FuNGI

A0A316V3Q9

Protein Details

Accession

A0A316V3Q9

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

13.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
892-911	EEGRRIRKRHEWEKWLPPPP	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
479-484	SKGKKA

Subcellular Location(s)

nucl 20.5, cyto_nucl 13, cyto 4.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR006630 La_HTH IPR002344 Lupus_La IPR036388 WH-like_DNA-bd_sf IPR036390 WH_DNA-bd_sf
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:1990904 C:ribonucleoprotein complex GO:0003723 F:RNA binding GO:0006396 P:RNA processing
Pfam	View protein in Pfam PF05383 La
PROSITE	View protein in PROSITE PS50961 HTH_LA
CDD	cd07323 LAM

Amino Acid Sequences

MWSNVGGGKPQMSYADLLRKAKEAKMGDVEASSPASGTSAATSSRPNAGPSFLVSPSPVRPGVNSTPPAKTVPTFPAAMPRPTFSSPIKAPLAIASATPPRPSQVNGAAKGLHDPTPAEQKPPLIADDKAVKPTALPSLSNNIWELRRQQRAAASAQAQTAPPAGRPASSPYTSSEAPARANAAVPAASSTKTEEISDAAKDAPYAASDETAGGSIGKAVAVASNATKMETRAQTPSQTPGSTKPRSSSDAADVVERLRSPLTPSPTKATEPLSSLQAVKIKPRDYDDAWLSRVALINEGHHKIAKEAVTAARADSDGERKPAWGKAVRGGALASPVPLPEDAPSAVDAKSPPPTTAAKGLEIKTDKGAKSDAASDKTLPPPLVFSAQEKSNWPSLDEAEKSSTASTTQSTPAQQHATVSTGSSTPGSAVSTGSGLEAIKGLQIRSGSGQRKAGKQWVEIVPEITHASPLPARKGVSASKGKKASRSSGSAERLSKDETKSEQASGSVDKTSSGSGWDEEPSTKTTVIEPSSDSWDEPHHGIALAGRKPSPESPNRQSKSSSKRRDEAAQVSSPVTIHTRPRLPSVPTHFNSDGSFSPSRLRREEDADGWRSAQQEETPTRGKKAGNRGRSGLHRSSPTKSSVALPATIDHAGLGASTSSPVRSQPSHAARYDNGIVQRSATDAPQSSWDQCTTFYEPGPPTMSLNHGLIPGPHPFSSPDDIPRWDPMFYDGARFWPAVPMHMHGHLMHHEHHHQGEGDQTSFPSAPPAPGQPQYWQPDAQGEQRPPLTAPAQGQPATPAPAPSAHLAGPMMDVPAAAMQLVTQVEYYLSERNLSGDVFLRSQMEPAAGWLPLSLIASFRRLRSMCDDLGVSLEHPEVKGRLLHSYHVELDEEGRRIRKRHEWEKWLPPPPGPPPSGLINSVPTHHSSMPPMPVSYSYEGPGGPFPFAVYTPRPEEMASGPIPPHPPSIPFYPSQPHYHSPHPANIYSAAQPNMTPTTPSSSALSYPNMISAPPPGMHASGRPTPHRLGSWQDPIPLHYDFHDGLYSPVAPDAGNLAMTGGNQHPQQQQQQQPTASRAYYQAQPYHQQQMPHTVDGSTPATRRYPDSNTSNDARQLAPAVVLGRGSSDSTPSGGALPPHPHSHRAPPGASLERQVSQQTDATNATTATSAISSSSSGEMAGLGLGLGGGAVDDTRRPSVTTSATTATSQSEGSATSMSPDAQAKMQAKTSPSDTPLKGKSKTSATKAGVAAGQKATQVSPEMSHQQSNGEGSALAAKHPSVASHSAHSSHTGEESEDDCLGIVAAEGLGGLVEANAK

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.21
2	0.29
3	0.33
4	0.36
5	0.36
6	0.4
7	0.42
8	0.43
9	0.46
10	0.4
11	0.39
12	0.43
13	0.43
14	0.39
15	0.37
16	0.34
17	0.28
18	0.26
19	0.2
20	0.13
21	0.11
22	0.1
23	0.09
24	0.09
25	0.09
26	0.09
27	0.11
28	0.13
29	0.15
30	0.17
31	0.23
32	0.24
33	0.25
34	0.25
35	0.27
36	0.26
37	0.27
38	0.29
39	0.24
40	0.24
41	0.22
42	0.24
43	0.24
44	0.28
45	0.26
46	0.23
47	0.24
48	0.3
49	0.36
50	0.41
51	0.43
52	0.42
53	0.43
54	0.45
55	0.45
56	0.41
57	0.35
58	0.32
59	0.32
60	0.32
61	0.3
62	0.28
63	0.36
64	0.37
65	0.41
66	0.38
67	0.36
68	0.38
69	0.38
70	0.43
71	0.35
72	0.4
73	0.36
74	0.41
75	0.41
76	0.35
77	0.34
78	0.31
79	0.31
80	0.23
81	0.21
82	0.18
83	0.22
84	0.24
85	0.26
86	0.24
87	0.23
88	0.25
89	0.27
90	0.3
91	0.33
92	0.4
93	0.4
94	0.42
95	0.41
96	0.39
97	0.41
98	0.37
99	0.29
100	0.22
101	0.21
102	0.22
103	0.31
104	0.32
105	0.32
106	0.31
107	0.31
108	0.33
109	0.33
110	0.32
111	0.25
112	0.24
113	0.26
114	0.32
115	0.33
116	0.33
117	0.32
118	0.29
119	0.26
120	0.28
121	0.31
122	0.25
123	0.23
124	0.23
125	0.3
126	0.31
127	0.32
128	0.3
129	0.27
130	0.26
131	0.29
132	0.33
133	0.35
134	0.42
135	0.42
136	0.44
137	0.46
138	0.48
139	0.48
140	0.47
141	0.41
142	0.35
143	0.35
144	0.33
145	0.28
146	0.25
147	0.25
148	0.19
149	0.16
150	0.18
151	0.17
152	0.16
153	0.18
154	0.24
155	0.27
156	0.28
157	0.28
158	0.27
159	0.32
160	0.32
161	0.32
162	0.3
163	0.26
164	0.26
165	0.26
166	0.25
167	0.2
168	0.21
169	0.19
170	0.16
171	0.13
172	0.12
173	0.13
174	0.12
175	0.12
176	0.12
177	0.15
178	0.15
179	0.16
180	0.16
181	0.15
182	0.15
183	0.17
184	0.17
185	0.15
186	0.13
187	0.12
188	0.12
189	0.12
190	0.1
191	0.09
192	0.1
193	0.09
194	0.09
195	0.09
196	0.1
197	0.09
198	0.09
199	0.09
200	0.07
201	0.06
202	0.06
203	0.06
204	0.05
205	0.05
206	0.04
207	0.05
208	0.06
209	0.07
210	0.07
211	0.1
212	0.1
213	0.11
214	0.12
215	0.12
216	0.19
217	0.21
218	0.24
219	0.27
220	0.29
221	0.33
222	0.34
223	0.39
224	0.36
225	0.34
226	0.33
227	0.36
228	0.43
229	0.44
230	0.44
231	0.42
232	0.43
233	0.46
234	0.47
235	0.42
236	0.38
237	0.38
238	0.36
239	0.33
240	0.29
241	0.25
242	0.24
243	0.2
244	0.16
245	0.12
246	0.12
247	0.16
248	0.22
249	0.29
250	0.32
251	0.35
252	0.39
253	0.41
254	0.43
255	0.4
256	0.38
257	0.34
258	0.32
259	0.31
260	0.27
261	0.26
262	0.24
263	0.24
264	0.25
265	0.23
266	0.27
267	0.31
268	0.32
269	0.33
270	0.37
271	0.4
272	0.38
273	0.44
274	0.42
275	0.4
276	0.39
277	0.36
278	0.32
279	0.27
280	0.28
281	0.21
282	0.18
283	0.15
284	0.17
285	0.22
286	0.24
287	0.23
288	0.22
289	0.22
290	0.2
291	0.24
292	0.21
293	0.16
294	0.17
295	0.18
296	0.19
297	0.19
298	0.18
299	0.14
300	0.13
301	0.14
302	0.13
303	0.16
304	0.17
305	0.19
306	0.2
307	0.2
308	0.22
309	0.24
310	0.28
311	0.28
312	0.27
313	0.31
314	0.36
315	0.35
316	0.33
317	0.31
318	0.25
319	0.22
320	0.2
321	0.14
322	0.09
323	0.09
324	0.09
325	0.09
326	0.09
327	0.07
328	0.1
329	0.09
330	0.1
331	0.11
332	0.11
333	0.11
334	0.12
335	0.12
336	0.12
337	0.18
338	0.18
339	0.18
340	0.19
341	0.21
342	0.23
343	0.29
344	0.29
345	0.27
346	0.31
347	0.31
348	0.35
349	0.35
350	0.33
351	0.3
352	0.34
353	0.3
354	0.27
355	0.28
356	0.22
357	0.21
358	0.27
359	0.27
360	0.25
361	0.26
362	0.27
363	0.29
364	0.31
365	0.32
366	0.25
367	0.21
368	0.19
369	0.19
370	0.21
371	0.18
372	0.18
373	0.19
374	0.21
375	0.22
376	0.23
377	0.24
378	0.26
379	0.25
380	0.23
381	0.21
382	0.21
383	0.25
384	0.24
385	0.23
386	0.21
387	0.2
388	0.2
389	0.19
390	0.17
391	0.12
392	0.12
393	0.11
394	0.11
395	0.13
396	0.15
397	0.16
398	0.18
399	0.21
400	0.22
401	0.21
402	0.2
403	0.18
404	0.18
405	0.16
406	0.15
407	0.12
408	0.1
409	0.1
410	0.09
411	0.08
412	0.07
413	0.07
414	0.07
415	0.07
416	0.07
417	0.06
418	0.06
419	0.06
420	0.06
421	0.06
422	0.05
423	0.05
424	0.05
425	0.05
426	0.06
427	0.07
428	0.07
429	0.08
430	0.08
431	0.09
432	0.12
433	0.2
434	0.22
435	0.25
436	0.32
437	0.33
438	0.37
439	0.4
440	0.43
441	0.38
442	0.36
443	0.39
444	0.37
445	0.36
446	0.33
447	0.31
448	0.25
449	0.23
450	0.23
451	0.16
452	0.12
453	0.09
454	0.1
455	0.11
456	0.12
457	0.14
458	0.15
459	0.16
460	0.16
461	0.2
462	0.21
463	0.27
464	0.35
465	0.35
466	0.41
467	0.47
468	0.48
469	0.51
470	0.52
471	0.51
472	0.46
473	0.47
474	0.44
475	0.45
476	0.48
477	0.46
478	0.44
479	0.39
480	0.36
481	0.35
482	0.34
483	0.27
484	0.26
485	0.24
486	0.27
487	0.27
488	0.27
489	0.23
490	0.2
491	0.2
492	0.18
493	0.17
494	0.12
495	0.11
496	0.1
497	0.1
498	0.1
499	0.09
500	0.09
501	0.08
502	0.08
503	0.09
504	0.1
505	0.1
506	0.1
507	0.12
508	0.13
509	0.13
510	0.13
511	0.12
512	0.13
513	0.16
514	0.16
515	0.16
516	0.15
517	0.15
518	0.19
519	0.19
520	0.18
521	0.14
522	0.15
523	0.16
524	0.15
525	0.13
526	0.09
527	0.09
528	0.09
529	0.11
530	0.15
531	0.15
532	0.16
533	0.15
534	0.15
535	0.17
536	0.22
537	0.26
538	0.27
539	0.33
540	0.4
541	0.5
542	0.52
543	0.52
544	0.52
545	0.53
546	0.58
547	0.6
548	0.62
549	0.57
550	0.59
551	0.6
552	0.62
553	0.59
554	0.54
555	0.48
556	0.4
557	0.35
558	0.32
559	0.29
560	0.24
561	0.19
562	0.15
563	0.12
564	0.13
565	0.16
566	0.2
567	0.21
568	0.26
569	0.29
570	0.29
571	0.33
572	0.38
573	0.42
574	0.39
575	0.45
576	0.41
577	0.38
578	0.37
579	0.33
580	0.26
581	0.22
582	0.22
583	0.15
584	0.21
585	0.24
586	0.27
587	0.27
588	0.3
589	0.26
590	0.31
591	0.33
592	0.32
593	0.33
594	0.33
595	0.31
596	0.28
597	0.28
598	0.23
599	0.2
600	0.17
601	0.12
602	0.15
603	0.16
604	0.19
605	0.23
606	0.23
607	0.24
608	0.27
609	0.28
610	0.28
611	0.37
612	0.42
613	0.43
614	0.45
615	0.46
616	0.46
617	0.49
618	0.5
619	0.42
620	0.37
621	0.35
622	0.35
623	0.36
624	0.35
625	0.33
626	0.27
627	0.25
628	0.23
629	0.22
630	0.21
631	0.19
632	0.16
633	0.14
634	0.15
635	0.14
636	0.12
637	0.08
638	0.07
639	0.05
640	0.05
641	0.04
642	0.03
643	0.03
644	0.03
645	0.03
646	0.04
647	0.04
648	0.06
649	0.08
650	0.09
651	0.12
652	0.2
653	0.26
654	0.29
655	0.3
656	0.31
657	0.29
658	0.32
659	0.3
660	0.24
661	0.2
662	0.17
663	0.16
664	0.14
665	0.14
666	0.12
667	0.11
668	0.09
669	0.09
670	0.08
671	0.09
672	0.12
673	0.13
674	0.13
675	0.14
676	0.14
677	0.13
678	0.13
679	0.17
680	0.17
681	0.17
682	0.16
683	0.19
684	0.19
685	0.2
686	0.21
687	0.18
688	0.15
689	0.15
690	0.16
691	0.14
692	0.14
693	0.13
694	0.11
695	0.11
696	0.11
697	0.12
698	0.12
699	0.12
700	0.12
701	0.11
702	0.12
703	0.15
704	0.18
705	0.17
706	0.19
707	0.19
708	0.21
709	0.22
710	0.24
711	0.22
712	0.19
713	0.18
714	0.17
715	0.18
716	0.16
717	0.17
718	0.14
719	0.14
720	0.15
721	0.15
722	0.13
723	0.14
724	0.14
725	0.14
726	0.15
727	0.16
728	0.16
729	0.17
730	0.18
731	0.13
732	0.15
733	0.15
734	0.16
735	0.14
736	0.16
737	0.17
738	0.17
739	0.17
740	0.17
741	0.15
742	0.13
743	0.16
744	0.15
745	0.14
746	0.12
747	0.12
748	0.12
749	0.12
750	0.12
751	0.1
752	0.09
753	0.09
754	0.1
755	0.13
756	0.15
757	0.17
758	0.19
759	0.18
760	0.25
761	0.28
762	0.29
763	0.27
764	0.24
765	0.25
766	0.26
767	0.3
768	0.29
769	0.25
770	0.26
771	0.26
772	0.26
773	0.23
774	0.23
775	0.18
776	0.15
777	0.16
778	0.16
779	0.19
780	0.19
781	0.19
782	0.18
783	0.18
784	0.19
785	0.17
786	0.14
787	0.11
788	0.12
789	0.14
790	0.12
791	0.13
792	0.1
793	0.11
794	0.1
795	0.09
796	0.09
797	0.07
798	0.07
799	0.05
800	0.05
801	0.04
802	0.04
803	0.04
804	0.03
805	0.03
806	0.03
807	0.05
808	0.05
809	0.05
810	0.05
811	0.05
812	0.05
813	0.06
814	0.08
815	0.08
816	0.09
817	0.09
818	0.09
819	0.1
820	0.11
821	0.1
822	0.1
823	0.1
824	0.11
825	0.11
826	0.12
827	0.13
828	0.12
829	0.13
830	0.12
831	0.1
832	0.08
833	0.09
834	0.1
835	0.07
836	0.07
837	0.07
838	0.07
839	0.07
840	0.08
841	0.06
842	0.06
843	0.07
844	0.12
845	0.14
846	0.14
847	0.2
848	0.2
849	0.22
850	0.27
851	0.31
852	0.27
853	0.27
854	0.26
855	0.2
856	0.21
857	0.18
858	0.12
859	0.08
860	0.08
861	0.07
862	0.07
863	0.08
864	0.08
865	0.09
866	0.1
867	0.11
868	0.16
869	0.16
870	0.19
871	0.2
872	0.23
873	0.22
874	0.21
875	0.21
876	0.15
877	0.17
878	0.19
879	0.17
880	0.16
881	0.2
882	0.23
883	0.24
884	0.3
885	0.35
886	0.42
887	0.51
888	0.59
889	0.63
890	0.68
891	0.77
892	0.81
893	0.79
894	0.71
895	0.62
896	0.58
897	0.54
898	0.52
899	0.43
900	0.35
901	0.31
902	0.33
903	0.33
904	0.29
905	0.25
906	0.23
907	0.22
908	0.22
909	0.21
910	0.19
911	0.2
912	0.19
913	0.19
914	0.19
915	0.21
916	0.24
917	0.24
918	0.22
919	0.2
920	0.2
921	0.23
922	0.22
923	0.2
924	0.17
925	0.16
926	0.16
927	0.16
928	0.18
929	0.14
930	0.12
931	0.11
932	0.1
933	0.1
934	0.11
935	0.14
936	0.13
937	0.16
938	0.19
939	0.2
940	0.21
941	0.2
942	0.21
943	0.19
944	0.21
945	0.18
946	0.17
947	0.16
948	0.18
949	0.21
950	0.2
951	0.21
952	0.17
953	0.19
954	0.21
955	0.25
956	0.26
957	0.24
958	0.26
959	0.29
960	0.32
961	0.35
962	0.36
963	0.37
964	0.38
965	0.43
966	0.48
967	0.45
968	0.48
969	0.47
970	0.42
971	0.39
972	0.36
973	0.33
974	0.28
975	0.29
976	0.23
977	0.19
978	0.19
979	0.2
980	0.2
981	0.18
982	0.16
983	0.14
984	0.19
985	0.2
986	0.22
987	0.21
988	0.19
989	0.21
990	0.22
991	0.22
992	0.17
993	0.16
994	0.16
995	0.15
996	0.14
997	0.12
998	0.12
999	0.13
1000	0.11
1001	0.13
1002	0.13
1003	0.14
1004	0.15
1005	0.17
1006	0.2
1007	0.23
1008	0.27
1009	0.28
1010	0.31
1011	0.32
1012	0.35
1013	0.35
1014	0.32
1015	0.34
1016	0.37
1017	0.41
1018	0.39
1019	0.41
1020	0.38
1021	0.37
1022	0.38
1023	0.32
1024	0.26
1025	0.19
1026	0.21
1027	0.17
1028	0.18
1029	0.18
1030	0.14
1031	0.14
1032	0.15
1033	0.14
1034	0.1
1035	0.1
1036	0.09
1037	0.08
1038	0.08
1039	0.09
1040	0.08
1041	0.07
1042	0.07
1043	0.07
1044	0.07
1045	0.07
1046	0.1
1047	0.09
1048	0.12
1049	0.12
1050	0.17
1051	0.21
1052	0.25
1053	0.33
1054	0.4
1055	0.46
1056	0.51
1057	0.56
1058	0.55
1059	0.55
1060	0.53
1061	0.5
1062	0.41
1063	0.35
1064	0.31
1065	0.28
1066	0.3
1067	0.32
1068	0.33
1069	0.33
1070	0.39
1071	0.41
1072	0.47
1073	0.45
1074	0.43
1075	0.4
1076	0.45
1077	0.45
1078	0.41
1079	0.37
1080	0.29
1081	0.27
1082	0.28
1083	0.3
1084	0.23
1085	0.2
1086	0.21
1087	0.23
1088	0.24
1089	0.28
1090	0.3
1091	0.32
1092	0.37
1093	0.41
1094	0.43
1095	0.46
1096	0.48
1097	0.47
1098	0.45
1099	0.41
1100	0.33
1101	0.29
1102	0.26
1103	0.2
1104	0.17
1105	0.15
1106	0.13
1107	0.11
1108	0.11
1109	0.1
1110	0.09
1111	0.1
1112	0.11
1113	0.1
1114	0.11
1115	0.11
1116	0.12
1117	0.13
1118	0.12
1119	0.13
1120	0.13
1121	0.14
1122	0.16
1123	0.21
1124	0.23
1125	0.3
1126	0.32
1127	0.35
1128	0.37
1129	0.46
1130	0.5
1131	0.51
1132	0.48
1133	0.44
1134	0.5
1135	0.5
1136	0.47
1137	0.41
1138	0.36
1139	0.32
1140	0.33
1141	0.32
1142	0.26
1143	0.23
1144	0.24
1145	0.21
1146	0.21
1147	0.21
1148	0.2
1149	0.19
1150	0.17
1151	0.16
1152	0.13
1153	0.13
1154	0.1
1155	0.09
1156	0.08
1157	0.07
1158	0.08
1159	0.08
1160	0.09
1161	0.1
1162	0.09
1163	0.09
1164	0.09
1165	0.08
1166	0.07
1167	0.07
1168	0.05
1169	0.04
1170	0.03
1171	0.03
1172	0.03
1173	0.02
1174	0.02
1175	0.02
1176	0.02
1177	0.02
1178	0.03
1179	0.05
1180	0.08
1181	0.11
1182	0.12
1183	0.13
1184	0.15
1185	0.21
1186	0.25
1187	0.27
1188	0.28
1189	0.28
1190	0.29
1191	0.29
1192	0.28
1193	0.24
1194	0.21
1195	0.18
1196	0.14
1197	0.12
1198	0.11
1199	0.12
1200	0.12
1201	0.1
1202	0.11
1203	0.12
1204	0.12
1205	0.13
1206	0.15
1207	0.15
1208	0.16
1209	0.23
1210	0.24
1211	0.26
1212	0.3
1213	0.31
1214	0.31
1215	0.33
1216	0.35
1217	0.34
1218	0.35
1219	0.4
1220	0.38
1221	0.43
1222	0.49
1223	0.53
1224	0.52
1225	0.51
1226	0.53
1227	0.55
1228	0.61
1229	0.6
1230	0.61
1231	0.57
1232	0.6
1233	0.57
1234	0.53
1235	0.46
1236	0.4
1237	0.37
1238	0.29
1239	0.27
1240	0.21
1241	0.22
1242	0.19
1243	0.18
1244	0.19
1245	0.17
1246	0.17
1247	0.21
1248	0.27
1249	0.28
1250	0.31
1251	0.29
1252	0.29
1253	0.3
1254	0.3
1255	0.25
1256	0.19
1257	0.16
1258	0.14
1259	0.19
1260	0.17
1261	0.15
1262	0.14
1263	0.14
1264	0.16
1265	0.16
1266	0.16
1267	0.16
1268	0.21
1269	0.22
1270	0.26
1271	0.29
1272	0.28
1273	0.29
1274	0.33
1275	0.29
1276	0.26
1277	0.26
1278	0.22
1279	0.2
1280	0.2
1281	0.2
1282	0.19
1283	0.17
1284	0.16
1285	0.13
1286	0.12
1287	0.11
1288	0.08
1289	0.07
1290	0.04
1291	0.04
1292	0.04
1293	0.04
1294	0.03
1295	0.03
1296	0.03
1297	0.03

A0A316V3Q9

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer