Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A316UUM6

Protein Details
Accession A0A316UUM6    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
235-258AATKAANERKQRERKEKQTLDIEQHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
46-62GAPRGGAAAAGPRGGQR
84-109AREPRKGRGGDGRGRGRGGRGAKGGR
268-306RGGRGGARGGRGGDFGGRGRGEGRGRGARGAPRGARGGN
Subcellular Location(s) cyto 17, cyto_nucl 13, nucl 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039764  HABP4/SERBP1  
IPR006861  HABP4_PAIRBP1-bd  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF04774  HABP4_PAI-RBP1  
Amino Acid Sequences MAFSSKNAFALLGDDDGPAPVAAAPKAAAPAAPAAAPRNVVGSGRGAPRGGAAAAGPRGGQRAPRNADAAAAGGAEDGQQTRDAREPRKGRGGDGRGRGRGGRGAKGGRLDRHSQTDRVDSEKNIHQGWGGDDGKRELKNEEDAVADANAEATPANGAATPATVEGDEAAPAAEAVPAEEVDNTKTLDEYLADMAAKKATLGGKAVTPRTVEGGQWEGFGNKVVKSQSGGDEFYAATKAANERKQRERKEKQTLDIEQTFNTPPVASRGGRGGARGGRGGDFGGRGRGEGRGRGARGAPRGARGGNAGPKVNLEDTRAFPSLS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.12
2 0.12
3 0.12
4 0.12
5 0.1
6 0.08
7 0.08
8 0.09
9 0.09
10 0.1
11 0.1
12 0.1
13 0.11
14 0.11
15 0.1
16 0.09
17 0.1
18 0.11
19 0.11
20 0.12
21 0.13
22 0.14
23 0.15
24 0.14
25 0.15
26 0.15
27 0.14
28 0.14
29 0.15
30 0.18
31 0.2
32 0.22
33 0.2
34 0.19
35 0.19
36 0.19
37 0.16
38 0.11
39 0.09
40 0.11
41 0.12
42 0.12
43 0.12
44 0.11
45 0.13
46 0.13
47 0.2
48 0.22
49 0.31
50 0.35
51 0.38
52 0.4
53 0.38
54 0.38
55 0.31
56 0.26
57 0.17
58 0.11
59 0.08
60 0.06
61 0.06
62 0.05
63 0.05
64 0.05
65 0.05
66 0.08
67 0.09
68 0.11
69 0.17
70 0.23
71 0.27
72 0.36
73 0.4
74 0.43
75 0.52
76 0.51
77 0.48
78 0.52
79 0.56
80 0.54
81 0.58
82 0.59
83 0.51
84 0.52
85 0.48
86 0.4
87 0.39
88 0.34
89 0.29
90 0.28
91 0.28
92 0.29
93 0.34
94 0.37
95 0.35
96 0.37
97 0.37
98 0.35
99 0.41
100 0.42
101 0.39
102 0.37
103 0.38
104 0.35
105 0.35
106 0.34
107 0.26
108 0.28
109 0.3
110 0.3
111 0.25
112 0.23
113 0.2
114 0.18
115 0.19
116 0.22
117 0.18
118 0.16
119 0.17
120 0.19
121 0.22
122 0.22
123 0.22
124 0.15
125 0.16
126 0.19
127 0.18
128 0.17
129 0.14
130 0.13
131 0.13
132 0.12
133 0.1
134 0.06
135 0.06
136 0.05
137 0.04
138 0.04
139 0.03
140 0.03
141 0.03
142 0.03
143 0.03
144 0.03
145 0.03
146 0.03
147 0.04
148 0.04
149 0.04
150 0.04
151 0.03
152 0.04
153 0.04
154 0.04
155 0.04
156 0.04
157 0.03
158 0.03
159 0.03
160 0.03
161 0.03
162 0.03
163 0.04
164 0.04
165 0.04
166 0.05
167 0.05
168 0.06
169 0.07
170 0.07
171 0.07
172 0.07
173 0.06
174 0.06
175 0.06
176 0.07
177 0.06
178 0.06
179 0.06
180 0.07
181 0.07
182 0.07
183 0.06
184 0.05
185 0.07
186 0.08
187 0.09
188 0.1
189 0.1
190 0.13
191 0.17
192 0.18
193 0.17
194 0.16
195 0.16
196 0.18
197 0.18
198 0.15
199 0.14
200 0.17
201 0.15
202 0.16
203 0.15
204 0.12
205 0.12
206 0.14
207 0.13
208 0.1
209 0.13
210 0.13
211 0.13
212 0.15
213 0.17
214 0.19
215 0.2
216 0.21
217 0.18
218 0.18
219 0.17
220 0.16
221 0.15
222 0.11
223 0.08
224 0.08
225 0.13
226 0.19
227 0.26
228 0.33
229 0.39
230 0.5
231 0.6
232 0.68
233 0.75
234 0.78
235 0.81
236 0.85
237 0.84
238 0.81
239 0.8
240 0.75
241 0.72
242 0.67
243 0.58
244 0.47
245 0.44
246 0.38
247 0.29
248 0.25
249 0.17
250 0.13
251 0.16
252 0.2
253 0.17
254 0.18
255 0.2
256 0.24
257 0.24
258 0.25
259 0.26
260 0.25
261 0.26
262 0.27
263 0.24
264 0.21
265 0.21
266 0.21
267 0.17
268 0.16
269 0.15
270 0.18
271 0.17
272 0.17
273 0.17
274 0.22
275 0.23
276 0.25
277 0.31
278 0.33
279 0.34
280 0.37
281 0.41
282 0.41
283 0.43
284 0.47
285 0.43
286 0.4
287 0.43
288 0.4
289 0.37
290 0.35
291 0.37
292 0.36
293 0.38
294 0.36
295 0.32
296 0.34
297 0.36
298 0.36
299 0.31
300 0.29
301 0.29
302 0.3
303 0.36