Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A316UYC6

Protein Details
Accession A0A316UYC6    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
243-268DSSSKASSATSKKRKKAKDDDGEAEAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
254-259KKRKKA
Subcellular Location(s) nucl 15.5, cyto_nucl 14.5, cyto 10.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001611  Leu-rich_rpt  
IPR032675  LRR_dom_sf  
IPR044640  RU2A  
Gene Ontology GO:0030620  F:U2 snRNA binding  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF14580  LRR_9  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51450  LRR  
Amino Acid Sequences MKLTPELIASTPTYLNPLGDRELSLRGRKIPTIENLGVTRDQIDTLDLTDNDVLTLANFPHLDRLAHLLLSNNLISRIDARLAWSLPRLTSLVLTNNQIASFAQLKGLGKFPMLQYLTLIGNPVAREKYYREWIVSRCKTVRVLDYRRVKDKERELAKSLMETSDGRPSALCVQLSAPKGAEGEPISMGVDTSARGGPAKGAAGRLMTAAERKKLEAAIDKSESLEEIRRLEERLRLGYAIEDSSSKASSATSKKRKKAKDDDGEAEAEEDE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.17
2 0.17
3 0.17
4 0.18
5 0.19
6 0.19
7 0.2
8 0.19
9 0.26
10 0.3
11 0.33
12 0.33
13 0.36
14 0.39
15 0.4
16 0.42
17 0.4
18 0.41
19 0.44
20 0.42
21 0.4
22 0.38
23 0.38
24 0.35
25 0.29
26 0.25
27 0.17
28 0.16
29 0.12
30 0.12
31 0.09
32 0.11
33 0.14
34 0.12
35 0.14
36 0.14
37 0.14
38 0.12
39 0.12
40 0.1
41 0.07
42 0.08
43 0.06
44 0.08
45 0.09
46 0.09
47 0.13
48 0.14
49 0.14
50 0.13
51 0.18
52 0.17
53 0.17
54 0.17
55 0.15
56 0.14
57 0.16
58 0.16
59 0.11
60 0.11
61 0.11
62 0.11
63 0.11
64 0.11
65 0.1
66 0.1
67 0.12
68 0.14
69 0.14
70 0.15
71 0.16
72 0.15
73 0.14
74 0.16
75 0.14
76 0.12
77 0.12
78 0.13
79 0.15
80 0.16
81 0.17
82 0.17
83 0.17
84 0.16
85 0.15
86 0.13
87 0.12
88 0.12
89 0.1
90 0.1
91 0.11
92 0.12
93 0.13
94 0.15
95 0.13
96 0.11
97 0.12
98 0.12
99 0.17
100 0.17
101 0.16
102 0.14
103 0.16
104 0.16
105 0.14
106 0.14
107 0.07
108 0.08
109 0.08
110 0.1
111 0.08
112 0.08
113 0.1
114 0.12
115 0.17
116 0.21
117 0.22
118 0.22
119 0.24
120 0.28
121 0.37
122 0.37
123 0.36
124 0.32
125 0.32
126 0.33
127 0.32
128 0.34
129 0.32
130 0.36
131 0.4
132 0.49
133 0.51
134 0.56
135 0.57
136 0.54
137 0.52
138 0.54
139 0.54
140 0.51
141 0.51
142 0.47
143 0.47
144 0.43
145 0.37
146 0.31
147 0.22
148 0.18
149 0.15
150 0.13
151 0.17
152 0.17
153 0.16
154 0.15
155 0.16
156 0.18
157 0.2
158 0.18
159 0.12
160 0.14
161 0.19
162 0.2
163 0.19
164 0.16
165 0.14
166 0.15
167 0.14
168 0.15
169 0.11
170 0.11
171 0.1
172 0.1
173 0.1
174 0.1
175 0.09
176 0.07
177 0.06
178 0.05
179 0.06
180 0.06
181 0.07
182 0.07
183 0.07
184 0.08
185 0.09
186 0.11
187 0.1
188 0.11
189 0.11
190 0.11
191 0.12
192 0.11
193 0.1
194 0.09
195 0.14
196 0.16
197 0.2
198 0.2
199 0.21
200 0.23
201 0.23
202 0.25
203 0.29
204 0.3
205 0.32
206 0.34
207 0.33
208 0.32
209 0.31
210 0.28
211 0.21
212 0.22
213 0.17
214 0.17
215 0.19
216 0.2
217 0.22
218 0.24
219 0.27
220 0.26
221 0.27
222 0.27
223 0.25
224 0.25
225 0.24
226 0.23
227 0.19
228 0.16
229 0.13
230 0.13
231 0.15
232 0.15
233 0.13
234 0.11
235 0.12
236 0.19
237 0.28
238 0.37
239 0.46
240 0.55
241 0.64
242 0.74
243 0.82
244 0.85
245 0.86
246 0.86
247 0.87
248 0.86
249 0.83
250 0.77
251 0.69
252 0.59