FuNGI

A0A2L2TIP7

Protein Details

Accession

A0A2L2TIP7

Localization Confidence

High

Confidence Score

21.9

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
13-48	NAPPRPNGSSRNKKANPLRPMRKKPANPMVSRRPAP	Hydrophilic
182-208	APVAKDPNPKRPKKQKEDKTTFNRAPK	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
15-48	PPRPNGSSRNKKANPLRPMRKKPANPMVSRRPAP
187-198	DPNPKRPKKQKE
461-508	KKEEEKKEAGKDDKAQSGSGSKGTNTPSGKKPESSKKGKSLKRAGSPA
518-523	SRKKLK

Subcellular Location(s)

nucl 23, mito 2, cyto 2, cyto_mito 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter

Amino Acid Sequences

MSAPPPPGNPPANAPPRPNGSSRNKKANPLRPMRKKPANPMVSRRPAPGPAAPSGSGTQNGAKPNIEEIRRQNGGWSEPPPATYSDIPIMTTKKALLDGIRYHMMKFTQSRVGDRSIDPSDQDDFARPVTLHRRDARQPPPGRAVKVEAPEAPQPDEQEAERMAQVKAEREAQRAIDQAKIAPVAKDPNPKRPKKQKEDKTTFNRAPKTDAAKKESDLRYEEALPWHLEDADGSNVWVGNYVSALSESNVAFMIDQSVFRMVPLEKWYRFTSKPPFQPYTIDEAEALMTKKVAVARWAMKNDERMAEQDDKVETRKMFYGGGQMIKTESATFKAASRSEKLDHDDIDFSGDEFQDDDETPMFEKNNDDEDAKDAKDRIRREQLGANLFGDGNEQEVDNELKEQLKEDELRRELGKTTKKALIKRDQENIYESDDSAENPWSSSSDDNSSDEEDEEKKEEEKKEEEKKEAGKDDKAQSGSGSKGTNTPSGKKPESSKKGKSLKRAGSPALSESSGNESSRKKLKKNVTSAAASRSGTPLPQGAAARRAMGAGSGSDGEATAGEMSDGTMGKRKLKLVSHSARGTPSASRAGSPIPQGAASPGSPGGSIVEPSEILDKIPPEGIAISELIKAFNHRLGDRPGQMPKSEWIQLVKKLCDYGNDKRLRRRT

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.54
2	0.54
3	0.58
4	0.6
5	0.57
6	0.57
7	0.59
8	0.65
9	0.69
10	0.73
11	0.7
12	0.76
13	0.82
14	0.82
15	0.82
16	0.82
17	0.84
18	0.84
19	0.9
20	0.91
21	0.91
22	0.89
23	0.89
24	0.89
25	0.87
26	0.84
27	0.83
28	0.84
29	0.83
30	0.78
31	0.71
32	0.65
33	0.59
34	0.55
35	0.51
36	0.45
37	0.39
38	0.41
39	0.37
40	0.35
41	0.33
42	0.31
43	0.26
44	0.24
45	0.24
46	0.24
47	0.27
48	0.26
49	0.25
50	0.24
51	0.3
52	0.35
53	0.33
54	0.36
55	0.38
56	0.45
57	0.46
58	0.45
59	0.43
60	0.4
61	0.42
62	0.4
63	0.37
64	0.33
65	0.31
66	0.32
67	0.29
68	0.27
69	0.27
70	0.23
71	0.24
72	0.23
73	0.23
74	0.23
75	0.25
76	0.26
77	0.22
78	0.23
79	0.2
80	0.17
81	0.18
82	0.19
83	0.18
84	0.22
85	0.24
86	0.27
87	0.32
88	0.31
89	0.3
90	0.32
91	0.3
92	0.29
93	0.29
94	0.29
95	0.31
96	0.32
97	0.36
98	0.36
99	0.4
100	0.38
101	0.35
102	0.37
103	0.32
104	0.32
105	0.28
106	0.28
107	0.26
108	0.24
109	0.24
110	0.2
111	0.18
112	0.17
113	0.19
114	0.16
115	0.2
116	0.28
117	0.33
118	0.38
119	0.42
120	0.48
121	0.53
122	0.62
123	0.64
124	0.65
125	0.64
126	0.63
127	0.68
128	0.66
129	0.61
130	0.54
131	0.52
132	0.47
133	0.45
134	0.41
135	0.33
136	0.32
137	0.33
138	0.33
139	0.31
140	0.26
141	0.24
142	0.23
143	0.23
144	0.19
145	0.18
146	0.17
147	0.15
148	0.15
149	0.16
150	0.14
151	0.16
152	0.17
153	0.17
154	0.18
155	0.25
156	0.26
157	0.27
158	0.3
159	0.29
160	0.3
161	0.31
162	0.3
163	0.24
164	0.22
165	0.21
166	0.2
167	0.2
168	0.18
169	0.15
170	0.16
171	0.18
172	0.23
173	0.32
174	0.33
175	0.42
176	0.52
177	0.58
178	0.67
179	0.73
180	0.79
181	0.8
182	0.88
183	0.87
184	0.89
185	0.91
186	0.9
187	0.88
188	0.87
189	0.82
190	0.79
191	0.75
192	0.64
193	0.6
194	0.56
195	0.56
196	0.54
197	0.53
198	0.51
199	0.47
200	0.47
201	0.52
202	0.49
203	0.44
204	0.38
205	0.35
206	0.32
207	0.31
208	0.31
209	0.24
210	0.23
211	0.2
212	0.17
213	0.16
214	0.13
215	0.11
216	0.1
217	0.09
218	0.09
219	0.08
220	0.08
221	0.07
222	0.08
223	0.08
224	0.09
225	0.06
226	0.05
227	0.05
228	0.05
229	0.05
230	0.05
231	0.06
232	0.05
233	0.08
234	0.08
235	0.08
236	0.08
237	0.08
238	0.07
239	0.07
240	0.09
241	0.06
242	0.07
243	0.07
244	0.08
245	0.08
246	0.08
247	0.1
248	0.08
249	0.1
250	0.16
251	0.21
252	0.21
253	0.25
254	0.28
255	0.3
256	0.32
257	0.36
258	0.41
259	0.43
260	0.49
261	0.53
262	0.53
263	0.49
264	0.51
265	0.47
266	0.44
267	0.37
268	0.3
269	0.22
270	0.19
271	0.19
272	0.17
273	0.15
274	0.07
275	0.07
276	0.06
277	0.07
278	0.09
279	0.09
280	0.09
281	0.13
282	0.18
283	0.23
284	0.24
285	0.25
286	0.26
287	0.28
288	0.28
289	0.26
290	0.21
291	0.18
292	0.21
293	0.22
294	0.2
295	0.18
296	0.18
297	0.17
298	0.18
299	0.2
300	0.16
301	0.14
302	0.15
303	0.14
304	0.14
305	0.13
306	0.17
307	0.16
308	0.18
309	0.16
310	0.15
311	0.14
312	0.14
313	0.14
314	0.09
315	0.07
316	0.07
317	0.08
318	0.09
319	0.1
320	0.13
321	0.15
322	0.16
323	0.18
324	0.19
325	0.2
326	0.22
327	0.24
328	0.23
329	0.22
330	0.21
331	0.19
332	0.16
333	0.16
334	0.14
335	0.1
336	0.1
337	0.09
338	0.07
339	0.07
340	0.07
341	0.06
342	0.06
343	0.07
344	0.06
345	0.06
346	0.07
347	0.08
348	0.08
349	0.07
350	0.08
351	0.09
352	0.12
353	0.13
354	0.13
355	0.12
356	0.16
357	0.18
358	0.17
359	0.17
360	0.15
361	0.17
362	0.23
363	0.25
364	0.28
365	0.35
366	0.37
367	0.38
368	0.41
369	0.43
370	0.41
371	0.39
372	0.32
373	0.24
374	0.22
375	0.19
376	0.15
377	0.1
378	0.07
379	0.06
380	0.06
381	0.05
382	0.07
383	0.07
384	0.06
385	0.07
386	0.07
387	0.08
388	0.08
389	0.1
390	0.09
391	0.12
392	0.16
393	0.17
394	0.24
395	0.24
396	0.26
397	0.26
398	0.26
399	0.25
400	0.29
401	0.34
402	0.3
403	0.33
404	0.37
405	0.41
406	0.45
407	0.51
408	0.53
409	0.54
410	0.57
411	0.6
412	0.57
413	0.54
414	0.52
415	0.45
416	0.39
417	0.31
418	0.26
419	0.19
420	0.17
421	0.15
422	0.14
423	0.14
424	0.1
425	0.1
426	0.1
427	0.09
428	0.11
429	0.11
430	0.12
431	0.14
432	0.15
433	0.17
434	0.18
435	0.18
436	0.18
437	0.17
438	0.17
439	0.14
440	0.14
441	0.15
442	0.14
443	0.15
444	0.2
445	0.23
446	0.25
447	0.3
448	0.37
449	0.45
450	0.49
451	0.51
452	0.51
453	0.53
454	0.55
455	0.56
456	0.52
457	0.46
458	0.48
459	0.48
460	0.49
461	0.44
462	0.38
463	0.32
464	0.31
465	0.28
466	0.24
467	0.21
468	0.16
469	0.18
470	0.21
471	0.26
472	0.26
473	0.3
474	0.34
475	0.41
476	0.43
477	0.43
478	0.49
479	0.53
480	0.6
481	0.64
482	0.65
483	0.67
484	0.75
485	0.76
486	0.78
487	0.77
488	0.76
489	0.75
490	0.73
491	0.66
492	0.6
493	0.56
494	0.48
495	0.41
496	0.33
497	0.25
498	0.21
499	0.23
500	0.22
501	0.21
502	0.23
503	0.22
504	0.27
505	0.36
506	0.42
507	0.41
508	0.47
509	0.57
510	0.63
511	0.7
512	0.72
513	0.69
514	0.68
515	0.65
516	0.61
517	0.55
518	0.45
519	0.37
520	0.32
521	0.26
522	0.21
523	0.2
524	0.17
525	0.13
526	0.17
527	0.18
528	0.18
529	0.22
530	0.22
531	0.22
532	0.2
533	0.19
534	0.15
535	0.14
536	0.12
537	0.08
538	0.08
539	0.08
540	0.08
541	0.07
542	0.07
543	0.07
544	0.06
545	0.06
546	0.05
547	0.04
548	0.04
549	0.04
550	0.05
551	0.06
552	0.07
553	0.07
554	0.13
555	0.15
556	0.21
557	0.24
558	0.28
559	0.33
560	0.38
561	0.45
562	0.49
563	0.56
564	0.59
565	0.59
566	0.58
567	0.54
568	0.49
569	0.44
570	0.36
571	0.32
572	0.3
573	0.27
574	0.25
575	0.24
576	0.26
577	0.27
578	0.27
579	0.26
580	0.2
581	0.2
582	0.19
583	0.2
584	0.19
585	0.16
586	0.15
587	0.13
588	0.13
589	0.12
590	0.12
591	0.13
592	0.11
593	0.12
594	0.1
595	0.11
596	0.11
597	0.12
598	0.14
599	0.12
600	0.12
601	0.14
602	0.14
603	0.14
604	0.16
605	0.15
606	0.13
607	0.13
608	0.13
609	0.12
610	0.12
611	0.12
612	0.13
613	0.13
614	0.13
615	0.13
616	0.16
617	0.17
618	0.2
619	0.24
620	0.23
621	0.28
622	0.34
623	0.42
624	0.43
625	0.47
626	0.51
627	0.5
628	0.5
629	0.48
630	0.45
631	0.43
632	0.42
633	0.39
634	0.38
635	0.4
636	0.46
637	0.51
638	0.5
639	0.46
640	0.45
641	0.43
642	0.44
643	0.46
644	0.49
645	0.51
646	0.58
647	0.61

A0A2L2TIP7

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer