Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A316UJX6

Protein Details
Accession A0A316UJX6    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
998-1018ACGLRYAKRVKKKAQAHAQVQHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 23, cyto_nucl 14.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000014  PAS  
IPR035965  PAS-like_dom_sf  
IPR013655  PAS_fold_3  
IPR000679  Znf_GATA  
IPR013088  Znf_NHR/GATA  
Gene Ontology GO:0043565  F:sequence-specific DNA binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
Pfam View protein in Pfam  
PF00320  GATA  
PF08447  PAS_3  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00344  GATA_ZN_FINGER_1  
PS50114  GATA_ZN_FINGER_2  
PS50112  PAS  
CDD cd00130  PAS  
cd00202  ZnF_GATA  
Amino Acid Sequences MDGPGGTGTGTGTSSAPGSGWIWDQVQVEGPADMDQAIHLQPPIAGGDDSLSSSVAPDPASSFLPRTMSNADFDALLHNYTAAGAGAPPSSMMTFDQNVDPQANNNKSDPIATAAADASTAAAVAALQANGLINPLRPNSSGASGSVHGFDWSQDPNNHDHNAGFGGDLSMAAPSMRFSNSNNSFASSCLAYDAGRSIGGGYQQGRASWDGASASRTALNQQLAAAARGESLTPGQESSDSGGNTSTASTKRRRMTFSGVDSSHQAGRGRPPGHGAAMYHQQPESSAINDGDDDGMRSLSNAWGRAAPAAPLPPFSTSAGGNNHVVNSRDLEAMAAETLQRASAENSRSIDGAGNLSAMPASIAPGLAHHQQHHQQQRQRQQPRSQAAKGSGPIYAGDSSAGQSSSAPTYVSSQQVGIGNNTNSHAAASANAHAHAQAHPSSSLAPTTTTTTLLRAGQDGSPSASSGAQAAHEFTRRKGWAHRVVDELLDFSFVLSPDQEARIVHATNSVHGITGWKADSLKGESLFSFIHPQDAPALQRQLARSLETGEDMLLYYRFRRNPATIAARAKVRLAKENGAAGGAAGAGAGAGGQRQARSPSAAMSSSADSSTTPSDEYGAGARSGKPHPASVGEVDPDADWVTFEMSGHVYHVPVDVDPSRDEVAGAREEEDEGSTSNSNSNSNDSSLTTKSRSTGSATANANAKLEEASNDGSAIYKPASTSSGPVATTSSSSPPRPKKYPLPLARRSEAQCFFCSCRVYPSKGVTVLDSFLELKLENEKLRRQLEDLNIAEAQGAAAGQDSGEGEAGSKGPFAQAQDRRSSNTPTGSSSASRPGPSVLQGKSKSSGSGGAASKVQSADSVTAVSGSHDRVPTTSEGSATGRDSLSEAGQIVRRKHSTTAAAAAGGGSARRKSHETGSAQSHSLGTPSNSTGGATTAMGTGAMSSSGASPSLPASTSTGGSSAAGAALEEDRVCTDCGRTDSPEWRKGPLGPKTLCNACGLRYAKRVKKKAQAHAQVQGAVHGNLVGGGQVQHGLPLGETMGVGVAGGEEMGMDGLTAGAGGGGGGAPPRMTTPRVPSNGAVLAHSPTPARRASGHAGMIYAGSAGGVGSEFGSPNSMAAQLSQQSPGSSYVNHQQHQHAHAHAHAHAHGQHGLPHQHQQSPYGPFAHPATATTAARYMNSHPYQHQPQPQQQQYAGMDTDLTGAFTSYDPSTGVSFPAGPGGGAGEHQQQQVQGGGLTDGGFGYNLQTQHQPGWGEGR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.09
2 0.09
3 0.09
4 0.1
5 0.1
6 0.11
7 0.12
8 0.14
9 0.15
10 0.19
11 0.2
12 0.19
13 0.22
14 0.21
15 0.2
16 0.18
17 0.17
18 0.14
19 0.13
20 0.12
21 0.08
22 0.08
23 0.09
24 0.09
25 0.1
26 0.1
27 0.1
28 0.1
29 0.11
30 0.12
31 0.11
32 0.11
33 0.09
34 0.11
35 0.11
36 0.12
37 0.11
38 0.1
39 0.08
40 0.09
41 0.11
42 0.1
43 0.1
44 0.1
45 0.11
46 0.13
47 0.16
48 0.17
49 0.18
50 0.19
51 0.22
52 0.22
53 0.24
54 0.27
55 0.26
56 0.27
57 0.26
58 0.24
59 0.21
60 0.21
61 0.2
62 0.16
63 0.15
64 0.13
65 0.11
66 0.11
67 0.11
68 0.11
69 0.07
70 0.06
71 0.05
72 0.07
73 0.07
74 0.07
75 0.07
76 0.08
77 0.08
78 0.09
79 0.1
80 0.13
81 0.15
82 0.17
83 0.2
84 0.2
85 0.22
86 0.23
87 0.22
88 0.23
89 0.31
90 0.34
91 0.33
92 0.33
93 0.34
94 0.32
95 0.33
96 0.29
97 0.24
98 0.21
99 0.19
100 0.19
101 0.16
102 0.15
103 0.14
104 0.12
105 0.08
106 0.06
107 0.05
108 0.04
109 0.03
110 0.03
111 0.04
112 0.06
113 0.05
114 0.05
115 0.05
116 0.06
117 0.06
118 0.08
119 0.07
120 0.08
121 0.11
122 0.13
123 0.16
124 0.17
125 0.2
126 0.21
127 0.24
128 0.24
129 0.21
130 0.23
131 0.22
132 0.22
133 0.2
134 0.18
135 0.15
136 0.14
137 0.14
138 0.13
139 0.15
140 0.19
141 0.21
142 0.23
143 0.28
144 0.33
145 0.33
146 0.31
147 0.28
148 0.24
149 0.23
150 0.21
151 0.15
152 0.11
153 0.1
154 0.09
155 0.09
156 0.07
157 0.05
158 0.05
159 0.05
160 0.05
161 0.05
162 0.07
163 0.09
164 0.1
165 0.12
166 0.23
167 0.28
168 0.32
169 0.32
170 0.33
171 0.32
172 0.31
173 0.31
174 0.21
175 0.16
176 0.13
177 0.13
178 0.1
179 0.11
180 0.12
181 0.1
182 0.09
183 0.09
184 0.09
185 0.09
186 0.11
187 0.14
188 0.13
189 0.17
190 0.17
191 0.18
192 0.19
193 0.19
194 0.19
195 0.16
196 0.16
197 0.13
198 0.13
199 0.14
200 0.13
201 0.12
202 0.13
203 0.13
204 0.14
205 0.17
206 0.18
207 0.17
208 0.16
209 0.19
210 0.18
211 0.18
212 0.17
213 0.12
214 0.11
215 0.11
216 0.11
217 0.08
218 0.08
219 0.09
220 0.09
221 0.09
222 0.09
223 0.09
224 0.1
225 0.12
226 0.15
227 0.14
228 0.14
229 0.14
230 0.13
231 0.13
232 0.13
233 0.15
234 0.14
235 0.2
236 0.26
237 0.34
238 0.41
239 0.47
240 0.51
241 0.53
242 0.58
243 0.6
244 0.61
245 0.61
246 0.54
247 0.5
248 0.47
249 0.44
250 0.37
251 0.32
252 0.26
253 0.2
254 0.26
255 0.33
256 0.32
257 0.3
258 0.32
259 0.31
260 0.32
261 0.31
262 0.25
263 0.21
264 0.27
265 0.29
266 0.26
267 0.24
268 0.22
269 0.21
270 0.24
271 0.22
272 0.15
273 0.16
274 0.14
275 0.15
276 0.15
277 0.15
278 0.12
279 0.1
280 0.1
281 0.08
282 0.08
283 0.07
284 0.07
285 0.08
286 0.11
287 0.13
288 0.13
289 0.14
290 0.15
291 0.15
292 0.17
293 0.16
294 0.13
295 0.13
296 0.15
297 0.14
298 0.15
299 0.16
300 0.16
301 0.17
302 0.18
303 0.17
304 0.15
305 0.19
306 0.2
307 0.21
308 0.21
309 0.2
310 0.2
311 0.2
312 0.21
313 0.18
314 0.17
315 0.17
316 0.15
317 0.15
318 0.13
319 0.11
320 0.1
321 0.09
322 0.07
323 0.05
324 0.05
325 0.05
326 0.05
327 0.05
328 0.06
329 0.08
330 0.13
331 0.16
332 0.19
333 0.2
334 0.21
335 0.21
336 0.21
337 0.19
338 0.15
339 0.14
340 0.1
341 0.09
342 0.08
343 0.08
344 0.07
345 0.06
346 0.05
347 0.04
348 0.05
349 0.04
350 0.05
351 0.05
352 0.06
353 0.09
354 0.13
355 0.15
356 0.15
357 0.2
358 0.26
359 0.35
360 0.44
361 0.49
362 0.51
363 0.58
364 0.66
365 0.72
366 0.75
367 0.75
368 0.74
369 0.75
370 0.78
371 0.78
372 0.71
373 0.65
374 0.59
375 0.55
376 0.48
377 0.39
378 0.31
379 0.23
380 0.2
381 0.18
382 0.15
383 0.11
384 0.09
385 0.09
386 0.09
387 0.09
388 0.09
389 0.07
390 0.06
391 0.08
392 0.08
393 0.08
394 0.08
395 0.08
396 0.11
397 0.14
398 0.15
399 0.14
400 0.13
401 0.16
402 0.18
403 0.19
404 0.17
405 0.18
406 0.17
407 0.17
408 0.18
409 0.16
410 0.13
411 0.12
412 0.11
413 0.07
414 0.08
415 0.08
416 0.1
417 0.1
418 0.11
419 0.11
420 0.1
421 0.11
422 0.11
423 0.12
424 0.1
425 0.11
426 0.11
427 0.11
428 0.12
429 0.12
430 0.12
431 0.09
432 0.09
433 0.09
434 0.12
435 0.13
436 0.13
437 0.13
438 0.14
439 0.15
440 0.15
441 0.15
442 0.12
443 0.13
444 0.12
445 0.13
446 0.12
447 0.12
448 0.11
449 0.1
450 0.1
451 0.09
452 0.08
453 0.08
454 0.07
455 0.07
456 0.07
457 0.08
458 0.09
459 0.14
460 0.15
461 0.15
462 0.23
463 0.23
464 0.25
465 0.3
466 0.37
467 0.42
468 0.45
469 0.47
470 0.42
471 0.42
472 0.4
473 0.34
474 0.25
475 0.16
476 0.12
477 0.09
478 0.06
479 0.07
480 0.06
481 0.06
482 0.06
483 0.07
484 0.07
485 0.08
486 0.09
487 0.07
488 0.1
489 0.12
490 0.12
491 0.12
492 0.15
493 0.14
494 0.14
495 0.16
496 0.14
497 0.11
498 0.11
499 0.12
500 0.08
501 0.1
502 0.1
503 0.08
504 0.09
505 0.09
506 0.11
507 0.13
508 0.14
509 0.13
510 0.14
511 0.13
512 0.14
513 0.14
514 0.13
515 0.14
516 0.12
517 0.14
518 0.13
519 0.14
520 0.14
521 0.15
522 0.16
523 0.15
524 0.16
525 0.15
526 0.17
527 0.18
528 0.2
529 0.19
530 0.19
531 0.17
532 0.17
533 0.16
534 0.14
535 0.13
536 0.09
537 0.08
538 0.07
539 0.07
540 0.06
541 0.06
542 0.07
543 0.12
544 0.13
545 0.15
546 0.19
547 0.2
548 0.22
549 0.29
550 0.32
551 0.33
552 0.34
553 0.34
554 0.32
555 0.31
556 0.3
557 0.27
558 0.22
559 0.24
560 0.24
561 0.24
562 0.24
563 0.25
564 0.23
565 0.2
566 0.18
567 0.11
568 0.08
569 0.05
570 0.04
571 0.02
572 0.02
573 0.02
574 0.02
575 0.02
576 0.02
577 0.02
578 0.03
579 0.04
580 0.04
581 0.05
582 0.07
583 0.08
584 0.1
585 0.1
586 0.11
587 0.12
588 0.12
589 0.12
590 0.12
591 0.12
592 0.11
593 0.1
594 0.09
595 0.07
596 0.09
597 0.09
598 0.08
599 0.07
600 0.06
601 0.07
602 0.07
603 0.08
604 0.07
605 0.07
606 0.07
607 0.08
608 0.08
609 0.11
610 0.12
611 0.14
612 0.14
613 0.14
614 0.14
615 0.15
616 0.16
617 0.15
618 0.15
619 0.12
620 0.11
621 0.11
622 0.1
623 0.09
624 0.07
625 0.06
626 0.04
627 0.04
628 0.05
629 0.04
630 0.04
631 0.05
632 0.05
633 0.05
634 0.06
635 0.06
636 0.06
637 0.06
638 0.07
639 0.06
640 0.06
641 0.08
642 0.08
643 0.09
644 0.09
645 0.11
646 0.11
647 0.11
648 0.11
649 0.09
650 0.11
651 0.11
652 0.1
653 0.09
654 0.09
655 0.09
656 0.09
657 0.09
658 0.07
659 0.06
660 0.07
661 0.07
662 0.07
663 0.08
664 0.09
665 0.1
666 0.1
667 0.12
668 0.12
669 0.12
670 0.13
671 0.12
672 0.14
673 0.15
674 0.17
675 0.16
676 0.15
677 0.16
678 0.16
679 0.16
680 0.17
681 0.21
682 0.21
683 0.26
684 0.26
685 0.27
686 0.29
687 0.28
688 0.24
689 0.19
690 0.17
691 0.11
692 0.1
693 0.08
694 0.08
695 0.08
696 0.08
697 0.08
698 0.08
699 0.08
700 0.08
701 0.08
702 0.06
703 0.06
704 0.06
705 0.06
706 0.09
707 0.08
708 0.1
709 0.11
710 0.13
711 0.12
712 0.13
713 0.13
714 0.11
715 0.12
716 0.11
717 0.13
718 0.14
719 0.17
720 0.25
721 0.33
722 0.39
723 0.42
724 0.47
725 0.53
726 0.59
727 0.67
728 0.69
729 0.7
730 0.72
731 0.73
732 0.69
733 0.65
734 0.58
735 0.55
736 0.5
737 0.43
738 0.36
739 0.33
740 0.33
741 0.31
742 0.31
743 0.24
744 0.27
745 0.28
746 0.3
747 0.32
748 0.33
749 0.33
750 0.33
751 0.33
752 0.27
753 0.24
754 0.21
755 0.16
756 0.14
757 0.11
758 0.08
759 0.09
760 0.07
761 0.07
762 0.09
763 0.12
764 0.13
765 0.16
766 0.19
767 0.25
768 0.27
769 0.28
770 0.27
771 0.3
772 0.32
773 0.36
774 0.34
775 0.3
776 0.27
777 0.26
778 0.24
779 0.18
780 0.14
781 0.06
782 0.05
783 0.03
784 0.03
785 0.03
786 0.02
787 0.03
788 0.03
789 0.03
790 0.04
791 0.04
792 0.04
793 0.05
794 0.05
795 0.05
796 0.05
797 0.05
798 0.05
799 0.07
800 0.08
801 0.17
802 0.22
803 0.26
804 0.32
805 0.33
806 0.37
807 0.38
808 0.41
809 0.36
810 0.34
811 0.32
812 0.29
813 0.3
814 0.28
815 0.26
816 0.23
817 0.26
818 0.23
819 0.22
820 0.2
821 0.19
822 0.18
823 0.21
824 0.25
825 0.21
826 0.27
827 0.28
828 0.3
829 0.31
830 0.3
831 0.27
832 0.22
833 0.23
834 0.16
835 0.21
836 0.2
837 0.19
838 0.19
839 0.19
840 0.2
841 0.17
842 0.15
843 0.09
844 0.1
845 0.09
846 0.09
847 0.09
848 0.07
849 0.07
850 0.07
851 0.08
852 0.08
853 0.09
854 0.12
855 0.12
856 0.12
857 0.12
858 0.15
859 0.15
860 0.17
861 0.16
862 0.13
863 0.15
864 0.16
865 0.17
866 0.15
867 0.16
868 0.12
869 0.12
870 0.12
871 0.11
872 0.1
873 0.09
874 0.09
875 0.09
876 0.14
877 0.18
878 0.2
879 0.25
880 0.27
881 0.28
882 0.3
883 0.33
884 0.32
885 0.3
886 0.32
887 0.26
888 0.24
889 0.22
890 0.2
891 0.15
892 0.11
893 0.09
894 0.07
895 0.08
896 0.09
897 0.12
898 0.15
899 0.17
900 0.23
901 0.3
902 0.33
903 0.36
904 0.42
905 0.42
906 0.4
907 0.38
908 0.33
909 0.25
910 0.21
911 0.18
912 0.12
913 0.11
914 0.12
915 0.12
916 0.12
917 0.12
918 0.11
919 0.11
920 0.11
921 0.08
922 0.08
923 0.07
924 0.07
925 0.07
926 0.06
927 0.05
928 0.04
929 0.04
930 0.04
931 0.04
932 0.04
933 0.05
934 0.05
935 0.05
936 0.06
937 0.06
938 0.07
939 0.08
940 0.08
941 0.1
942 0.11
943 0.12
944 0.12
945 0.12
946 0.11
947 0.11
948 0.1
949 0.08
950 0.06
951 0.05
952 0.05
953 0.05
954 0.05
955 0.06
956 0.05
957 0.06
958 0.06
959 0.08
960 0.09
961 0.08
962 0.09
963 0.12
964 0.17
965 0.19
966 0.22
967 0.26
968 0.35
969 0.42
970 0.49
971 0.47
972 0.46
973 0.45
974 0.47
975 0.52
976 0.5
977 0.52
978 0.45
979 0.48
980 0.51
981 0.51
982 0.47
983 0.41
984 0.34
985 0.27
986 0.33
987 0.32
988 0.31
989 0.36
990 0.45
991 0.49
992 0.59
993 0.66
994 0.65
995 0.73
996 0.78
997 0.8
998 0.81
999 0.83
1000 0.78
1001 0.76
1002 0.7
1003 0.63
1004 0.54
1005 0.46
1006 0.38
1007 0.28
1008 0.22
1009 0.15
1010 0.12
1011 0.09
1012 0.09
1013 0.06
1014 0.04
1015 0.05
1016 0.05
1017 0.06
1018 0.06
1019 0.06
1020 0.07
1021 0.07
1022 0.06
1023 0.06
1024 0.06
1025 0.05
1026 0.05
1027 0.05
1028 0.05
1029 0.04
1030 0.04
1031 0.03
1032 0.03
1033 0.03
1034 0.03
1035 0.02
1036 0.02
1037 0.02
1038 0.03
1039 0.02
1040 0.02
1041 0.02
1042 0.02
1043 0.02
1044 0.02
1045 0.02
1046 0.02
1047 0.02
1048 0.02
1049 0.02
1050 0.02
1051 0.03
1052 0.03
1053 0.04
1054 0.04
1055 0.04
1056 0.07
1057 0.1
1058 0.13
1059 0.17
1060 0.25
1061 0.34
1062 0.38
1063 0.41
1064 0.39
1065 0.41
1066 0.43
1067 0.39
1068 0.32
1069 0.24
1070 0.23
1071 0.2
1072 0.21
1073 0.17
1074 0.14
1075 0.17
1076 0.17
1077 0.18
1078 0.18
1079 0.24
1080 0.29
1081 0.33
1082 0.35
1083 0.31
1084 0.3
1085 0.28
1086 0.26
1087 0.2
1088 0.14
1089 0.07
1090 0.05
1091 0.04
1092 0.03
1093 0.03
1094 0.03
1095 0.03
1096 0.04
1097 0.05
1098 0.06
1099 0.06
1100 0.08
1101 0.08
1102 0.08
1103 0.09
1104 0.09
1105 0.09
1106 0.09
1107 0.13
1108 0.14
1109 0.16
1110 0.18
1111 0.18
1112 0.17
1113 0.19
1114 0.21
1115 0.19
1116 0.17
1117 0.19
1118 0.27
1119 0.33
1120 0.35
1121 0.37
1122 0.4
1123 0.45
1124 0.48
1125 0.49
1126 0.42
1127 0.37
1128 0.38
1129 0.39
1130 0.34
1131 0.31
1132 0.28
1133 0.27
1134 0.26
1135 0.27
1136 0.27
1137 0.24
1138 0.27
1139 0.3
1140 0.34
1141 0.32
1142 0.39
1143 0.39
1144 0.42
1145 0.42
1146 0.42
1147 0.42
1148 0.43
1149 0.43
1150 0.39
1151 0.36
1152 0.33
1153 0.34
1154 0.33
1155 0.27
1156 0.22
1157 0.24
1158 0.26
1159 0.26
1160 0.25
1161 0.25
1162 0.23
1163 0.24
1164 0.25
1165 0.24
1166 0.28
1167 0.32
1168 0.34
1169 0.35
1170 0.43
1171 0.5
1172 0.56
1173 0.61
1174 0.6
1175 0.65
1176 0.72
1177 0.76
1178 0.73
1179 0.65
1180 0.65
1181 0.57
1182 0.53
1183 0.44
1184 0.33
1185 0.26
1186 0.21
1187 0.22
1188 0.14
1189 0.13
1190 0.09
1191 0.08
1192 0.09
1193 0.09
1194 0.12
1195 0.1
1196 0.11
1197 0.1
1198 0.12
1199 0.14
1200 0.14
1201 0.15
1202 0.13
1203 0.13
1204 0.13
1205 0.15
1206 0.14
1207 0.11
1208 0.11
1209 0.11
1210 0.1
1211 0.1
1212 0.12
1213 0.15
1214 0.18
1215 0.2
1216 0.21
1217 0.2
1218 0.21
1219 0.22
1220 0.21
1221 0.15
1222 0.13
1223 0.12
1224 0.12
1225 0.12
1226 0.1
1227 0.08
1228 0.08
1229 0.07
1230 0.06
1231 0.09
1232 0.12
1233 0.12
1234 0.15
1235 0.18
1236 0.2
1237 0.22
1238 0.27
1239 0.25