Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2L2T541

Protein Details
Accession A0A2L2T541    Localization Confidence High Confidence Score 20.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
50-69QPPKEASPPPRKRSPSPPHEBasic
301-323GEEKRKRRDYRQMRKEQFKRPEPBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
36-63SKKGIQKYFSKVKEQPPKEASPPPRKRS
302-320EEKRKRRDYRQMRKEQFKR
Subcellular Location(s) nucl 22, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR028942  WHIM1_dom  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
Pfam View protein in Pfam  
PF15612  WHIM1  
Amino Acid Sequences MSAEDDSSDLSSLSSLSPAPSDIELEEPVKEPVAKSKKGIQKYFSKVKEQPPKEASPPPRKRSPSPPHEYVLADNPDIAFIVMFRSRFSDAFPKSLAHFGPQEIERDVVEPIPGDRAEHFLCALLGLLLNRKQDVKPGHYGRALEDAISSHKNQWAPAWKDKSPLSGGATFTSMDPTQRLTLLRYLVLWTLSSSESVKGLINQSYKQNRHEDDMNQPRSIQPWGSDGDKRRYFLIEGQDDTAFRVYRESNPAGTNRTWYSVAGTIEELRALAEKLETKDGGPKAKKLAQKMYTAIPRFEAGEEKRKRRDYRQMRKEQFKRPEPGFSLYEGRTRGKKMKYTYSDDEDVFTTDSTTRRSTRNTGTHTPVETGPLTTASGRQIKAPTRLNPTTGSSAPGSVQGDTSEVEKDTSVGPTGRPRRSAAVNHGKSGWAEPRKTSRRNASDDSDEESEAEFGDDEEDVDEHVSGESEDEDELDEDEVMADDDLEEHNQSLVVKLSVTPPKLRNVLECNAQTGNKLPTPSSDKAAEESRPSGETVEMEDALAATPSKESQPTTQQSPNPDPDLAERQNSTPGTIHATSLAFRGSPEKTQT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.09
2 0.08
3 0.09
4 0.1
5 0.11
6 0.13
7 0.12
8 0.14
9 0.13
10 0.15
11 0.17
12 0.17
13 0.18
14 0.17
15 0.17
16 0.18
17 0.18
18 0.16
19 0.24
20 0.31
21 0.33
22 0.36
23 0.44
24 0.51
25 0.6
26 0.66
27 0.62
28 0.64
29 0.7
30 0.77
31 0.72
32 0.73
33 0.7
34 0.74
35 0.78
36 0.72
37 0.73
38 0.69
39 0.7
40 0.67
41 0.69
42 0.69
43 0.7
44 0.76
45 0.74
46 0.77
47 0.77
48 0.78
49 0.79
50 0.8
51 0.8
52 0.78
53 0.76
54 0.69
55 0.66
56 0.61
57 0.53
58 0.5
59 0.43
60 0.34
61 0.29
62 0.26
63 0.22
64 0.2
65 0.17
66 0.09
67 0.05
68 0.09
69 0.11
70 0.11
71 0.12
72 0.15
73 0.17
74 0.18
75 0.22
76 0.28
77 0.28
78 0.31
79 0.32
80 0.31
81 0.3
82 0.34
83 0.31
84 0.24
85 0.24
86 0.21
87 0.25
88 0.25
89 0.25
90 0.22
91 0.22
92 0.19
93 0.18
94 0.18
95 0.13
96 0.12
97 0.1
98 0.09
99 0.12
100 0.12
101 0.12
102 0.12
103 0.16
104 0.17
105 0.17
106 0.17
107 0.13
108 0.13
109 0.12
110 0.11
111 0.07
112 0.07
113 0.07
114 0.11
115 0.13
116 0.15
117 0.16
118 0.18
119 0.18
120 0.25
121 0.3
122 0.31
123 0.38
124 0.42
125 0.46
126 0.47
127 0.47
128 0.42
129 0.42
130 0.37
131 0.27
132 0.22
133 0.18
134 0.19
135 0.21
136 0.2
137 0.16
138 0.2
139 0.21
140 0.21
141 0.26
142 0.32
143 0.36
144 0.44
145 0.48
146 0.45
147 0.49
148 0.5
149 0.48
150 0.4
151 0.37
152 0.32
153 0.29
154 0.29
155 0.25
156 0.25
157 0.21
158 0.18
159 0.18
160 0.14
161 0.12
162 0.11
163 0.13
164 0.13
165 0.14
166 0.15
167 0.14
168 0.17
169 0.18
170 0.17
171 0.16
172 0.16
173 0.15
174 0.15
175 0.12
176 0.09
177 0.1
178 0.1
179 0.1
180 0.1
181 0.1
182 0.09
183 0.1
184 0.1
185 0.1
186 0.13
187 0.16
188 0.17
189 0.19
190 0.27
191 0.34
192 0.37
193 0.4
194 0.45
195 0.42
196 0.44
197 0.46
198 0.41
199 0.43
200 0.5
201 0.49
202 0.42
203 0.41
204 0.37
205 0.34
206 0.33
207 0.23
208 0.14
209 0.13
210 0.15
211 0.18
212 0.22
213 0.25
214 0.33
215 0.35
216 0.34
217 0.33
218 0.32
219 0.3
220 0.3
221 0.33
222 0.27
223 0.25
224 0.26
225 0.26
226 0.24
227 0.24
228 0.21
229 0.13
230 0.1
231 0.12
232 0.11
233 0.14
234 0.2
235 0.21
236 0.21
237 0.23
238 0.25
239 0.26
240 0.25
241 0.25
242 0.2
243 0.21
244 0.19
245 0.17
246 0.17
247 0.17
248 0.17
249 0.14
250 0.14
251 0.12
252 0.12
253 0.11
254 0.09
255 0.06
256 0.06
257 0.05
258 0.05
259 0.05
260 0.08
261 0.09
262 0.11
263 0.11
264 0.11
265 0.17
266 0.19
267 0.25
268 0.24
269 0.25
270 0.28
271 0.34
272 0.36
273 0.35
274 0.42
275 0.38
276 0.4
277 0.4
278 0.4
279 0.41
280 0.39
281 0.35
282 0.27
283 0.23
284 0.21
285 0.19
286 0.19
287 0.15
288 0.24
289 0.3
290 0.35
291 0.41
292 0.48
293 0.52
294 0.54
295 0.63
296 0.64
297 0.69
298 0.75
299 0.79
300 0.79
301 0.86
302 0.86
303 0.85
304 0.83
305 0.79
306 0.74
307 0.65
308 0.63
309 0.56
310 0.52
311 0.44
312 0.36
313 0.33
314 0.28
315 0.29
316 0.26
317 0.25
318 0.23
319 0.26
320 0.3
321 0.31
322 0.36
323 0.37
324 0.45
325 0.49
326 0.54
327 0.55
328 0.53
329 0.51
330 0.45
331 0.42
332 0.32
333 0.27
334 0.2
335 0.15
336 0.11
337 0.1
338 0.11
339 0.12
340 0.15
341 0.17
342 0.19
343 0.23
344 0.27
345 0.34
346 0.41
347 0.45
348 0.47
349 0.5
350 0.51
351 0.48
352 0.45
353 0.36
354 0.31
355 0.25
356 0.19
357 0.14
358 0.12
359 0.11
360 0.1
361 0.11
362 0.12
363 0.17
364 0.16
365 0.19
366 0.23
367 0.27
368 0.33
369 0.38
370 0.4
371 0.44
372 0.45
373 0.44
374 0.42
375 0.41
376 0.38
377 0.33
378 0.3
379 0.21
380 0.21
381 0.19
382 0.2
383 0.17
384 0.13
385 0.13
386 0.1
387 0.11
388 0.1
389 0.11
390 0.09
391 0.08
392 0.09
393 0.08
394 0.09
395 0.09
396 0.09
397 0.1
398 0.09
399 0.11
400 0.2
401 0.28
402 0.31
403 0.33
404 0.35
405 0.37
406 0.42
407 0.46
408 0.47
409 0.5
410 0.48
411 0.47
412 0.46
413 0.42
414 0.37
415 0.35
416 0.34
417 0.29
418 0.28
419 0.31
420 0.41
421 0.49
422 0.54
423 0.58
424 0.59
425 0.61
426 0.66
427 0.67
428 0.62
429 0.6
430 0.56
431 0.54
432 0.45
433 0.37
434 0.3
435 0.26
436 0.2
437 0.14
438 0.12
439 0.07
440 0.05
441 0.06
442 0.05
443 0.05
444 0.06
445 0.06
446 0.06
447 0.06
448 0.06
449 0.06
450 0.06
451 0.06
452 0.05
453 0.06
454 0.06
455 0.06
456 0.06
457 0.06
458 0.06
459 0.07
460 0.07
461 0.07
462 0.07
463 0.06
464 0.06
465 0.06
466 0.06
467 0.05
468 0.04
469 0.04
470 0.05
471 0.06
472 0.07
473 0.07
474 0.07
475 0.07
476 0.08
477 0.08
478 0.09
479 0.1
480 0.09
481 0.09
482 0.1
483 0.17
484 0.22
485 0.25
486 0.31
487 0.32
488 0.38
489 0.43
490 0.43
491 0.43
492 0.43
493 0.45
494 0.46
495 0.44
496 0.41
497 0.39
498 0.38
499 0.33
500 0.3
501 0.31
502 0.26
503 0.27
504 0.24
505 0.27
506 0.35
507 0.36
508 0.36
509 0.34
510 0.33
511 0.35
512 0.39
513 0.36
514 0.32
515 0.32
516 0.3
517 0.28
518 0.27
519 0.24
520 0.21
521 0.18
522 0.18
523 0.19
524 0.17
525 0.15
526 0.15
527 0.14
528 0.13
529 0.13
530 0.09
531 0.06
532 0.07
533 0.08
534 0.11
535 0.14
536 0.16
537 0.21
538 0.31
539 0.37
540 0.43
541 0.49
542 0.5
543 0.56
544 0.61
545 0.62
546 0.56
547 0.51
548 0.45
549 0.44
550 0.5
551 0.45
552 0.42
553 0.37
554 0.35
555 0.41
556 0.4
557 0.36
558 0.29
559 0.27
560 0.3
561 0.28
562 0.27
563 0.23
564 0.24
565 0.22
566 0.22
567 0.21
568 0.14
569 0.14
570 0.19
571 0.19