Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A316V1C9

Protein Details
Accession A0A316V1C9    Localization Confidence High Confidence Score 22.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
45-70EAKEKAEREKRREQLKAREEERKKREBasic
75-99RLAAQREEWKRQKQKEQERAAKGDGHydrophilic
444-463EEEILKRREREKAERRRMGRBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
46-104AKEKAEREKRREQLKAREEERKKREAEQIRLAAQREEWKRQKQKEQERAAKGDGKKRAS
115-123KKMIKAKEK
318-347ERFLREEGERKARKQDEKATSGAKKGKPTA
442-463KREEEILKRREREKAERRRMGR
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 12.5, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013256  Chromatin_SPT2  
Pfam View protein in Pfam  
PF08243  SPT2  
Amino Acid Sequences MASLGGDFEALKRRAQQQDAEKQATLLKQRAQQDKEAAARQAALEAKEKAEREKRREQLKAREEERKKREAEQIRLAAQREEWKRQKQKEQERAAKGDGKKRASQEDIGDRVVTKKMIKAKEKAGLGGLGRTAGKASSSSSSDYLPLTRQEKRERREREAMGMPARNIRAAGRSNAATGGTGASGLRGPAGSSSSTPLNARGSIASASSSSSRTALQSSTPASPSPALKLLQVRLNKAIESRRQAERLPEGKDRSIQLRDAESLEKDLRRKMAMERKREEQAEMERIKNGGLPPGQEGRAGVVAAGPPTPARPETARERFLREEGERKARKQDEKATSGAKKGKPTAGKSMRFDEDEEDSDAGSDDYEDDSDLDSFIDDDDGTLGAPPDDGESNDIWSIMNPGRERRRYIEDDDEDDDMEADMGSVLREEMRSARMGREEDKREEEILKRREREKAERRRMGR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.42
2 0.46
3 0.52
4 0.53
5 0.63
6 0.69
7 0.68
8 0.59
9 0.53
10 0.52
11 0.49
12 0.45
13 0.41
14 0.38
15 0.4
16 0.48
17 0.57
18 0.56
19 0.58
20 0.58
21 0.59
22 0.6
23 0.58
24 0.51
25 0.43
26 0.4
27 0.33
28 0.32
29 0.27
30 0.23
31 0.23
32 0.23
33 0.25
34 0.29
35 0.3
36 0.34
37 0.41
38 0.48
39 0.52
40 0.6
41 0.66
42 0.71
43 0.79
44 0.79
45 0.8
46 0.81
47 0.82
48 0.78
49 0.8
50 0.8
51 0.81
52 0.8
53 0.77
54 0.7
55 0.66
56 0.7
57 0.7
58 0.69
59 0.68
60 0.66
61 0.64
62 0.65
63 0.6
64 0.51
65 0.44
66 0.45
67 0.41
68 0.45
69 0.48
70 0.55
71 0.63
72 0.7
73 0.78
74 0.79
75 0.85
76 0.85
77 0.87
78 0.87
79 0.84
80 0.8
81 0.75
82 0.72
83 0.66
84 0.64
85 0.61
86 0.56
87 0.54
88 0.53
89 0.55
90 0.51
91 0.49
92 0.48
93 0.49
94 0.47
95 0.43
96 0.39
97 0.33
98 0.31
99 0.29
100 0.24
101 0.17
102 0.19
103 0.25
104 0.33
105 0.39
106 0.42
107 0.47
108 0.51
109 0.51
110 0.47
111 0.41
112 0.35
113 0.3
114 0.25
115 0.19
116 0.14
117 0.13
118 0.12
119 0.11
120 0.08
121 0.08
122 0.07
123 0.09
124 0.1
125 0.12
126 0.14
127 0.15
128 0.15
129 0.16
130 0.16
131 0.16
132 0.15
133 0.18
134 0.2
135 0.25
136 0.31
137 0.4
138 0.48
139 0.52
140 0.6
141 0.62
142 0.66
143 0.7
144 0.65
145 0.61
146 0.58
147 0.58
148 0.53
149 0.48
150 0.41
151 0.35
152 0.34
153 0.27
154 0.22
155 0.18
156 0.18
157 0.17
158 0.19
159 0.17
160 0.17
161 0.18
162 0.18
163 0.17
164 0.12
165 0.1
166 0.09
167 0.06
168 0.06
169 0.05
170 0.05
171 0.05
172 0.05
173 0.05
174 0.04
175 0.04
176 0.04
177 0.06
178 0.06
179 0.07
180 0.09
181 0.09
182 0.11
183 0.11
184 0.12
185 0.13
186 0.12
187 0.12
188 0.1
189 0.11
190 0.1
191 0.1
192 0.08
193 0.07
194 0.08
195 0.08
196 0.09
197 0.08
198 0.09
199 0.09
200 0.09
201 0.1
202 0.1
203 0.1
204 0.11
205 0.13
206 0.14
207 0.14
208 0.13
209 0.13
210 0.14
211 0.14
212 0.13
213 0.14
214 0.13
215 0.14
216 0.16
217 0.17
218 0.21
219 0.22
220 0.22
221 0.23
222 0.23
223 0.21
224 0.22
225 0.25
226 0.25
227 0.28
228 0.3
229 0.3
230 0.32
231 0.32
232 0.33
233 0.36
234 0.36
235 0.36
236 0.37
237 0.37
238 0.36
239 0.37
240 0.35
241 0.31
242 0.29
243 0.26
244 0.22
245 0.21
246 0.21
247 0.2
248 0.2
249 0.16
250 0.17
251 0.17
252 0.18
253 0.18
254 0.19
255 0.19
256 0.19
257 0.2
258 0.25
259 0.33
260 0.38
261 0.45
262 0.47
263 0.5
264 0.54
265 0.53
266 0.46
267 0.41
268 0.39
269 0.39
270 0.37
271 0.34
272 0.3
273 0.29
274 0.28
275 0.25
276 0.2
277 0.16
278 0.14
279 0.14
280 0.17
281 0.2
282 0.2
283 0.18
284 0.18
285 0.14
286 0.14
287 0.13
288 0.1
289 0.07
290 0.07
291 0.08
292 0.08
293 0.06
294 0.06
295 0.06
296 0.08
297 0.08
298 0.1
299 0.12
300 0.17
301 0.27
302 0.34
303 0.39
304 0.39
305 0.44
306 0.44
307 0.44
308 0.45
309 0.38
310 0.38
311 0.38
312 0.47
313 0.45
314 0.45
315 0.53
316 0.55
317 0.58
318 0.59
319 0.63
320 0.61
321 0.6
322 0.62
323 0.59
324 0.54
325 0.54
326 0.54
327 0.48
328 0.45
329 0.46
330 0.49
331 0.49
332 0.51
333 0.55
334 0.57
335 0.6
336 0.58
337 0.6
338 0.56
339 0.51
340 0.48
341 0.4
342 0.34
343 0.29
344 0.28
345 0.22
346 0.19
347 0.17
348 0.16
349 0.13
350 0.09
351 0.07
352 0.05
353 0.06
354 0.06
355 0.06
356 0.06
357 0.07
358 0.08
359 0.08
360 0.07
361 0.06
362 0.06
363 0.06
364 0.06
365 0.05
366 0.05
367 0.05
368 0.05
369 0.05
370 0.06
371 0.06
372 0.05
373 0.06
374 0.06
375 0.07
376 0.08
377 0.09
378 0.11
379 0.11
380 0.13
381 0.13
382 0.13
383 0.11
384 0.11
385 0.15
386 0.15
387 0.2
388 0.2
389 0.29
390 0.39
391 0.44
392 0.49
393 0.5
394 0.56
395 0.56
396 0.61
397 0.62
398 0.57
399 0.57
400 0.54
401 0.49
402 0.41
403 0.35
404 0.29
405 0.19
406 0.14
407 0.09
408 0.06
409 0.05
410 0.05
411 0.05
412 0.05
413 0.05
414 0.06
415 0.07
416 0.08
417 0.11
418 0.14
419 0.18
420 0.2
421 0.24
422 0.28
423 0.32
424 0.36
425 0.43
426 0.47
427 0.5
428 0.53
429 0.52
430 0.49
431 0.51
432 0.53
433 0.53
434 0.56
435 0.58
436 0.59
437 0.61
438 0.67
439 0.71
440 0.74
441 0.75
442 0.77
443 0.79