Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A316UPE5

Protein Details
Accession A0A316UPE5    Localization Confidence High Confidence Score 20.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
556-581ADEKAGIRKKRTRKPPPKPRDASTATBasic
589-612ARAMMEKKTRHQPKSRKINYNAMAHydrophilic
615-646GSMFDNEKSHKKKKKGSKKKGDKRQRVSSGGEBasic
673-698EVPRNDPRRRTESKANRKRKASSAARHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
318-318R
320-340LAKEEQNRLKEERKAERLAKK
559-575KAGIRKKRTRKPPPKPR
622-640KSHKKKKKGSKKKGDKRQR
679-694PRRRTESKANRKRKAS
Subcellular Location(s) nucl 13.5, cyto_nucl 13, cyto 11.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011665  BRF1_TBP-bd_dom  
IPR013763  Cyclin-like_dom  
IPR036915  Cyclin-like_sf  
IPR000812  TFIIB  
IPR013150  TFIIB_cyclin  
IPR013137  Znf_TFIIB  
Gene Ontology GO:0017025  F:TBP-class protein binding  
GO:0070897  P:transcription preinitiation complex assembly  
Pfam View protein in Pfam  
PF07741  BRF1  
PF08271  TF_Zn_Ribbon  
PF00382  TFIIB  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51134  ZF_TFIIB  
CDD cd20554  CYCLIN_TFIIIB90_rpt2  
Amino Acid Sequences MRCPQCHSDNVEFDNSQAICQACGNVLAESQIVSDVTFGETSAGAATVQGSYLSQDQSHVRSSNPRFRSGGSGESREQTHYRAKEAIDRMGRAHRVGFSTRERANRMFRLALAGEVHEARTVGQDPTKNFVLGRKHEYTVAACLYVACRMDKTTHMLIDFADSMNINVFTLGRHYLKLIRALNLQLPVIDPAIYILRFAALLHFGEEVHRVAADATRLVKRFDKDWIIQGRRPAGVCGAALLLAARMNNFRRSMNEIVQVVKMADVTIRERLKEFKRTPTAQLSVADFKKVWLESEYEPPAFYRPAMEEERKAQKEARALAKEEQNRLKEERKAERLAKKFKQGSAAVEDEGLADQTGEQAAGEDEALDPEADAMVQRMLQDEMGQYIDDPRYRDLDQQLEQHNAAAMERARLGGATVGTAPELEMNEFRQRRAVDEEDEDEDGQNQSGGKQQEEQGQVEGEPSFNDLVPKESATQGENHERAAGPSTSTSSTRRLKYSQLSHGAPIDDPLTDLDEDELDQFILGPEEVAIKERVWMEFNHDYLVAAMKRQLKEEADEKAGIRKKRTRKPPPKPRDASTATGATAEEAARAMMEKKTRHQPKSRKINYNAMAGIGSMFDNEKSHKKKKKGSKKKGDKRQRVSSGGEGSGTEGEATGARGATSELEPVEEEGDEVPRNDPRRRTESKANRKRKASSAARSGGATSEGEDTGGETTDLGTQRGDTDGGEDGEADEGDMEAQMRARMGAMYSQPVDDYEGEEAY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.45
2 0.37
3 0.28
4 0.26
5 0.22
6 0.17
7 0.18
8 0.19
9 0.12
10 0.14
11 0.15
12 0.12
13 0.12
14 0.12
15 0.12
16 0.11
17 0.1
18 0.09
19 0.08
20 0.07
21 0.07
22 0.07
23 0.09
24 0.08
25 0.08
26 0.08
27 0.08
28 0.08
29 0.08
30 0.08
31 0.06
32 0.06
33 0.07
34 0.06
35 0.06
36 0.06
37 0.06
38 0.08
39 0.11
40 0.12
41 0.12
42 0.15
43 0.18
44 0.21
45 0.27
46 0.26
47 0.25
48 0.34
49 0.43
50 0.5
51 0.5
52 0.52
53 0.49
54 0.5
55 0.55
56 0.48
57 0.49
58 0.45
59 0.47
60 0.44
61 0.45
62 0.44
63 0.41
64 0.39
65 0.34
66 0.37
67 0.34
68 0.36
69 0.36
70 0.36
71 0.41
72 0.43
73 0.47
74 0.43
75 0.43
76 0.42
77 0.46
78 0.46
79 0.39
80 0.38
81 0.32
82 0.31
83 0.33
84 0.35
85 0.34
86 0.39
87 0.43
88 0.47
89 0.49
90 0.51
91 0.56
92 0.56
93 0.54
94 0.48
95 0.43
96 0.42
97 0.37
98 0.34
99 0.26
100 0.21
101 0.19
102 0.18
103 0.18
104 0.13
105 0.12
106 0.1
107 0.12
108 0.13
109 0.13
110 0.17
111 0.21
112 0.22
113 0.28
114 0.29
115 0.27
116 0.26
117 0.29
118 0.34
119 0.36
120 0.41
121 0.4
122 0.4
123 0.41
124 0.43
125 0.38
126 0.34
127 0.29
128 0.22
129 0.18
130 0.17
131 0.16
132 0.16
133 0.16
134 0.12
135 0.12
136 0.13
137 0.15
138 0.17
139 0.23
140 0.24
141 0.25
142 0.24
143 0.24
144 0.22
145 0.23
146 0.22
147 0.15
148 0.12
149 0.1
150 0.1
151 0.11
152 0.11
153 0.08
154 0.07
155 0.07
156 0.06
157 0.09
158 0.13
159 0.12
160 0.12
161 0.14
162 0.19
163 0.22
164 0.29
165 0.29
166 0.28
167 0.3
168 0.31
169 0.33
170 0.3
171 0.27
172 0.2
173 0.18
174 0.16
175 0.14
176 0.12
177 0.08
178 0.08
179 0.1
180 0.1
181 0.09
182 0.08
183 0.07
184 0.07
185 0.08
186 0.08
187 0.07
188 0.07
189 0.08
190 0.08
191 0.08
192 0.09
193 0.11
194 0.1
195 0.09
196 0.08
197 0.07
198 0.08
199 0.09
200 0.09
201 0.09
202 0.12
203 0.16
204 0.17
205 0.2
206 0.24
207 0.24
208 0.25
209 0.29
210 0.32
211 0.3
212 0.37
213 0.44
214 0.46
215 0.46
216 0.49
217 0.46
218 0.42
219 0.4
220 0.33
221 0.24
222 0.2
223 0.18
224 0.14
225 0.11
226 0.08
227 0.08
228 0.07
229 0.05
230 0.05
231 0.05
232 0.05
233 0.09
234 0.11
235 0.15
236 0.17
237 0.18
238 0.2
239 0.26
240 0.3
241 0.3
242 0.33
243 0.3
244 0.3
245 0.29
246 0.27
247 0.2
248 0.16
249 0.12
250 0.07
251 0.07
252 0.07
253 0.09
254 0.15
255 0.16
256 0.16
257 0.18
258 0.25
259 0.29
260 0.37
261 0.39
262 0.42
263 0.49
264 0.51
265 0.55
266 0.55
267 0.53
268 0.45
269 0.43
270 0.37
271 0.35
272 0.33
273 0.29
274 0.22
275 0.2
276 0.21
277 0.19
278 0.17
279 0.12
280 0.15
281 0.15
282 0.22
283 0.25
284 0.21
285 0.21
286 0.21
287 0.21
288 0.18
289 0.16
290 0.11
291 0.1
292 0.14
293 0.19
294 0.21
295 0.21
296 0.27
297 0.36
298 0.35
299 0.36
300 0.33
301 0.31
302 0.34
303 0.37
304 0.4
305 0.33
306 0.35
307 0.37
308 0.42
309 0.42
310 0.43
311 0.44
312 0.38
313 0.38
314 0.4
315 0.41
316 0.39
317 0.42
318 0.44
319 0.44
320 0.48
321 0.52
322 0.57
323 0.6
324 0.64
325 0.61
326 0.62
327 0.6
328 0.56
329 0.55
330 0.48
331 0.43
332 0.38
333 0.35
334 0.26
335 0.22
336 0.21
337 0.14
338 0.13
339 0.1
340 0.05
341 0.03
342 0.03
343 0.03
344 0.03
345 0.03
346 0.03
347 0.03
348 0.03
349 0.03
350 0.03
351 0.03
352 0.03
353 0.03
354 0.04
355 0.03
356 0.03
357 0.03
358 0.03
359 0.03
360 0.03
361 0.03
362 0.03
363 0.04
364 0.04
365 0.05
366 0.05
367 0.05
368 0.06
369 0.05
370 0.06
371 0.06
372 0.06
373 0.05
374 0.07
375 0.08
376 0.09
377 0.11
378 0.11
379 0.14
380 0.15
381 0.18
382 0.19
383 0.22
384 0.23
385 0.27
386 0.28
387 0.27
388 0.26
389 0.23
390 0.21
391 0.16
392 0.14
393 0.11
394 0.09
395 0.07
396 0.08
397 0.08
398 0.07
399 0.07
400 0.07
401 0.06
402 0.05
403 0.05
404 0.05
405 0.05
406 0.05
407 0.05
408 0.05
409 0.04
410 0.05
411 0.05
412 0.06
413 0.08
414 0.15
415 0.16
416 0.16
417 0.2
418 0.2
419 0.22
420 0.27
421 0.27
422 0.22
423 0.24
424 0.26
425 0.23
426 0.24
427 0.21
428 0.16
429 0.14
430 0.12
431 0.09
432 0.08
433 0.06
434 0.06
435 0.1
436 0.11
437 0.11
438 0.13
439 0.15
440 0.22
441 0.24
442 0.25
443 0.21
444 0.2
445 0.19
446 0.19
447 0.16
448 0.09
449 0.07
450 0.07
451 0.07
452 0.07
453 0.08
454 0.07
455 0.1
456 0.1
457 0.11
458 0.11
459 0.12
460 0.13
461 0.13
462 0.15
463 0.17
464 0.23
465 0.23
466 0.22
467 0.22
468 0.2
469 0.2
470 0.21
471 0.17
472 0.11
473 0.11
474 0.13
475 0.14
476 0.16
477 0.17
478 0.21
479 0.28
480 0.3
481 0.33
482 0.33
483 0.37
484 0.43
485 0.48
486 0.49
487 0.49
488 0.47
489 0.45
490 0.45
491 0.4
492 0.31
493 0.26
494 0.18
495 0.11
496 0.1
497 0.09
498 0.09
499 0.08
500 0.08
501 0.07
502 0.07
503 0.07
504 0.07
505 0.07
506 0.05
507 0.05
508 0.05
509 0.05
510 0.05
511 0.04
512 0.04
513 0.04
514 0.05
515 0.06
516 0.08
517 0.09
518 0.08
519 0.11
520 0.12
521 0.13
522 0.13
523 0.14
524 0.19
525 0.22
526 0.23
527 0.21
528 0.2
529 0.19
530 0.18
531 0.22
532 0.14
533 0.11
534 0.16
535 0.21
536 0.21
537 0.23
538 0.26
539 0.23
540 0.27
541 0.3
542 0.29
543 0.26
544 0.27
545 0.26
546 0.31
547 0.36
548 0.35
549 0.39
550 0.44
551 0.51
552 0.59
553 0.7
554 0.73
555 0.79
556 0.87
557 0.91
558 0.93
559 0.94
560 0.9
561 0.84
562 0.82
563 0.75
564 0.68
565 0.61
566 0.53
567 0.42
568 0.36
569 0.31
570 0.22
571 0.18
572 0.13
573 0.09
574 0.07
575 0.06
576 0.06
577 0.07
578 0.08
579 0.1
580 0.16
581 0.18
582 0.25
583 0.36
584 0.46
585 0.53
586 0.62
587 0.69
588 0.74
589 0.83
590 0.87
591 0.87
592 0.83
593 0.85
594 0.79
595 0.74
596 0.64
597 0.53
598 0.43
599 0.33
600 0.27
601 0.17
602 0.13
603 0.07
604 0.07
605 0.07
606 0.08
607 0.12
608 0.21
609 0.29
610 0.39
611 0.48
612 0.56
613 0.66
614 0.75
615 0.84
616 0.86
617 0.89
618 0.91
619 0.93
620 0.95
621 0.96
622 0.96
623 0.96
624 0.94
625 0.93
626 0.9
627 0.84
628 0.78
629 0.73
630 0.67
631 0.57
632 0.48
633 0.37
634 0.3
635 0.25
636 0.2
637 0.13
638 0.08
639 0.08
640 0.07
641 0.08
642 0.07
643 0.07
644 0.07
645 0.07
646 0.07
647 0.09
648 0.09
649 0.1
650 0.1
651 0.1
652 0.11
653 0.12
654 0.12
655 0.1
656 0.1
657 0.09
658 0.11
659 0.11
660 0.12
661 0.14
662 0.19
663 0.25
664 0.3
665 0.37
666 0.42
667 0.5
668 0.56
669 0.61
670 0.67
671 0.73
672 0.78
673 0.82
674 0.85
675 0.85
676 0.86
677 0.84
678 0.81
679 0.81
680 0.79
681 0.78
682 0.77
683 0.72
684 0.67
685 0.61
686 0.53
687 0.43
688 0.35
689 0.26
690 0.18
691 0.15
692 0.13
693 0.13
694 0.12
695 0.12
696 0.11
697 0.11
698 0.09
699 0.06
700 0.07
701 0.12
702 0.13
703 0.13
704 0.13
705 0.13
706 0.14
707 0.15
708 0.15
709 0.1
710 0.11
711 0.14
712 0.14
713 0.14
714 0.13
715 0.12
716 0.12
717 0.12
718 0.1
719 0.07
720 0.06
721 0.06
722 0.06
723 0.06
724 0.06
725 0.07
726 0.08
727 0.08
728 0.09
729 0.09
730 0.1
731 0.1
732 0.15
733 0.16
734 0.21
735 0.22
736 0.22
737 0.22
738 0.22
739 0.24
740 0.2
741 0.19