Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C4QZX9

Protein Details
Accession C4QZX9    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
40-59EKLKIPLKRLPKRSLPTPKSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
46-51LKRLPK
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 13.5, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR047260  ERCC1-like_central_dom  
IPR004579  ERCC1/RAD10/SWI10  
IPR011335  Restrct_endonuc-II-like  
IPR010994  RuvA_2-like  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003684  F:damaged DNA binding  
GO:0004519  F:endonuclease activity  
GO:0006310  P:DNA recombination  
GO:0006302  P:double-strand break repair  
KEGG ppa:PAS_chr2-1_0195  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF03834  Rad10  
CDD cd22325  ERCC1_C-like  
Amino Acid Sequences MSGADDGKDKTDTTSFEAILAGVKRLREQDQNKDAKQGSEKLKIPLKRLPKRSLPTPKSDQIQNVKTTEDAAPVSSAPVTSTTTSKVIRMDNTPSNLAIRHQKKTGKTTFNSIQVNKSQTGNPLLKHLKTVSWEFSSNIKQVDYLVNSQTFVLFLSLKYHKLHPEYIMNKIKSMNGNDTSFTNNNLKLLLVVVDIDSHEDILRELTKTCVNNDLSLVLSWSFEEAANYIVYLKQYELSDLSESTLINNSKQDSSSYNSLVKSVTSIRNITKTDAVNLISEFGSLRELVNANPESMSAVQGMGDIKVNRWASVVEDQFVLNKEYT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.29
2 0.27
3 0.26
4 0.26
5 0.22
6 0.23
7 0.22
8 0.18
9 0.16
10 0.17
11 0.19
12 0.23
13 0.27
14 0.33
15 0.39
16 0.47
17 0.55
18 0.63
19 0.62
20 0.65
21 0.62
22 0.57
23 0.56
24 0.54
25 0.51
26 0.51
27 0.53
28 0.52
29 0.58
30 0.57
31 0.57
32 0.56
33 0.6
34 0.6
35 0.66
36 0.67
37 0.69
38 0.72
39 0.77
40 0.81
41 0.75
42 0.74
43 0.74
44 0.72
45 0.67
46 0.64
47 0.62
48 0.59
49 0.6
50 0.56
51 0.49
52 0.43
53 0.39
54 0.37
55 0.3
56 0.23
57 0.18
58 0.14
59 0.14
60 0.13
61 0.13
62 0.11
63 0.1
64 0.08
65 0.09
66 0.1
67 0.11
68 0.12
69 0.14
70 0.18
71 0.18
72 0.19
73 0.21
74 0.22
75 0.24
76 0.26
77 0.29
78 0.31
79 0.33
80 0.33
81 0.29
82 0.28
83 0.25
84 0.25
85 0.29
86 0.29
87 0.29
88 0.34
89 0.39
90 0.43
91 0.52
92 0.58
93 0.56
94 0.53
95 0.57
96 0.56
97 0.58
98 0.58
99 0.51
100 0.46
101 0.42
102 0.44
103 0.37
104 0.33
105 0.27
106 0.25
107 0.29
108 0.28
109 0.24
110 0.28
111 0.3
112 0.29
113 0.3
114 0.28
115 0.23
116 0.24
117 0.26
118 0.22
119 0.21
120 0.22
121 0.21
122 0.24
123 0.26
124 0.24
125 0.22
126 0.18
127 0.16
128 0.16
129 0.18
130 0.16
131 0.14
132 0.15
133 0.14
134 0.14
135 0.14
136 0.13
137 0.1
138 0.08
139 0.07
140 0.05
141 0.05
142 0.1
143 0.11
144 0.13
145 0.15
146 0.16
147 0.19
148 0.21
149 0.23
150 0.21
151 0.27
152 0.27
153 0.34
154 0.4
155 0.37
156 0.35
157 0.34
158 0.34
159 0.3
160 0.3
161 0.27
162 0.23
163 0.24
164 0.23
165 0.23
166 0.25
167 0.22
168 0.22
169 0.2
170 0.17
171 0.16
172 0.16
173 0.15
174 0.11
175 0.1
176 0.08
177 0.05
178 0.05
179 0.05
180 0.05
181 0.05
182 0.06
183 0.05
184 0.05
185 0.05
186 0.05
187 0.05
188 0.06
189 0.08
190 0.07
191 0.08
192 0.09
193 0.13
194 0.14
195 0.15
196 0.2
197 0.2
198 0.2
199 0.2
200 0.19
201 0.16
202 0.15
203 0.15
204 0.09
205 0.08
206 0.07
207 0.07
208 0.07
209 0.06
210 0.06
211 0.06
212 0.07
213 0.07
214 0.07
215 0.07
216 0.07
217 0.07
218 0.08
219 0.08
220 0.09
221 0.09
222 0.11
223 0.12
224 0.13
225 0.14
226 0.13
227 0.14
228 0.12
229 0.12
230 0.12
231 0.16
232 0.15
233 0.15
234 0.17
235 0.18
236 0.19
237 0.2
238 0.2
239 0.18
240 0.22
241 0.26
242 0.27
243 0.28
244 0.27
245 0.27
246 0.26
247 0.23
248 0.2
249 0.21
250 0.23
251 0.23
252 0.27
253 0.29
254 0.35
255 0.37
256 0.37
257 0.37
258 0.33
259 0.32
260 0.32
261 0.3
262 0.25
263 0.24
264 0.22
265 0.17
266 0.16
267 0.13
268 0.1
269 0.1
270 0.09
271 0.09
272 0.1
273 0.11
274 0.11
275 0.19
276 0.19
277 0.18
278 0.18
279 0.18
280 0.17
281 0.17
282 0.18
283 0.11
284 0.1
285 0.09
286 0.11
287 0.11
288 0.09
289 0.14
290 0.13
291 0.14
292 0.22
293 0.23
294 0.22
295 0.22
296 0.22
297 0.21
298 0.3
299 0.31
300 0.24
301 0.24
302 0.24
303 0.26
304 0.27