Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A316USM5

Protein Details
Accession A0A316USM5    Localization Confidence Medium Confidence Score 10
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
32-62GGYVPDSTSSKKKKKYKTKKPGKDKTTGDGSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
42-55KKKKKYKTKKPGKD
Subcellular Location(s) mito 12.5, cyto_mito 8.666, nucl 8, cyto_nucl 6.833, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000743  Glyco_hydro_28  
IPR006626  PbH1  
IPR012334  Pectin_lyas_fold  
IPR011050  Pectin_lyase_fold/virulence  
Gene Ontology GO:0004650  F:polygalacturonase activity  
GO:0071555  P:cell wall organization  
GO:0045490  P:pectin catabolic process  
Pfam View protein in Pfam  
PF00295  Glyco_hydro_28  
Amino Acid Sequences MKLVKRGSVAAHIHVAKDFGFGSGAPPGPWGGGYVPDSTSSKKKKKYKTKKPGKDKTTGDGSTTSSQDKSPPSDPSDEGSHSTTTSHPDSNSTTTTKPSSAKPGTDNSTTTSTSTSNTTSEDDTYSESTGNTTGSPSTTSGCTFSSVSSLMSGKKSCRHIVLNSIEVPAGETLDLGALTPGTEVTFAGTTTFGYKEWAGPLISIINSNSISVTGAKGHILSFEGERWWDGWGGLGGKKKPRAVFVAKLDNSSISGLRLKNTPIQGFSLSWSTGLGFYGNVIDNYEGVMGGKGHNNDGFNIGRCTDCRVIGNTVDSTDDCVAINSGQSIKILQNNCIHTHGISMAPAGSASEVDDVLVKSNRIARGKFGLRLKSSSKGKGYVNNVRFINNELIGLWQVGIEVVQNYKNGVGFSQAQAGAGCPFQNIEFSGNTVSVTERAAKFSVACAPGACTRFSWDGSLDGGGKEDMCQNAPRGLPCGDKSSGGGSGGKENS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.33
2 0.32
3 0.23
4 0.22
5 0.18
6 0.12
7 0.11
8 0.1
9 0.11
10 0.16
11 0.16
12 0.14
13 0.15
14 0.15
15 0.14
16 0.14
17 0.14
18 0.1
19 0.13
20 0.15
21 0.16
22 0.17
23 0.19
24 0.21
25 0.24
26 0.33
27 0.39
28 0.46
29 0.55
30 0.64
31 0.72
32 0.81
33 0.88
34 0.9
35 0.91
36 0.94
37 0.95
38 0.96
39 0.96
40 0.93
41 0.91
42 0.84
43 0.8
44 0.78
45 0.68
46 0.59
47 0.5
48 0.47
49 0.41
50 0.38
51 0.33
52 0.25
53 0.24
54 0.27
55 0.29
56 0.3
57 0.3
58 0.34
59 0.35
60 0.39
61 0.39
62 0.38
63 0.39
64 0.36
65 0.34
66 0.31
67 0.27
68 0.23
69 0.23
70 0.21
71 0.21
72 0.22
73 0.22
74 0.2
75 0.23
76 0.26
77 0.29
78 0.31
79 0.29
80 0.27
81 0.28
82 0.3
83 0.31
84 0.3
85 0.29
86 0.36
87 0.37
88 0.39
89 0.39
90 0.43
91 0.44
92 0.44
93 0.42
94 0.36
95 0.36
96 0.33
97 0.3
98 0.25
99 0.21
100 0.19
101 0.2
102 0.18
103 0.15
104 0.16
105 0.17
106 0.17
107 0.17
108 0.17
109 0.16
110 0.17
111 0.17
112 0.16
113 0.14
114 0.13
115 0.12
116 0.12
117 0.11
118 0.09
119 0.08
120 0.08
121 0.08
122 0.1
123 0.1
124 0.11
125 0.12
126 0.12
127 0.13
128 0.13
129 0.15
130 0.14
131 0.13
132 0.13
133 0.12
134 0.12
135 0.12
136 0.13
137 0.13
138 0.15
139 0.17
140 0.18
141 0.24
142 0.28
143 0.29
144 0.32
145 0.34
146 0.33
147 0.4
148 0.42
149 0.39
150 0.36
151 0.34
152 0.29
153 0.24
154 0.23
155 0.14
156 0.1
157 0.06
158 0.05
159 0.04
160 0.05
161 0.04
162 0.03
163 0.03
164 0.03
165 0.03
166 0.03
167 0.03
168 0.03
169 0.03
170 0.03
171 0.05
172 0.05
173 0.05
174 0.06
175 0.06
176 0.06
177 0.07
178 0.08
179 0.07
180 0.08
181 0.09
182 0.09
183 0.1
184 0.12
185 0.1
186 0.09
187 0.1
188 0.09
189 0.09
190 0.09
191 0.08
192 0.09
193 0.09
194 0.09
195 0.08
196 0.07
197 0.07
198 0.07
199 0.08
200 0.06
201 0.07
202 0.07
203 0.07
204 0.07
205 0.07
206 0.07
207 0.07
208 0.07
209 0.08
210 0.08
211 0.08
212 0.08
213 0.08
214 0.08
215 0.07
216 0.06
217 0.06
218 0.07
219 0.08
220 0.1
221 0.14
222 0.15
223 0.19
224 0.23
225 0.26
226 0.26
227 0.27
228 0.31
229 0.32
230 0.36
231 0.37
232 0.44
233 0.41
234 0.4
235 0.37
236 0.31
237 0.27
238 0.21
239 0.16
240 0.08
241 0.11
242 0.11
243 0.12
244 0.13
245 0.14
246 0.18
247 0.2
248 0.2
249 0.17
250 0.19
251 0.19
252 0.18
253 0.18
254 0.15
255 0.12
256 0.11
257 0.1
258 0.09
259 0.08
260 0.08
261 0.06
262 0.04
263 0.04
264 0.06
265 0.06
266 0.06
267 0.06
268 0.06
269 0.06
270 0.06
271 0.06
272 0.04
273 0.04
274 0.05
275 0.04
276 0.05
277 0.08
278 0.08
279 0.09
280 0.11
281 0.12
282 0.12
283 0.15
284 0.15
285 0.14
286 0.15
287 0.15
288 0.13
289 0.13
290 0.18
291 0.17
292 0.17
293 0.17
294 0.18
295 0.2
296 0.2
297 0.22
298 0.17
299 0.16
300 0.16
301 0.14
302 0.14
303 0.12
304 0.11
305 0.09
306 0.09
307 0.09
308 0.08
309 0.08
310 0.06
311 0.07
312 0.07
313 0.07
314 0.08
315 0.09
316 0.15
317 0.16
318 0.2
319 0.25
320 0.27
321 0.29
322 0.3
323 0.29
324 0.23
325 0.23
326 0.2
327 0.15
328 0.12
329 0.1
330 0.08
331 0.07
332 0.07
333 0.06
334 0.05
335 0.04
336 0.05
337 0.05
338 0.05
339 0.05
340 0.07
341 0.07
342 0.1
343 0.11
344 0.1
345 0.11
346 0.16
347 0.22
348 0.25
349 0.25
350 0.26
351 0.33
352 0.37
353 0.42
354 0.44
355 0.45
356 0.44
357 0.48
358 0.48
359 0.48
360 0.5
361 0.51
362 0.48
363 0.46
364 0.46
365 0.49
366 0.54
367 0.55
368 0.53
369 0.53
370 0.5
371 0.46
372 0.44
373 0.4
374 0.36
375 0.26
376 0.23
377 0.16
378 0.17
379 0.16
380 0.15
381 0.11
382 0.07
383 0.06
384 0.06
385 0.05
386 0.05
387 0.05
388 0.07
389 0.09
390 0.09
391 0.1
392 0.11
393 0.13
394 0.12
395 0.11
396 0.13
397 0.14
398 0.15
399 0.2
400 0.19
401 0.18
402 0.18
403 0.18
404 0.16
405 0.14
406 0.13
407 0.08
408 0.09
409 0.09
410 0.1
411 0.11
412 0.12
413 0.12
414 0.13
415 0.15
416 0.14
417 0.14
418 0.13
419 0.13
420 0.11
421 0.12
422 0.17
423 0.17
424 0.2
425 0.2
426 0.21
427 0.2
428 0.21
429 0.27
430 0.22
431 0.21
432 0.19
433 0.22
434 0.27
435 0.28
436 0.27
437 0.2
438 0.24
439 0.26
440 0.27
441 0.26
442 0.21
443 0.21
444 0.22
445 0.23
446 0.19
447 0.16
448 0.17
449 0.14
450 0.13
451 0.13
452 0.15
453 0.15
454 0.16
455 0.19
456 0.21
457 0.25
458 0.28
459 0.28
460 0.28
461 0.3
462 0.33
463 0.33
464 0.36
465 0.33
466 0.31
467 0.31
468 0.31
469 0.3
470 0.26
471 0.26
472 0.21