FuNGI

A0A316UVI5

Protein Details

Accession

A0A316UVI5

Localization Confidence

High

Confidence Score

17.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
39-66	QAQPAQPAKKVRSRPKKKQSKSGAAGGA	Hydrophilic
490-511	QQQQKNRAAKWKAKGKDKEKGT	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
45-72	PAKKVRSRPKKKQSKSGAAGGAGGPGGK
351-394	KAKKAQSAAAAAAAAQAKAASKKQKGKGAAGPAGKGAATSGKKG
432-457	PPTGPANRKGKSKELKPSAAAHHAKK
495-529	NRAAKWKAKGKDKEKGTQEEAAGGAGGAAGGKKGS
535-539	KGNRP

Subcellular Location(s)

nucl 14, cyto_nucl 10, mito 9, cyto 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR012677 Nucleotide-bd_a/b_plait_sf IPR035979 RBD_domain_sf IPR039722 Upf3 IPR005120 UPF3_dom
Gene Ontology	GO:0003676 F:nucleic acid binding GO:0000184 P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay
Pfam	View protein in Pfam PF03467 Smg4_UPF3
CDD	cd12455 RRM_like_Smg4_UPF3

Amino Acid Sequences

MPPKQPSAGGATSSKGTQGPRHHSGKHSKAASGPTAAQQAQPAQPAKKVRSRPKKKQSKSGAAGGAGGPGGKEDDAGKQRLKVVVRRLPPNLPEDIFWKSVEPWTGKQLVDKPAPILVKQTAAAEDAPTRVGQETDDGEQHEATKDSSDDAANPANAAAEAKSAAPPIVKPGPYIHLGVPAQEKLVWRRYVQGKFKTPPNAASSSSQSSLPHVHSRAYLRFRSLTDLLDFHRNFDGHVFRDSKGRESVALVEWAPYQKVPPLASVAGGQTQVRRRPDKREGTIHEEPDFLAFVERLEKGGKEEASEERKDTKSDAEVMAFLSAATSAKGKETADSAAGDKKKLTPLLEHLKAKKAQSAAAAAAAAQAKAASKKQKGKGAAGPAGKGAATSGKKGAASSKQTDAQVEAVRAHMKASIGGPASPSAPDTSSPKPPTGPANRKGKSKELKPSAAAHHAKKGTSTPPTSSTAAGGPPSSSASTTSIPTGPKAQQQQQKNRAAKWKAKGKDKEKGTQEEAAGGAGGAAGGKKGSQQQQGKGNRPKPGSDHAGGGAPAAAASAPTPTLLRRPD

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.26
2	0.22
3	0.23
4	0.27
5	0.35
6	0.42
7	0.49
8	0.55
9	0.58
10	0.63
11	0.71
12	0.72
13	0.71
14	0.66
15	0.6
16	0.58
17	0.59
18	0.54
19	0.47
20	0.4
21	0.35
22	0.38
23	0.36
24	0.32
25	0.29
26	0.3
27	0.29
28	0.33
29	0.35
30	0.31
31	0.37
32	0.43
33	0.47
34	0.51
35	0.59
36	0.64
37	0.7
38	0.79
39	0.84
40	0.87
41	0.92
42	0.92
43	0.92
44	0.92
45	0.92
46	0.87
47	0.84
48	0.77
49	0.66
50	0.59
51	0.48
52	0.38
53	0.27
54	0.21
55	0.12
56	0.08
57	0.08
58	0.07
59	0.07
60	0.07
61	0.16
62	0.21
63	0.26
64	0.27
65	0.28
66	0.32
67	0.37
68	0.41
69	0.39
70	0.44
71	0.48
72	0.53
73	0.57
74	0.59
75	0.59
76	0.58
77	0.55
78	0.5
79	0.43
80	0.37
81	0.33
82	0.33
83	0.29
84	0.26
85	0.23
86	0.2
87	0.22
88	0.26
89	0.27
90	0.24
91	0.29
92	0.33
93	0.31
94	0.35
95	0.38
96	0.4
97	0.4
98	0.39
99	0.34
100	0.35
101	0.36
102	0.31
103	0.29
104	0.23
105	0.21
106	0.21
107	0.2
108	0.16
109	0.17
110	0.17
111	0.14
112	0.14
113	0.12
114	0.12
115	0.11
116	0.11
117	0.1
118	0.1
119	0.09
120	0.11
121	0.12
122	0.14
123	0.15
124	0.15
125	0.16
126	0.16
127	0.16
128	0.15
129	0.13
130	0.12
131	0.11
132	0.1
133	0.11
134	0.12
135	0.12
136	0.11
137	0.13
138	0.15
139	0.13
140	0.13
141	0.12
142	0.1
143	0.1
144	0.1
145	0.07
146	0.05
147	0.06
148	0.07
149	0.07
150	0.07
151	0.08
152	0.08
153	0.08
154	0.13
155	0.19
156	0.18
157	0.19
158	0.21
159	0.23
160	0.24
161	0.26
162	0.21
163	0.22
164	0.21
165	0.23
166	0.23
167	0.2
168	0.19
169	0.18
170	0.2
171	0.18
172	0.25
173	0.25
174	0.23
175	0.31
176	0.38
177	0.45
178	0.52
179	0.56
180	0.57
181	0.58
182	0.64
183	0.64
184	0.58
185	0.54
186	0.5
187	0.45
188	0.39
189	0.38
190	0.35
191	0.31
192	0.3
193	0.27
194	0.22
195	0.21
196	0.22
197	0.23
198	0.23
199	0.21
200	0.21
201	0.23
202	0.27
203	0.32
204	0.34
205	0.32
206	0.3
207	0.31
208	0.31
209	0.33
210	0.3
211	0.25
212	0.21
213	0.21
214	0.2
215	0.27
216	0.26
217	0.22
218	0.24
219	0.22
220	0.2
221	0.22
222	0.24
223	0.16
224	0.21
225	0.21
226	0.19
227	0.25
228	0.26
229	0.25
230	0.24
231	0.23
232	0.19
233	0.18
234	0.2
235	0.15
236	0.16
237	0.13
238	0.12
239	0.12
240	0.12
241	0.11
242	0.09
243	0.08
244	0.08
245	0.11
246	0.11
247	0.11
248	0.13
249	0.13
250	0.13
251	0.13
252	0.12
253	0.1
254	0.1
255	0.1
256	0.11
257	0.15
258	0.2
259	0.24
260	0.31
261	0.32
262	0.4
263	0.5
264	0.55
265	0.56
266	0.6
267	0.59
268	0.61
269	0.63
270	0.56
271	0.48
272	0.39
273	0.33
274	0.25
275	0.21
276	0.12
277	0.08
278	0.06
279	0.05
280	0.07
281	0.07
282	0.07
283	0.08
284	0.08
285	0.09
286	0.12
287	0.12
288	0.11
289	0.13
290	0.17
291	0.22
292	0.22
293	0.22
294	0.24
295	0.24
296	0.24
297	0.23
298	0.2
299	0.17
300	0.19
301	0.18
302	0.14
303	0.13
304	0.13
305	0.12
306	0.1
307	0.08
308	0.05
309	0.04
310	0.04
311	0.04
312	0.04
313	0.05
314	0.05
315	0.07
316	0.07
317	0.08
318	0.09
319	0.09
320	0.1
321	0.11
322	0.11
323	0.16
324	0.17
325	0.17
326	0.16
327	0.17
328	0.2
329	0.21
330	0.21
331	0.18
332	0.25
333	0.33
334	0.39
335	0.41
336	0.4
337	0.44
338	0.46
339	0.45
340	0.41
341	0.33
342	0.28
343	0.26
344	0.25
345	0.2
346	0.17
347	0.16
348	0.12
349	0.13
350	0.11
351	0.09
352	0.07
353	0.06
354	0.07
355	0.09
356	0.14
357	0.19
358	0.26
359	0.34
360	0.41
361	0.47
362	0.5
363	0.53
364	0.55
365	0.55
366	0.54
367	0.47
368	0.42
369	0.35
370	0.32
371	0.26
372	0.2
373	0.13
374	0.13
375	0.13
376	0.14
377	0.15
378	0.16
379	0.17
380	0.17
381	0.22
382	0.23
383	0.27
384	0.29
385	0.32
386	0.35
387	0.35
388	0.35
389	0.32
390	0.29
391	0.25
392	0.23
393	0.19
394	0.17
395	0.17
396	0.17
397	0.16
398	0.13
399	0.11
400	0.12
401	0.12
402	0.14
403	0.13
404	0.14
405	0.14
406	0.13
407	0.14
408	0.12
409	0.13
410	0.1
411	0.1
412	0.12
413	0.16
414	0.19
415	0.28
416	0.3
417	0.31
418	0.31
419	0.32
420	0.4
421	0.46
422	0.51
423	0.5
424	0.59
425	0.61
426	0.67
427	0.69
428	0.7
429	0.68
430	0.67
431	0.69
432	0.67
433	0.68
434	0.64
435	0.65
436	0.61
437	0.61
438	0.59
439	0.51
440	0.51
441	0.49
442	0.45
443	0.42
444	0.41
445	0.37
446	0.39
447	0.39
448	0.35
449	0.36
450	0.41
451	0.4
452	0.37
453	0.31
454	0.26
455	0.24
456	0.22
457	0.18
458	0.14
459	0.13
460	0.15
461	0.14
462	0.13
463	0.13
464	0.15
465	0.16
466	0.17
467	0.19
468	0.2
469	0.2
470	0.21
471	0.25
472	0.25
473	0.3
474	0.37
475	0.43
476	0.48
477	0.57
478	0.66
479	0.71
480	0.78
481	0.77
482	0.75
483	0.77
484	0.78
485	0.76
486	0.75
487	0.75
488	0.73
489	0.78
490	0.81
491	0.8
492	0.8
493	0.79
494	0.78
495	0.76
496	0.76
497	0.7
498	0.65
499	0.57
500	0.5
501	0.43
502	0.34
503	0.26
504	0.18
505	0.13
506	0.07
507	0.06
508	0.04
509	0.04
510	0.04
511	0.04
512	0.04
513	0.08
514	0.15
515	0.23
516	0.32
517	0.39
518	0.46
519	0.55
520	0.65
521	0.72
522	0.76
523	0.75
524	0.74
525	0.71
526	0.69
527	0.65
528	0.64
529	0.62
530	0.53
531	0.5
532	0.43
533	0.43
534	0.38
535	0.32
536	0.24
537	0.15
538	0.13
539	0.1
540	0.08
541	0.05
542	0.05
543	0.06
544	0.06
545	0.07
546	0.09
547	0.1

A0A316UVI5

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer