FuNGI

A0A316V2L1

Protein Details

Accession

A0A316V2L1

Localization Confidence

High

Confidence Score

21.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
312-354	DDRSKRKKKSSSSSSSKKRSSSSKKDTKKRRRRKDDSDESDSE	Basic
392-467	SSDGGSRKRKRKGGSKKSSKKRRKGSSKSSSKKKKKSSKRGGSSSSSSKKKRDKKKEKKGRKSRSRSRRDDSDSVS	Basic
483-502	SDDGRSRKSNSRKAKSRVLT	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
314-345	RSKRKKKSSSSSSSKKRSSSSKKDTKKRRRRK
397-460	SRKRKRKGGSKKSSKKRRKGSSKSSSKKKKKSSKRGGSSSSSSKKKRDKKKEKKGRKSRSRSRR

Subcellular Location(s)

nucl 24.5, cyto_nucl 15

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007832 RNA_pol_Rpc34 IPR016049 RNA_pol_Rpc34-like IPR036388 WH-like_DNA-bd_sf IPR036390 WH_DNA-bd_sf
Gene Ontology	GO:0005666 C:RNA polymerase III complex GO:0006383 P:transcription by RNA polymerase III
Pfam	View protein in Pfam PF05158 RNA_pol_Rpc34

Amino Acid Sequences

MPSSSAASGSGSSSKGSKALSSVEKKVHNAVLKAKESTLAQDELLQRFEDINTHEMLEIINSLMKKSLFRLQMDRDKKVFYVASSTAQASMMGGLEPDERLIYNQIRDASTEGIWTKLLKSKTNLHQAVLTRAVKSLESRDLIKTVKSVKNPTRKIYMLRELEPSIELSGGAWYTDNELDTGLIHALGKWCLHYIQQETWAVKPNGARGERKLYPSAYARHLPTAGRILEQIKASAITSATLAVRDIQDLLETLVYDEKIEKIPMMDGAYALASADGGAGHATSSKVNGGGKGKVAKRETDDDEDSDDESEDDRSKRKKKSSSSSSSKKRSSSSKKDTKKRRRRKDDSDESDSESDTAESSDESDSESSASEDSDDESEAEFTDGDSDTSESSDGGSRKRKRKGGSKKSSKKRRKGSSKSSSKKKKKSSKRGGSSSSSSKKKRDKKKEKKGRKSRSRSRRDDSDSVSSDPESSSDSEEETSSSDDGRSRKSNSRKAKSRVLTPSPKPEDDAVDFDYVAASGPLVNRDDFWVYRALAQDTGMQQGFFEAPCARCPVFDFCRPGGPVNASCVYYDHWLEAAIDEEGEEEADGEEGDDDGGDDDGEGDGEVGE

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.17
2	0.18
3	0.19
4	0.18
5	0.17
6	0.23
7	0.32
8	0.37
9	0.42
10	0.46
11	0.5
12	0.51
13	0.54
14	0.54
15	0.5
16	0.48
17	0.5
18	0.52
19	0.52
20	0.51
21	0.46
22	0.42
23	0.38
24	0.38
25	0.33
26	0.26
27	0.22
28	0.26
29	0.3
30	0.3
31	0.31
32	0.26
33	0.23
34	0.22
35	0.22
36	0.2
37	0.18
38	0.18
39	0.17
40	0.18
41	0.17
42	0.16
43	0.15
44	0.12
45	0.1
46	0.08
47	0.1
48	0.09
49	0.1
50	0.13
51	0.13
52	0.14
53	0.17
54	0.24
55	0.27
56	0.31
57	0.39
58	0.45
59	0.54
60	0.6
61	0.63
62	0.58
63	0.55
64	0.51
65	0.49
66	0.41
67	0.32
68	0.31
69	0.27
70	0.28
71	0.27
72	0.28
73	0.23
74	0.22
75	0.21
76	0.14
77	0.12
78	0.09
79	0.07
80	0.06
81	0.06
82	0.07
83	0.07
84	0.07
85	0.07
86	0.07
87	0.09
88	0.14
89	0.16
90	0.17
91	0.21
92	0.23
93	0.23
94	0.24
95	0.24
96	0.22
97	0.19
98	0.2
99	0.17
100	0.16
101	0.16
102	0.16
103	0.16
104	0.2
105	0.23
106	0.24
107	0.28
108	0.36
109	0.44
110	0.54
111	0.53
112	0.49
113	0.51
114	0.48
115	0.49
116	0.48
117	0.4
118	0.3
119	0.3
120	0.29
121	0.25
122	0.25
123	0.24
124	0.22
125	0.22
126	0.24
127	0.24
128	0.27
129	0.27
130	0.26
131	0.25
132	0.29
133	0.32
134	0.35
135	0.43
136	0.48
137	0.58
138	0.63
139	0.63
140	0.62
141	0.59
142	0.6
143	0.58
144	0.59
145	0.53
146	0.5
147	0.49
148	0.43
149	0.41
150	0.35
151	0.28
152	0.19
153	0.14
154	0.12
155	0.08
156	0.08
157	0.07
158	0.06
159	0.06
160	0.05
161	0.07
162	0.08
163	0.08
164	0.07
165	0.08
166	0.08
167	0.08
168	0.08
169	0.06
170	0.06
171	0.05
172	0.06
173	0.07
174	0.08
175	0.08
176	0.08
177	0.09
178	0.09
179	0.11
180	0.14
181	0.17
182	0.18
183	0.23
184	0.26
185	0.26
186	0.27
187	0.34
188	0.3
189	0.28
190	0.27
191	0.27
192	0.31
193	0.33
194	0.34
195	0.29
196	0.37
197	0.38
198	0.41
199	0.39
200	0.33
201	0.33
202	0.35
203	0.35
204	0.32
205	0.33
206	0.31
207	0.29
208	0.3
209	0.26
210	0.24
211	0.25
212	0.21
213	0.17
214	0.18
215	0.17
216	0.18
217	0.18
218	0.16
219	0.11
220	0.11
221	0.11
222	0.1
223	0.09
224	0.06
225	0.06
226	0.07
227	0.07
228	0.07
229	0.07
230	0.07
231	0.07
232	0.07
233	0.07
234	0.06
235	0.06
236	0.06
237	0.06
238	0.05
239	0.05
240	0.05
241	0.06
242	0.06
243	0.06
244	0.06
245	0.07
246	0.08
247	0.08
248	0.08
249	0.07
250	0.07
251	0.09
252	0.09
253	0.08
254	0.07
255	0.07
256	0.07
257	0.06
258	0.06
259	0.04
260	0.03
261	0.03
262	0.03
263	0.02
264	0.02
265	0.02
266	0.02
267	0.03
268	0.03
269	0.04
270	0.04
271	0.05
272	0.05
273	0.07
274	0.07
275	0.1
276	0.12
277	0.12
278	0.15
279	0.2
280	0.22
281	0.27
282	0.28
283	0.27
284	0.28
285	0.32
286	0.33
287	0.32
288	0.32
289	0.26
290	0.26
291	0.25
292	0.22
293	0.17
294	0.14
295	0.08
296	0.08
297	0.08
298	0.08
299	0.09
300	0.13
301	0.21
302	0.28
303	0.35
304	0.42
305	0.49
306	0.56
307	0.66
308	0.71
309	0.74
310	0.76
311	0.79
312	0.81
313	0.81
314	0.77
315	0.69
316	0.63
317	0.63
318	0.63
319	0.64
320	0.65
321	0.67
322	0.73
323	0.79
324	0.87
325	0.88
326	0.89
327	0.9
328	0.91
329	0.92
330	0.92
331	0.93
332	0.93
333	0.93
334	0.89
335	0.86
336	0.76
337	0.69
338	0.6
339	0.49
340	0.38
341	0.27
342	0.18
343	0.11
344	0.09
345	0.05
346	0.05
347	0.06
348	0.06
349	0.05
350	0.06
351	0.06
352	0.06
353	0.06
354	0.07
355	0.06
356	0.06
357	0.06
358	0.05
359	0.05
360	0.06
361	0.06
362	0.07
363	0.07
364	0.07
365	0.07
366	0.07
367	0.07
368	0.06
369	0.05
370	0.06
371	0.06
372	0.06
373	0.06
374	0.06
375	0.06
376	0.07
377	0.07
378	0.05
379	0.06
380	0.1
381	0.11
382	0.16
383	0.26
384	0.34
385	0.42
386	0.5
387	0.56
388	0.59
389	0.69
390	0.75
391	0.77
392	0.8
393	0.83
394	0.86
395	0.9
396	0.94
397	0.94
398	0.92
399	0.92
400	0.91
401	0.91
402	0.91
403	0.91
404	0.91
405	0.92
406	0.91
407	0.92
408	0.92
409	0.91
410	0.91
411	0.91
412	0.9
413	0.9
414	0.92
415	0.93
416	0.92
417	0.92
418	0.9
419	0.85
420	0.8
421	0.75
422	0.73
423	0.7
424	0.68
425	0.63
426	0.64
427	0.68
428	0.72
429	0.77
430	0.79
431	0.82
432	0.84
433	0.91
434	0.94
435	0.95
436	0.97
437	0.97
438	0.97
439	0.96
440	0.96
441	0.95
442	0.95
443	0.94
444	0.92
445	0.89
446	0.88
447	0.85
448	0.8
449	0.75
450	0.73
451	0.65
452	0.57
453	0.51
454	0.41
455	0.33
456	0.26
457	0.21
458	0.14
459	0.12
460	0.13
461	0.12
462	0.13
463	0.13
464	0.13
465	0.13
466	0.12
467	0.13
468	0.11
469	0.11
470	0.11
471	0.14
472	0.16
473	0.22
474	0.26
475	0.3
476	0.39
477	0.49
478	0.57
479	0.64
480	0.73
481	0.77
482	0.79
483	0.84
484	0.8
485	0.79
486	0.79
487	0.78
488	0.77
489	0.73
490	0.77
491	0.73
492	0.68
493	0.62
494	0.54
495	0.5
496	0.43
497	0.41
498	0.33
499	0.27
500	0.26
501	0.23
502	0.21
503	0.15
504	0.12
505	0.08
506	0.05
507	0.05
508	0.07
509	0.1
510	0.11
511	0.12
512	0.12
513	0.15
514	0.19
515	0.18
516	0.19
517	0.2
518	0.19
519	0.22
520	0.24
521	0.23
522	0.2
523	0.21
524	0.23
525	0.21
526	0.25
527	0.22
528	0.19
529	0.17
530	0.18
531	0.18
532	0.13
533	0.15
534	0.14
535	0.15
536	0.17
537	0.23
538	0.22
539	0.21
540	0.25
541	0.31
542	0.33
543	0.39
544	0.43
545	0.39
546	0.47
547	0.48
548	0.47
549	0.43
550	0.42
551	0.37
552	0.37
553	0.38
554	0.31
555	0.3
556	0.29
557	0.26
558	0.25
559	0.24
560	0.19
561	0.16
562	0.16
563	0.16
564	0.15
565	0.14
566	0.11
567	0.09
568	0.08
569	0.09
570	0.08
571	0.08
572	0.07
573	0.05
574	0.05
575	0.06
576	0.06
577	0.05
578	0.05
579	0.05
580	0.05
581	0.05
582	0.05
583	0.05
584	0.06
585	0.05
586	0.05
587	0.05
588	0.05
589	0.06
590	0.05

A0A316V2L1

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer