Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q2UK86

Protein Details
Accession Q2UK86    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
338-366LSVTRGKGFTKEKNKKKRGSYRGGPIDISHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
344-357KGFTKEKNKKKRGS
Subcellular Location(s) nucl 17, mito 3, cyto 3, cyto_mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007718  Srp40_C  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
Pfam View protein in Pfam  
PF05022  SRP40_C  
Amino Acid Sequences MSREAHVKATLIASIEAFLTESGFTSTGKAFAKEQASKSVSKSLSDSKNAPSLLEIFQNWADNEKATEKSSESSSSESSSSSSSSEESSSSSDESSDSDVEMNDAPKAQSKKQSKNSSSSSSSSSSSSSSSSGSDSDADDESEEETAAPAPAKPQGTKRKAESDSSSSESESDSDKAPQNKKTKIAAKKESSSSDSSASSDSSSSESSSSASDSSDSSSDSNSDSDSSDSDSSDSSSSSSDSDEEDGKENKTSSSSQSSSGSETVQNSDSGVQKSTNISTPVTGSSSASPAPRNGPAQKKHTGARPTPLALLSEQPTDHLLSNDYVPYAYADRAFKDLSVTRGKGFTKEKNKKKRGSYRGGPIDISGGKSFKFED
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.13
2 0.12
3 0.1
4 0.1
5 0.08
6 0.07
7 0.07
8 0.07
9 0.08
10 0.09
11 0.09
12 0.11
13 0.12
14 0.16
15 0.18
16 0.19
17 0.19
18 0.25
19 0.33
20 0.36
21 0.38
22 0.43
23 0.44
24 0.45
25 0.46
26 0.48
27 0.41
28 0.37
29 0.39
30 0.38
31 0.42
32 0.44
33 0.45
34 0.4
35 0.45
36 0.43
37 0.39
38 0.32
39 0.28
40 0.25
41 0.25
42 0.22
43 0.19
44 0.2
45 0.22
46 0.21
47 0.2
48 0.19
49 0.16
50 0.18
51 0.19
52 0.19
53 0.18
54 0.2
55 0.19
56 0.2
57 0.23
58 0.24
59 0.22
60 0.23
61 0.23
62 0.23
63 0.22
64 0.2
65 0.18
66 0.16
67 0.15
68 0.13
69 0.12
70 0.11
71 0.12
72 0.12
73 0.11
74 0.12
75 0.13
76 0.14
77 0.13
78 0.13
79 0.12
80 0.11
81 0.12
82 0.13
83 0.11
84 0.1
85 0.1
86 0.1
87 0.11
88 0.12
89 0.11
90 0.09
91 0.1
92 0.1
93 0.15
94 0.19
95 0.22
96 0.3
97 0.38
98 0.48
99 0.58
100 0.68
101 0.66
102 0.7
103 0.72
104 0.69
105 0.64
106 0.56
107 0.5
108 0.41
109 0.38
110 0.31
111 0.27
112 0.21
113 0.18
114 0.17
115 0.14
116 0.12
117 0.12
118 0.12
119 0.11
120 0.11
121 0.11
122 0.1
123 0.11
124 0.1
125 0.1
126 0.09
127 0.09
128 0.08
129 0.08
130 0.07
131 0.05
132 0.05
133 0.05
134 0.05
135 0.05
136 0.05
137 0.06
138 0.09
139 0.11
140 0.13
141 0.21
142 0.32
143 0.37
144 0.41
145 0.44
146 0.5
147 0.5
148 0.53
149 0.48
150 0.42
151 0.41
152 0.4
153 0.37
154 0.28
155 0.26
156 0.22
157 0.18
158 0.15
159 0.12
160 0.1
161 0.12
162 0.16
163 0.22
164 0.26
165 0.33
166 0.38
167 0.41
168 0.45
169 0.49
170 0.53
171 0.55
172 0.6
173 0.61
174 0.59
175 0.6
176 0.58
177 0.54
178 0.49
179 0.42
180 0.35
181 0.28
182 0.23
183 0.2
184 0.17
185 0.15
186 0.12
187 0.1
188 0.09
189 0.09
190 0.09
191 0.08
192 0.08
193 0.08
194 0.08
195 0.08
196 0.09
197 0.07
198 0.07
199 0.07
200 0.07
201 0.08
202 0.08
203 0.08
204 0.08
205 0.08
206 0.09
207 0.09
208 0.09
209 0.08
210 0.08
211 0.08
212 0.08
213 0.09
214 0.11
215 0.1
216 0.1
217 0.1
218 0.1
219 0.1
220 0.1
221 0.1
222 0.07
223 0.07
224 0.08
225 0.08
226 0.08
227 0.08
228 0.08
229 0.1
230 0.11
231 0.12
232 0.15
233 0.16
234 0.16
235 0.17
236 0.17
237 0.16
238 0.17
239 0.17
240 0.18
241 0.23
242 0.24
243 0.24
244 0.27
245 0.27
246 0.27
247 0.27
248 0.24
249 0.19
250 0.19
251 0.19
252 0.17
253 0.16
254 0.14
255 0.16
256 0.18
257 0.17
258 0.18
259 0.16
260 0.16
261 0.19
262 0.2
263 0.21
264 0.19
265 0.18
266 0.18
267 0.19
268 0.19
269 0.18
270 0.17
271 0.14
272 0.13
273 0.15
274 0.16
275 0.16
276 0.16
277 0.17
278 0.2
279 0.22
280 0.27
281 0.33
282 0.4
283 0.45
284 0.5
285 0.55
286 0.56
287 0.56
288 0.59
289 0.6
290 0.54
291 0.55
292 0.54
293 0.49
294 0.47
295 0.44
296 0.37
297 0.29
298 0.29
299 0.24
300 0.21
301 0.19
302 0.18
303 0.18
304 0.19
305 0.19
306 0.15
307 0.15
308 0.14
309 0.16
310 0.16
311 0.14
312 0.12
313 0.12
314 0.13
315 0.13
316 0.13
317 0.16
318 0.16
319 0.18
320 0.21
321 0.21
322 0.19
323 0.23
324 0.25
325 0.26
326 0.33
327 0.33
328 0.32
329 0.37
330 0.39
331 0.41
332 0.45
333 0.49
334 0.53
335 0.62
336 0.7
337 0.76
338 0.85
339 0.86
340 0.9
341 0.91
342 0.9
343 0.9
344 0.89
345 0.88
346 0.88
347 0.82
348 0.72
349 0.61
350 0.57
351 0.48
352 0.42
353 0.34
354 0.26
355 0.22