Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A316UPK7

Protein Details
Accession A0A316UPK7    Localization Confidence High Confidence Score 17.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
465-489SLRALAKQEEERKKRKRVLLSDAFHHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
212-224SRGKKDGKQKEKR
254-267RRKRAQLRAERERR
476-480RKKRK
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 12, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007900  TAF4_C  
Gene Ontology GO:0005669  C:transcription factor TFIID complex  
GO:0006352  P:DNA-templated transcription initiation  
Pfam View protein in Pfam  
PF05236  TAF4  
Amino Acid Sequences MASPANGVGPTQHASSPSAPAQSPASQPHPPSSAAAAAAIQQGFQPNASQHLVAHPFRAPGSGQGNAGPSTSSSSNQNASSSSNSNANSWVAAGGIDLRAEEEALRAGERQAPPPSDPYSNSTQRGQTGAAASSSASSSSSSTGYLQLLPLAQMVHRTSSSYDINDVDPEVLNILSAGARIRFRNLLEGMVRAARHRGWSDAEREPPLEEGSRGKKDGKQKEKRPLYHEELLSDPSKWLRALEKAERGQEAVMRRKRAQLRAERERREAERAAGVSTPLASKDGANDDSIMDGGAGDDTEEGGSSRKKAKLATNASSSANGGGGSGSAPGSGDGTTGPSTPTAAPIASNATASMSAKNMSDDVRRRLANNTAARALGSLGGSMPKWMTMGGGAGAGAGGGGFGSAGGEGGMSPASNLPKPRFAPQPPVQQQEGNQAGWARAPSGKAGSPIAREGTVNPQGWGDLSLRALAKQEEERKKRKRVLLSDAFHALEMERRNGGGGSSGGDRVVMRWRALGGKEGKEGQEQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.21
2 0.23
3 0.27
4 0.27
5 0.28
6 0.27
7 0.27
8 0.3
9 0.3
10 0.33
11 0.33
12 0.36
13 0.38
14 0.4
15 0.43
16 0.42
17 0.39
18 0.36
19 0.33
20 0.29
21 0.24
22 0.23
23 0.18
24 0.17
25 0.19
26 0.16
27 0.14
28 0.12
29 0.15
30 0.14
31 0.15
32 0.15
33 0.13
34 0.18
35 0.19
36 0.19
37 0.17
38 0.24
39 0.3
40 0.29
41 0.31
42 0.28
43 0.27
44 0.27
45 0.29
46 0.22
47 0.21
48 0.25
49 0.24
50 0.23
51 0.23
52 0.26
53 0.24
54 0.24
55 0.17
56 0.14
57 0.16
58 0.17
59 0.16
60 0.18
61 0.21
62 0.24
63 0.25
64 0.25
65 0.22
66 0.23
67 0.26
68 0.25
69 0.23
70 0.25
71 0.25
72 0.25
73 0.26
74 0.23
75 0.19
76 0.17
77 0.15
78 0.09
79 0.08
80 0.07
81 0.07
82 0.06
83 0.06
84 0.06
85 0.06
86 0.06
87 0.06
88 0.06
89 0.06
90 0.07
91 0.07
92 0.08
93 0.08
94 0.1
95 0.16
96 0.18
97 0.22
98 0.26
99 0.28
100 0.29
101 0.33
102 0.36
103 0.32
104 0.33
105 0.32
106 0.35
107 0.39
108 0.4
109 0.39
110 0.38
111 0.36
112 0.36
113 0.32
114 0.26
115 0.22
116 0.2
117 0.17
118 0.14
119 0.13
120 0.11
121 0.11
122 0.08
123 0.07
124 0.07
125 0.07
126 0.09
127 0.09
128 0.09
129 0.1
130 0.12
131 0.12
132 0.12
133 0.11
134 0.11
135 0.1
136 0.1
137 0.1
138 0.08
139 0.07
140 0.1
141 0.11
142 0.12
143 0.12
144 0.13
145 0.13
146 0.18
147 0.19
148 0.17
149 0.18
150 0.17
151 0.17
152 0.17
153 0.16
154 0.13
155 0.11
156 0.1
157 0.08
158 0.07
159 0.06
160 0.05
161 0.05
162 0.04
163 0.04
164 0.05
165 0.07
166 0.09
167 0.1
168 0.12
169 0.14
170 0.15
171 0.2
172 0.2
173 0.2
174 0.19
175 0.2
176 0.19
177 0.18
178 0.18
179 0.13
180 0.15
181 0.13
182 0.15
183 0.15
184 0.16
185 0.18
186 0.22
187 0.26
188 0.29
189 0.31
190 0.29
191 0.29
192 0.27
193 0.24
194 0.22
195 0.18
196 0.14
197 0.16
198 0.21
199 0.23
200 0.24
201 0.25
202 0.28
203 0.37
204 0.47
205 0.53
206 0.57
207 0.63
208 0.72
209 0.79
210 0.8
211 0.75
212 0.73
213 0.69
214 0.65
215 0.57
216 0.48
217 0.4
218 0.37
219 0.32
220 0.25
221 0.18
222 0.12
223 0.13
224 0.11
225 0.11
226 0.11
227 0.14
228 0.19
229 0.24
230 0.31
231 0.32
232 0.33
233 0.33
234 0.31
235 0.27
236 0.24
237 0.25
238 0.27
239 0.29
240 0.31
241 0.32
242 0.39
243 0.44
244 0.48
245 0.51
246 0.51
247 0.56
248 0.63
249 0.71
250 0.67
251 0.65
252 0.62
253 0.56
254 0.52
255 0.44
256 0.34
257 0.28
258 0.25
259 0.22
260 0.18
261 0.16
262 0.11
263 0.1
264 0.09
265 0.06
266 0.06
267 0.06
268 0.05
269 0.07
270 0.1
271 0.1
272 0.1
273 0.11
274 0.1
275 0.1
276 0.1
277 0.08
278 0.05
279 0.04
280 0.03
281 0.03
282 0.03
283 0.03
284 0.03
285 0.03
286 0.03
287 0.03
288 0.03
289 0.05
290 0.06
291 0.08
292 0.14
293 0.16
294 0.18
295 0.22
296 0.28
297 0.36
298 0.43
299 0.45
300 0.44
301 0.44
302 0.43
303 0.4
304 0.34
305 0.24
306 0.17
307 0.12
308 0.08
309 0.05
310 0.05
311 0.04
312 0.05
313 0.04
314 0.04
315 0.04
316 0.04
317 0.05
318 0.05
319 0.05
320 0.04
321 0.06
322 0.07
323 0.07
324 0.08
325 0.07
326 0.09
327 0.09
328 0.1
329 0.09
330 0.08
331 0.08
332 0.09
333 0.12
334 0.1
335 0.1
336 0.09
337 0.09
338 0.09
339 0.1
340 0.1
341 0.08
342 0.09
343 0.09
344 0.09
345 0.1
346 0.11
347 0.18
348 0.22
349 0.26
350 0.31
351 0.32
352 0.32
353 0.35
354 0.39
355 0.41
356 0.4
357 0.38
358 0.34
359 0.33
360 0.32
361 0.29
362 0.23
363 0.16
364 0.11
365 0.08
366 0.07
367 0.08
368 0.08
369 0.08
370 0.08
371 0.06
372 0.06
373 0.06
374 0.06
375 0.05
376 0.06
377 0.06
378 0.06
379 0.05
380 0.05
381 0.05
382 0.04
383 0.03
384 0.02
385 0.02
386 0.02
387 0.02
388 0.02
389 0.02
390 0.02
391 0.02
392 0.02
393 0.02
394 0.02
395 0.03
396 0.03
397 0.04
398 0.03
399 0.04
400 0.07
401 0.1
402 0.12
403 0.17
404 0.2
405 0.27
406 0.3
407 0.35
408 0.42
409 0.43
410 0.51
411 0.54
412 0.62
413 0.62
414 0.65
415 0.62
416 0.55
417 0.53
418 0.52
419 0.48
420 0.37
421 0.32
422 0.27
423 0.25
424 0.24
425 0.23
426 0.15
427 0.13
428 0.14
429 0.15
430 0.17
431 0.19
432 0.19
433 0.23
434 0.24
435 0.25
436 0.27
437 0.26
438 0.24
439 0.23
440 0.23
441 0.27
442 0.31
443 0.3
444 0.27
445 0.25
446 0.25
447 0.25
448 0.25
449 0.17
450 0.12
451 0.12
452 0.15
453 0.15
454 0.16
455 0.17
456 0.16
457 0.19
458 0.25
459 0.35
460 0.43
461 0.52
462 0.61
463 0.69
464 0.78
465 0.83
466 0.83
467 0.83
468 0.81
469 0.83
470 0.83
471 0.77
472 0.72
473 0.67
474 0.59
475 0.48
476 0.4
477 0.29
478 0.24
479 0.24
480 0.22
481 0.18
482 0.18
483 0.19
484 0.19
485 0.19
486 0.16
487 0.13
488 0.13
489 0.15
490 0.15
491 0.14
492 0.15
493 0.15
494 0.13
495 0.22
496 0.23
497 0.21
498 0.22
499 0.25
500 0.29
501 0.3
502 0.37
503 0.35
504 0.36
505 0.41
506 0.43