FuNGI

Q2PIN6

Protein Details

Accession

Q2PIN6

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

10.9

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
237-257	YVKARNRKGRIINRSLRRGFR	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
239-255	KARNRKGRIINRSLRRG

Subcellular Location(s)

pero 10, nucl 9.5, cyto_nucl 8, cyto 5.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR043502 DNA/RNA_pol_sf IPR036691 Endo/exonu/phosph_ase_sf IPR012337 RNaseH-like_sf IPR002156 RNaseH_domain IPR036397 RNaseH_sf IPR000477 RT_dom
Gene Ontology	GO:0003676 F:nucleic acid binding GO:0004523 F:RNA-DNA hybrid ribonuclease activity
Pfam	View protein in Pfam PF00075 RNase_H PF00078 RVT_1
PROSITE	View protein in PROSITE PS50879 RNASE_H_1 PS50878 RT_POL
CDD	cd09276 Rnase_HI_RT_non_LTR cd01650 RT_nLTR_like

Amino Acid Sequences

MASGQRSTDPNDRTTETFHGLGGYKRGWGGRASPFPHARPDERVPLATRHSETTTAGEATTTNDDTDDTSQDRQIRTDQKAPQLLEFADSRLLDLWLELGTITQDRNNHRSTIDLVFGAQSLADQHIACEVAPKVHADSNHLLIQAAKLRKFMASNLNIYSHWDVLKMNLSAASIDAAVDFLMEVVQRAIQHAVPWARPSEWAKPDFTPECKRAVKITRKLRRIYMRHRLPSDWTAYVKARNRKGRIINRSLRRGFRRWVSEAIDQGTHGIWRVAKWARNRGGRAANMIPTLNGPHGPADTTEAKAEVLRESFFPEPPPADLSDIARRTQPPQIEFPEVTKEEVAKAIRRAPPDKAPGPDAVPNKIWHELCKVPVFPERATALFNASNKTGHNPRHFQTSTTVALRKGGPRDYRKPKSYRPVALLNTFGKILESIIATRIAWALEEHKLLPQTHLGGRKGISTDHVIQLILDNIYRAWGQGKKVSMILLDVSGAFDNVSHARLLFNLRQLKLGHFADWLQSFLTGRTTRISLAGELSAEFPTPTGIPQGSPLSPILYLIYNTPLIQDLHVRRPQGGSTTAFGWIDDACTLAVSDTFAENVETLNAALRHASKFAPDKFELIHFTNPRETETPPQSPGLPPDHPDQIWEVPLPPAGHDQMEIIFTDTIIKPTETAKYLGVWLDKTLSFSIHRTKALAKAHGTLAALKGIAGSTWGAPLRAMRRIYQAVIVPQLFYAAAAWYSPKGGQIVASINQKMLAEFTQIQKQAALLISGAFRGTSAAALNVELYILPVHLQLQQIIEETAVRIRTGPELACPESVLRPRTVQERRRSGWTPMEALSRKGGPLWPLGKKEWETRKPYILAPWEPPVTTVIDSHEAALIYHRHYCARREGIAVYTDGSGLNGRVGASTVCLSQGWKRNCTLGTEEESTVYAGELTGIRMALHRLRRETRPATVFVDSQAAIQAIQNPRRPSGQYILDQIYYIIRRYNMQNRVQIHWIPAHIGVPGNEAADEAAREGATREGTQQTGEAICLAAAAKRQIRRSIKDRWIREWKTEKTGPTTYRLVEVPNKKILDLYKNLSKSYASIIIQMRTQRNGLRHFLHKIKAVDSDQYLYALGSQTARHILLQCPLYAELRGRMIGKLDPGVQKRLDYNGIMSHPQAIRYVAEFMHQTELLSQFRDVEQTGHY

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.43
2	0.42
3	0.38
4	0.35
5	0.32
6	0.3
7	0.28
8	0.29
9	0.29
10	0.24
11	0.21
12	0.23
13	0.25
14	0.23
15	0.23
16	0.27
17	0.31
18	0.39
19	0.41
20	0.47
21	0.52
22	0.53
23	0.59
24	0.59
25	0.54
26	0.53
27	0.57
28	0.57
29	0.54
30	0.56
31	0.5
32	0.49
33	0.51
34	0.5
35	0.45
36	0.41
37	0.4
38	0.38
39	0.36
40	0.34
41	0.32
42	0.26
43	0.23
44	0.2
45	0.17
46	0.18
47	0.21
48	0.18
49	0.15
50	0.14
51	0.15
52	0.17
53	0.19
54	0.2
55	0.18
56	0.2
57	0.24
58	0.29
59	0.3
60	0.3
61	0.36
62	0.41
63	0.44
64	0.5
65	0.53
66	0.57
67	0.62
68	0.61
69	0.55
70	0.5
71	0.44
72	0.39
73	0.33
74	0.25
75	0.23
76	0.21
77	0.19
78	0.17
79	0.17
80	0.13
81	0.12
82	0.12
83	0.07
84	0.08
85	0.06
86	0.06
87	0.07
88	0.08
89	0.09
90	0.11
91	0.17
92	0.23
93	0.3
94	0.32
95	0.33
96	0.32
97	0.33
98	0.35
99	0.33
100	0.29
101	0.23
102	0.21
103	0.2
104	0.19
105	0.16
106	0.12
107	0.08
108	0.07
109	0.08
110	0.1
111	0.09
112	0.09
113	0.11
114	0.11
115	0.11
116	0.14
117	0.13
118	0.13
119	0.14
120	0.16
121	0.17
122	0.19
123	0.2
124	0.23
125	0.26
126	0.28
127	0.3
128	0.29
129	0.26
130	0.23
131	0.26
132	0.28
133	0.3
134	0.27
135	0.25
136	0.26
137	0.28
138	0.29
139	0.3
140	0.33
141	0.31
142	0.34
143	0.35
144	0.37
145	0.34
146	0.38
147	0.36
148	0.27
149	0.23
150	0.2
151	0.18
152	0.18
153	0.23
154	0.19
155	0.17
156	0.16
157	0.16
158	0.15
159	0.15
160	0.13
161	0.08
162	0.07
163	0.06
164	0.06
165	0.05
166	0.05
167	0.04
168	0.03
169	0.04
170	0.04
171	0.04
172	0.05
173	0.07
174	0.07
175	0.09
176	0.11
177	0.1
178	0.11
179	0.18
180	0.21
181	0.21
182	0.23
183	0.24
184	0.23
185	0.28
186	0.32
187	0.35
188	0.38
189	0.39
190	0.4
191	0.39
192	0.46
193	0.46
194	0.48
195	0.47
196	0.42
197	0.48
198	0.47
199	0.47
200	0.48
201	0.53
202	0.56
203	0.58
204	0.67
205	0.69
206	0.74
207	0.76
208	0.77
209	0.78
210	0.77
211	0.78
212	0.78
213	0.78
214	0.79
215	0.79
216	0.72
217	0.67
218	0.63
219	0.57
220	0.5
221	0.41
222	0.37
223	0.36
224	0.42
225	0.43
226	0.47
227	0.51
228	0.56
229	0.6
230	0.64
231	0.72
232	0.74
233	0.76
234	0.78
235	0.78
236	0.78
237	0.83
238	0.8
239	0.79
240	0.76
241	0.71
242	0.67
243	0.66
244	0.64
245	0.58
246	0.58
247	0.54
248	0.51
249	0.49
250	0.44
251	0.37
252	0.29
253	0.26
254	0.21
255	0.16
256	0.12
257	0.11
258	0.09
259	0.09
260	0.16
261	0.2
262	0.24
263	0.31
264	0.4
265	0.47
266	0.53
267	0.56
268	0.56
269	0.58
270	0.55
271	0.54
272	0.47
273	0.41
274	0.36
275	0.33
276	0.26
277	0.2
278	0.2
279	0.16
280	0.13
281	0.11
282	0.11
283	0.11
284	0.11
285	0.11
286	0.14
287	0.15
288	0.16
289	0.16
290	0.15
291	0.15
292	0.15
293	0.15
294	0.12
295	0.12
296	0.11
297	0.11
298	0.15
299	0.16
300	0.16
301	0.17
302	0.18
303	0.18
304	0.18
305	0.2
306	0.17
307	0.17
308	0.18
309	0.19
310	0.25
311	0.26
312	0.25
313	0.26
314	0.26
315	0.27
316	0.31
317	0.32
318	0.28
319	0.32
320	0.36
321	0.38
322	0.37
323	0.36
324	0.38
325	0.34
326	0.31
327	0.26
328	0.22
329	0.18
330	0.21
331	0.22
332	0.18
333	0.2
334	0.26
335	0.29
336	0.34
337	0.36
338	0.37
339	0.42
340	0.46
341	0.47
342	0.43
343	0.42
344	0.38
345	0.38
346	0.4
347	0.35
348	0.3
349	0.29
350	0.28
351	0.28
352	0.31
353	0.29
354	0.24
355	0.28
356	0.27
357	0.28
358	0.3
359	0.28
360	0.26
361	0.31
362	0.32
363	0.27
364	0.29
365	0.26
366	0.23
367	0.24
368	0.21
369	0.19
370	0.19
371	0.2
372	0.17
373	0.17
374	0.17
375	0.16
376	0.21
377	0.25
378	0.29
379	0.35
380	0.38
381	0.38
382	0.47
383	0.47
384	0.44
385	0.4
386	0.38
387	0.34
388	0.34
389	0.34
390	0.25
391	0.27
392	0.28
393	0.28
394	0.27
395	0.3
396	0.34
397	0.4
398	0.5
399	0.58
400	0.65
401	0.69
402	0.72
403	0.74
404	0.76
405	0.77
406	0.72
407	0.66
408	0.66
409	0.61
410	0.56
411	0.53
412	0.43
413	0.35
414	0.29
415	0.24
416	0.16
417	0.13
418	0.11
419	0.07
420	0.07
421	0.06
422	0.07
423	0.08
424	0.08
425	0.08
426	0.08
427	0.07
428	0.06
429	0.07
430	0.08
431	0.09
432	0.11
433	0.11
434	0.12
435	0.15
436	0.15
437	0.16
438	0.15
439	0.16
440	0.19
441	0.24
442	0.23
443	0.22
444	0.22
445	0.23
446	0.22
447	0.2
448	0.18
449	0.16
450	0.18
451	0.17
452	0.17
453	0.15
454	0.15
455	0.15
456	0.14
457	0.1
458	0.07
459	0.06
460	0.05
461	0.06
462	0.06
463	0.06
464	0.08
465	0.11
466	0.12
467	0.16
468	0.17
469	0.17
470	0.18
471	0.18
472	0.15
473	0.13
474	0.12
475	0.08
476	0.07
477	0.06
478	0.06
479	0.05
480	0.05
481	0.04
482	0.04
483	0.05
484	0.06
485	0.07
486	0.06
487	0.06
488	0.06
489	0.08
490	0.12
491	0.12
492	0.18
493	0.23
494	0.23
495	0.27
496	0.27
497	0.28
498	0.3
499	0.28
500	0.22
501	0.18
502	0.17
503	0.17
504	0.17
505	0.16
506	0.1
507	0.1
508	0.09
509	0.09
510	0.14
511	0.11
512	0.12
513	0.12
514	0.13
515	0.13
516	0.14
517	0.14
518	0.1
519	0.1
520	0.1
521	0.09
522	0.08
523	0.09
524	0.08
525	0.07
526	0.06
527	0.05
528	0.06
529	0.06
530	0.06
531	0.06
532	0.06
533	0.06
534	0.08
535	0.11
536	0.1
537	0.11
538	0.11
539	0.1
540	0.1
541	0.1
542	0.09
543	0.07
544	0.07
545	0.07
546	0.08
547	0.08
548	0.08
549	0.08
550	0.08
551	0.08
552	0.08
553	0.14
554	0.15
555	0.22
556	0.24
557	0.24
558	0.24
559	0.24
560	0.24
561	0.21
562	0.21
563	0.15
564	0.14
565	0.14
566	0.15
567	0.14
568	0.13
569	0.11
570	0.08
571	0.07
572	0.06
573	0.05
574	0.04
575	0.04
576	0.04
577	0.04
578	0.04
579	0.03
580	0.04
581	0.04
582	0.04
583	0.04
584	0.04
585	0.04
586	0.04
587	0.04
588	0.04
589	0.04
590	0.05
591	0.05
592	0.05
593	0.06
594	0.07
595	0.08
596	0.09
597	0.09
598	0.11
599	0.16
600	0.18
601	0.22
602	0.22
603	0.22
604	0.22
605	0.23
606	0.24
607	0.21
608	0.25
609	0.2
610	0.22
611	0.24
612	0.23
613	0.24
614	0.22
615	0.22
616	0.23
617	0.27
618	0.28
619	0.26
620	0.27
621	0.25
622	0.24
623	0.26
624	0.24
625	0.2
626	0.19
627	0.21
628	0.23
629	0.21
630	0.22
631	0.21
632	0.17
633	0.17
634	0.15
635	0.13
636	0.1
637	0.13
638	0.12
639	0.1
640	0.11
641	0.11
642	0.1
643	0.1
644	0.1
645	0.08
646	0.09
647	0.08
648	0.07
649	0.06
650	0.06
651	0.09
652	0.08
653	0.09
654	0.1
655	0.09
656	0.09
657	0.1
658	0.13
659	0.12
660	0.13
661	0.12
662	0.12
663	0.13
664	0.14
665	0.14
666	0.11
667	0.1
668	0.11
669	0.11
670	0.12
671	0.11
672	0.11
673	0.11
674	0.13
675	0.2
676	0.21
677	0.21
678	0.21
679	0.22
680	0.27
681	0.3
682	0.32
683	0.26
684	0.26
685	0.26
686	0.26
687	0.25
688	0.19
689	0.16
690	0.12
691	0.11
692	0.08
693	0.08
694	0.05
695	0.05
696	0.05
697	0.05
698	0.04
699	0.06
700	0.06
701	0.06
702	0.07
703	0.1
704	0.12
705	0.17
706	0.19
707	0.18
708	0.23
709	0.25
710	0.25
711	0.25
712	0.24
713	0.2
714	0.22
715	0.2
716	0.16
717	0.14
718	0.13
719	0.11
720	0.09
721	0.08
722	0.04
723	0.04
724	0.04
725	0.05
726	0.05
727	0.06
728	0.06
729	0.07
730	0.07
731	0.07
732	0.08
733	0.09
734	0.11
735	0.14
736	0.18
737	0.17
738	0.16
739	0.18
740	0.17
741	0.15
742	0.14
743	0.1
744	0.1
745	0.12
746	0.14
747	0.19
748	0.2
749	0.2
750	0.19
751	0.18
752	0.17
753	0.15
754	0.13
755	0.07
756	0.07
757	0.07
758	0.07
759	0.07
760	0.05
761	0.05
762	0.05
763	0.05
764	0.05
765	0.05
766	0.05
767	0.06
768	0.06
769	0.06
770	0.05
771	0.05
772	0.04
773	0.05
774	0.04
775	0.04
776	0.04
777	0.04
778	0.05
779	0.08
780	0.09
781	0.09
782	0.1
783	0.1
784	0.11
785	0.11
786	0.1
787	0.07
788	0.07
789	0.09
790	0.09
791	0.08
792	0.08
793	0.09
794	0.1
795	0.12
796	0.12
797	0.13
798	0.17
799	0.18
800	0.18
801	0.18
802	0.17
803	0.2
804	0.24
805	0.23
806	0.2
807	0.21
808	0.23
809	0.32
810	0.4
811	0.44
812	0.49
813	0.56
814	0.57
815	0.62
816	0.64
817	0.59
818	0.57
819	0.52
820	0.45
821	0.38
822	0.43
823	0.37
824	0.35
825	0.33
826	0.26
827	0.23
828	0.21
829	0.21
830	0.15
831	0.21
832	0.25
833	0.28
834	0.31
835	0.32
836	0.36
837	0.37
838	0.44
839	0.48
840	0.51
841	0.53
842	0.53
843	0.58
844	0.55
845	0.53
846	0.51
847	0.47
848	0.42
849	0.38
850	0.39
851	0.35
852	0.32
853	0.31
854	0.26
855	0.21
856	0.18
857	0.16
858	0.14
859	0.16
860	0.16
861	0.16
862	0.16
863	0.14
864	0.13
865	0.15
866	0.14
867	0.13
868	0.16
869	0.17
870	0.2
871	0.22
872	0.26
873	0.31
874	0.35
875	0.35
876	0.34
877	0.34
878	0.32
879	0.31
880	0.28
881	0.21
882	0.16
883	0.14
884	0.12
885	0.11
886	0.09
887	0.07
888	0.07
889	0.07
890	0.06
891	0.06
892	0.07
893	0.06
894	0.07
895	0.08
896	0.08
897	0.08
898	0.08
899	0.1
900	0.16
901	0.25
902	0.28
903	0.3
904	0.31
905	0.35
906	0.36
907	0.38
908	0.36
909	0.31
910	0.32
911	0.33
912	0.32
913	0.28
914	0.28
915	0.24
916	0.2
917	0.15
918	0.09
919	0.05
920	0.06
921	0.06
922	0.06
923	0.07
924	0.07
925	0.07
926	0.08
927	0.11
928	0.16
929	0.22
930	0.26
931	0.33
932	0.38
933	0.43
934	0.51
935	0.53
936	0.55
937	0.52
938	0.51
939	0.48
940	0.45
941	0.41
942	0.33
943	0.31
944	0.24
945	0.2
946	0.18
947	0.14
948	0.11
949	0.11
950	0.17
951	0.21
952	0.27
953	0.33
954	0.34
955	0.36
956	0.39
957	0.41
958	0.39
959	0.39
960	0.4
961	0.37
962	0.41
963	0.41
964	0.38
965	0.36
966	0.31
967	0.28
968	0.23
969	0.2
970	0.18
971	0.16
972	0.18
973	0.26
974	0.35
975	0.39
976	0.44
977	0.5
978	0.51
979	0.54
980	0.56
981	0.51
982	0.45
983	0.39
984	0.33
985	0.29
986	0.26
987	0.22
988	0.18
989	0.18
990	0.15
991	0.14
992	0.14
993	0.13
994	0.12
995	0.11
996	0.1
997	0.09
998	0.09
999	0.07
1000	0.07
1001	0.07
1002	0.07
1003	0.08
1004	0.1
1005	0.11
1006	0.12
1007	0.15
1008	0.17
1009	0.17
1010	0.18
1011	0.17
1012	0.17
1013	0.15
1014	0.15
1015	0.12
1016	0.09
1017	0.08
1018	0.08
1019	0.08
1020	0.07
1021	0.09
1022	0.14
1023	0.2
1024	0.25
1025	0.3
1026	0.39
1027	0.47
1028	0.54
1029	0.58
1030	0.63
1031	0.68
1032	0.72
1033	0.73
1034	0.73
1035	0.76
1036	0.72
1037	0.76
1038	0.75
1039	0.71
1040	0.7
1041	0.7
1042	0.64
1043	0.6
1044	0.64
1045	0.57
1046	0.53
1047	0.52
1048	0.43
1049	0.42
1050	0.38
1051	0.36
1052	0.37
1053	0.42
1054	0.42
1055	0.45
1056	0.45
1057	0.41
1058	0.44
1059	0.44
1060	0.43
1061	0.41
1062	0.42
1063	0.43
1064	0.45
1065	0.45
1066	0.43
1067	0.39
1068	0.32
1069	0.32
1070	0.32
1071	0.24
1072	0.28
1073	0.31
1074	0.32
1075	0.35
1076	0.4
1077	0.39
1078	0.35
1079	0.38
1080	0.36
1081	0.4
1082	0.44
1083	0.47
1084	0.46
1085	0.48
1086	0.53
1087	0.56
1088	0.57
1089	0.57
1090	0.53
1091	0.5
1092	0.51
1093	0.47
1094	0.44
1095	0.4
1096	0.38
1097	0.31
1098	0.29
1099	0.27
1100	0.2
1101	0.19
1102	0.15
1103	0.13
1104	0.11
1105	0.11
1106	0.13
1107	0.16
1108	0.17
1109	0.18
1110	0.19
1111	0.21
1112	0.26
1113	0.27
1114	0.25
1115	0.25
1116	0.26
1117	0.25
1118	0.24
1119	0.25
1120	0.22
1121	0.23
1122	0.25
1123	0.23
1124	0.22
1125	0.24
1126	0.24
1127	0.24
1128	0.24
1129	0.27
1130	0.33
1131	0.36
1132	0.41
1133	0.4
1134	0.4
1135	0.39
1136	0.41
1137	0.39
1138	0.32
1139	0.32
1140	0.32
1141	0.33
1142	0.33
1143	0.31
1144	0.33
1145	0.3
1146	0.3
1147	0.28
1148	0.24
1149	0.22
1150	0.22
1151	0.25
1152	0.18
1153	0.2
1154	0.2
1155	0.2
1156	0.23
1157	0.21
1158	0.2
1159	0.21
1160	0.25
1161	0.24
1162	0.24
1163	0.23
1164	0.2
1165	0.2
1166	0.23
1167	0.2

Q2PIN6

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer