FuNGI

A0A316UHP6

Protein Details

Accession

A0A316UHP6

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

10.6

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
109-136	AQFVPPLKLNRKQPPKPRQTWPKAGDTL	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 22.5, cyto_nucl 14.5, cyto 3.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter

Amino Acid Sequences

MSQLRAVKAESSQDAAGSSSPSGSSSPRPNASRMSTGTTVVRSSSSRLIKRGDEANSPATAGTPRRSPSPPPPTTYRDIPLLSTSAATPWVHHLARFVHHQRIDPTDAAQFVPPLKLNRKQPPKPRQTWPKAGDTLVDRYGRSVRLANGKELTWPQKGEDTSEHRKILERLAPTPKGPEGAARGHANGYDASLVAPGAASAARNSNRPLFQKRVRQIHKASATARRIHNDESLPWVLEDFETGNHWESSRTARKDSVHALAKHFLDGGEGLAGPKEEEGGEEEEKKGRIKREDNRLVQHAPWIGKLEGGDGAVSSSSSSTSNGRAPSTSTSDASAQVLFVFDERNQGGFKVVPLRKTYRFMQKSRFADERGDEEREKEFERLQKSRSVGATDRFAGRSGERGSGIATPSSVRGGGAGGGVGSGLVMPGSGGMRGNNGSARGVKKEESLDEDWPALRGLSLGSYVSSRPRGLVSVSGGSNGRRRGGYDDDDVHGSGGYGGGEDATYDEVEYHEDFADDEERMGGEAELVEDADEREREDRLRREMARAGVGEGMGQMVKEEEEDDDLFGSASQSGSAQQPRGRRRDDQLTGSGRQMKKIMRALARREGQDVDGLYDSDDDDDGGDLLDIDGTRRGRGANPYAEDDEDGDDDEEEPALANPEEAIRRAMEEKREREAREAKDAATSGQGSERTSRGSTPTPGQQPTAARTPSQTGRGQGSTTPTKRQRDTSSSGSVRGPPGRPQQQQGHRRTATAASSHSRAVSPSAAVSRSPSPGPQGQQQGHLSHIPRQSSPLAHPSGSSMEGAAAGVKRPASPQPGGTTGLPPSSSNSRPASPTSKRARRDSTGSSSSSRRSTPAPGSTSTTSLERELINMVRSGQVKSIAEVIAAFKKRLQAKPELKGEMMGAFKRCLTGGTRGEVLRVKDGF

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.23
2	0.21
3	0.19
4	0.15
5	0.14
6	0.11
7	0.11
8	0.12
9	0.13
10	0.15
11	0.22
12	0.28
13	0.36
14	0.43
15	0.46
16	0.48
17	0.54
18	0.56
19	0.56
20	0.5
21	0.49
22	0.43
23	0.43
24	0.43
25	0.38
26	0.33
27	0.27
28	0.27
29	0.21
30	0.23
31	0.29
32	0.35
33	0.38
34	0.41
35	0.45
36	0.46
37	0.49
38	0.52
39	0.48
40	0.45
41	0.45
42	0.44
43	0.39
44	0.37
45	0.31
46	0.25
47	0.26
48	0.23
49	0.23
50	0.25
51	0.27
52	0.32
53	0.36
54	0.42
55	0.48
56	0.56
57	0.57
58	0.57
59	0.62
60	0.63
61	0.65
62	0.64
63	0.57
64	0.51
65	0.47
66	0.43
67	0.38
68	0.33
69	0.28
70	0.23
71	0.19
72	0.14
73	0.17
74	0.15
75	0.14
76	0.17
77	0.24
78	0.23
79	0.24
80	0.27
81	0.27
82	0.3
83	0.39
84	0.39
85	0.4
86	0.43
87	0.46
88	0.46
89	0.49
90	0.5
91	0.41
92	0.38
93	0.32
94	0.31
95	0.28
96	0.25
97	0.2
98	0.17
99	0.19
100	0.21
101	0.24
102	0.3
103	0.37
104	0.46
105	0.54
106	0.64
107	0.7
108	0.78
109	0.82
110	0.86
111	0.87
112	0.88
113	0.89
114	0.87
115	0.89
116	0.83
117	0.81
118	0.73
119	0.66
120	0.59
121	0.52
122	0.47
123	0.42
124	0.39
125	0.3
126	0.29
127	0.32
128	0.29
129	0.28
130	0.26
131	0.25
132	0.33
133	0.36
134	0.38
135	0.36
136	0.35
137	0.37
138	0.39
139	0.4
140	0.34
141	0.33
142	0.3
143	0.34
144	0.34
145	0.34
146	0.35
147	0.38
148	0.43
149	0.48
150	0.48
151	0.42
152	0.46
153	0.44
154	0.44
155	0.41
156	0.36
157	0.36
158	0.43
159	0.45
160	0.41
161	0.43
162	0.37
163	0.33
164	0.3
165	0.27
166	0.23
167	0.24
168	0.28
169	0.26
170	0.26
171	0.25
172	0.25
173	0.22
174	0.18
175	0.15
176	0.11
177	0.09
178	0.08
179	0.08
180	0.07
181	0.05
182	0.05
183	0.04
184	0.04
185	0.04
186	0.05
187	0.05
188	0.12
189	0.14
190	0.16
191	0.19
192	0.25
193	0.3
194	0.36
195	0.42
196	0.44
197	0.51
198	0.59
199	0.65
200	0.7
201	0.71
202	0.73
203	0.72
204	0.73
205	0.7
206	0.65
207	0.61
208	0.59
209	0.58
210	0.56
211	0.55
212	0.49
213	0.47
214	0.44
215	0.45
216	0.37
217	0.33
218	0.33
219	0.31
220	0.27
221	0.24
222	0.21
223	0.16
224	0.14
225	0.14
226	0.08
227	0.07
228	0.08
229	0.1
230	0.11
231	0.11
232	0.12
233	0.12
234	0.13
235	0.21
236	0.28
237	0.3
238	0.31
239	0.35
240	0.37
241	0.41
242	0.44
243	0.43
244	0.42
245	0.41
246	0.42
247	0.42
248	0.4
249	0.36
250	0.32
251	0.23
252	0.16
253	0.14
254	0.11
255	0.07
256	0.06
257	0.06
258	0.06
259	0.06
260	0.05
261	0.05
262	0.05
263	0.04
264	0.05
265	0.08
266	0.11
267	0.13
268	0.14
269	0.15
270	0.18
271	0.19
272	0.22
273	0.24
274	0.26
275	0.32
276	0.4
277	0.47
278	0.56
279	0.65
280	0.67
281	0.69
282	0.68
283	0.62
284	0.53
285	0.49
286	0.41
287	0.32
288	0.28
289	0.25
290	0.2
291	0.19
292	0.18
293	0.15
294	0.12
295	0.11
296	0.1
297	0.06
298	0.06
299	0.05
300	0.05
301	0.04
302	0.04
303	0.05
304	0.05
305	0.07
306	0.08
307	0.11
308	0.14
309	0.16
310	0.16
311	0.16
312	0.18
313	0.2
314	0.24
315	0.23
316	0.2
317	0.2
318	0.21
319	0.21
320	0.2
321	0.17
322	0.11
323	0.09
324	0.09
325	0.07
326	0.06
327	0.06
328	0.06
329	0.09
330	0.1
331	0.11
332	0.11
333	0.11
334	0.12
335	0.11
336	0.12
337	0.18
338	0.2
339	0.22
340	0.26
341	0.31
342	0.34
343	0.38
344	0.42
345	0.43
346	0.48
347	0.5
348	0.54
349	0.57
350	0.57
351	0.59
352	0.57
353	0.47
354	0.43
355	0.4
356	0.38
357	0.32
358	0.33
359	0.27
360	0.26
361	0.26
362	0.25
363	0.25
364	0.2
365	0.2
366	0.21
367	0.28
368	0.29
369	0.3
370	0.33
371	0.32
372	0.35
373	0.33
374	0.32
375	0.28
376	0.27
377	0.28
378	0.24
379	0.25
380	0.21
381	0.21
382	0.18
383	0.15
384	0.17
385	0.16
386	0.16
387	0.15
388	0.15
389	0.15
390	0.15
391	0.16
392	0.11
393	0.09
394	0.08
395	0.08
396	0.09
397	0.07
398	0.06
399	0.05
400	0.05
401	0.05
402	0.05
403	0.04
404	0.03
405	0.03
406	0.03
407	0.03
408	0.02
409	0.02
410	0.02
411	0.02
412	0.02
413	0.01
414	0.02
415	0.03
416	0.03
417	0.03
418	0.04
419	0.05
420	0.06
421	0.06
422	0.07
423	0.07
424	0.08
425	0.11
426	0.12
427	0.14
428	0.15
429	0.15
430	0.16
431	0.17
432	0.17
433	0.19
434	0.2
435	0.19
436	0.19
437	0.18
438	0.16
439	0.15
440	0.14
441	0.09
442	0.06
443	0.05
444	0.04
445	0.04
446	0.04
447	0.04
448	0.04
449	0.05
450	0.06
451	0.08
452	0.09
453	0.09
454	0.09
455	0.1
456	0.1
457	0.1
458	0.12
459	0.11
460	0.12
461	0.12
462	0.13
463	0.13
464	0.13
465	0.16
466	0.16
467	0.15
468	0.13
469	0.14
470	0.17
471	0.2
472	0.22
473	0.22
474	0.23
475	0.22
476	0.23
477	0.22
478	0.18
479	0.14
480	0.1
481	0.07
482	0.05
483	0.04
484	0.03
485	0.03
486	0.03
487	0.03
488	0.03
489	0.03
490	0.03
491	0.03
492	0.03
493	0.04
494	0.04
495	0.06
496	0.06
497	0.07
498	0.06
499	0.06
500	0.06
501	0.07
502	0.08
503	0.07
504	0.07
505	0.06
506	0.06
507	0.06
508	0.06
509	0.05
510	0.04
511	0.04
512	0.04
513	0.04
514	0.04
515	0.03
516	0.03
517	0.04
518	0.05
519	0.05
520	0.06
521	0.07
522	0.08
523	0.1
524	0.17
525	0.21
526	0.25
527	0.32
528	0.32
529	0.35
530	0.38
531	0.37
532	0.34
533	0.3
534	0.25
535	0.19
536	0.18
537	0.14
538	0.1
539	0.08
540	0.05
541	0.05
542	0.04
543	0.03
544	0.03
545	0.04
546	0.04
547	0.04
548	0.06
549	0.07
550	0.07
551	0.07
552	0.07
553	0.07
554	0.06
555	0.06
556	0.05
557	0.04
558	0.04
559	0.04
560	0.06
561	0.09
562	0.11
563	0.14
564	0.17
565	0.25
566	0.32
567	0.39
568	0.42
569	0.42
570	0.47
571	0.53
572	0.55
573	0.51
574	0.51
575	0.49
576	0.47
577	0.46
578	0.48
579	0.38
580	0.35
581	0.35
582	0.3
583	0.32
584	0.36
585	0.39
586	0.38
587	0.45
588	0.48
589	0.53
590	0.55
591	0.49
592	0.46
593	0.41
594	0.34
595	0.3
596	0.25
597	0.18
598	0.14
599	0.13
600	0.11
601	0.1
602	0.1
603	0.07
604	0.07
605	0.05
606	0.05
607	0.05
608	0.04
609	0.04
610	0.04
611	0.03
612	0.03
613	0.04
614	0.04
615	0.04
616	0.08
617	0.09
618	0.09
619	0.1
620	0.11
621	0.13
622	0.19
623	0.25
624	0.26
625	0.28
626	0.32
627	0.33
628	0.32
629	0.3
630	0.25
631	0.2
632	0.15
633	0.13
634	0.09
635	0.08
636	0.08
637	0.08
638	0.07
639	0.05
640	0.05
641	0.05
642	0.06
643	0.06
644	0.05
645	0.06
646	0.08
647	0.09
648	0.1
649	0.11
650	0.09
651	0.11
652	0.15
653	0.19
654	0.26
655	0.33
656	0.36
657	0.42
658	0.48
659	0.48
660	0.52
661	0.56
662	0.51
663	0.51
664	0.49
665	0.42
666	0.39
667	0.38
668	0.31
669	0.26
670	0.22
671	0.14
672	0.16
673	0.17
674	0.15
675	0.17
676	0.17
677	0.18
678	0.18
679	0.19
680	0.2
681	0.23
682	0.25
683	0.26
684	0.33
685	0.36
686	0.37
687	0.37
688	0.37
689	0.36
690	0.37
691	0.4
692	0.33
693	0.28
694	0.28
695	0.32
696	0.32
697	0.35
698	0.33
699	0.29
700	0.32
701	0.33
702	0.32
703	0.29
704	0.31
705	0.35
706	0.36
707	0.43
708	0.46
709	0.52
710	0.54
711	0.59
712	0.61
713	0.59
714	0.62
715	0.59
716	0.6
717	0.55
718	0.54
719	0.49
720	0.44
721	0.42
722	0.41
723	0.37
724	0.35
725	0.43
726	0.5
727	0.51
728	0.55
729	0.6
730	0.65
731	0.72
732	0.72
733	0.72
734	0.64
735	0.61
736	0.57
737	0.51
738	0.44
739	0.37
740	0.34
741	0.28
742	0.29
743	0.29
744	0.27
745	0.24
746	0.21
747	0.21
748	0.18
749	0.15
750	0.15
751	0.17
752	0.17
753	0.17
754	0.2
755	0.2
756	0.22
757	0.22
758	0.21
759	0.23
760	0.28
761	0.31
762	0.34
763	0.4
764	0.39
765	0.45
766	0.47
767	0.43
768	0.41
769	0.42
770	0.37
771	0.35
772	0.38
773	0.34
774	0.31
775	0.34
776	0.35
777	0.33
778	0.35
779	0.36
780	0.34
781	0.32
782	0.31
783	0.3
784	0.29
785	0.27
786	0.23
787	0.15
788	0.12
789	0.12
790	0.11
791	0.11
792	0.09
793	0.09
794	0.1
795	0.11
796	0.11
797	0.14
798	0.19
799	0.23
800	0.25
801	0.28
802	0.31
803	0.34
804	0.36
805	0.35
806	0.32
807	0.28
808	0.28
809	0.25
810	0.21
811	0.23
812	0.26
813	0.27
814	0.3
815	0.33
816	0.33
817	0.35
818	0.4
819	0.45
820	0.44
821	0.52
822	0.57
823	0.62
824	0.67
825	0.72
826	0.75
827	0.72
828	0.73
829	0.71
830	0.69
831	0.66
832	0.62
833	0.58
834	0.54
835	0.52
836	0.49
837	0.42
838	0.36
839	0.34
840	0.38
841	0.41
842	0.45
843	0.44
844	0.43
845	0.47
846	0.47
847	0.46
848	0.41
849	0.35
850	0.29
851	0.26
852	0.26
853	0.2
854	0.19
855	0.21
856	0.21
857	0.2
858	0.19
859	0.19
860	0.22
861	0.23
862	0.24
863	0.22
864	0.25
865	0.24
866	0.25
867	0.27
868	0.22
869	0.21
870	0.2
871	0.21
872	0.23
873	0.25
874	0.24
875	0.23
876	0.3
877	0.38
878	0.43
879	0.46
880	0.48
881	0.56
882	0.64
883	0.71
884	0.68
885	0.6
886	0.55
887	0.51
888	0.44
889	0.4
890	0.34
891	0.28
892	0.25
893	0.25
894	0.25
895	0.24
896	0.21
897	0.21
898	0.26
899	0.28
900	0.31
901	0.35
902	0.34
903	0.38
904	0.41
905	0.39

A0A316UHP6

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer