FuNGI

A0A316UKD6

Protein Details

Accession

A0A316UKD6

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

14.6

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
456-475	ITTRTTLRVKRQRRRGAASQ	Hydrophilic
632-653	EEVDAPKKKRPAKSNRSDSGSS	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
638-644	KKKRPAK

Subcellular Location(s)

nucl 18, cyto_nucl 12.5, cyto 5, mito 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007133 RNA_pol_II-assoc_Paf1
Gene Ontology	GO:0016593 C:Cdc73/Paf1 complex GO:0016570 P:histone modification GO:0006368 P:transcription elongation by RNA polymerase II
Pfam	View protein in Pfam PF03985 Paf1

Amino Acid Sequences

MSSGRKRTDLIERTRYPNPLPLPPYPPKLLSIPTPATRYADPTWANRLAQSVPLPLVVDSEGGMPLDINAFPELWATDERGRPIPIADATLPPLDAADLDAEDAWLLNPDLVNAPIPPLATATPSSSSILASSGDTAAIASRDGTPDVSAKDVAWLRRTEYLGADRKAKAEAALRASKPSSSANKEVTPDAEAQRINETFSAIESQPLGDASLRHPNPAKRNLQPVEVMDLYPDFDTWATEMHVFKFADPPGKHNDEDSAAAAAAAAATSATLPLSILRPRTHPLTRQTHVSLYVPSAEPIDLPLKEFDELLLADPDAFADDEEREFFSDQAGQLDASVRQGAVVRREEMRRRRGWASQLPLEPTDEQEEEEEESEDMRAAKEEYARKRAECTTPYRHQRDYDPERQGLEEDLARLLVLSFDKGATTQLPLLEREAKYLDSPAASTSSSTVYYHPITTRTTLRVKRQRRRGAASQAEEDEGHWTDLALTHRDVTDKELVKRLRKRVEIEHGALKEEELPELSESESEEEEEEEEPEEHEEVGKVNGQKSVAGEDGVVDADADEEEEEDDVAAAARRAARARAAFSDDEDDEETGGETSSSQKPKTSDGADKSAQPADEEAEEEEEEEEEEEEEVDAPKKKRPAKSNRSDSGSSGEEDEDEDDESLDGDDELAALREEAGGEEVDAAEDEGEEGGRSRRSRRAAAVAPAAPTDGEGDAGGDDDDEMDD

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.68
2	0.68
3	0.6
4	0.59
5	0.54
6	0.52
7	0.52
8	0.52
9	0.55
10	0.57
11	0.6
12	0.56
13	0.53
14	0.47
15	0.46
16	0.43
17	0.4
18	0.41
19	0.41
20	0.42
21	0.43
22	0.42
23	0.42
24	0.4
25	0.4
26	0.34
27	0.36
28	0.35
29	0.35
30	0.41
31	0.42
32	0.41
33	0.36
34	0.37
35	0.3
36	0.32
37	0.3
38	0.25
39	0.22
40	0.22
41	0.22
42	0.19
43	0.19
44	0.14
45	0.12
46	0.1
47	0.1
48	0.09
49	0.09
50	0.09
51	0.07
52	0.07
53	0.08
54	0.08
55	0.08
56	0.09
57	0.09
58	0.09
59	0.1
60	0.1
61	0.1
62	0.12
63	0.14
64	0.19
65	0.22
66	0.26
67	0.29
68	0.3
69	0.28
70	0.28
71	0.28
72	0.23
73	0.24
74	0.22
75	0.2
76	0.22
77	0.22
78	0.21
79	0.16
80	0.15
81	0.11
82	0.09
83	0.08
84	0.07
85	0.06
86	0.07
87	0.07
88	0.06
89	0.06
90	0.06
91	0.05
92	0.06
93	0.06
94	0.06
95	0.06
96	0.07
97	0.09
98	0.09
99	0.1
100	0.09
101	0.1
102	0.11
103	0.11
104	0.1
105	0.11
106	0.1
107	0.12
108	0.13
109	0.14
110	0.15
111	0.17
112	0.18
113	0.16
114	0.16
115	0.14
116	0.14
117	0.12
118	0.1
119	0.1
120	0.09
121	0.08
122	0.08
123	0.07
124	0.07
125	0.07
126	0.06
127	0.06
128	0.07
129	0.08
130	0.09
131	0.1
132	0.1
133	0.12
134	0.13
135	0.14
136	0.14
137	0.12
138	0.18
139	0.21
140	0.22
141	0.24
142	0.24
143	0.25
144	0.3
145	0.31
146	0.27
147	0.27
148	0.33
149	0.37
150	0.38
151	0.41
152	0.36
153	0.36
154	0.36
155	0.32
156	0.27
157	0.24
158	0.27
159	0.28
160	0.34
161	0.34
162	0.36
163	0.36
164	0.34
165	0.3
166	0.32
167	0.33
168	0.32
169	0.37
170	0.38
171	0.4
172	0.42
173	0.41
174	0.36
175	0.3
176	0.27
177	0.24
178	0.24
179	0.21
180	0.2
181	0.24
182	0.23
183	0.21
184	0.18
185	0.17
186	0.13
187	0.13
188	0.16
189	0.11
190	0.12
191	0.11
192	0.11
193	0.1
194	0.1
195	0.1
196	0.07
197	0.08
198	0.1
199	0.2
200	0.2
201	0.22
202	0.27
203	0.32
204	0.4
205	0.48
206	0.51
207	0.46
208	0.56
209	0.55
210	0.53
211	0.5
212	0.43
213	0.4
214	0.34
215	0.29
216	0.19
217	0.17
218	0.16
219	0.13
220	0.12
221	0.07
222	0.06
223	0.06
224	0.06
225	0.07
226	0.07
227	0.09
228	0.1
229	0.11
230	0.16
231	0.16
232	0.16
233	0.19
234	0.2
235	0.26
236	0.26
237	0.28
238	0.3
239	0.34
240	0.34
241	0.3
242	0.31
243	0.24
244	0.24
245	0.22
246	0.15
247	0.11
248	0.11
249	0.1
250	0.07
251	0.05
252	0.04
253	0.03
254	0.02
255	0.02
256	0.02
257	0.02
258	0.02
259	0.02
260	0.03
261	0.04
262	0.06
263	0.09
264	0.12
265	0.13
266	0.16
267	0.19
268	0.25
269	0.28
270	0.31
271	0.38
272	0.43
273	0.43
274	0.46
275	0.45
276	0.41
277	0.39
278	0.34
279	0.26
280	0.18
281	0.19
282	0.14
283	0.13
284	0.12
285	0.1
286	0.08
287	0.1
288	0.12
289	0.09
290	0.1
291	0.11
292	0.11
293	0.11
294	0.11
295	0.09
296	0.08
297	0.08
298	0.08
299	0.08
300	0.06
301	0.06
302	0.06
303	0.06
304	0.05
305	0.05
306	0.04
307	0.04
308	0.05
309	0.05
310	0.06
311	0.07
312	0.07
313	0.08
314	0.08
315	0.07
316	0.09
317	0.08
318	0.08
319	0.08
320	0.07
321	0.07
322	0.08
323	0.08
324	0.07
325	0.07
326	0.06
327	0.06
328	0.08
329	0.1
330	0.13
331	0.15
332	0.15
333	0.19
334	0.23
335	0.31
336	0.36
337	0.42
338	0.41
339	0.44
340	0.46
341	0.47
342	0.5
343	0.48
344	0.46
345	0.43
346	0.42
347	0.39
348	0.36
349	0.33
350	0.26
351	0.21
352	0.18
353	0.13
354	0.12
355	0.1
356	0.11
357	0.1
358	0.1
359	0.09
360	0.06
361	0.06
362	0.06
363	0.06
364	0.06
365	0.05
366	0.05
367	0.05
368	0.07
369	0.11
370	0.18
371	0.22
372	0.29
373	0.3
374	0.3
375	0.33
376	0.35
377	0.36
378	0.33
379	0.36
380	0.38
381	0.45
382	0.54
383	0.55
384	0.54
385	0.51
386	0.51
387	0.54
388	0.54
389	0.54
390	0.5
391	0.47
392	0.45
393	0.43
394	0.39
395	0.29
396	0.22
397	0.14
398	0.1
399	0.08
400	0.07
401	0.07
402	0.06
403	0.05
404	0.05
405	0.05
406	0.04
407	0.05
408	0.05
409	0.05
410	0.05
411	0.06
412	0.06
413	0.07
414	0.08
415	0.09
416	0.1
417	0.11
418	0.13
419	0.18
420	0.18
421	0.19
422	0.19
423	0.18
424	0.17
425	0.17
426	0.16
427	0.1
428	0.1
429	0.09
430	0.09
431	0.09
432	0.08
433	0.08
434	0.09
435	0.1
436	0.1
437	0.1
438	0.12
439	0.13
440	0.15
441	0.15
442	0.16
443	0.16
444	0.19
445	0.21
446	0.22
447	0.3
448	0.34
449	0.43
450	0.51
451	0.6
452	0.67
453	0.74
454	0.79
455	0.79
456	0.81
457	0.79
458	0.79
459	0.77
460	0.71
461	0.63
462	0.54
463	0.48
464	0.4
465	0.32
466	0.24
467	0.17
468	0.13
469	0.1
470	0.09
471	0.08
472	0.11
473	0.13
474	0.12
475	0.12
476	0.12
477	0.13
478	0.14
479	0.14
480	0.15
481	0.21
482	0.23
483	0.25
484	0.32
485	0.36
486	0.44
487	0.52
488	0.56
489	0.57
490	0.58
491	0.61
492	0.61
493	0.66
494	0.64
495	0.6
496	0.58
497	0.5
498	0.46
499	0.41
500	0.33
501	0.26
502	0.2
503	0.16
504	0.1
505	0.11
506	0.1
507	0.1
508	0.1
509	0.08
510	0.08
511	0.1
512	0.09
513	0.09
514	0.08
515	0.08
516	0.09
517	0.09
518	0.09
519	0.09
520	0.09
521	0.09
522	0.09
523	0.09
524	0.08
525	0.08
526	0.08
527	0.08
528	0.09
529	0.12
530	0.13
531	0.14
532	0.16
533	0.16
534	0.17
535	0.17
536	0.19
537	0.15
538	0.14
539	0.12
540	0.11
541	0.11
542	0.1
543	0.09
544	0.05
545	0.05
546	0.05
547	0.05
548	0.04
549	0.04
550	0.04
551	0.04
552	0.04
553	0.05
554	0.04
555	0.04
556	0.04
557	0.05
558	0.05
559	0.05
560	0.06
561	0.08
562	0.1
563	0.11
564	0.13
565	0.18
566	0.2
567	0.23
568	0.25
569	0.29
570	0.27
571	0.28
572	0.31
573	0.25
574	0.25
575	0.23
576	0.2
577	0.15
578	0.15
579	0.14
580	0.09
581	0.09
582	0.06
583	0.05
584	0.1
585	0.17
586	0.21
587	0.22
588	0.25
589	0.27
590	0.32
591	0.38
592	0.39
593	0.41
594	0.42
595	0.48
596	0.46
597	0.47
598	0.46
599	0.42
600	0.36
601	0.28
602	0.24
603	0.19
604	0.18
605	0.16
606	0.14
607	0.14
608	0.13
609	0.13
610	0.12
611	0.1
612	0.1
613	0.09
614	0.09
615	0.07
616	0.07
617	0.07
618	0.07
619	0.07
620	0.09
621	0.12
622	0.18
623	0.19
624	0.25
625	0.33
626	0.4
627	0.48
628	0.58
629	0.66
630	0.7
631	0.8
632	0.85
633	0.85
634	0.84
635	0.77
636	0.69
637	0.63
638	0.54
639	0.44
640	0.35
641	0.27
642	0.2
643	0.19
644	0.18
645	0.13
646	0.12
647	0.11
648	0.1
649	0.09
650	0.09
651	0.09
652	0.08
653	0.07
654	0.06
655	0.05
656	0.05
657	0.05
658	0.06
659	0.05
660	0.05
661	0.05
662	0.05
663	0.06
664	0.06
665	0.07
666	0.07
667	0.07
668	0.07
669	0.07
670	0.07
671	0.07
672	0.07
673	0.05
674	0.05
675	0.05
676	0.05
677	0.05
678	0.05
679	0.07
680	0.1
681	0.16
682	0.19
683	0.24
684	0.32
685	0.39
686	0.45
687	0.51
688	0.57
689	0.58
690	0.62
691	0.65
692	0.59
693	0.54
694	0.48
695	0.41
696	0.32
697	0.25
698	0.2
699	0.12
700	0.1
701	0.08
702	0.09
703	0.08
704	0.09
705	0.08
706	0.06
707	0.06

A0A316UKD6

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer