Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2L2TT20

Protein Details
Accession A0A2L2TT20    Localization Confidence High Confidence Score 20.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
5-31DHAAAKAEKKAKKEKKRAREEDAAAETBasic
46-73IPATEDLKADKKKKKSKKDKHAEDSAAPBasic
79-131AAVDEAKPEKKHKKKKHHDAEVAEPTEEAVDGEKKKKKSKKNKDTEDNSEKQKBasic
395-415TAKMRQGKSGGQKGRRRNIPEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
9-39AKAEKKAKKEKKRAREEDAAAETERKHKKSK
53-66KADKKKKKSKKDKH
85-95KPEKKHKKKKH
111-121EKKKKKSKKNK
Subcellular Location(s) nucl 12.5, cyto_nucl 12, cyto 10.5, pero 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036898  RNA_pol_Rpb7-like_N_sf  
IPR041901  RNAP_I_Rpa43_N  
IPR041178  RPA43_OB  
IPR045113  Rpb7-like  
Gene Ontology GO:0000428  C:DNA-directed RNA polymerase complex  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006352  P:DNA-templated transcription initiation  
Pfam View protein in Pfam  
PF17875  RPA43_OB  
CDD cd04328  RNAP_I_Rpa43_N  
Amino Acid Sequences MAPIDHAAAKAEKKAKKEKKRAREEDAAAETERKHKKSKSVVAVDIPATEDLKADKKKKKSKKDKHAEDSAAPQDSESAAVDEAKPEKKHKKKKHHDAEVAEPTEEAVDGEKKKKKSKKNKDTEDNSEKQKHSEDAAPADTDAMDIDMPPPAKPSKSSDNIYQPPDIPANPQFPFFTQTVSLYEPLFPIGWAQPVTNCQFQHLQHLQNKYVPSLRGVLLDYRNVAFGENPGRNGAATDDETPTTVMAKGEAAVGWGWITAEVDLFVPSRGAWMEGSVNLQTEGHIGVVCFGKFNASIEARRLPPDWKWVPNESPEAQGFEETASVITADDHGVVRQIHSTGFWADGSGDKVKGKIRFRIRNFDVGTSGEISYLSLEGTMLDKAGEKAVVAEEAETAKMRQGKSGGQKGRRRNIPEFAMTRFTVDDEEQTQDNEEEKREVLALPEDQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.55
2 0.63
3 0.69
4 0.79
5 0.82
6 0.84
7 0.91
8 0.93
9 0.9
10 0.89
11 0.83
12 0.81
13 0.74
14 0.66
15 0.56
16 0.5
17 0.43
18 0.42
19 0.46
20 0.41
21 0.44
22 0.47
23 0.55
24 0.62
25 0.71
26 0.72
27 0.72
28 0.73
29 0.69
30 0.68
31 0.59
32 0.49
33 0.4
34 0.31
35 0.23
36 0.18
37 0.14
38 0.13
39 0.21
40 0.28
41 0.36
42 0.43
43 0.53
44 0.64
45 0.74
46 0.82
47 0.86
48 0.89
49 0.91
50 0.94
51 0.95
52 0.93
53 0.92
54 0.86
55 0.78
56 0.74
57 0.68
58 0.59
59 0.47
60 0.38
61 0.29
62 0.24
63 0.22
64 0.15
65 0.11
66 0.08
67 0.1
68 0.1
69 0.12
70 0.16
71 0.21
72 0.24
73 0.31
74 0.42
75 0.51
76 0.62
77 0.7
78 0.77
79 0.83
80 0.91
81 0.94
82 0.94
83 0.93
84 0.87
85 0.86
86 0.83
87 0.74
88 0.62
89 0.51
90 0.4
91 0.31
92 0.25
93 0.15
94 0.08
95 0.12
96 0.15
97 0.23
98 0.29
99 0.35
100 0.44
101 0.53
102 0.62
103 0.68
104 0.77
105 0.8
106 0.85
107 0.91
108 0.92
109 0.91
110 0.91
111 0.88
112 0.82
113 0.79
114 0.75
115 0.65
116 0.56
117 0.51
118 0.42
119 0.36
120 0.36
121 0.31
122 0.27
123 0.27
124 0.25
125 0.22
126 0.21
127 0.18
128 0.12
129 0.09
130 0.06
131 0.05
132 0.04
133 0.05
134 0.07
135 0.07
136 0.07
137 0.1
138 0.11
139 0.12
140 0.15
141 0.2
142 0.26
143 0.32
144 0.35
145 0.39
146 0.46
147 0.51
148 0.51
149 0.47
150 0.4
151 0.36
152 0.35
153 0.28
154 0.22
155 0.21
156 0.23
157 0.22
158 0.23
159 0.21
160 0.2
161 0.23
162 0.2
163 0.17
164 0.13
165 0.14
166 0.15
167 0.16
168 0.16
169 0.13
170 0.13
171 0.12
172 0.11
173 0.1
174 0.08
175 0.08
176 0.07
177 0.09
178 0.09
179 0.09
180 0.09
181 0.12
182 0.16
183 0.18
184 0.17
185 0.18
186 0.21
187 0.22
188 0.3
189 0.3
190 0.34
191 0.35
192 0.38
193 0.37
194 0.36
195 0.37
196 0.29
197 0.28
198 0.22
199 0.19
200 0.18
201 0.17
202 0.15
203 0.15
204 0.17
205 0.15
206 0.15
207 0.14
208 0.12
209 0.12
210 0.11
211 0.1
212 0.07
213 0.08
214 0.13
215 0.13
216 0.13
217 0.13
218 0.13
219 0.13
220 0.13
221 0.12
222 0.08
223 0.09
224 0.1
225 0.1
226 0.1
227 0.11
228 0.11
229 0.1
230 0.09
231 0.08
232 0.06
233 0.06
234 0.06
235 0.06
236 0.06
237 0.06
238 0.05
239 0.05
240 0.05
241 0.04
242 0.04
243 0.04
244 0.04
245 0.04
246 0.03
247 0.03
248 0.04
249 0.04
250 0.05
251 0.05
252 0.05
253 0.05
254 0.05
255 0.06
256 0.05
257 0.06
258 0.05
259 0.06
260 0.07
261 0.08
262 0.09
263 0.09
264 0.09
265 0.09
266 0.09
267 0.07
268 0.07
269 0.07
270 0.06
271 0.06
272 0.05
273 0.07
274 0.08
275 0.08
276 0.08
277 0.07
278 0.08
279 0.08
280 0.1
281 0.13
282 0.14
283 0.15
284 0.18
285 0.23
286 0.23
287 0.25
288 0.25
289 0.23
290 0.23
291 0.31
292 0.33
293 0.34
294 0.37
295 0.4
296 0.42
297 0.43
298 0.47
299 0.38
300 0.37
301 0.33
302 0.3
303 0.26
304 0.23
305 0.19
306 0.14
307 0.13
308 0.09
309 0.08
310 0.05
311 0.05
312 0.05
313 0.05
314 0.05
315 0.05
316 0.06
317 0.06
318 0.06
319 0.09
320 0.09
321 0.1
322 0.11
323 0.11
324 0.1
325 0.1
326 0.12
327 0.1
328 0.11
329 0.11
330 0.09
331 0.09
332 0.11
333 0.14
334 0.14
335 0.15
336 0.15
337 0.17
338 0.22
339 0.29
340 0.33
341 0.38
342 0.47
343 0.55
344 0.61
345 0.69
346 0.68
347 0.69
348 0.67
349 0.6
350 0.52
351 0.43
352 0.39
353 0.3
354 0.26
355 0.17
356 0.15
357 0.12
358 0.11
359 0.1
360 0.08
361 0.05
362 0.05
363 0.05
364 0.07
365 0.07
366 0.06
367 0.06
368 0.07
369 0.08
370 0.1
371 0.09
372 0.08
373 0.09
374 0.1
375 0.11
376 0.1
377 0.09
378 0.09
379 0.1
380 0.11
381 0.11
382 0.1
383 0.14
384 0.18
385 0.18
386 0.21
387 0.23
388 0.3
389 0.39
390 0.49
391 0.54
392 0.59
393 0.67
394 0.74
395 0.81
396 0.82
397 0.8
398 0.76
399 0.75
400 0.72
401 0.73
402 0.66
403 0.6
404 0.57
405 0.49
406 0.44
407 0.36
408 0.3
409 0.25
410 0.23
411 0.22
412 0.19
413 0.22
414 0.21
415 0.21
416 0.23
417 0.21
418 0.23
419 0.22
420 0.22
421 0.21
422 0.21
423 0.21
424 0.2
425 0.19
426 0.19