439	0.36
440	0.38
441	0.34
442	0.38
443	0.43
444	0.49
445	0.48
446	0.55
447	0.58
448	0.66
449	0.74
450	0.72
451	0.76
452	0.72
453	0.69
454	0.61
455	0.55
456	0.47
457	0.39
458	0.34
459	0.24
460	0.18
461	0.18
462	0.2
463	0.2
464	0.21
465	0.2
466	0.2
467	0.24
468	0.31
469	0.35
470	0.38
471	0.44
472	0.51
473	0.61
474	0.69
475	0.71
476	0.71
477	0.72
478	0.76
479	0.77
480	0.78
481	0.77
482	0.77
483	0.78
484	0.73
485	0.7
486	0.63
487	0.55
488	0.46
489	0.37
490	0.3
491	0.25
492	0.23
493	0.19
494	0.2
495	0.2
496	0.25
497	0.27
498	0.26
499	0.28
500	0.27
501	0.3
502	0.3
503	0.29
504	0.27
505	0.25
506	0.28
507	0.28
508	0.31
509	0.34
510	0.34
511	0.41
512	0.42
513	0.49
514	0.51
515	0.53
516	0.58
517	0.6
518	0.65
519	0.66
520	0.71
521	0.73
522	0.77
523	0.82
524	0.84
525	0.85
526	0.86
527	0.86
528	0.87
529	0.88
530	0.89
531	0.88
532	0.84
533	0.85
534	0.85
535	0.86
536	0.83
537	0.77
538	0.74
539	0.7
540	0.75
541	0.74
542	0.74

A0A2L2TSH6

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer